Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 54020161

Identifier: 54020161

GI number: 54020161

Start: 436224

End: 437780

Strand: Direct

Name: 54020161

Synonym: mhp368

Alternate gene names: NA

Gene position: 436224-437780 (Clockwise)

Preceding gene: 54020160

Following gene: 54020162

Centisome position: 48.86

GC content: 29.74

Gene sequence:

>1557_bases
ATGACGCTTAAAAGTTCGCGAAAGCTAGGTTTTTTTGCAGCCCTGTCAATGTTAGTAAGCTCGGTTGTTGGAATCGGGAT
TTTCTTTAAAAATCAAAGTGTTGCGGATATAACAGGATATAATGGTTATGCTTGACTTTTTGCTTGAATCATCGGTGGCA
TAATTTCACTTTTTGCGGCAATTACTTTTTCAGAAATTAGCTTTTTAAAACCAACAAAACTCAACGGGCTGCCAAATTGA
ACCTGACAAACCGCTGGTAAAAAAATGGGTTATGGTGTTTTATTTAATTATAGCTTTTATTATTCAGGAATTCTAAGCAT
AGTTTTAGGATTTTTTTCTTCTGAAATAACAATTTTCTTTCTTCAAACAGCAGGGGCTGATATTAATGTTCCAGTTTGAG
GTCATCTAATAATTGGGACAGTTTTTTGTATTTTTTTCACTAGCCTTAATTATATTTCAATAAAAACATCAGGATGAATT
GCGCTTGCATCAACAATTTTAAAATTTATTCCTTTAGTATTTGCAGTTTTTGCAGGAATTCTATTTCCAAAAACTTATAA
TGCCGGCGGTTCTAATGCCTTTGTTCAAACAGCTACAAATAGTTTTAATTTTGCAAAATTAATTCTTGCCTTGCCTCCAG
TTTTATTTGCATATGATTCATTTTTATCTGTTGGTTCAATTCATAATAGGATCGAAAAAGCAAATAAAAGAGTTCCAATA
ATTATTATAGTTGGGATGATAATTATTGCGGTTGTCTATACTTTGATTGGTTTATCATCTGCATTGCATAATCAGGGCAC
AATTAGTGGCTTGATTAGTGATGTTTTTCCAAAAAGTTCTGCAAAATCAATTAGTATTTTTGTTGGATTTTTCTTACTAA
TTTCTACATATGGTGTAACAAATTCACTTAGTGCAACCTATGTAAATTCAGTTACTGATTTAGTTAAATTAAATGCGATT
GTTGGTGCATTTAGTCTTAAAAAGAAAATGAGTCAAGCAAAAGTGACAATTTTTTACCTTGCAATAATTTTATTTTTTTG
GGCTTTAATTATTTATATCCCTTCAGTTTCTGTACCTTTTCCATCTGCTAATAATTCTGGTTCTGGTTATGGTACTGATG
TTGTTGTTGATTCGATGTCCAATTTTCCAACATTAATTTTTATGTGAGTTTATATGGCTGTTATTATTGCTTATGCACGA
AAAAGAAAACAACTTATGGATTCATCAAAGCAAATAAATAAAACATTATTTTGAACAGCTGCAATAATTTCTTCTATATT
AATTCTTACAGCTATGATTGCATATATTTACGCACAAATTGATGCTGTAACAAATGAAAAAAATTCAAGTTCAGGTTCTG
GTGTTTTTGCAGCTAATGGGCTTATTTTAACAAATCAGGGAAATTTCTTAATTCTTATTTTTCATTTATTTGTTTTTAGC
ACCCTCCCTTTCATAAATTATTTATTAATAAAAATAGTTGATAAAATTAATGTACTTGATTATTTTAAAGCTAGCGAAAT
TGAAAATTTAGAAAGCAAAACAACCACTAGAACATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTAAAATAAAAAATTTAAATTTTTTAAAATTATTTTAATTTTATATTATAATATTTTTTTATTAATAATTAAAATTAAA
TTTACAGAAACGAGATAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTTAAATTGTTAATAAAATAAAATTATCACATAAAAAAAGCGCTAATTTAGTGCTTTTTTTATTGAATTAGAACAAAAA
TTTTATTTTAATATTTATTT

Product: putative membrane lipoprotein

Products: NA

Alternate protein names: Amino Acid Transporter Protein

Number of amino acids: Translated: 518; Mature: 517

Protein sequence:

>518_residues
MTLKSSRKLGFFAALSMLVSSVVGIGIFFKNQSVADITGYNGYAWLFAWIIGGIISLFAAITFSEISFLKPTKLNGLPNW
TWQTAGKKMGYGVLFNYSFYYSGILSIVLGFFSSEITIFFLQTAGADINVPVWGHLIIGTVFCIFFTSLNYISIKTSGWI
ALASTILKFIPLVFAVFAGILFPKTYNAGGSNAFVQTATNSFNFAKLILALPPVLFAYDSFLSVGSIHNRIEKANKRVPI
IIIVGMIIIAVVYTLIGLSSALHNQGTISGLISDVFPKSSAKSISIFVGFFLLISTYGVTNSLSATYVNSVTDLVKLNAI
VGAFSLKKKMSQAKVTIFYLAIILFFWALIIYIPSVSVPFPSANNSGSGYGTDVVVDSMSNFPTLIFMWVYMAVIIAYAR
KRKQLMDSSKQINKTLFWTAAIISSILILTAMIAYIYAQIDAVTNEKNSSSGSGVFAANGLILTNQGNFLILIFHLFVFS
TLPFINYLLIKIVDKINVLDYFKASEIENLESKTTTRT

Sequences:

>Translated_518_residues
MTLKSSRKLGFFAALSMLVSSVVGIGIFFKNQSVADITGYNGYA*LFA*IIGGIISLFAAITFSEISFLKPTKLNGLPN*
T*QTAGKKMGYGVLFNYSFYYSGILSIVLGFFSSEITIFFLQTAGADINVPV*GHLIIGTVFCIFFTSLNYISIKTSG*I
ALASTILKFIPLVFAVFAGILFPKTYNAGGSNAFVQTATNSFNFAKLILALPPVLFAYDSFLSVGSIHNRIEKANKRVPI
IIIVGMIIIAVVYTLIGLSSALHNQGTISGLISDVFPKSSAKSISIFVGFFLLISTYGVTNSLSATYVNSVTDLVKLNAI
VGAFSLKKKMSQAKVTIFYLAIILFFWALIIYIPSVSVPFPSANNSGSGYGTDVVVDSMSNFPTLIFM*VYMAVIIAYAR
KRKQLMDSSKQINKTLF*TAAIISSILILTAMIAYIYAQIDAVTNEKNSSSGSGVFAANGLILTNQGNFLILIFHLFVFS
TLPFINYLLIKIVDKINVLDYFKASEIENLESKTTTRT
>Mature_517_residues
TLKSSRKLGFFAALSMLVSSVVGIGIFFKNQSVADITGYNGYA*LFA*IIGGIISLFAAITFSEISFLKPTKLNGLPN*T
*QTAGKKMGYGVLFNYSFYYSGILSIVLGFFSSEITIFFLQTAGADINVPV*GHLIIGTVFCIFFTSLNYISIKTSG*IA
LASTILKFIPLVFAVFAGILFPKTYNAGGSNAFVQTATNSFNFAKLILALPPVLFAYDSFLSVGSIHNRIEKANKRVPII
IIVGMIIIAVVYTLIGLSSALHNQGTISGLISDVFPKSSAKSISIFVGFFLLISTYGVTNSLSATYVNSVTDLVKLNAIV
GAFSLKKKMSQAKVTIFYLAIILFFWALIIYIPSVSVPFPSANNSGSGYGTDVVVDSMSNFPTLIFM*VYMAVIIAYARK
RKQLMDSSKQINKTLF*TAAIISSILILTAMIAYIYAQIDAVTNEKNSSSGSGVFAANGLILTNQGNFLILIFHLFVFST
LPFINYLLIKIVDKINVLDYFKASEIENLESKTTTRT

Specific function: Unknown

COG id: COG0531

COG function: function code E; Amino acid transporters

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55135; Mature: 55003

Theoretical pI: Translated: 10.09; Mature: 10.09

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTLKSSRKLGFFAALSMLVSSVVGIGIFFKNQSVADITGYNGYALFAIIGGIISLFAAIT
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSEISFLKPTKLNGLPNTQTAGKKMGYGVLFNYSFYYSGILSIVLGFFSSEITIFFLQTA
HHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEC
GADINVPVGHLIIGTVFCIFFTSLNYISIKTSGIALASTILKFIPLVFAVFAGILFPKTY
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
NAGGSNAFVQTATNSFNFAKLILALPPVLFAYDSFLSVGSIHNRIEKANKRVPIIIIVGM
CCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
IIIAVVYTLIGLSSALHNQGTISGLISDVFPKSSAKSISIFVGFFLLISTYGVTNSLSAT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
YVNSVTDLVKLNAIVGAFSLKKKMSQAKVTIFYLAIILFFWALIIYIPSVSVPFPSANNS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
GSGYGTDVVVDSMSNFPTLIFMVYMAVIIAYARKRKQLMDSSKQINKTLFTAAIISSILI
CCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTAMIAYIYAQIDAVTNEKNSSSGSGVFAANGLILTNQGNFLILIFHLFVFSTLPFINYL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIKIVDKINVLDYFKASEIENLESKTTTRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TLKSSRKLGFFAALSMLVSSVVGIGIFFKNQSVADITGYNGYALFAIIGGIISLFAAIT
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSEISFLKPTKLNGLPNTQTAGKKMGYGVLFNYSFYYSGILSIVLGFFSSEITIFFLQTA
HHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEC
GADINVPVGHLIIGTVFCIFFTSLNYISIKTSGIALASTILKFIPLVFAVFAGILFPKTY
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
NAGGSNAFVQTATNSFNFAKLILALPPVLFAYDSFLSVGSIHNRIEKANKRVPIIIIVGM
CCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
IIIAVVYTLIGLSSALHNQGTISGLISDVFPKSSAKSISIFVGFFLLISTYGVTNSLSAT
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
YVNSVTDLVKLNAIVGAFSLKKKMSQAKVTIFYLAIILFFWALIIYIPSVSVPFPSANNS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
GSGYGTDVVVDSMSNFPTLIFMVYMAVIIAYARKRKQLMDSSKQINKTLFTAAIISSILI
CCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LTAMIAYIYAQIDAVTNEKNSSSGSGVFAANGLILTNQGNFLILIFHLFVFSTLPFINYL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIKIVDKINVLDYFKASEIENLESKTTTRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA