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The map label for this gene is 54020176

Identifier: 54020176

GI number: 54020176

Start: 470707

End: 471687

Strand: Direct

Name: 54020176

Synonym: mhp392

Alternate gene names: NA

Gene position: 470707-471687 (Clockwise)

Preceding gene: 54020175

Following gene: 54020177

Centisome position: 52.73

GC content: 28.75

Gene sequence:

>981_bases
ATGATCAAAGCAAAATTCTTGCCTTTGATAAAGAGGGTAATCGTGTTCGGGATTAAAAAAAATACTATAAAATCGGTTGT
TTTTAATAAAAATACGCAGGCAATTTTGCTAATTAGCCCTCTTGTAATCTTTCTTTTAATTTTTTCTGTCTATCCTATTT
TTCAGTCATTTTTTAATGCTTTCAAGGTTGAAAATAATACAAATTGGCGGCTTGGATTTAGTAATTTTTCTAGCCTTTTT
TCCAAGTCAGCTTTCAGGGACGCTCTAAAAAACAGCACAATTTTATTTTTTTTAAGTTCGCCAATTGCGCTTTTTTGTGG
GTTTGTAATCGCAATTTTGCTTACAAAACTTAAAAACAAAATTGTGCGCAGTTTTCTTATTAGCGGATTTTATTCACAAT
TTTTCATCTCTGCTTTTGCAATTGGAATTGCTTTTAGTTTCCTTTTTGGTGAAAAAAATGTTTTTTCTAAAATTTTAGGC
CTTAATTTTTCTTTTGTTGGCGACCAAAATCGTATTAGTTTGATTTGACTTTATCTAATTTTTCAATTATGAAGGGCGAT
TCCGTTTAATTCAGTTTTGTTTTTTTTCGCTTTTTCAACAATTAATGCAAAATATGAAAAAAATTTCAAAATTGATAAAA
TTAGCCTAAAAGATAAAATTTTTAACCTTTATTTTAAAGAAATTAGTACCCAATTTATGGTTATCGCCTACACAAACTTT
GTTTTTGCAACGATGTTATACCCGAATGTAATAACGGCAAATTTGAACTTGGATCTCAACCACGGGCATACGCTGGCTTC
TTATATTTTGAATGTGCGTGATGATTTAGGACTTCAGGCAGCAGCAAGTTTTGTGAGTTTTCTATACCTTTTAGCAATTT
TTTCTACTTTTTTAATTTTTCGGCCAAAAATCTGAAAAATAATTTATAAAAAAATAAAAACAAAAATTAAAAGAAAGGTT
GAAAATGCACTTAAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCTGAAAATTTTTTCTACCAAATTTATGATATTGAAAAAAATACTAATCTTGAAATTGTAACTCCGATTGATATTACTGG
TCAAAAAGTTCAAATTGAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTAAAAACTCTTTTATTCAACTTTTTCTTATGTTTTTGTTAATTTTTTTATTAATGATTTTTCTATTTCCGCTATATT
ATTTAATTTTAAATGCAAGT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Glycerol Transporter Subunit B; Glycerol ABC Transporter Permease; ABC Transporter Permease; ABC Transporter Permease Protein; Glycerol ABC Transporter Permease Protein GtsB; Sugar ABC Transporter Permease

Number of amino acids: Translated: 326; Mature: 326

Protein sequence:

>326_residues
MIKAKFLPLIKRVIVFGIKKNTIKSVVFNKNTQAILLISPLVIFLLIFSVYPIFQSFFNAFKVENNTNWRLGFSNFSSLF
SKSAFRDALKNSTILFFLSSPIALFCGFVIAILLTKLKNKIVRSFLISGFYSQFFISAFAIGIAFSFLFGEKNVFSKILG
LNFSFVGDQNRISLIWLYLIFQLWRAIPFNSVLFFFAFSTINAKYEKNFKIDKISLKDKIFNLYFKEISTQFMVIAYTNF
VFATMLYPNVITANLNLDLNHGHTLASYILNVRDDLGLQAAASFVSFLYLLAIFSTFLIFRPKIWKIIYKKIKTKIKRKV
ENALKN

Sequences:

>Translated_326_residues
MIKAKFLPLIKRVIVFGIKKNTIKSVVFNKNTQAILLISPLVIFLLIFSVYPIFQSFFNAFKVENNTNWRLGFSNFSSLF
SKSAFRDALKNSTILFFLSSPIALFCGFVIAILLTKLKNKIVRSFLISGFYSQFFISAFAIGIAFSFLFGEKNVFSKILG
LNFSFVGDQNRISLI*LYLIFQL*RAIPFNSVLFFFAFSTINAKYEKNFKIDKISLKDKIFNLYFKEISTQFMVIAYTNF
VFATMLYPNVITANLNLDLNHGHTLASYILNVRDDLGLQAAASFVSFLYLLAIFSTFLIFRPKI*KIIYKKIKTKIKRKV
ENALKN
>Mature_326_residues
MIKAKFLPLIKRVIVFGIKKNTIKSVVFNKNTQAILLISPLVIFLLIFSVYPIFQSFFNAFKVENNTNWRLGFSNFSSLF
SKSAFRDALKNSTILFFLSSPIALFCGFVIAILLTKLKNKIVRSFLISGFYSQFFISAFAIGIAFSFLFGEKNVFSKILG
LNFSFVGDQNRISLI*LYLIFQL*RAIPFNSVLFFFAFSTINAKYEKNFKIDKISLKDKIFNLYFKEISTQFMVIAYTNF
VFATMLYPNVITANLNLDLNHGHTLASYILNVRDDLGLQAAASFVSFLYLLAIFSTFLIFRPKI*KIIYKKIKTKIKRKV
ENALKN

Specific function: Unknown

COG id: COG1175

COG function: function code G; ABC-type sugar transport systems, permease components

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 37047; Mature: 37047

Theoretical pI: Translated: 10.89; Mature: 10.89

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
1.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
1.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIKAKFLPLIKRVIVFGIKKNTIKSVVFNKNTQAILLISPLVIFLLIFSVYPIFQSFFNA
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKVENNTNWRLGFSNFSSLFSKSAFRDALKNSTILFFLSSPIALFCGFVIAILLTKLKNK
HCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVRSFLISGFYSQFFISAFAIGIAFSFLFGEKNVFSKILGLNFSFVGDQNRISLILYLIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHH
QLRAIPFNSVLFFFAFSTINAKYEKNFKIDKISLKDKIFNLYFKEISTQFMVIAYTNFVF
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHH
ATMLYPNVITANLNLDLNHGHTLASYILNVRDDLGLQAAASFVSFLYLLAIFSTFLIFRP
HHHHCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KIKIIYKKIKTKIKRKVENALKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MIKAKFLPLIKRVIVFGIKKNTIKSVVFNKNTQAILLISPLVIFLLIFSVYPIFQSFFNA
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FKVENNTNWRLGFSNFSSLFSKSAFRDALKNSTILFFLSSPIALFCGFVIAILLTKLKNK
HCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVRSFLISGFYSQFFISAFAIGIAFSFLFGEKNVFSKILGLNFSFVGDQNRISLILYLIF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHH
QLRAIPFNSVLFFFAFSTINAKYEKNFKIDKISLKDKIFNLYFKEISTQFMVIAYTNFVF
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHH
ATMLYPNVITANLNLDLNHGHTLASYILNVRDDLGLQAAASFVSFLYLLAIFSTFLIFRP
HHHHCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KIKIIYKKIKTKIKRKVENALKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 10.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA