Definition | Mesoplasma florum L1, complete genome. |
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Accession | NC_006055 |
Length | 793,224 |
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The map label for this gene is 50365219
Identifier: 50365219
GI number: 50365219
Start: 460796
End: 465022
Strand: Reverse
Name: 50365219
Synonym: Mfl401
Alternate gene names: NA
Gene position: 465022-460796 (Counterclockwise)
Preceding gene: 50365220
Following gene: 50365218
Centisome position: 58.62
GC content: 22.95
Gene sequence:
>4227_bases ATGAATAAAATAATGAAAAGTTATCTAAAAACTTTTTTTAAAAACTGATTATCAACTTTATTCATGATAATTTTTATTGT TACATTAGCTGCATCAGTCATTGGGATGTTAGCAACACCTTTACAAATATATTCAAAAATGAATTCAGCACAACAACAAA ATGTAGCTTATAATTCAAATTTTTCTTCTGCTAGTGAAGATATGCTTTACAGTGAGGAATTTATAACTAAGTATGCAAAA GATTATTTAGATCCTAAATTTATAGAATTTTTAAATGCAAAATTATGAACTGATTCAACAAATAAAAAAGATAAAGATTA TTATTTAAATTGAAATAATTTTAATTCTGAGGAAAAAGAAAGAATAACATTACAAGTCAATTCATCTTTAAGAAGATATA GATTATCAGCTAATTCTACAGCATTTGAATTATCATACAAAGATTCAGCAAACTTTGATTCAAAATTTGAATTACCTACA CCTCAAGAAGTTTTTAAATATCATGTTCAAAAATCATTAGAGTTAGGTTTATATGATTTAGAAAATTTTTTACAAAACGA TGATGAAACTAATATTTATTCTTCAGTTGCAAGTATAGGATTTTCAACATTATATAGAATATTAAATTTTGCTTATGTGA ATGGTATTATTCAAGATATAAATTCAATTTCATCAATAACTAATCTTGACGATATAAAAAATTTAATTGCTAACTGAAAT CCTAAAACAATTAAAATTTCAAGTTATACAGTTTTTAATTCTGAGTATTCAAAAATTTTAGCAAATGAAAAATATCAACA TGATGATAGAATACTACTTTTTAATGAAATTTTAAATAAAAATAATGATGAATCTAATTACGAAATAAACATTAATAAAA ATTTTGTATTTCAAAAAAGTGAAGCAGGAGTTTTAACTAGTTCTCAAACTTTTGAAATAAGAACTGATTCAACTAATGAA TTTAATAATATTATTTTTGATAAAGGTAATAAAAAATCAAGAAAAACTGAAAGTTGAAATTTAAACAAACAACCTGAAAT TATTATTTCATCAGCTTTTGCAAGTGCAAATAATATTAAAATAGGTGATGAAATAAAAATGCCTATAGCTAATTCAAATA ATTTAATATTTAATGCAATACTATCAAACAAAATAGTTCAAAGCATATTACCAACAGAAAGTTTTTTTGCAAATCAATCA ACAACTGTTAAAATTGTTGGAATAGGGCAAACTTTTGATGACTTTGTTCCTGGTAATAACTTTTCAGCATTTTCACAAAG CATGGAAACTTATGGTTTTATTTATTTAAATCAAAAATTCATTAATAAATTTAGAGATTACTCTTGAAACCTATTAAGTA ACGAAGCTTCATATAATTTAGAATTAAAGATAAAAAATGTAAACTCAACAAATGAAATACCTTTTGAACTATTTAAAACA AATGATGATGTTAAAATACTATCAAATTTAGAAAATAATTTTATTCCTTGAAGCGAAACAAAAGTTGCTAAAGCGTTAGA AAATCTACAAATTAGAATAATTATAAATGTTGTTTTAGGAACTATAATTTTAGTGCTAGCTTTCTTATTCATTAATTTTC AACTTAAAAAAGAAATGAATGAAACAAGAAAACAGTTAGGAATATTTAAATCATTTGGTTATAAAACTAGTGAGTTAAGT TGAATATTTTCAATAAAAACCGGTATTTTATTTTTTATTAGTTTAATCTTTGGATTTATAATTTCTATTCCTATACAGAC TTTCGCTGCAAAGGCATTTGAAAATACTGTTTCAATTAGCTTTAGCACTATTTACTTAAGCCCATTATTCTTGTTTTCTC TATTTATTCTTATACCATTACTTTTTATTCTAATAAGTTACATAACAACTATCTTATATATAAAAGAGCCTGTTTTATCA TTAATGTCTAATAGTAGAAAAACAAAAGCTAATATAAAACAAGGAATATTATTTAAAAAAATATTTGCAGGAGAAAAGTT TTTCAATTGAAGATTGAGAAGAGCTTTTGTTAGAACTTCAAAAGGAAAGTTTTATACTGTTCAAACATTATTTGCATGTG CATCATTTACTTATATATTATTATTTGGTGCTCAAAGTTTAATGACAAAAATGTTAAATCAATCGTTTGCAGTTTATAAC GAAAAAACAGATCATTACTATAATTGATGAAATTCTAATCCAACATTAGATATTACTGAAGGACAAAATAAATTTAATTA CAAATATGAATGAAATAGAACATCTCCTGATTATAATGATTATTCTGAATATAAAAATACAAATGAATATTTGAACAAAA CATCTTCAGAAGAATATAGATTTAGAATAGATGCAGTAATTCAAATGACTAATAACTATTTTATGACATTAAATTCAACT GATAAAGCTAATTTCTTATTACCAAGAAGTGAAATGTATTTTATTTTAAACAATATGTTGAACATTAAAACAAATGATTT AATCTTAGAAGAAAGTAGTAATAATAGTTTTATAAAAACAATTATGTCATATAATTTAAATTCTCAAAATTCTGCTTTTA TAAAAGGTGTTGAGGAAATTAAATTAACTGGAACAACTTCTCAAATATTAGATTTAAATGAAAAAACAAACGAAAGTAAT TCTTTATCAATTGCATCTATGCAATCTGATATTGTAAAACATATTTTCAGTAAGGATTTATCTTATATTTTTGCAGTAAA AATAGCTCAAATTGATTTAACAATTTCTGCATTACAAGAAATTATAGGTAAGTCTAATCAAATAATTGAGATAAACGATC TAGTTGGAGCAACAACAACAAATGAATATATTGATAATGCGTATCAAAAATTATATACAAACAAGTTAATTAATAAAGTT AATATCTATGACACAAAACAAAGAAACTTATTAGACAATTGATTATTAAGTCAAATTGATGAGATATTTTCTAATGATTT AAAACAGTATATACCGCTTTTAGTTAGAGCTAATTTTACAAATATGAATTCGGTTGCAACAAATGTATTTCAAACAACAC AATTAACAGATTTTGATAATTATGATGAAAATGATTACATGTTAAATATTAATAATGTTATGTATGATAAAGAAAATGAA GTCTTATTTGACTGAATTGGTTTATCACAAAGCGGCCAATATAATGATGTTGATGTTTATGCAAGATTAGTAAATACTCA GTCTAATCAATATGGAAATTTTGAAAATATGTTTAATTTTGAAGATGTATCAACTTCTGAAATTGAAAGATTTAAAAATT CAGCTCAAGAGAATGTAAATTCAAATATTGTTAATGCAATAATTCCATATAGTATGGCTAGAAATCAAAATATAAAGATT AACGACATTATAGAATTTAAAACTAAAACATTAGATCCCCAAACAGTTCAACTTAGAGTTGTAGGAATTAATAAAGCAGA AACTATAAAATTAGGCACAGATAATATTTGAATTAATTCAGAAGATTTTAAAACTAAATTTTATGATGAAAGCCTTCCAG TGAGATTTTCAAGTTTATATTCAAAAAATGAAATGATTTCAGTTAATACAAAAACTAGTGATTTTATGGAATTATTTTAT TCAATTAAAATTATTGAAAAAAATTCATCAATTTTAATTAATGAAGATACACCAATAATGTTAGATATTTTAAGACCAGT TTTCAAATATACTAATTCTTTGAGTCCAAATGTAACTACAAACTTAAAATCTGTTGTTAATCCATATTTCTTAAACTTTT CTTCAAGAACATCAACAGTTTCTTTTATCATAAATAATTTAGTTATAAATAAAGCAACTGAAATAGTTGATAGAGTTATG TTAATATTTGTATTATTAACAACTGTTCTTCTTGCAATAATTCTAGTTGTAATTATTGGTATCATAGTTGAAGAAGCTAA AATAGTTATATTAACTCTACAAGCTTTAGGTTATAAAGATAAAGAAATAAATTGAGTTGTAATGGGTAGTTATGCTATTG GGGCTTTAATATCTTTTATAGCTGCATATATTGCGTCTGTTATATTCTGAAAAATATTATTAACATGAATAGCAAACAAG TTTAGTGTTTATATTTTTATGACAGTTGATTTAAAAACTATTTTAATAACTTTATCAGTTATGTCAGTAGTTTTACTATT TGGTTGGTATGCATCAAATAAACAAGTAAAAAGAAACCCTTTAACTCAAATAACAAGTTTAGCGTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TAGAACGCTGCCAGTTTATGAAAGAATCCGTAAGGATTCTTTTTTTTAGTTATAAATGTTAAAATATATTTAAAATAAGA AGGGTTTTTTGGTGATTTTA
Downstream 100 bases:
>100_bases GAGAAATATGGAAGTAAAACAATCTATTATTAATCACTTTCAAGAAGCAAGAATTAAAAAAGATCAAACTGTAAAAGTTT TTGAAATAAATTTTACATGA
Product: substrate ABC transporter permease component
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1408; Mature: 1408
Protein sequence:
>1408_residues MNKIMKSYLKTFFKNWLSTLFMIIFIVTLAASVIGMLATPLQIYSKMNSAQQQNVAYNSNFSSASEDMLYSEEFITKYAK DYLDPKFIEFLNAKLWTDSTNKKDKDYYLNWNNFNSEEKERITLQVNSSLRRYRLSANSTAFELSYKDSANFDSKFELPT PQEVFKYHVQKSLELGLYDLENFLQNDDETNIYSSVASIGFSTLYRILNFAYVNGIIQDINSISSITNLDDIKNLIANWN PKTIKISSYTVFNSEYSKILANEKYQHDDRILLFNEILNKNNDESNYEININKNFVFQKSEAGVLTSSQTFEIRTDSTNE FNNIIFDKGNKKSRKTESWNLNKQPEIIISSAFASANNIKIGDEIKMPIANSNNLIFNAILSNKIVQSILPTESFFANQS TTVKIVGIGQTFDDFVPGNNFSAFSQSMETYGFIYLNQKFINKFRDYSWNLLSNEASYNLELKIKNVNSTNEIPFELFKT NDDVKILSNLENNFIPWSETKVAKALENLQIRIIINVVLGTIILVLAFLFINFQLKKEMNETRKQLGIFKSFGYKTSELS WIFSIKTGILFFISLIFGFIISIPIQTFAAKAFENTVSISFSTIYLSPLFLFSLFILIPLLFILISYITTILYIKEPVLS LMSNSRKTKANIKQGILFKKIFAGEKFFNWRLRRAFVRTSKGKFYTVQTLFACASFTYILLFGAQSLMTKMLNQSFAVYN EKTDHYYNWWNSNPTLDITEGQNKFNYKYEWNRTSPDYNDYSEYKNTNEYLNKTSSEEYRFRIDAVIQMTNNYFMTLNST DKANFLLPRSEMYFILNNMLNIKTNDLILEESSNNSFIKTIMSYNLNSQNSAFIKGVEEIKLTGTTSQILDLNEKTNESN SLSIASMQSDIVKHIFSKDLSYIFAVKIAQIDLTISALQEIIGKSNQIIEINDLVGATTTNEYIDNAYQKLYTNKLINKV NIYDTKQRNLLDNWLLSQIDEIFSNDLKQYIPLLVRANFTNMNSVATNVFQTTQLTDFDNYDENDYMLNINNVMYDKENE VLFDWIGLSQSGQYNDVDVYARLVNTQSNQYGNFENMFNFEDVSTSEIERFKNSAQENVNSNIVNAIIPYSMARNQNIKI NDIIEFKTKTLDPQTVQLRVVGINKAETIKLGTDNIWINSEDFKTKFYDESLPVRFSSLYSKNEMISVNTKTSDFMELFY SIKIIEKNSSILINEDTPIMLDILRPVFKYTNSLSPNVTTNLKSVVNPYFLNFSSRTSTVSFIINNLVINKATEIVDRVM LIFVLLTTVLLAIILVVIIGIIVEEAKIVILTLQALGYKDKEINWVVMGSYAIGALISFIAAYIASVIFWKILLTWIANK FSVYIFMTVDLKTILITLSVMSVVLLFGWYASNKQVKRNPLTQITSLA
Sequences:
>Translated_1408_residues MNKIMKSYLKTFFKN*LSTLFMIIFIVTLAASVIGMLATPLQIYSKMNSAQQQNVAYNSNFSSASEDMLYSEEFITKYAK DYLDPKFIEFLNAKL*TDSTNKKDKDYYLN*NNFNSEEKERITLQVNSSLRRYRLSANSTAFELSYKDSANFDSKFELPT PQEVFKYHVQKSLELGLYDLENFLQNDDETNIYSSVASIGFSTLYRILNFAYVNGIIQDINSISSITNLDDIKNLIAN*N PKTIKISSYTVFNSEYSKILANEKYQHDDRILLFNEILNKNNDESNYEININKNFVFQKSEAGVLTSSQTFEIRTDSTNE FNNIIFDKGNKKSRKTES*NLNKQPEIIISSAFASANNIKIGDEIKMPIANSNNLIFNAILSNKIVQSILPTESFFANQS TTVKIVGIGQTFDDFVPGNNFSAFSQSMETYGFIYLNQKFINKFRDYS*NLLSNEASYNLELKIKNVNSTNEIPFELFKT NDDVKILSNLENNFIP*SETKVAKALENLQIRIIINVVLGTIILVLAFLFINFQLKKEMNETRKQLGIFKSFGYKTSELS *IFSIKTGILFFISLIFGFIISIPIQTFAAKAFENTVSISFSTIYLSPLFLFSLFILIPLLFILISYITTILYIKEPVLS LMSNSRKTKANIKQGILFKKIFAGEKFFN*RLRRAFVRTSKGKFYTVQTLFACASFTYILLFGAQSLMTKMLNQSFAVYN EKTDHYYN**NSNPTLDITEGQNKFNYKYE*NRTSPDYNDYSEYKNTNEYLNKTSSEEYRFRIDAVIQMTNNYFMTLNST DKANFLLPRSEMYFILNNMLNIKTNDLILEESSNNSFIKTIMSYNLNSQNSAFIKGVEEIKLTGTTSQILDLNEKTNESN SLSIASMQSDIVKHIFSKDLSYIFAVKIAQIDLTISALQEIIGKSNQIIEINDLVGATTTNEYIDNAYQKLYTNKLINKV NIYDTKQRNLLDN*LLSQIDEIFSNDLKQYIPLLVRANFTNMNSVATNVFQTTQLTDFDNYDENDYMLNINNVMYDKENE VLFD*IGLSQSGQYNDVDVYARLVNTQSNQYGNFENMFNFEDVSTSEIERFKNSAQENVNSNIVNAIIPYSMARNQNIKI NDIIEFKTKTLDPQTVQLRVVGINKAETIKLGTDNI*INSEDFKTKFYDESLPVRFSSLYSKNEMISVNTKTSDFMELFY SIKIIEKNSSILINEDTPIMLDILRPVFKYTNSLSPNVTTNLKSVVNPYFLNFSSRTSTVSFIINNLVINKATEIVDRVM LIFVLLTTVLLAIILVVIIGIIVEEAKIVILTLQALGYKDKEIN*VVMGSYAIGALISFIAAYIASVIF*KILLT*IANK FSVYIFMTVDLKTILITLSVMSVVLLFGWYASNKQVKRNPLTQITSLA >Mature_1408_residues MNKIMKSYLKTFFKN*LSTLFMIIFIVTLAASVIGMLATPLQIYSKMNSAQQQNVAYNSNFSSASEDMLYSEEFITKYAK DYLDPKFIEFLNAKL*TDSTNKKDKDYYLN*NNFNSEEKERITLQVNSSLRRYRLSANSTAFELSYKDSANFDSKFELPT PQEVFKYHVQKSLELGLYDLENFLQNDDETNIYSSVASIGFSTLYRILNFAYVNGIIQDINSISSITNLDDIKNLIAN*N PKTIKISSYTVFNSEYSKILANEKYQHDDRILLFNEILNKNNDESNYEININKNFVFQKSEAGVLTSSQTFEIRTDSTNE FNNIIFDKGNKKSRKTES*NLNKQPEIIISSAFASANNIKIGDEIKMPIANSNNLIFNAILSNKIVQSILPTESFFANQS TTVKIVGIGQTFDDFVPGNNFSAFSQSMETYGFIYLNQKFINKFRDYS*NLLSNEASYNLELKIKNVNSTNEIPFELFKT NDDVKILSNLENNFIP*SETKVAKALENLQIRIIINVVLGTIILVLAFLFINFQLKKEMNETRKQLGIFKSFGYKTSELS *IFSIKTGILFFISLIFGFIISIPIQTFAAKAFENTVSISFSTIYLSPLFLFSLFILIPLLFILISYITTILYIKEPVLS LMSNSRKTKANIKQGILFKKIFAGEKFFN*RLRRAFVRTSKGKFYTVQTLFACASFTYILLFGAQSLMTKMLNQSFAVYN EKTDHYYN**NSNPTLDITEGQNKFNYKYE*NRTSPDYNDYSEYKNTNEYLNKTSSEEYRFRIDAVIQMTNNYFMTLNST DKANFLLPRSEMYFILNNMLNIKTNDLILEESSNNSFIKTIMSYNLNSQNSAFIKGVEEIKLTGTTSQILDLNEKTNESN SLSIASMQSDIVKHIFSKDLSYIFAVKIAQIDLTISALQEIIGKSNQIIEINDLVGATTTNEYIDNAYQKLYTNKLINKV NIYDTKQRNLLDN*LLSQIDEIFSNDLKQYIPLLVRANFTNMNSVATNVFQTTQLTDFDNYDENDYMLNINNVMYDKENE VLFD*IGLSQSGQYNDVDVYARLVNTQSNQYGNFENMFNFEDVSTSEIERFKNSAQENVNSNIVNAIIPYSMARNQNIKI NDIIEFKTKTLDPQTVQLRVVGINKAETIKLGTDNI*INSEDFKTKFYDESLPVRFSSLYSKNEMISVNTKTSDFMELFY SIKIIEKNSSILINEDTPIMLDILRPVFKYTNSLSPNVTTNLKSVVNPYFLNFSSRTSTVSFIINNLVINKATEIVDRVM LIFVLLTTVLLAIILVVIIGIIVEEAKIVILTLQALGYKDKEIN*VVMGSYAIGALISFIAAYIASVIF*KILLT*IANK FSVYIFMTVDLKTILITLSVMSVVLLFGWYASNKQVKRNPLTQITSLA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 158666; Mature: 158666
Theoretical pI: Translated: 5.90; Mature: 5.90
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 2.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKIMKSYLKTFFKNLSTLFMIIFIVTLAASVIGMLATPLQIYSKMNSAQQQNVAYNSNF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCC SSASEDMLYSEEFITKYAKDYLDPKFIEFLNAKLTDSTNKKDKDYYLNNNFNSEEKERIT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCEEEE LQVNSSLRRYRLSANSTAFELSYKDSANFDSKFELPTPQEVFKYHVQKSLELGLYDLENF EEECCCHHHEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH LQNDDETNIYSSVASIGFSTLYRILNFAYVNGIIQDINSISSITNLDDIKNLIANNPKTI HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEE KISSYTVFNSEYSKILANEKYQHDDRILLFNEILNKNNDESNYEININKNFVFQKSEAGV EEEEEEEECCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHCCCCCCCCEEEEECCCEEEEECCCCE LTSSQTFEIRTDSTNEFNNIIFDKGNKKSRKTESNLNKQPEIIISSAFASANNIKIGDEI EECCCEEEEECCCCCCCCCEEECCCCCCCCCHHHCCCCCCCEEEEEHHCCCCCCEECCCE KMPIANSNNLIFNAILSNKIVQSILPTESFFANQSTTVKIVGIGQTFDDFVPGNNFSAFS ECCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHCCCCCCHHHHH QSMETYGFIYLNQKFINKFRDYSNLLSNEASYNLELKIKNVNSTNEIPFELFKTNDDVKI 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NLLSQIDEIFSNDLKQYIPLLVRANFTNMNSVATNVFQTTQLTDFDNYDENDYMLNINNV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHHHHCEECCCCCCCCCCEEEEECCE MYDKENEVLFDIGLSQSGQYNDVDVYARLVNTQSNQYGNFENMFNFEDVSTSEIERFKNS EECCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH AQENVNSNIVNAIIPYSMARNQNIKINDIIEFKTKTLDPQTVQLRVVGINKAETIKLGTD HHHCCCCHHHHHHHCHHHCCCCCCEEEEEEEEHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCEEEECCC NIINSEDFKTKFYDESLPVRFSSLYSKNEMISVNTKTSDFMELFYSIKIIEKNSSILINE CCCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHEEEEECCCCEEEEC DTPIMLDILRPVFKYTNSLSPNVTTNLKSVVNPYFLNFSSRTSTVSFIINNLVINKATEI CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VDRVMLIFVLLTTVLLAIILVVIIGIIVEEAKIVILTLQALGYKDKEINVVMGSYAIGAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECHHHHHHH ISFIAAYIASVIFKILLTIANKFSVYIFMTVDLKTILITLSVMSVVLLFGWYASNKQVKR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC NPLTQITSLA CCHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
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References: NA