Definition Mesoplasma florum L1, complete genome.
Accession NC_006055
Length 793,224

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The map label for this gene is 50364831

Identifier: 50364831

GI number: 50364831

Start: 21759

End: 23372

Strand: Reverse

Name: 50364831

Synonym: Mfl016

Alternate gene names: NA

Gene position: 23372-21759 (Counterclockwise)

Preceding gene: 50364832

Following gene: 50364830

Centisome position: 2.95

GC content: 28.07

Gene sequence:

>1614_bases
ATGAATACTAAAAAAACTAAAACTAAAACGTTTGAATTTTTAACTCTTTTTGTAATGGTTATTGGAACTGTAATTGGTTC
TGGTATTTATATGAAAAATAGTGAATTATTAAATCAAACAAACAACCCAATAATTGCATTAATTCTTTGATCCTTTGTTG
GTGTTATTTGTATCATGTCAATGATTGTTTTTATTGAAATTTCATCATCAACAAAACATTTTGGTAATGGTACATTGGGG
AACTGAGCTAAAATATTTATAAATAGAAAAACTGCTTCTTTTTTCTCTATTATGTATGGATGAGTTTATATACCCAGCAC
ACAAAGTGTTTTTGTGGCTGGAGCTGTTAACTATTTATTATTAGCAATTGGTGCTCCAATTACACCTTATCAACAATTAC
TAATTTATTTAGTTGTTGGGATAAGTATATTTATTACTTGTACAATTTTGTCTATCTATAAAAGATTTATTAACAGAAAA
ATTCAAGTTGTCGGTATTTTAATTAAATTTTTACCTTTACTAATTGCGTTTATTGCAGGTTTTATTTTAATTGATAAAAC
AGGTGGTACAAGTGCATGATGAAATGGTGGAATTGACAAAAATACATGAGGAACAAATGAATGATCACCAATACTTTTCC
TAGGTGGATTTGGTGGTATTTTATTTGCATTTGATGGATATGTATATATTGCTAATGCACAAAAAACTGCAACAAATAAA
GATGTTGTTCCAAAAGCTTTATTCGCAGGTATGATATTTGTTGCTATATTTTATGTACTAATGGCCTTATCATTGTTTAT
GGGTTCTCCAGATGGATCAATTGTTAAGTTATTAGAAAAAATGTTAGGTGGTAAAGAAAGTGCTGCTGCCAGAATTATCT
CAAACTTAATACTGATGAGTATATGTTTATTAGGATCAAACATATTCGTTGATATCGCTATAGTTGATTTAGCATCTGAT
GCTAACAATAAAACAATTTATACAAAAAAAAGAAGTATGAACTATAAAGAAGCTGGTTTCATACAATTAATAATTTTTAT
TGTTGCTTACACTTTCCTAATAACTATAGGTATTTCTACAACAAGAGATGGATGAGATGGAATAGGTTCAGCCGTTGGCT
CAGGAAGCATTGAAAATGTAGAAGAGTTATTAAATAGACCAACTGATTATATAAATTGGTTTTCTTCTGGAACTAGTGCA
TTAGTTTTTATAATGGTATTAGCTGTTATGGTAGCAGGTGTTGTTAATAGATTCACAAAGAAAGTTAAAGTTGAACAAAC
TAAATTATTTATGGTTTGTGGGATTATTTCTTCACTCTTTATGGCTATATTTATTTTCTTTGGAATTTTCGCATTTATTT
GAGAGCCAAAAAACATTGCTAAAGGTGACTGAGGAATAACTCAGTCAGGAATGTGATTCTTAATTATCTTAGTGGTTTCT
TTAACTATTAATGTTATTGTTTTCTTAATTCAAGAATACAAATTTAAGAAAGATCCATATTTGGATGGGTGAGATGGAGA
AATCAACCCAAACATTGAAATTGAAGATAGCATAAGTATAAAAACTGATTTAATCTATTTAAAAAATAAGGTTTTTAAAA
GAAAAGAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAATACATCGATTAAAACACTTAGAGTGTTTTTTTATTTTGTTTTCACTTTTAAAAATTTTATATTACAATTATTTTTAA
TCTTATAGAAAGTTAAAACA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATATTTCAAGGGTACTAAAAGTACTCTTTTTTTTATATAATCATTTTACTTAATAAATTTTAAAGATTGGGGTCAATTC
TAATGAAAAACGATTTTAAA

Product: putrescine/ornithine APC transporter

Products: NA

Alternate protein names: Putrescine/Ornithine APC Transporter

Number of amino acids: Translated: 537; Mature: 537

Protein sequence:

>537_residues
MNTKKTKTKTFEFLTLFVMVIGTVIGSGIYMKNSELLNQTNNPIIALILWSFVGVICIMSMIVFIEISSSTKHFGNGTLG
NWAKIFINRKTASFFSIMYGWVYIPSTQSVFVAGAVNYLLLAIGAPITPYQQLLIYLVVGISIFITCTILSIYKRFINRK
IQVVGILIKFLPLLIAFIAGFILIDKTGGTSAWWNGGIDKNTWGTNEWSPILFLGGFGGILFAFDGYVYIANAQKTATNK
DVVPKALFAGMIFVAIFYVLMALSLFMGSPDGSIVKLLEKMLGGKESAAARIISNLILMSICLLGSNIFVDIAIVDLASD
ANNKTIYTKKRSMNYKEAGFIQLIIFIVAYTFLITIGISTTRDGWDGIGSAVGSGSIENVEELLNRPTDYINWFSSGTSA
LVFIMVLAVMVAGVVNRFTKKVKVEQTKLFMVCGIISSLFMAIFIFFGIFAFIWEPKNIAKGDWGITQSGMWFLIILVVS
LTINVIVFLIQEYKFKKDPYLDGWDGEINPNIEIEDSISIKTDLIYLKNKVFKRKEN

Sequences:

>Translated_537_residues
MNTKKTKTKTFEFLTLFVMVIGTVIGSGIYMKNSELLNQTNNPIIALIL*SFVGVICIMSMIVFIEISSSTKHFGNGTLG
N*AKIFINRKTASFFSIMYG*VYIPSTQSVFVAGAVNYLLLAIGAPITPYQQLLIYLVVGISIFITCTILSIYKRFINRK
IQVVGILIKFLPLLIAFIAGFILIDKTGGTSA**NGGIDKNT*GTNE*SPILFLGGFGGILFAFDGYVYIANAQKTATNK
DVVPKALFAGMIFVAIFYVLMALSLFMGSPDGSIVKLLEKMLGGKESAAARIISNLILMSICLLGSNIFVDIAIVDLASD
ANNKTIYTKKRSMNYKEAGFIQLIIFIVAYTFLITIGISTTRDG*DGIGSAVGSGSIENVEELLNRPTDYINWFSSGTSA
LVFIMVLAVMVAGVVNRFTKKVKVEQTKLFMVCGIISSLFMAIFIFFGIFAFI*EPKNIAKGD*GITQSGM*FLIILVVS
LTINVIVFLIQEYKFKKDPYLDG*DGEINPNIEIEDSISIKTDLIYLKNKVFKRKEN
>Mature_537_residues
MNTKKTKTKTFEFLTLFVMVIGTVIGSGIYMKNSELLNQTNNPIIALIL*SFVGVICIMSMIVFIEISSSTKHFGNGTLG
N*AKIFINRKTASFFSIMYG*VYIPSTQSVFVAGAVNYLLLAIGAPITPYQQLLIYLVVGISIFITCTILSIYKRFINRK
IQVVGILIKFLPLLIAFIAGFILIDKTGGTSA**NGGIDKNT*GTNE*SPILFLGGFGGILFAFDGYVYIANAQKTATNK
DVVPKALFAGMIFVAIFYVLMALSLFMGSPDGSIVKLLEKMLGGKESAAARIISNLILMSICLLGSNIFVDIAIVDLASD
ANNKTIYTKKRSMNYKEAGFIQLIIFIVAYTFLITIGISTTRDG*DGIGSAVGSGSIENVEELLNRPTDYINWFSSGTSA
LVFIMVLAVMVAGVVNRFTKKVKVEQTKLFMVCGIISSLFMAIFIFFGIFAFI*EPKNIAKGD*GITQSGM*FLIILVVS
LTINVIVFLIQEYKFKKDPYLDG*DGEINPNIEIEDSISIKTDLIYLKNKVFKRKEN

Specific function: Unknown

COG id: COG0531

COG function: function code E; Amino acid transporters

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57229; Mature: 57229

Theoretical pI: Translated: 9.68; Mature: 9.68

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNTKKTKTKTFEFLTLFVMVIGTVIGSGIYMKNSELLNQTNNPIIALILSFVGVICIMSM
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVFIEISSSTKHFGNGTLGNAKIFINRKTASFFSIMYGVYIPSTQSVFVAGAVNYLLLAI
HHHEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
GAPITPYQQLLIYLVVGISIFITCTILSIYKRFINRKIQVVGILIKFLPLLIAFIAGFIL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
IDKTGGTSANGGIDKNTGTNESPILFLGGFGGILFAFDGYVYIANAQKTATNKDVVPKAL
EECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHEECCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHH
FAGMIFVAIFYVLMALSLFMGSPDGSIVKLLEKMLGGKESAAARIISNLILMSICLLGSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
IFVDIAIVDLASDANNKTIYTKKRSMNYKEAGFIQLIIFIVAYTFLITIGISTTRDGDGI
EEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
GSAVGSGSIENVEELLNRPTDYINWFSSGTSALVFIMVLAVMVAGVVNRFTKKVKVEQTK
CHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFMVCGIISSLFMAIFIFFGIFAFIEPKNIAKGDGITQSGMFLIILVVSLTINVIVFLIQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EYKFKKDPYLDGDGEINPNIEIEDSISIKTDLIYLKNKVFKRKEN
HHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MNTKKTKTKTFEFLTLFVMVIGTVIGSGIYMKNSELLNQTNNPIIALILSFVGVICIMSM
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVFIEISSSTKHFGNGTLGNAKIFINRKTASFFSIMYGVYIPSTQSVFVAGAVNYLLLAI
HHHEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
GAPITPYQQLLIYLVVGISIFITCTILSIYKRFINRKIQVVGILIKFLPLLIAFIAGFIL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
IDKTGGTSANGGIDKNTGTNESPILFLGGFGGILFAFDGYVYIANAQKTATNKDVVPKAL
EECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHEECCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHH
FAGMIFVAIFYVLMALSLFMGSPDGSIVKLLEKMLGGKESAAARIISNLILMSICLLGSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
IFVDIAIVDLASDANNKTIYTKKRSMNYKEAGFIQLIIFIVAYTFLITIGISTTRDGDGI
EEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
GSAVGSGSIENVEELLNRPTDYINWFSSGTSALVFIMVLAVMVAGVVNRFTKKVKVEQTK
CHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFMVCGIISSLFMAIFIFFGIFAFIEPKNIAKGDGITQSGMFLIILVVSLTINVIVFLIQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EYKFKKDPYLDGDGEINPNIEIEDSISIKTDLIYLKNKVFKRKEN
HHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA