Definition Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome.
Accession NC_006360
Length 892,758

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The map label for this gene is 54020158

Identifier: 54020158

GI number: 54020158

Start: 428617

End: 430722

Strand: Direct

Name: 54020158

Synonym: mhp363

Alternate gene names: NA

Gene position: 428617-430722 (Clockwise)

Preceding gene: 54020157

Following gene: 54020159

Centisome position: 48.01

GC content: 28.4

Gene sequence:

>2106_bases
ATGAAGAAACAAAATATATTTCAGAAAATTGCTAATTTAAATTCTAATATAAACCAGGAAAAACCAAAAAAAACTCCAAA
AAATAACAAAAAAGTTTGGATTTCAATTATTGCTGTAGCAGGTTTTCTAACTGTTATTGGTTTAGGTGTTGGAATTCCGC
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GGGTCAGAAATATTTAATCGAATTTCTTTATAATCAAGAATATCAAGCATCCAAAGTTTTCCAGGCAGCTTGAGAAAATT
CTAATTCAGATAAAACAACCGGGAATTCCCGTAATTTTGCTCTTGAATCATTTGCTGAAATCCGTGAAAGTCAAGTAAAA
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CTTTTGGCCGATTTAAACTTAGTTTTAATAAAAATTTTACCAAAAGCGATATTCAGGACCGGGTATTAAATGATGATATC
AAAGATGAAAAAGGCAAAATAGTCTATAAAAAAGGTGATAAATTATTTAAAGATATTATCGAAATCGGCATAAATGGCTT
TATTCCAAATATTATAAATAACCAAAATAATAAAACTGAAGAGCAAAATGTGACTGCTTTTTTAAGCAACTCTTATATAA
AAGAGTATATGAATCCCCAAAAAATTATTAATGAGATCTATTTTGATGAAAAAGCACCTTTAAAAGGAAATTTCAATTTT
TTTGAAATTTCCCAGATTAGCATTAACGCAAAACCAAATAATAAAGACGCAAAAACACCTTGGGATCTATCAAAACAAAC
ACTTGAAGAATTATTAACTTATAAAATTCTTAAAACAGATGATAATACCGAACTTGCTCTAAAGGTAAGTAATAATCTTG
AATTAATTGAGAAATTTCAAGGCGGAAATTCTGAAGATAGTAGCCAAAATAATCAGGACAAAATTCTGCTTTCAACAATT
GATTATCAAAAAAACAAAGAAAATGCTGCTGTTTTTGGTAAACAGCCAATTGCATCTCTTAATCAAATTCTTAATAATAA
CGAGGCTGGTTATGTTTTTGCTTTCCTTGGCGATTTTGAAAATTCAGAAAAGACTGATAATCTTTTTAGCAAAGTTTTAT
TTGAAAAATTAAAACTTTTAGTTTTTAAGAATAGTCCAAGTTTGTTAGTTGAACCTAGTTTATTAAATTCAAAGTCAATT
ACTGAAATCAAATCCTTAAATGAAAGACTAAAAAACTTCATTCAGGGACTTTCAGATAATGAACTAAAAGAAGCTGGCCG
GGCTTTCTTAGAAACTTTTGGGGCTAGCCAAAATGATACGCGTACCAAATTAGTCTATAAAATACGGGATAATTTAAATG
TTGTCCTTGATTCAAGCGGGATGAAAGTGCTTGCTTATAATAAAATTGCAAGTCTTGAAGAATTTAATGAAATTATTAAA
AAACAGTTACAATTAAGCGCAAATAATCAGGTCGATCCCAAACAGGATGCAACAATTAATTTAGACCAACTTTTTGCTGA
TATTTCCAATAATGATTTCATTCAGGCGCTATTAATTCGCAATTTAGAATATCTAAAGAAGCTTTCCGAAGCAAAAAAAA
CTCAATCAGAACAAGAAAAAACTGAATTTTTAGAATCAATTAAACAATCTGCAGCTAATTATTTAAATTTTTATATTCTT
GATCAGGTTTTAAAAATCAATGCAAAACTTCAGGATTATATCTCAAATGCAACTTTAAATGATTTAAATGCCGATTTTTG
GTATAATAATCAAAATGAGCGTTGGGAGCTAAGATCAGATCCAAATACTGAACTTCGTCAAGCGATAATTAAGCGGCTTG
AAAGTTTGTTTAAATTTAGCTATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACTTAATTTGAATAATTATTTGTTTAGATTTCTTAAAAAGTTTTAAAAAACTATATATTATAATATAATTTTAAGGCTAC
AAGTTAAGGATTTTATTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGAAAGGATAATTTGTGAAAACTCGATTCAAAAAGAAAAAAAACTGGTATAAATCTCTATTTTTTCTAGTACTAAATTT
TTCCTTTCTTAGTCTTAGTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 701; Mature: 701

Protein sequence:

>701_residues
MKKQNIFQKIANLNSNINQEKPKKTPKNNKKVWISIIAVAGFLTVIGLGVGIPLVYSNVPKNFLYKRDPKLDIILLKSPK
SNKNLKVEDLLSVFRSNHLKQKENLEEGQKYLIEFLYNQEYQASKVFQAAWENSNSDKTTGNSRNFALESFAEIRESQVK
YLQDERARYQKTFGFNNWESEFNKYLNSDSRFNNAINFDQAVDALTIEKARDVAFGRFKLSFNKNFTKSDIQDRVLNDDI
KDEKGKIVYKKGDKLFKDIIEIGINGFIPNIINNQNNKTEEQNVTAFLSNSYIKEYMNPQKIINEIYFDEKAPLKGNFNF
FEISQISINAKPNNKDAKTPWDLSKQTLEELLTYKILKTDDNTELALKVSNNLELIEKFQGGNSEDSSQNNQDKILLSTI
DYQKNKENAAVFGKQPIASLNQILNNNEAGYVFAFLGDFENSEKTDNLFSKVLFEKLKLLVFKNSPSLLVEPSLLNSKSI
TEIKSLNERLKNFIQGLSDNELKEAGRAFLETFGASQNDTRTKLVYKIRDNLNVVLDSSGMKVLAYNKIASLEEFNEIIK
KQLQLSANNQVDPKQDATINLDQLFADISNNDFIQALLIRNLEYLKKLSEAKKTQSEQEKTEFLESIKQSAANYLNFYIL
DQVLKINAKLQDYISNATLNDLNADFWYNNQNERWELRSDPNTELRQAIIKRLESLFKFSY

Sequences:

>Translated_701_residues
MKKQNIFQKIANLNSNINQEKPKKTPKNNKKVWISIIAVAGFLTVIGLGVGIPLVYSNVPKNFLYKRDPKLDIILLKSPK
SNKNLKVEDLLSVFRSNHLKQKENLEEGQKYLIEFLYNQEYQASKVFQAA*ENSNSDKTTGNSRNFALESFAEIRESQVK
YLQDERARYQKTFGFNN*ESEFNKYLNSDSRFNNAINFDQAVDALTIEKARDVAFGRFKLSFNKNFTKSDIQDRVLNDDI
KDEKGKIVYKKGDKLFKDIIEIGINGFIPNIINNQNNKTEEQNVTAFLSNSYIKEYMNPQKIINEIYFDEKAPLKGNFNF
FEISQISINAKPNNKDAKTPWDLSKQTLEELLTYKILKTDDNTELALKVSNNLELIEKFQGGNSEDSSQNNQDKILLSTI
DYQKNKENAAVFGKQPIASLNQILNNNEAGYVFAFLGDFENSEKTDNLFSKVLFEKLKLLVFKNSPSLLVEPSLLNSKSI
TEIKSLNERLKNFIQGLSDNELKEAGRAFLETFGASQNDTRTKLVYKIRDNLNVVLDSSGMKVLAYNKIASLEEFNEIIK
KQLQLSANNQVDPKQDATINLDQLFADISNNDFIQALLIRNLEYLKKLSEAKKTQSEQEKTEFLESIKQSAANYLNFYIL
DQVLKINAKLQDYISNATLNDLNADFWYNNQNERWELRSDPNTELRQAIIKRLESLFKFSY
>Mature_701_residues
MKKQNIFQKIANLNSNINQEKPKKTPKNNKKVWISIIAVAGFLTVIGLGVGIPLVYSNVPKNFLYKRDPKLDIILLKSPK
SNKNLKVEDLLSVFRSNHLKQKENLEEGQKYLIEFLYNQEYQASKVFQAA*ENSNSDKTTGNSRNFALESFAEIRESQVK
YLQDERARYQKTFGFNN*ESEFNKYLNSDSRFNNAINFDQAVDALTIEKARDVAFGRFKLSFNKNFTKSDIQDRVLNDDI
KDEKGKIVYKKGDKLFKDIIEIGINGFIPNIINNQNNKTEEQNVTAFLSNSYIKEYMNPQKIINEIYFDEKAPLKGNFNF
FEISQISINAKPNNKDAKTPWDLSKQTLEELLTYKILKTDDNTELALKVSNNLELIEKFQGGNSEDSSQNNQDKILLSTI
DYQKNKENAAVFGKQPIASLNQILNNNEAGYVFAFLGDFENSEKTDNLFSKVLFEKLKLLVFKNSPSLLVEPSLLNSKSI
TEIKSLNERLKNFIQGLSDNELKEAGRAFLETFGASQNDTRTKLVYKIRDNLNVVLDSSGMKVLAYNKIASLEEFNEIIK
KQLQLSANNQVDPKQDATINLDQLFADISNNDFIQALLIRNLEYLKKLSEAKKTQSEQEKTEFLESIKQSAANYLNFYIL
DQVLKINAKLQDYISNATLNDLNADFWYNNQNERWELRSDPNTELRQAIIKRLESLFKFSY

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80428; Mature: 80428

Theoretical pI: Translated: 9.05; Mature: 9.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
0.4 %Met     (Translated Protein)
0.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
0.4 %Met     (Mature Protein)
0.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKQNIFQKIANLNSNINQEKPKKTPKNNKKVWISIIAVAGFLTVIGLGVGIPLVYSNVP
CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCC
KNFLYKRDPKLDIILLKSPKSNKNLKVEDLLSVFRSNHLKQKENLEEGQKYLIEFLYNQE
HHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
YQASKVFQAAENSNSDKTTGNSRNFALESFAEIRESQVKYLQDERARYQKTFGFNNESEF
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
NKYLNSDSRFNNAINFDQAVDALTIEKARDVAFGRFKLSFNKNFTKSDIQDRVLNDDIKD
HHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCC
EKGKIVYKKGDKLFKDIIEIGINGFIPNIINNQNNKTEEQNVTAFLSNSYIKEYMNPQKI
CCCCEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
INEIYFDEKAPLKGNFNFFEISQISINAKPNNKDAKTPWDLSKQTLEELLTYKILKTDDN
HHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCC
TELALKVSNNLELIEKFQGGNSEDSSQNNQDKILLSTIDYQKNKENAAVFGKQPIASLNQ
CEEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEECCCHHHHHHH
ILNNNEAGYVFAFLGDFENSEKTDNLFSKVLFEKLKLLVFKNSPSLLVEPSLLNSKSITE
HHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEECCCCCCCCHHHH
IKSLNERLKNFIQGLSDNELKEAGRAFLETFGASQNDTRTKLVYKIRDNLNVVLDSSGMK
HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHEEEEEECCCEEEECCCCCE
VLAYNKIASLEEFNEIIKKQLQLSANNQVDPKQDATINLDQLFADISNNDFIQALLIRNL
EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
EYLKKLSEAKKTQSEQEKTEFLESIKQSAANYLNFYILDQVLKINAKLQDYISNATLNDL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
NADFWYNNQNERWELRSDPNTELRQAIIKRLESLFKFSY
CCCCEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCC
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NKYLNSDSRFNNAINFDQAVDALTIEKARDVAFGRFKLSFNKNFTKSDIQDRVLNDDIKD
HHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCC
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CCCCEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
INEIYFDEKAPLKGNFNFFEISQISINAKPNNKDAKTPWDLSKQTLEELLTYKILKTDDN
HHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCC
TELALKVSNNLELIEKFQGGNSEDSSQNNQDKILLSTIDYQKNKENAAVFGKQPIASLNQ
CEEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEECCCHHHHHHH
ILNNNEAGYVFAFLGDFENSEKTDNLFSKVLFEKLKLLVFKNSPSLLVEPSLLNSKSITE
HHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEECCCCCCCCHHHH
IKSLNERLKNFIQGLSDNELKEAGRAFLETFGASQNDTRTKLVYKIRDNLNVVLDSSGMK
HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHEEEEEECCCEEEECCCCCE
VLAYNKIASLEEFNEIIKKQLQLSANNQVDPKQDATINLDQLFADISNNDFIQALLIRNL
EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
NADFWYNNQNERWELRSDPNTELRQAIIKRLESLFKFSY
CCCCEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA