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The map label for this gene is 51893846

Identifier: 51893846

GI number: 51893846

Start: 2904076

End: 2905347

Strand: Reverse

Name: 51893846

Synonym: STH2708

Alternate gene names: NA

Gene position: 2905347-2904076 (Counterclockwise)

Preceding gene: 51893847

Following gene: 51893845

Centisome position: 81.47

GC content: 51.02

Gene sequence:

>1272_bases
TTGGAGCACAGTCGGAGTGGACTTTCTCATGCCCTCCTCTACATGAGTACGTCTAAGTTGGTACACCAGGTCTTGTGTCT
CCTAGTGGCAGTACTACCGTTCCTTCCGATTTGGAAACGGATGACAAGCCGAGGTGGTATCTCTTGGAGTGGAGCACTGG
TAGAAGTCGCGCTGTTTGGTTTGCTAGGTGTAGCGAGTATACTTAGCTTGACGCGCACCAAATTCTGGCTTGCTCGGAGA
GTTCTCCCCTTTTTGGCAGTCACATTCATCATTGGGCTGATACAGACTTGTCGGTCATCGGTTGGGCTGATTGGAGCAGC
AGACGTTTTTAGGCTATATCTAGAACCTCTAGTCGTTTTTTTGGCTGTGCATAGCCTGCCGACTGATCACTACCGCATAC
AAGTCGCAAAGGTGATTGCTCGTGTGGGCCTGTTCTTGGCGGTCATCGGGATGATTCAGTTGGTTGCGCCGGAACCTATC
CGGCAGTTCCACATCGTTACCGGTGCTGACCCGCTTGTGTTGAGCACGAAGTCGAACTTTATGGCTGGTTCACAGTATAA
TCGTGTCATTTCGTTCCTTGACGACCCGAACATAGCAAGTCAGGTGTTTATTGCGGGTTTGACCGCTCAGCTATACCTCT
TCCTTCGCCGATTCGAAACAAAGTGGTTAGTTTCGGTTGTAATCAGTAGTTCGGCTGTCATCGCAACAGGATCCAGGTCT
GGGTTGTTATCTTTCGCTGCGGCCCTGGGTTGCCTTCTGCTGTACGTTTGGTTGTCATCCAATAAACGGCTCAAAGCCAG
GGCGCTCTGGGCTGGTGTCTCCGGGTTGCTGTTGTTGACATTGCCGTTAAGTGTTGGGAACATAAGGGCGATAGCGTTGG
ACAGGTTCGGACGGTTCGGGGTTAGTGCCCTTGCGGCGGATGGCAGGCTTGAGAACTGGCAGCAAGTCATGCGGGAAGTG
TCCGGGTCGATATGGACTGTACTGTTCGGCACGGGCTTAACACCGGGCGATCTAGTCACCTCTACGATAGTGGAGAATGC
TTATTTATCCGCGTTGAGAGATTTTGGTGTGATCTGGCTCATAGTCCTGTGTGCGGCGTTTTTGATCGCTTTCTTACCTA
TTATCCGCAAATCAAGTTTCTTCGGCATAGTGGTGTTAGCACCATTCTTGGTGGCGAATATTTTTGGAGACTACACGAAG
ATTCCGTTGGTTAGCTGCTGGTACGCAGTAATGCTCGGATTATCGCACAAGTCAGGGGTGAGTGAGGCGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATTTCGCGATCCGCCTGTTTCATTACAATTGTGAGGAATCGCCTCGTCGGTTCTAGTTCGCGTATTACGCCACCACCC
GGTTTTCGGAGGGATTGTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGGTGTTGATGATTTCTGAACCACTTGCTTGGGCAGGAGCAGAACGAATGGAAGTGCTTTACTGCGACCTCATCTCGCAA
ATTGCAAAGGCTGAGGTGGT

Product: putative polysaccharide polymerase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 423; Mature: 423

Protein sequence:

>423_residues
MEHSRSGLSHALLYMSTSKLVHQVLCLLVAVLPFLPIWKRMTSRGGISWSGALVEVALFGLLGVASILSLTRTKFWLARR
VLPFLAVTFIIGLIQTCRSSVGLIGAADVFRLYLEPLVVFLAVHSLPTDHYRIQVAKVIARVGLFLAVIGMIQLVAPEPI
RQFHIVTGADPLVLSTKSNFMAGSQYNRVISFLDDPNIASQVFIAGLTAQLYLFLRRFETKWLVSVVISSSAVIATGSRS
GLLSFAAALGCLLLYVWLSSNKRLKARALWAGVSGLLLLTLPLSVGNIRAIALDRFGRFGVSALAADGRLENWQQVMREV
SGSIWTVLFGTGLTPGDLVTSTIVENAYLSALRDFGVIWLIVLCAAFLIAFLPIIRKSSFFGIVVLAPFLVANIFGDYTK
IPLVSCWYAVMLGLSHKSGVSEA

Sequences:

>Translated_423_residues
MEHSRSGLSHALLYMSTSKLVHQVLCLLVAVLPFLPIWKRMTSRGGISWSGALVEVALFGLLGVASILSLTRTKFWLARR
VLPFLAVTFIIGLIQTCRSSVGLIGAADVFRLYLEPLVVFLAVHSLPTDHYRIQVAKVIARVGLFLAVIGMIQLVAPEPI
RQFHIVTGADPLVLSTKSNFMAGSQYNRVISFLDDPNIASQVFIAGLTAQLYLFLRRFETKWLVSVVISSSAVIATGSRS
GLLSFAAALGCLLLYVWLSSNKRLKARALWAGVSGLLLLTLPLSVGNIRAIALDRFGRFGVSALAADGRLENWQQVMREV
SGSIWTVLFGTGLTPGDLVTSTIVENAYLSALRDFGVIWLIVLCAAFLIAFLPIIRKSSFFGIVVLAPFLVANIFGDYTK
IPLVSCWYAVMLGLSHKSGVSEA
>Mature_423_residues
MEHSRSGLSHALLYMSTSKLVHQVLCLLVAVLPFLPIWKRMTSRGGISWSGALVEVALFGLLGVASILSLTRTKFWLARR
VLPFLAVTFIIGLIQTCRSSVGLIGAADVFRLYLEPLVVFLAVHSLPTDHYRIQVAKVIARVGLFLAVIGMIQLVAPEPI
RQFHIVTGADPLVLSTKSNFMAGSQYNRVISFLDDPNIASQVFIAGLTAQLYLFLRRFETKWLVSVVISSSAVIATGSRS
GLLSFAAALGCLLLYVWLSSNKRLKARALWAGVSGLLLLTLPLSVGNIRAIALDRFGRFGVSALAADGRLENWQQVMREV
SGSIWTVLFGTGLTPGDLVTSTIVENAYLSALRDFGVIWLIVLCAAFLIAFLPIIRKSSFFGIVVLAPFLVANIFGDYTK
IPLVSCWYAVMLGLSHKSGVSEA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 46043; Mature: 46043

Theoretical pI: Translated: 10.47; Mature: 10.47

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEHSRSGLSHALLYMSTSKLVHQVLCLLVAVLPFLPIWKRMTSRGGISWSGALVEVALFG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
LLGVASILSLTRTKFWLARRVLPFLAVTFIIGLIQTCRSSVGLIGAADVFRLYLEPLVVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVHSLPTDHYRIQVAKVIARVGLFLAVIGMIQLVAPEPIRQFHIVTGADPLVLSTKSNF
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEECCCCEEEECCCCC
MAGSQYNRVISFLDDPNIASQVFIAGLTAQLYLFLRRFETKWLVSVVISSSAVIATGSRS
CCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCH
GLLSFAAALGCLLLYVWLSSNKRLKARALWAGVSGLLLLTLPLSVGNIRAIALDRFGRFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCHHC
VSALAADGRLENWQQVMREVSGSIWTVLFGTGLTPGDLVTSTIVENAYLSALRDFGVIWL
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVLCAAFLIAFLPIIRKSSFFGIVVLAPFLVANIFGDYTKIPLVSCWYAVMLGLSHKSGV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
SEA
CCC
>Mature Secondary Structure
MEHSRSGLSHALLYMSTSKLVHQVLCLLVAVLPFLPIWKRMTSRGGISWSGALVEVALFG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
LLGVASILSLTRTKFWLARRVLPFLAVTFIIGLIQTCRSSVGLIGAADVFRLYLEPLVVF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVHSLPTDHYRIQVAKVIARVGLFLAVIGMIQLVAPEPIRQFHIVTGADPLVLSTKSNF
HHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEECCCCEEEECCCCC
MAGSQYNRVISFLDDPNIASQVFIAGLTAQLYLFLRRFETKWLVSVVISSSAVIATGSRS
CCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCH
GLLSFAAALGCLLLYVWLSSNKRLKARALWAGVSGLLLLTLPLSVGNIRAIALDRFGRFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCHHC
VSALAADGRLENWQQVMREVSGSIWTVLFGTGLTPGDLVTSTIVENAYLSALRDFGVIWL
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEEHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVLCAAFLIAFLPIIRKSSFFGIVVLAPFLVANIFGDYTKIPLVSCWYAVMLGLSHKSGV
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
SEA
CCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA