Definition | Mesoplasma florum L1, complete genome. |
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Accession | NC_006055 |
Length | 793,224 |
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The map label for this gene is 50365078
Identifier: 50365078
GI number: 50365078
Start: 296634
End: 301808
Strand: Direct
Name: 50365078
Synonym: Mfl262
Alternate gene names: NA
Gene position: 296634-301808 (Clockwise)
Preceding gene: 50365077
Following gene: 50365079
Centisome position: 37.4
GC content: 25.93
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases GAATAAAAAATAAAAACTTATCACTTTGGAAATTATCCAAAAATTGATAAGTTTTTTTATCATATAGTATAATCTTATTA AAAGAAATAAAGGCGATAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases AGGAGAAATTATGAAAAAAGTAGCAATAATTTTACATAAAAATTTTGAAGAATCAGAAGCTATTGTAACAATTGATATAC TAAGAAGATCTGAAATTATT
Product: substrate ABC transporter permease component
Products: NA
Alternate protein names: Permease
Number of amino acids: Translated: 1724; Mature: 1724
Protein sequence:
>1724_residues MDKFKNNLLFFKQSLKSIFKFRIQFLSILLLSFMSIVVLTSSLTIKDRLNDTYNSVVGDVEKFDYHVSDQMSFIKNQPST NKVSKQLILSFLPVDSRTSVDQQETVNINFNSIYGRTFITEAFEKDNRMLNTFISNTFNEDSNNNWNAFSSNAFFWTTRM LLLESFYTDLDLYYNHNDSSVDYLNYVPIVSYINEIDDKSFIENDLNNIKTNLSTKKFDENINENNTVFTLNSLNNNESQ TNDIIGIENKDIYLYASNAFSSAFAFIREFLNSSNWSFENENRGKAIFQFITGQDIQNNWNQSNVNQEWVVNEQNKLYDS VVTGDTKEKNYIYVSKDTNNSDVYAKIKSNGLKGKATPIVAFYDDEDKITKASTEYINLNPLSLNSNSLNDDWSGKFSAI NNSNMSDQFFGNLFSERNIEWLTWSQSNYSLFEANSPWTNNISNNYRMFLKIAASYSNFNIEFRKEFNVFDNLNQIQYKA VILDEYNHTNLKILNDNEGGRLPLNHGEILVSEQYAKAHNIKNNSTIKIGPQVLTVVGIATDTFSYYPIVDENVPFPQYR NSAIIYGTEQTLFPIVENSQSTSKEQISNTNINYFLWSKDNSASKNFETFASFTPLSKNTKTFNESSYRMNWVLQPSIVS GLLIIMISISVIVGVISLLGVVIYIKKMVKANIKQIAILKAMGVNSFSIAKSYAAVGLIITFLVIPIGWMVGTSVQLIFI KMFIPYFSVQISQISISMVALLIGVFAFGFAVIILSILFAYIETREDVTLMLNKVGKVKQQAAIMNWINRVFANSKFTLR FSLIVSASAIRNTTTTAFVIFISSFLIFFGLSIPALVETTKNGYYNHLNYNNQHRFVENVYNAPLSKSTISYTEDLKTID ANYKTTSLMEYYSNPTYSYDSSFDVSPLSKYVYSKNQAGSGQITNTFKYIVNDSSNNAVYSTEIEENGNNTGLFQLITEQ FGNNFANGIGSQFSVGMIDQALNVIMNSYYDATAYGTNAYSRINSDMDNLNKFNIITKNLTDAIPMILGAVLGGGSGESS GNWKEDILSIILKNVPPYVERYLQDPSRKEQYAFGYNVKKVTKNEDSLATSINVDTEEYKNMSFTGINPNQQAFDLNNEK IFVSDKTATEIEMLINNQWDMTKSISENGFVYYDAQTKTLTIPIMPNNQAKNKYHLSNNKVLQNESVFGNQLKFKSKNDS QFLSLPKQAWVYNDSDFLNSDYFKTNLNQKDSDSNIKSNRTGVISDQNYLDPANLDNNKFTYKIQYTGENENTSLDNNAY MFNDFAVDNNENGVSYVRPYYQYENIELFIPENLIGSVDEWANTTNNTPDKSKYFESDISGENIPKDVKHAWESMYSSAK DSKYIKIKPYSLSYKRTDYKNKGLANLLEKESNYVWYASAMRNNLFKQENDSVKYLNSNLNIDYKVVGTLNSYNTSMILM DQKMANILSNYSLAKKQDVKNNVFEDTPKVKAGQTITDNNGNKIVSEFDRYELHDDNKDIYLNDWTNMLSEGADSTQYTQ YMWSNTKYSNVEESIDLTTGIWQSISENNGLLMLSQTPIGNISDGFVTSSIISSKLLSTEKELIKQITSLAIVLGSFFII IVIITASLLIMLIGDIYIASLQRFMILMKSFGYSNWKTQKYSFGVVSVLAIFAWFISTLLATAAMSSVSIILASYGLAIP MALTWWPFIVSAVIIGLSFFGSLSVITRKIRKGDPAGLLSETHE
Sequences:
>Translated_1724_residues MDKFKNNLLFFKQSLKSIFKFRIQFLSILLLSFMSIVVLTSSLTIKDRLNDTYNSVVGDVEKFDYHVSDQMSFIKNQPST NKVSKQLILSFLPVDSRTSVDQQETVNINFNSIYGRTFITEAFEKDNRMLNTFISNTFNEDSNNN*NAFSSNAFF*TTRM LLLESFYTDLDLYYNHNDSSVDYLNYVPIVSYINEIDDKSFIENDLNNIKTNLSTKKFDENINENNTVFTLNSLNNNESQ TNDIIGIENKDIYLYASNAFSSAFAFIREFLNSSN*SFENENRGKAIFQFITGQDIQNN*NQSNVNQE*VVNEQNKLYDS VVTGDTKEKNYIYVSKDTNNSDVYAKIKSNGLKGKATPIVAFYDDEDKITKASTEYINLNPLSLNSNSLNDD*SGKFSAI NNSNMSDQFFGNLFSERNIE*LT*SQSNYSLFEANSP*TNNISNNYRMFLKIAASYSNFNIEFRKEFNVFDNLNQIQYKA VILDEYNHTNLKILNDNEGGRLPLNHGEILVSEQYAKAHNIKNNSTIKIGPQVLTVVGIATDTFSYYPIVDENVPFPQYR NSAIIYGTEQTLFPIVENSQSTSKEQISNTNINYFL*SKDNSASKNFETFASFTPLSKNTKTFNESSYRMN*VLQPSIVS GLLIIMISISVIVGVISLLGVVIYIKKMVKANIKQIAILKAMGVNSFSIAKSYAAVGLIITFLVIPIG*MVGTSVQLIFI KMFIPYFSVQISQISISMVALLIGVFAFGFAVIILSILFAYIETREDVTLMLNKVGKVKQQAAIMN*INRVFANSKFTLR FSLIVSASAIRNTTTTAFVIFISSFLIFFGLSIPALVETTKNGYYNHLNYNNQHRFVENVYNAPLSKSTISYTEDLKTID ANYKTTSLMEYYSNPTYSYDSSFDVSPLSKYVYSKNQAGSGQITNTFKYIVNDSSNNAVYSTEIEENGNNTGLFQLITEQ FGNNFANGIGSQFSVGMIDQALNVIMNSYYDATAYGTNAYSRINSDMDNLNKFNIITKNLTDAIPMILGAVLGGGSGESS GN*KEDILSIILKNVPPYVERYLQDPSRKEQYAFGYNVKKVTKNEDSLATSINVDTEEYKNMSFTGINPNQQAFDLNNEK IFVSDKTATEIEMLINNQ*DMTKSISENGFVYYDAQTKTLTIPIMPNNQAKNKYHLSNNKVLQNESVFGNQLKFKSKNDS QFLSLPKQA*VYNDSDFLNSDYFKTNLNQKDSDSNIKSNRTGVISDQNYLDPANLDNNKFTYKIQYTGENENTSLDNNAY MFNDFAVDNNENGVSYVRPYYQYENIELFIPENLIGSVDE*ANTTNNTPDKSKYFESDISGENIPKDVKHA*ESMYSSAK DSKYIKIKPYSLSYKRTDYKNKGLANLLEKESNYV*YASAMRNNLFKQENDSVKYLNSNLNIDYKVVGTLNSYNTSMILM DQKMANILSNYSLAKKQDVKNNVFEDTPKVKAGQTITDNNGNKIVSEFDRYELHDDNKDIYLND*TNMLSEGADSTQYTQ YM*SNTKYSNVEESIDLTTGI*QSISENNGLLMLSQTPIGNISDGFVTSSIISSKLLSTEKELIKQITSLAIVLGSFFII IVIITASLLIMLIGDIYIASLQRFMILMKSFGYSN*KTQKYSFGVVSVLAIFA*FISTLLATAAMSSVSIILASYGLAIP MALT**PFIVSAVIIGLSFFGSLSVITRKIRKGDPAGLLSETHE >Mature_1724_residues MDKFKNNLLFFKQSLKSIFKFRIQFLSILLLSFMSIVVLTSSLTIKDRLNDTYNSVVGDVEKFDYHVSDQMSFIKNQPST NKVSKQLILSFLPVDSRTSVDQQETVNINFNSIYGRTFITEAFEKDNRMLNTFISNTFNEDSNNN*NAFSSNAFF*TTRM LLLESFYTDLDLYYNHNDSSVDYLNYVPIVSYINEIDDKSFIENDLNNIKTNLSTKKFDENINENNTVFTLNSLNNNESQ TNDIIGIENKDIYLYASNAFSSAFAFIREFLNSSN*SFENENRGKAIFQFITGQDIQNN*NQSNVNQE*VVNEQNKLYDS VVTGDTKEKNYIYVSKDTNNSDVYAKIKSNGLKGKATPIVAFYDDEDKITKASTEYINLNPLSLNSNSLNDD*SGKFSAI NNSNMSDQFFGNLFSERNIE*LT*SQSNYSLFEANSP*TNNISNNYRMFLKIAASYSNFNIEFRKEFNVFDNLNQIQYKA VILDEYNHTNLKILNDNEGGRLPLNHGEILVSEQYAKAHNIKNNSTIKIGPQVLTVVGIATDTFSYYPIVDENVPFPQYR NSAIIYGTEQTLFPIVENSQSTSKEQISNTNINYFL*SKDNSASKNFETFASFTPLSKNTKTFNESSYRMN*VLQPSIVS GLLIIMISISVIVGVISLLGVVIYIKKMVKANIKQIAILKAMGVNSFSIAKSYAAVGLIITFLVIPIG*MVGTSVQLIFI KMFIPYFSVQISQISISMVALLIGVFAFGFAVIILSILFAYIETREDVTLMLNKVGKVKQQAAIMN*INRVFANSKFTLR FSLIVSASAIRNTTTTAFVIFISSFLIFFGLSIPALVETTKNGYYNHLNYNNQHRFVENVYNAPLSKSTISYTEDLKTID ANYKTTSLMEYYSNPTYSYDSSFDVSPLSKYVYSKNQAGSGQITNTFKYIVNDSSNNAVYSTEIEENGNNTGLFQLITEQ FGNNFANGIGSQFSVGMIDQALNVIMNSYYDATAYGTNAYSRINSDMDNLNKFNIITKNLTDAIPMILGAVLGGGSGESS GN*KEDILSIILKNVPPYVERYLQDPSRKEQYAFGYNVKKVTKNEDSLATSINVDTEEYKNMSFTGINPNQQAFDLNNEK IFVSDKTATEIEMLINNQ*DMTKSISENGFVYYDAQTKTLTIPIMPNNQAKNKYHLSNNKVLQNESVFGNQLKFKSKNDS QFLSLPKQA*VYNDSDFLNSDYFKTNLNQKDSDSNIKSNRTGVISDQNYLDPANLDNNKFTYKIQYTGENENTSLDNNAY MFNDFAVDNNENGVSYVRPYYQYENIELFIPENLIGSVDE*ANTTNNTPDKSKYFESDISGENIPKDVKHA*ESMYSSAK DSKYIKIKPYSLSYKRTDYKNKGLANLLEKESNYV*YASAMRNNLFKQENDSVKYLNSNLNIDYKVVGTLNSYNTSMILM DQKMANILSNYSLAKKQDVKNNVFEDTPKVKAGQTITDNNGNKIVSEFDRYELHDDNKDIYLND*TNMLSEGADSTQYTQ YM*SNTKYSNVEESIDLTTGI*QSISENNGLLMLSQTPIGNISDGFVTSSIISSKLLSTEKELIKQITSLAIVLGSFFII IVIITASLLIMLIGDIYIASLQRFMILMKSFGYSN*KTQKYSFGVVSVLAIFA*FISTLLATAAMSSVSIILASYGLAIP MALT**PFIVSAVIIGLSFFGSLSVITRKIRKGDPAGLLSETHE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 190647; Mature: 190647
Theoretical pI: Translated: 5.01; Mature: 5.01
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDKFKNNLLFFKQSLKSIFKFRIQFLSILLLSFMSIVVLTSSLTIKDRLNDTYNSVVGDV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHCHHHHHHHCCH EKFDYHVSDQMSFIKNQPSTNKVSKQLILSFLPVDSRTSVDQQETVNINFNSIYGRTFIT HHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEHEEECHHHHH EAFEKDNRMLNTFISNTFNEDSNNNNAFSSNAFFTTRMLLLESFYTDLDLYYNHNDSSVD HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCCCCC YLNYVPIVSYINEIDDKSFIENDLNNIKTNLSTKKFDENINENNTVFTLNSLNNNESQTN HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCC DIIGIENKDIYLYASNAFSSAFAFIREFLNSSNSFENENRGKAIFQFITGQDIQNNNQSN CEEEECCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCC VNQEVVNEQNKLYDSVVTGDTKEKNYIYVSKDTNNSDVYAKIKSNGLKGKATPIVAFYDD CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECC EDKITKASTEYINLNPLSLNSNSLNDDSGKFSAINNSNMSDQFFGNLFSERNIELTSQSN CCCCEECCCCEEEECEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCC YSLFEANSPTNNISNNYRMFLKIAASYSNFNIEFRKEFNVFDNLNQIQYKAVILDEYNHT 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