Definition | Mesoplasma florum L1, complete genome. |
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Accession | NC_006055 |
Length | 793,224 |
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The map label for this gene is 50365245
Identifier: 50365245
GI number: 50365245
Start: 501265
End: 502704
Strand: Reverse
Name: 50365245
Synonym: Mfl427
Alternate gene names: NA
Gene position: 502704-501265 (Counterclockwise)
Preceding gene: 50365246
Following gene: 50365242
Centisome position: 63.37
GC content: 23.82
Gene sequence:
>1440_bases ATGAGCGATATACTTTTTCGTTGCCCCAAATGTGGCGAAGAAATCACAAAAGATTCTTTTAAGAATCATAATTCAAACTG AACAGTTATTGAAAACTATTTAAGTGAATTAAAACAAAAGCAAGAGAATGAAATTCGAGTGCAACTTAAAAATGAATTAA TAGCACAAATGAATGATAAACAGATTGCTGAAATTAGTTTAGTTAAACAAGAAATGCTAAATAACTTTAATAAACAATTA GAAAGCTTAAATATTTCAATTAATGAAAAAGATAATTTAATTAATAAATTAAATGAACAAAAGGCATTAGAAATAGATAA AGAAAGAAATGCTGTTATTAATGAGTTTAATGAAAAAATTAAAACATATGAATTGAACATTCAAAAACAACAAAATATGA TTGATCAATTAAATCAACAAAAGATTGCAGAATTGAATGAAGCAAAAAGTAATTTATTAAATGAGTTTAATGATGTTAAA AATTCATTAGAGATTAAACTTGCAAATAAAGAAGTTGAAATTAAAGCTTTGGATCAAAAACTAAATCTTGAGATTGAAAA AAATAAAGAAGTTTTAATTAATCAATTTAGTCAAGAAATAAATAATTTAAAACTAGAGTTAAATAATAAAAAAATTGAAT TAGAAAACTTTGCTATTCAAAAAGAAGCTGAATCAAAAACTAAAGAATTAACTTTAATAAATGATTATGATAAAAGAATA GCTGATTTAGTGCAAGCTAACCGTGAATTTAAAATTATTAATTCAAAACGAAAAGGTGAAAACTTTGAACATGAAGTGTA TGAAGATTTAGTTAAAGCGTTTTCATTGTTTGATGGTATTGAAAAAATAACAACTGGTGAAAAGAAAGCAGATTACTTAC AAACTATTAAAAATCATAAACGTGAAGAAATTGGAAAAATTGTTTATGAAGTTAAGAATGCGGAATGAAGTAATACTTGA ATTCCTAAATTATCAACTGACGCTGCAAGTAATAACACTAAATATGGAATTTTAATTGCAACAAGTTTTAATGATAAATA CCCAGGAATACCTTTTATGAGAAGTGATGAATATGAAAACATTTGAATAACTGATTCAGAAAGTTTTGTATTTGTCGGTC AAATCGTAAGAAGACTAGTTGAATTTGAAAATGAATATAATCAAAAAATTAAAACAGTTACTAAAGCTTCTGATAATGAA TTACTAAAAGAATTAGAAAAACAAAAAGCTGAATTAAATGAATATTGAACGATTCAATTCCCAACAGCGTATAAAAAAAT GCAAAAAGAATTAGAAGATCTTGATAAAGTGGCTGATAGTTTAGAAAGAAACTCATCAAGAATAAAAAAATCAATTAATG TTATTAATCAACAATTCTTTAATAAAGTACAAAAAGGATTATCAAGTATACTTGGAGAAATGAAAGCAGAATATTTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CCTTAGAATGATAAAGAAAGTGAGCCAAAGTTGACAGTCTGTGCTTATTCTAGACTCTAAAAATAAAACAAAGAAATATT AAATAAAGGAGGATATATCC
Downstream 100 bases:
>100_bases TATAAAAAATTCACAAATAATGTGAATTTTTTATATTAAGCTCTTTTCGCTTTTTTAGTTTTTGGTAAAAGTTTTAATTC ATTAATATCTTCATGGAAAT
Product: chromosome segregation ATPase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 479; Mature: 478
Protein sequence:
>479_residues MSDILFRCPKCGEEITKDSFKNHNSNWTVIENYLSELKQKQENEIRVQLKNELIAQMNDKQIAEISLVKQEMLNNFNKQL ESLNISINEKDNLINKLNEQKALEIDKERNAVINEFNEKIKTYELNIQKQQNMIDQLNQQKIAELNEAKSNLLNEFNDVK NSLEIKLANKEVEIKALDQKLNLEIEKNKEVLINQFSQEINNLKLELNNKKIELENFAIQKEAESKTKELTLINDYDKRI ADLVQANREFKIINSKRKGENFEHEVYEDLVKAFSLFDGIEKITTGEKKADYLQTIKNHKREEIGKIVYEVKNAEWSNTW IPKLSTDAASNNTKYGILIATSFNDKYPGIPFMRSDEYENIWITDSESFVFVGQIVRRLVEFENEYNQKIKTVTKASDNE LLKELEKQKAELNEYWTIQFPTAYKKMQKELEDLDKVADSLERNSSRIKKSINVINQQFFNKVQKGLSSILGEMKAEYL
Sequences:
>Translated_479_residues MSDILFRCPKCGEEITKDSFKNHNSN*TVIENYLSELKQKQENEIRVQLKNELIAQMNDKQIAEISLVKQEMLNNFNKQL ESLNISINEKDNLINKLNEQKALEIDKERNAVINEFNEKIKTYELNIQKQQNMIDQLNQQKIAELNEAKSNLLNEFNDVK NSLEIKLANKEVEIKALDQKLNLEIEKNKEVLINQFSQEINNLKLELNNKKIELENFAIQKEAESKTKELTLINDYDKRI ADLVQANREFKIINSKRKGENFEHEVYEDLVKAFSLFDGIEKITTGEKKADYLQTIKNHKREEIGKIVYEVKNAE*SNT* IPKLSTDAASNNTKYGILIATSFNDKYPGIPFMRSDEYENI*ITDSESFVFVGQIVRRLVEFENEYNQKIKTVTKASDNE LLKELEKQKAELNEY*TIQFPTAYKKMQKELEDLDKVADSLERNSSRIKKSINVINQQFFNKVQKGLSSILGEMKAEYL >Mature_478_residues SDILFRCPKCGEEITKDSFKNHNSN*TVIENYLSELKQKQENEIRVQLKNELIAQMNDKQIAEISLVKQEMLNNFNKQLE SLNISINEKDNLINKLNEQKALEIDKERNAVINEFNEKIKTYELNIQKQQNMIDQLNQQKIAELNEAKSNLLNEFNDVKN SLEIKLANKEVEIKALDQKLNLEIEKNKEVLINQFSQEINNLKLELNNKKIELENFAIQKEAESKTKELTLINDYDKRIA DLVQANREFKIINSKRKGENFEHEVYEDLVKAFSLFDGIEKITTGEKKADYLQTIKNHKREEIGKIVYEVKNAE*SNT*I PKLSTDAASNNTKYGILIATSFNDKYPGIPFMRSDEYENI*ITDSESFVFVGQIVRRLVEFENEYNQKIKTVTKASDNEL LKELEKQKAELNEY*TIQFPTAYKKMQKELEDLDKVADSLERNSSRIKKSINVINQQFFNKVQKGLSSILGEMKAEYL
Specific function: Unknown
COG id: COG4487
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 55144; Mature: 55013
Theoretical pI: Translated: 5.15; Mature: 5.15
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 1.3 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSDILFRCPKCGEEITKDSFKNHNSNTVIENYLSELKQKQENEIRVQLKNELIAQMNDKQ CCCHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH IAEISLVKQEMLNNFNKQLESLNISINEKDNLINKLNEQKALEIDKERNAVINEFNEKIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH TYELNIQKQQNMIDQLNQQKIAELNEAKSNLLNEFNDVKNSLEIKLANKEVEIKALDQKL HHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEHHHHH NLEIEKNKEVLINQFSQEINNLKLELNNKKIELENFAIQKEAESKTKELTLINDYDKRIA CCEECCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHH DLVQANREFKIINSKRKGENFEHEVYEDLVKAFSLFDGIEKITTGEKKADYLQTIKNHKR HHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH EEIGKIVYEVKNAESNTIPKLSTDAASNNTKYGILIATSFNDKYPGIPFMRSDEYENIIT HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHC DSESFVFVGQIVRRLVEFENEYNQKIKTVTKASDNELLKELEKQKAELNEYTIQFPTAYK CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHH KMQKELEDLDKVADSLERNSSRIKKSINVINQQFFNKVQKGLSSILGEMKAEYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure SDILFRCPKCGEEITKDSFKNHNSNTVIENYLSELKQKQENEIRVQLKNELIAQMNDKQ CCHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH IAEISLVKQEMLNNFNKQLESLNISINEKDNLINKLNEQKALEIDKERNAVINEFNEKIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH TYELNIQKQQNMIDQLNQQKIAELNEAKSNLLNEFNDVKNSLEIKLANKEVEIKALDQKL HHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEHHHHH NLEIEKNKEVLINQFSQEINNLKLELNNKKIELENFAIQKEAESKTKELTLINDYDKRIA CCEECCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHH DLVQANREFKIINSKRKGENFEHEVYEDLVKAFSLFDGIEKITTGEKKADYLQTIKNHKR HHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH EEIGKIVYEVKNAESNTIPKLSTDAASNNTKYGILIATSFNDKYPGIPFMRSDEYENIIT HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHC DSESFVFVGQIVRRLVEFENEYNQKIKTVTKASDNELLKELEKQKAELNEYTIQFPTAYK CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHH KMQKELEDLDKVADSLERNSSRIKKSINVINQQFFNKVQKGLSSILGEMKAEYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA