Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
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Accession | NC_006360 |
Length | 892,758 |
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The map label for this gene is 54020158
Identifier: 54020158
GI number: 54020158
Start: 428617
End: 430722
Strand: Direct
Name: 54020158
Synonym: mhp363
Alternate gene names: NA
Gene position: 428617-430722 (Clockwise)
Preceding gene: 54020157
Following gene: 54020159
Centisome position: 48.01
GC content: 28.4
Gene sequence:
>2106_bases ATGAAGAAACAAAATATATTTCAGAAAATTGCTAATTTAAATTCTAATATAAACCAGGAAAAACCAAAAAAAACTCCAAA AAATAACAAAAAAGTTTGGATTTCAATTATTGCTGTAGCAGGTTTTCTAACTGTTATTGGTTTAGGTGTTGGAATTCCGC TAGTTTATTCAAATGTTCCTAAAAATTTTTTATATAAAAGAGATCCAAAATTAGATATTATCCTTCTTAAATCGCCAAAA AGTAATAAAAACCTTAAAGTTGAAGACTTATTAAGTGTTTTTAGATCCAATCATTTAAAACAAAAAGAAAATTTAGAAGA GGGTCAGAAATATTTAATCGAATTTCTTTATAATCAAGAATATCAAGCATCCAAAGTTTTCCAGGCAGCTTGAGAAAATT CTAATTCAGATAAAACAACCGGGAATTCCCGTAATTTTGCTCTTGAATCATTTGCTGAAATCCGTGAAAGTCAAGTAAAA TATCTTCAAGATGAAAGAGCTAGATACCAGAAAACTTTCGGCTTTAATAATTGAGAATCTGAATTTAACAAATATCTAAA TTCAGATTCGCGTTTTAATAATGCCATTAATTTTGATCAGGCAGTTGATGCTCTTACAATTGAAAAAGCTCGTGATGTTG CTTTTGGCCGATTTAAACTTAGTTTTAATAAAAATTTTACCAAAAGCGATATTCAGGACCGGGTATTAAATGATGATATC AAAGATGAAAAAGGCAAAATAGTCTATAAAAAAGGTGATAAATTATTTAAAGATATTATCGAAATCGGCATAAATGGCTT TATTCCAAATATTATAAATAACCAAAATAATAAAACTGAAGAGCAAAATGTGACTGCTTTTTTAAGCAACTCTTATATAA AAGAGTATATGAATCCCCAAAAAATTATTAATGAGATCTATTTTGATGAAAAAGCACCTTTAAAAGGAAATTTCAATTTT TTTGAAATTTCCCAGATTAGCATTAACGCAAAACCAAATAATAAAGACGCAAAAACACCTTGGGATCTATCAAAACAAAC ACTTGAAGAATTATTAACTTATAAAATTCTTAAAACAGATGATAATACCGAACTTGCTCTAAAGGTAAGTAATAATCTTG AATTAATTGAGAAATTTCAAGGCGGAAATTCTGAAGATAGTAGCCAAAATAATCAGGACAAAATTCTGCTTTCAACAATT GATTATCAAAAAAACAAAGAAAATGCTGCTGTTTTTGGTAAACAGCCAATTGCATCTCTTAATCAAATTCTTAATAATAA CGAGGCTGGTTATGTTTTTGCTTTCCTTGGCGATTTTGAAAATTCAGAAAAGACTGATAATCTTTTTAGCAAAGTTTTAT TTGAAAAATTAAAACTTTTAGTTTTTAAGAATAGTCCAAGTTTGTTAGTTGAACCTAGTTTATTAAATTCAAAGTCAATT ACTGAAATCAAATCCTTAAATGAAAGACTAAAAAACTTCATTCAGGGACTTTCAGATAATGAACTAAAAGAAGCTGGCCG GGCTTTCTTAGAAACTTTTGGGGCTAGCCAAAATGATACGCGTACCAAATTAGTCTATAAAATACGGGATAATTTAAATG TTGTCCTTGATTCAAGCGGGATGAAAGTGCTTGCTTATAATAAAATTGCAAGTCTTGAAGAATTTAATGAAATTATTAAA AAACAGTTACAATTAAGCGCAAATAATCAGGTCGATCCCAAACAGGATGCAACAATTAATTTAGACCAACTTTTTGCTGA TATTTCCAATAATGATTTCATTCAGGCGCTATTAATTCGCAATTTAGAATATCTAAAGAAGCTTTCCGAAGCAAAAAAAA CTCAATCAGAACAAGAAAAAACTGAATTTTTAGAATCAATTAAACAATCTGCAGCTAATTATTTAAATTTTTATATTCTT GATCAGGTTTTAAAAATCAATGCAAAACTTCAGGATTATATCTCAAATGCAACTTTAAATGATTTAAATGCCGATTTTTG GTATAATAATCAAAATGAGCGTTGGGAGCTAAGATCAGATCCAAATACTGAACTTCGTCAAGCGATAATTAAGCGGCTTG AAAGTTTGTTTAAATTTAGCTATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ACTTAATTTGAATAATTATTTGTTTAGATTTCTTAAAAAGTTTTAAAAAACTATATATTATAATATAATTTTAAGGCTAC AAGTTAAGGATTTTATTTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGAAAGGATAATTTGTGAAAACTCGATTCAAAAAGAAAAAAAACTGGTATAAATCTCTATTTTTTCTAGTACTAAATTT TTCCTTTCTTAGTCTTAGTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 701; Mature: 701
Protein sequence:
>701_residues MKKQNIFQKIANLNSNINQEKPKKTPKNNKKVWISIIAVAGFLTVIGLGVGIPLVYSNVPKNFLYKRDPKLDIILLKSPK SNKNLKVEDLLSVFRSNHLKQKENLEEGQKYLIEFLYNQEYQASKVFQAAWENSNSDKTTGNSRNFALESFAEIRESQVK YLQDERARYQKTFGFNNWESEFNKYLNSDSRFNNAINFDQAVDALTIEKARDVAFGRFKLSFNKNFTKSDIQDRVLNDDI KDEKGKIVYKKGDKLFKDIIEIGINGFIPNIINNQNNKTEEQNVTAFLSNSYIKEYMNPQKIINEIYFDEKAPLKGNFNF FEISQISINAKPNNKDAKTPWDLSKQTLEELLTYKILKTDDNTELALKVSNNLELIEKFQGGNSEDSSQNNQDKILLSTI DYQKNKENAAVFGKQPIASLNQILNNNEAGYVFAFLGDFENSEKTDNLFSKVLFEKLKLLVFKNSPSLLVEPSLLNSKSI TEIKSLNERLKNFIQGLSDNELKEAGRAFLETFGASQNDTRTKLVYKIRDNLNVVLDSSGMKVLAYNKIASLEEFNEIIK KQLQLSANNQVDPKQDATINLDQLFADISNNDFIQALLIRNLEYLKKLSEAKKTQSEQEKTEFLESIKQSAANYLNFYIL DQVLKINAKLQDYISNATLNDLNADFWYNNQNERWELRSDPNTELRQAIIKRLESLFKFSY
Sequences:
>Translated_701_residues MKKQNIFQKIANLNSNINQEKPKKTPKNNKKVWISIIAVAGFLTVIGLGVGIPLVYSNVPKNFLYKRDPKLDIILLKSPK SNKNLKVEDLLSVFRSNHLKQKENLEEGQKYLIEFLYNQEYQASKVFQAA*ENSNSDKTTGNSRNFALESFAEIRESQVK YLQDERARYQKTFGFNN*ESEFNKYLNSDSRFNNAINFDQAVDALTIEKARDVAFGRFKLSFNKNFTKSDIQDRVLNDDI KDEKGKIVYKKGDKLFKDIIEIGINGFIPNIINNQNNKTEEQNVTAFLSNSYIKEYMNPQKIINEIYFDEKAPLKGNFNF FEISQISINAKPNNKDAKTPWDLSKQTLEELLTYKILKTDDNTELALKVSNNLELIEKFQGGNSEDSSQNNQDKILLSTI DYQKNKENAAVFGKQPIASLNQILNNNEAGYVFAFLGDFENSEKTDNLFSKVLFEKLKLLVFKNSPSLLVEPSLLNSKSI TEIKSLNERLKNFIQGLSDNELKEAGRAFLETFGASQNDTRTKLVYKIRDNLNVVLDSSGMKVLAYNKIASLEEFNEIIK KQLQLSANNQVDPKQDATINLDQLFADISNNDFIQALLIRNLEYLKKLSEAKKTQSEQEKTEFLESIKQSAANYLNFYIL DQVLKINAKLQDYISNATLNDLNADFWYNNQNERWELRSDPNTELRQAIIKRLESLFKFSY >Mature_701_residues MKKQNIFQKIANLNSNINQEKPKKTPKNNKKVWISIIAVAGFLTVIGLGVGIPLVYSNVPKNFLYKRDPKLDIILLKSPK SNKNLKVEDLLSVFRSNHLKQKENLEEGQKYLIEFLYNQEYQASKVFQAA*ENSNSDKTTGNSRNFALESFAEIRESQVK YLQDERARYQKTFGFNN*ESEFNKYLNSDSRFNNAINFDQAVDALTIEKARDVAFGRFKLSFNKNFTKSDIQDRVLNDDI KDEKGKIVYKKGDKLFKDIIEIGINGFIPNIINNQNNKTEEQNVTAFLSNSYIKEYMNPQKIINEIYFDEKAPLKGNFNF FEISQISINAKPNNKDAKTPWDLSKQTLEELLTYKILKTDDNTELALKVSNNLELIEKFQGGNSEDSSQNNQDKILLSTI DYQKNKENAAVFGKQPIASLNQILNNNEAGYVFAFLGDFENSEKTDNLFSKVLFEKLKLLVFKNSPSLLVEPSLLNSKSI TEIKSLNERLKNFIQGLSDNELKEAGRAFLETFGASQNDTRTKLVYKIRDNLNVVLDSSGMKVLAYNKIASLEEFNEIIK KQLQLSANNQVDPKQDATINLDQLFADISNNDFIQALLIRNLEYLKKLSEAKKTQSEQEKTEFLESIKQSAANYLNFYIL DQVLKINAKLQDYISNATLNDLNADFWYNNQNERWELRSDPNTELRQAIIKRLESLFKFSY
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 80428; Mature: 80428
Theoretical pI: Translated: 9.05; Mature: 9.05
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 0.4 %Met (Translated Protein) 0.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 0.4 %Met (Mature Protein) 0.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKQNIFQKIANLNSNINQEKPKKTPKNNKKVWISIIAVAGFLTVIGLGVGIPLVYSNVP CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCC KNFLYKRDPKLDIILLKSPKSNKNLKVEDLLSVFRSNHLKQKENLEEGQKYLIEFLYNQE HHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC YQASKVFQAAENSNSDKTTGNSRNFALESFAEIRESQVKYLQDERARYQKTFGFNNESEF HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH NKYLNSDSRFNNAINFDQAVDALTIEKARDVAFGRFKLSFNKNFTKSDIQDRVLNDDIKD HHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCC EKGKIVYKKGDKLFKDIIEIGINGFIPNIINNQNNKTEEQNVTAFLSNSYIKEYMNPQKI CCCCEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH INEIYFDEKAPLKGNFNFFEISQISINAKPNNKDAKTPWDLSKQTLEELLTYKILKTDDN HHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCC TELALKVSNNLELIEKFQGGNSEDSSQNNQDKILLSTIDYQKNKENAAVFGKQPIASLNQ CEEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEECCCHHHHHHH ILNNNEAGYVFAFLGDFENSEKTDNLFSKVLFEKLKLLVFKNSPSLLVEPSLLNSKSITE HHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEECCCCCCCCHHHH IKSLNERLKNFIQGLSDNELKEAGRAFLETFGASQNDTRTKLVYKIRDNLNVVLDSSGMK HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHEEEEEECCCEEEECCCCCE VLAYNKIASLEEFNEIIKKQLQLSANNQVDPKQDATINLDQLFADISNNDFIQALLIRNL EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH EYLKKLSEAKKTQSEQEKTEFLESIKQSAANYLNFYILDQVLKINAKLQDYISNATLNDL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC NADFWYNNQNERWELRSDPNTELRQAIIKRLESLFKFSY CCCCEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MKKQNIFQKIANLNSNINQEKPKKTPKNNKKVWISIIAVAGFLTVIGLGVGIPLVYSNVP CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCC KNFLYKRDPKLDIILLKSPKSNKNLKVEDLLSVFRSNHLKQKENLEEGQKYLIEFLYNQE HHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC YQASKVFQAAENSNSDKTTGNSRNFALESFAEIRESQVKYLQDERARYQKTFGFNNESEF HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH NKYLNSDSRFNNAINFDQAVDALTIEKARDVAFGRFKLSFNKNFTKSDIQDRVLNDDIKD HHHHCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCC EKGKIVYKKGDKLFKDIIEIGINGFIPNIINNQNNKTEEQNVTAFLSNSYIKEYMNPQKI CCCCEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH INEIYFDEKAPLKGNFNFFEISQISINAKPNNKDAKTPWDLSKQTLEELLTYKILKTDDN HHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEECCCC TELALKVSNNLELIEKFQGGNSEDSSQNNQDKILLSTIDYQKNKENAAVFGKQPIASLNQ CEEEEEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEECCCHHHHHHH ILNNNEAGYVFAFLGDFENSEKTDNLFSKVLFEKLKLLVFKNSPSLLVEPSLLNSKSITE HHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEECCCCCCCCHHHH IKSLNERLKNFIQGLSDNELKEAGRAFLETFGASQNDTRTKLVYKIRDNLNVVLDSSGMK HHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHEEEEEECCCEEEECCCCCE VLAYNKIASLEEFNEIIKKQLQLSANNQVDPKQDATINLDQLFADISNNDFIQALLIRNL EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH EYLKKLSEAKKTQSEQEKTEFLESIKQSAANYLNFYILDQVLKINAKLQDYISNATLNDL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC NADFWYNNQNERWELRSDPNTELRQAIIKRLESLFKFSY CCCCEECCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA