Definition | Mesoplasma florum L1, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_006055 |
Length | 793,224 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 50364831
Identifier: 50364831
GI number: 50364831
Start: 21759
End: 23372
Strand: Reverse
Name: 50364831
Synonym: Mfl016
Alternate gene names: NA
Gene position: 23372-21759 (Counterclockwise)
Preceding gene: 50364832
Following gene: 50364830
Centisome position: 2.95
GC content: 28.07
Gene sequence:
>1614_bases ATGAATACTAAAAAAACTAAAACTAAAACGTTTGAATTTTTAACTCTTTTTGTAATGGTTATTGGAACTGTAATTGGTTC TGGTATTTATATGAAAAATAGTGAATTATTAAATCAAACAAACAACCCAATAATTGCATTAATTCTTTGATCCTTTGTTG GTGTTATTTGTATCATGTCAATGATTGTTTTTATTGAAATTTCATCATCAACAAAACATTTTGGTAATGGTACATTGGGG AACTGAGCTAAAATATTTATAAATAGAAAAACTGCTTCTTTTTTCTCTATTATGTATGGATGAGTTTATATACCCAGCAC ACAAAGTGTTTTTGTGGCTGGAGCTGTTAACTATTTATTATTAGCAATTGGTGCTCCAATTACACCTTATCAACAATTAC TAATTTATTTAGTTGTTGGGATAAGTATATTTATTACTTGTACAATTTTGTCTATCTATAAAAGATTTATTAACAGAAAA ATTCAAGTTGTCGGTATTTTAATTAAATTTTTACCTTTACTAATTGCGTTTATTGCAGGTTTTATTTTAATTGATAAAAC AGGTGGTACAAGTGCATGATGAAATGGTGGAATTGACAAAAATACATGAGGAACAAATGAATGATCACCAATACTTTTCC TAGGTGGATTTGGTGGTATTTTATTTGCATTTGATGGATATGTATATATTGCTAATGCACAAAAAACTGCAACAAATAAA GATGTTGTTCCAAAAGCTTTATTCGCAGGTATGATATTTGTTGCTATATTTTATGTACTAATGGCCTTATCATTGTTTAT GGGTTCTCCAGATGGATCAATTGTTAAGTTATTAGAAAAAATGTTAGGTGGTAAAGAAAGTGCTGCTGCCAGAATTATCT CAAACTTAATACTGATGAGTATATGTTTATTAGGATCAAACATATTCGTTGATATCGCTATAGTTGATTTAGCATCTGAT GCTAACAATAAAACAATTTATACAAAAAAAAGAAGTATGAACTATAAAGAAGCTGGTTTCATACAATTAATAATTTTTAT TGTTGCTTACACTTTCCTAATAACTATAGGTATTTCTACAACAAGAGATGGATGAGATGGAATAGGTTCAGCCGTTGGCT CAGGAAGCATTGAAAATGTAGAAGAGTTATTAAATAGACCAACTGATTATATAAATTGGTTTTCTTCTGGAACTAGTGCA TTAGTTTTTATAATGGTATTAGCTGTTATGGTAGCAGGTGTTGTTAATAGATTCACAAAGAAAGTTAAAGTTGAACAAAC TAAATTATTTATGGTTTGTGGGATTATTTCTTCACTCTTTATGGCTATATTTATTTTCTTTGGAATTTTCGCATTTATTT GAGAGCCAAAAAACATTGCTAAAGGTGACTGAGGAATAACTCAGTCAGGAATGTGATTCTTAATTATCTTAGTGGTTTCT TTAACTATTAATGTTATTGTTTTCTTAATTCAAGAATACAAATTTAAGAAAGATCCATATTTGGATGGGTGAGATGGAGA AATCAACCCAAACATTGAAATTGAAGATAGCATAAGTATAAAAACTGATTTAATCTATTTAAAAAATAAGGTTTTTAAAA GAAAAGAAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GAATACATCGATTAAAACACTTAGAGTGTTTTTTTATTTTGTTTTCACTTTTAAAAATTTTATATTACAATTATTTTTAA TCTTATAGAAAGTTAAAACA
Downstream 100 bases:
>100_bases TATATTTCAAGGGTACTAAAAGTACTCTTTTTTTTATATAATCATTTTACTTAATAAATTTTAAAGATTGGGGTCAATTC TAATGAAAAACGATTTTAAA
Product: putrescine/ornithine APC transporter
Products: NA
Alternate protein names: Putrescine/Ornithine APC Transporter
Number of amino acids: Translated: 537; Mature: 537
Protein sequence:
>537_residues MNTKKTKTKTFEFLTLFVMVIGTVIGSGIYMKNSELLNQTNNPIIALILWSFVGVICIMSMIVFIEISSSTKHFGNGTLG NWAKIFINRKTASFFSIMYGWVYIPSTQSVFVAGAVNYLLLAIGAPITPYQQLLIYLVVGISIFITCTILSIYKRFINRK IQVVGILIKFLPLLIAFIAGFILIDKTGGTSAWWNGGIDKNTWGTNEWSPILFLGGFGGILFAFDGYVYIANAQKTATNK DVVPKALFAGMIFVAIFYVLMALSLFMGSPDGSIVKLLEKMLGGKESAAARIISNLILMSICLLGSNIFVDIAIVDLASD ANNKTIYTKKRSMNYKEAGFIQLIIFIVAYTFLITIGISTTRDGWDGIGSAVGSGSIENVEELLNRPTDYINWFSSGTSA LVFIMVLAVMVAGVVNRFTKKVKVEQTKLFMVCGIISSLFMAIFIFFGIFAFIWEPKNIAKGDWGITQSGMWFLIILVVS LTINVIVFLIQEYKFKKDPYLDGWDGEINPNIEIEDSISIKTDLIYLKNKVFKRKEN
Sequences:
>Translated_537_residues MNTKKTKTKTFEFLTLFVMVIGTVIGSGIYMKNSELLNQTNNPIIALIL*SFVGVICIMSMIVFIEISSSTKHFGNGTLG N*AKIFINRKTASFFSIMYG*VYIPSTQSVFVAGAVNYLLLAIGAPITPYQQLLIYLVVGISIFITCTILSIYKRFINRK IQVVGILIKFLPLLIAFIAGFILIDKTGGTSA**NGGIDKNT*GTNE*SPILFLGGFGGILFAFDGYVYIANAQKTATNK DVVPKALFAGMIFVAIFYVLMALSLFMGSPDGSIVKLLEKMLGGKESAAARIISNLILMSICLLGSNIFVDIAIVDLASD ANNKTIYTKKRSMNYKEAGFIQLIIFIVAYTFLITIGISTTRDG*DGIGSAVGSGSIENVEELLNRPTDYINWFSSGTSA LVFIMVLAVMVAGVVNRFTKKVKVEQTKLFMVCGIISSLFMAIFIFFGIFAFI*EPKNIAKGD*GITQSGM*FLIILVVS LTINVIVFLIQEYKFKKDPYLDG*DGEINPNIEIEDSISIKTDLIYLKNKVFKRKEN >Mature_537_residues MNTKKTKTKTFEFLTLFVMVIGTVIGSGIYMKNSELLNQTNNPIIALIL*SFVGVICIMSMIVFIEISSSTKHFGNGTLG N*AKIFINRKTASFFSIMYG*VYIPSTQSVFVAGAVNYLLLAIGAPITPYQQLLIYLVVGISIFITCTILSIYKRFINRK IQVVGILIKFLPLLIAFIAGFILIDKTGGTSA**NGGIDKNT*GTNE*SPILFLGGFGGILFAFDGYVYIANAQKTATNK DVVPKALFAGMIFVAIFYVLMALSLFMGSPDGSIVKLLEKMLGGKESAAARIISNLILMSICLLGSNIFVDIAIVDLASD ANNKTIYTKKRSMNYKEAGFIQLIIFIVAYTFLITIGISTTRDG*DGIGSAVGSGSIENVEELLNRPTDYINWFSSGTSA LVFIMVLAVMVAGVVNRFTKKVKVEQTKLFMVCGIISSLFMAIFIFFGIFAFI*EPKNIAKGD*GITQSGM*FLIILVVS LTINVIVFLIQEYKFKKDPYLDG*DGEINPNIEIEDSISIKTDLIYLKNKVFKRKEN
Specific function: Unknown
COG id: COG0531
COG function: function code E; Amino acid transporters
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 57229; Mature: 57229
Theoretical pI: Translated: 9.68; Mature: 9.68
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNTKKTKTKTFEFLTLFVMVIGTVIGSGIYMKNSELLNQTNNPIIALILSFVGVICIMSM CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVFIEISSSTKHFGNGTLGNAKIFINRKTASFFSIMYGVYIPSTQSVFVAGAVNYLLLAI HHHEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH GAPITPYQQLLIYLVVGISIFITCTILSIYKRFINRKIQVVGILIKFLPLLIAFIAGFIL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE IDKTGGTSANGGIDKNTGTNESPILFLGGFGGILFAFDGYVYIANAQKTATNKDVVPKAL EECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHEECCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHH FAGMIFVAIFYVLMALSLFMGSPDGSIVKLLEKMLGGKESAAARIISNLILMSICLLGSN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC IFVDIAIVDLASDANNKTIYTKKRSMNYKEAGFIQLIIFIVAYTFLITIGISTTRDGDGI EEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC GSAVGSGSIENVEELLNRPTDYINWFSSGTSALVFIMVLAVMVAGVVNRFTKKVKVEQTK CHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFMVCGIISSLFMAIFIFFGIFAFIEPKNIAKGDGITQSGMFLIILVVSLTINVIVFLIQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EYKFKKDPYLDGDGEINPNIEIEDSISIKTDLIYLKNKVFKRKEN HHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MNTKKTKTKTFEFLTLFVMVIGTVIGSGIYMKNSELLNQTNNPIIALILSFVGVICIMSM CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH IVFIEISSSTKHFGNGTLGNAKIFINRKTASFFSIMYGVYIPSTQSVFVAGAVNYLLLAI HHHEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH GAPITPYQQLLIYLVVGISIFITCTILSIYKRFINRKIQVVGILIKFLPLLIAFIAGFIL CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE IDKTGGTSANGGIDKNTGTNESPILFLGGFGGILFAFDGYVYIANAQKTATNKDVVPKAL EECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHEECCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHH FAGMIFVAIFYVLMALSLFMGSPDGSIVKLLEKMLGGKESAAARIISNLILMSICLLGSN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC IFVDIAIVDLASDANNKTIYTKKRSMNYKEAGFIQLIIFIVAYTFLITIGISTTRDGDGI EEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC GSAVGSGSIENVEELLNRPTDYINWFSSGTSALVFIMVLAVMVAGVVNRFTKKVKVEQTK CHHCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFMVCGIISSLFMAIFIFFGIFAFIEPKNIAKGDGITQSGMFLIILVVSLTINVIVFLIQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EYKFKKDPYLDGDGEINPNIEIEDSISIKTDLIYLKNKVFKRKEN HHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA