Definition | Mycoplasma hyopneumoniae 232, complete genome. |
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Accession | NC_006360 |
Length | 892,758 |
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The map label for this gene is 54020157
Identifier: 54020157
GI number: 54020157
Start: 421071
End: 422138
Strand: Direct
Name: 54020157
Synonym: mhp358
Alternate gene names: NA
Gene position: 421071-422138 (Clockwise)
Preceding gene: 54020156
Following gene: 54020158
Centisome position: 47.17
GC content: 23.13
Gene sequence:
>1068_bases ATGTTTAATAAGGAAAGTTTAGAAAAATTTTTCAATTTAAAATTCAATAATTGAATTTTTTTTATTCCATTTTTTGGTAC TAATAGCTATTATAAATTATTCGATTTACTTGTAGAATACAACAGTTTTGAGCCGATTTTATACTATAAAACCAGACTAA TTTCATGACTTTTCTATTTAATACTTAATTTGTTTTCAATTATTTTGACCATTTTATTATTTTTGTTAATTTTTGTTTAT AGAGTTCATTTATTTTCCTTTGGTAAAAATTTTGTTTTTAGCCTTGAAAATAAACATAATTATTTTTATGACTATAATAT TTGATTTCCAAATATTATGAATGTGGCGATATATTCTTTCATTGCATTTTTTGGGTTTTTTTTAAATGCTTTTTGAGCAA AATTTGTTATTTACTTTTTTAAGAAATTTTTATATCGAAAATATGATTTGAAAAATAAAGCCACAACCTTTGAATTTTTA GAAAATTTTAATTTAGAATCTTTTGTAAATTCCGTTCTTGTTGACACTGAAAATTGTAAAAAAAAGAGGAAGAAACCAAG AAAAATTTGTTGAAAATATCAACATAGGGGCACAATAATTAGCTTTCTAATAGAAGGAATTCCCTTCCCTAAGCATACTA GACGTTTTGTTAAATATAATTATATTAAGTCAAGGAACCGCAAGGAAATTAGTGAATTTGACTGGGTTGTAACTGAGGTG CAAAACTATTATTGATTTTATACATTTGTTTTTGCTTCAATTTTTAATAAAAATGAAAAAAATTTTAACAGAAAAAAGTT TTTCTACTACTTATTTAAAATTTTATTTTTTTATATTTTATCAATTTGAATTCTTCTTTTTTCAACAATTTTTGTATTCT TTAATCATTTTCTTCTTGATGAACCGACATTTTTGTTAAAAATTTCAGCATTAGGATCTGTTATTGTTGTCATTTTTCTA TTCGTTGTTATGCTAAAATCTAAGTTTATTGAGTGGACATACCGCCGCATCAAAAAGCGTTTTTTTGACGCTAAGCTAAT TAAGTCTGAAAAACAAGATTCAATATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTCTACTAATATAAAAATTGCCATTGCTATAATTGATATTATTCAAAATATAATTTGAAGATATGTATAAAAATAGAGG TTAACCAATTTAATTAGATA
Downstream 100 bases:
>100_bases CTATTTTTTTAACACCATTATCTAAATGCCCTTAAATTAGTGGAAAAATTCAGATTATTGCTTTTTATTTATGATTTTTA TTCCACTGTTTTTGTTAATT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 355; Mature: 355
Protein sequence:
>355_residues MFNKESLEKFFNLKFNNWIFFIPFFGTNSYYKLFDLLVEYNSFEPILYYKTRLISWLFYLILNLFSIILTILLFLLIFVY RVHLFSFGKNFVFSLENKHNYFYDYNIWFPNIMNVAIYSFIAFFGFFLNAFWAKFVIYFFKKFLYRKYDLKNKATTFEFL ENFNLESFVNSVLVDTENCKKKRKKPRKICWKYQHRGTIISFLIEGIPFPKHTRRFVKYNYIKSRNRKEISEFDWVVTEV QNYYWFYTFVFASIFNKNEKNFNRKKFFYYLFKILFFYILSIWILLFSTIFVFFNHFLLDEPTFLLKISALGSVIVVIFL FVVMLKSKFIEWTYRRIKKRFFDAKLIKSEKQDSI
Sequences:
>Translated_355_residues MFNKESLEKFFNLKFNN*IFFIPFFGTNSYYKLFDLLVEYNSFEPILYYKTRLIS*LFYLILNLFSIILTILLFLLIFVY RVHLFSFGKNFVFSLENKHNYFYDYNI*FPNIMNVAIYSFIAFFGFFLNAF*AKFVIYFFKKFLYRKYDLKNKATTFEFL ENFNLESFVNSVLVDTENCKKKRKKPRKIC*KYQHRGTIISFLIEGIPFPKHTRRFVKYNYIKSRNRKEISEFDWVVTEV QNYY*FYTFVFASIFNKNEKNFNRKKFFYYLFKILFFYILSI*ILLFSTIFVFFNHFLLDEPTFLLKISALGSVIVVIFL FVVMLKSKFIEWTYRRIKKRFFDAKLIKSEKQDSI >Mature_355_residues MFNKESLEKFFNLKFNN*IFFIPFFGTNSYYKLFDLLVEYNSFEPILYYKTRLIS*LFYLILNLFSIILTILLFLLIFVY RVHLFSFGKNFVFSLENKHNYFYDYNI*FPNIMNVAIYSFIAFFGFFLNAF*AKFVIYFFKKFLYRKYDLKNKATTFEFL ENFNLESFVNSVLVDTENCKKKRKKPRKIC*KYQHRGTIISFLIEGIPFPKHTRRFVKYNYIKSRNRKEISEFDWVVTEV QNYY*FYTFVFASIFNKNEKNFNRKKFFYYLFKILFFYILSI*ILLFSTIFVFFNHFLLDEPTFLLKISALGSVIVVIFL FVVMLKSKFIEWTYRRIKKRFFDAKLIKSEKQDSI
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 42524; Mature: 42524
Theoretical pI: Translated: 10.28; Mature: 10.28
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 0.8 %Met (Translated Protein) 1.4 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 1.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFNKESLEKFFNLKFNNIFFIPFFGTNSYYKLFDLLVEYNSFEPILYYKTRLISLFYLIL CCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH NLFSIILTILLFLLIFVYRVHLFSFGKNFVFSLENKHNYFYDYNIFPNIMNVAIYSFIAF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH FGFFLNAFAKFVIYFFKKFLYRKYDLKNKATTFEFLENFNLESFVNSVLVDTENCKKKRK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHC KPRKICKYQHRGTIISFLIEGIPFPKHTRRFVKYNYIKSRNRKEISEFDWVVTEVQNYYF CHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTFVFASIFNKNEKNFNRKKFFYYLFKILFFYILSIILLFSTIFVFFNHFLLDEPTFLLK HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH ISALGSVIVVIFLFVVMLKSKFIEWTYRRIKKRFFDAKLIKSEKQDSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MFNKESLEKFFNLKFNNIFFIPFFGTNSYYKLFDLLVEYNSFEPILYYKTRLISLFYLIL CCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH NLFSIILTILLFLLIFVYRVHLFSFGKNFVFSLENKHNYFYDYNIFPNIMNVAIYSFIAF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHH FGFFLNAFAKFVIYFFKKFLYRKYDLKNKATTFEFLENFNLESFVNSVLVDTENCKKKRK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHC KPRKICKYQHRGTIISFLIEGIPFPKHTRRFVKYNYIKSRNRKEISEFDWVVTEVQNYYF CHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTFVFASIFNKNEKNFNRKKFFYYLFKILFFYILSIILLFSTIFVFFNHFLLDEPTFLLK HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH ISALGSVIVVIFLFVVMLKSKFIEWTYRRIKKRFFDAKLIKSEKQDSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA