Definition Mesoplasma florum L1, complete genome.
Accession NC_006055
Length 793,224

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 50365245

Identifier: 50365245

GI number: 50365245

Start: 501265

End: 502704

Strand: Reverse

Name: 50365245

Synonym: Mfl427

Alternate gene names: NA

Gene position: 502704-501265 (Counterclockwise)

Preceding gene: 50365246

Following gene: 50365242

Centisome position: 63.37

GC content: 23.82

Gene sequence:

>1440_bases
ATGAGCGATATACTTTTTCGTTGCCCCAAATGTGGCGAAGAAATCACAAAAGATTCTTTTAAGAATCATAATTCAAACTG
AACAGTTATTGAAAACTATTTAAGTGAATTAAAACAAAAGCAAGAGAATGAAATTCGAGTGCAACTTAAAAATGAATTAA
TAGCACAAATGAATGATAAACAGATTGCTGAAATTAGTTTAGTTAAACAAGAAATGCTAAATAACTTTAATAAACAATTA
GAAAGCTTAAATATTTCAATTAATGAAAAAGATAATTTAATTAATAAATTAAATGAACAAAAGGCATTAGAAATAGATAA
AGAAAGAAATGCTGTTATTAATGAGTTTAATGAAAAAATTAAAACATATGAATTGAACATTCAAAAACAACAAAATATGA
TTGATCAATTAAATCAACAAAAGATTGCAGAATTGAATGAAGCAAAAAGTAATTTATTAAATGAGTTTAATGATGTTAAA
AATTCATTAGAGATTAAACTTGCAAATAAAGAAGTTGAAATTAAAGCTTTGGATCAAAAACTAAATCTTGAGATTGAAAA
AAATAAAGAAGTTTTAATTAATCAATTTAGTCAAGAAATAAATAATTTAAAACTAGAGTTAAATAATAAAAAAATTGAAT
TAGAAAACTTTGCTATTCAAAAAGAAGCTGAATCAAAAACTAAAGAATTAACTTTAATAAATGATTATGATAAAAGAATA
GCTGATTTAGTGCAAGCTAACCGTGAATTTAAAATTATTAATTCAAAACGAAAAGGTGAAAACTTTGAACATGAAGTGTA
TGAAGATTTAGTTAAAGCGTTTTCATTGTTTGATGGTATTGAAAAAATAACAACTGGTGAAAAGAAAGCAGATTACTTAC
AAACTATTAAAAATCATAAACGTGAAGAAATTGGAAAAATTGTTTATGAAGTTAAGAATGCGGAATGAAGTAATACTTGA
ATTCCTAAATTATCAACTGACGCTGCAAGTAATAACACTAAATATGGAATTTTAATTGCAACAAGTTTTAATGATAAATA
CCCAGGAATACCTTTTATGAGAAGTGATGAATATGAAAACATTTGAATAACTGATTCAGAAAGTTTTGTATTTGTCGGTC
AAATCGTAAGAAGACTAGTTGAATTTGAAAATGAATATAATCAAAAAATTAAAACAGTTACTAAAGCTTCTGATAATGAA
TTACTAAAAGAATTAGAAAAACAAAAAGCTGAATTAAATGAATATTGAACGATTCAATTCCCAACAGCGTATAAAAAAAT
GCAAAAAGAATTAGAAGATCTTGATAAAGTGGCTGATAGTTTAGAAAGAAACTCATCAAGAATAAAAAAATCAATTAATG
TTATTAATCAACAATTCTTTAATAAAGTACAAAAAGGATTATCAAGTATACTTGGAGAAATGAAAGCAGAATATTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCTTAGAATGATAAAGAAAGTGAGCCAAAGTTGACAGTCTGTGCTTATTCTAGACTCTAAAAATAAAACAAAGAAATATT
AAATAAAGGAGGATATATCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATAAAAAATTCACAAATAATGTGAATTTTTTATATTAAGCTCTTTTCGCTTTTTTAGTTTTTGGTAAAAGTTTTAATTC
ATTAATATCTTCATGGAAAT

Product: chromosome segregation ATPase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 479; Mature: 478

Protein sequence:

>479_residues
MSDILFRCPKCGEEITKDSFKNHNSNWTVIENYLSELKQKQENEIRVQLKNELIAQMNDKQIAEISLVKQEMLNNFNKQL
ESLNISINEKDNLINKLNEQKALEIDKERNAVINEFNEKIKTYELNIQKQQNMIDQLNQQKIAELNEAKSNLLNEFNDVK
NSLEIKLANKEVEIKALDQKLNLEIEKNKEVLINQFSQEINNLKLELNNKKIELENFAIQKEAESKTKELTLINDYDKRI
ADLVQANREFKIINSKRKGENFEHEVYEDLVKAFSLFDGIEKITTGEKKADYLQTIKNHKREEIGKIVYEVKNAEWSNTW
IPKLSTDAASNNTKYGILIATSFNDKYPGIPFMRSDEYENIWITDSESFVFVGQIVRRLVEFENEYNQKIKTVTKASDNE
LLKELEKQKAELNEYWTIQFPTAYKKMQKELEDLDKVADSLERNSSRIKKSINVINQQFFNKVQKGLSSILGEMKAEYL

Sequences:

>Translated_479_residues
MSDILFRCPKCGEEITKDSFKNHNSN*TVIENYLSELKQKQENEIRVQLKNELIAQMNDKQIAEISLVKQEMLNNFNKQL
ESLNISINEKDNLINKLNEQKALEIDKERNAVINEFNEKIKTYELNIQKQQNMIDQLNQQKIAELNEAKSNLLNEFNDVK
NSLEIKLANKEVEIKALDQKLNLEIEKNKEVLINQFSQEINNLKLELNNKKIELENFAIQKEAESKTKELTLINDYDKRI
ADLVQANREFKIINSKRKGENFEHEVYEDLVKAFSLFDGIEKITTGEKKADYLQTIKNHKREEIGKIVYEVKNAE*SNT*
IPKLSTDAASNNTKYGILIATSFNDKYPGIPFMRSDEYENI*ITDSESFVFVGQIVRRLVEFENEYNQKIKTVTKASDNE
LLKELEKQKAELNEY*TIQFPTAYKKMQKELEDLDKVADSLERNSSRIKKSINVINQQFFNKVQKGLSSILGEMKAEYL
>Mature_478_residues
SDILFRCPKCGEEITKDSFKNHNSN*TVIENYLSELKQKQENEIRVQLKNELIAQMNDKQIAEISLVKQEMLNNFNKQLE
SLNISINEKDNLINKLNEQKALEIDKERNAVINEFNEKIKTYELNIQKQQNMIDQLNQQKIAELNEAKSNLLNEFNDVKN
SLEIKLANKEVEIKALDQKLNLEIEKNKEVLINQFSQEINNLKLELNNKKIELENFAIQKEAESKTKELTLINDYDKRIA
DLVQANREFKIINSKRKGENFEHEVYEDLVKAFSLFDGIEKITTGEKKADYLQTIKNHKREEIGKIVYEVKNAE*SNT*I
PKLSTDAASNNTKYGILIATSFNDKYPGIPFMRSDEYENI*ITDSESFVFVGQIVRRLVEFENEYNQKIKTVTKASDNEL
LKELEKQKAELNEY*TIQFPTAYKKMQKELEDLDKVADSLERNSSRIKKSINVINQQFFNKVQKGLSSILGEMKAEYL

Specific function: Unknown

COG id: COG4487

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55144; Mature: 55013

Theoretical pI: Translated: 5.15; Mature: 5.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSDILFRCPKCGEEITKDSFKNHNSNTVIENYLSELKQKQENEIRVQLKNELIAQMNDKQ
CCCHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
IAEISLVKQEMLNNFNKQLESLNISINEKDNLINKLNEQKALEIDKERNAVINEFNEKIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
TYELNIQKQQNMIDQLNQQKIAELNEAKSNLLNEFNDVKNSLEIKLANKEVEIKALDQKL
HHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEHHHHH
NLEIEKNKEVLINQFSQEINNLKLELNNKKIELENFAIQKEAESKTKELTLINDYDKRIA
CCEECCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHH
DLVQANREFKIINSKRKGENFEHEVYEDLVKAFSLFDGIEKITTGEKKADYLQTIKNHKR
HHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
EEIGKIVYEVKNAESNTIPKLSTDAASNNTKYGILIATSFNDKYPGIPFMRSDEYENIIT
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHC
DSESFVFVGQIVRRLVEFENEYNQKIKTVTKASDNELLKELEKQKAELNEYTIQFPTAYK
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHH
KMQKELEDLDKVADSLERNSSRIKKSINVINQQFFNKVQKGLSSILGEMKAEYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SDILFRCPKCGEEITKDSFKNHNSNTVIENYLSELKQKQENEIRVQLKNELIAQMNDKQ
CCHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
IAEISLVKQEMLNNFNKQLESLNISINEKDNLINKLNEQKALEIDKERNAVINEFNEKIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
TYELNIQKQQNMIDQLNQQKIAELNEAKSNLLNEFNDVKNSLEIKLANKEVEIKALDQKL
HHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEEEEHHHHH
NLEIEKNKEVLINQFSQEINNLKLELNNKKIELENFAIQKEAESKTKELTLINDYDKRIA
CCEECCCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHEEEEECHHHHHHH
DLVQANREFKIINSKRKGENFEHEVYEDLVKAFSLFDGIEKITTGEKKADYLQTIKNHKR
HHHHCCCCEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
EEIGKIVYEVKNAESNTIPKLSTDAASNNTKYGILIATSFNDKYPGIPFMRSDEYENIIT
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHC
DSESFVFVGQIVRRLVEFENEYNQKIKTVTKASDNELLKELEKQKAELNEYTIQFPTAYK
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCHHHH
KMQKELEDLDKVADSLERNSSRIKKSINVINQQFFNKVQKGLSSILGEMKAEYL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA