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The map label for this gene is yxdM [H]

Identifier: 49187721

GI number: 49187721

Start: 4612414

End: 4614369

Strand: Direct

Name: yxdM [H]

Synonym: BAS4730

Alternate gene names: 49187721

Gene position: 4612414-4614369 (Clockwise)

Preceding gene: 49187720

Following gene: 49187722

Centisome position: 88.21

GC content: 32.92

Gene sequence:

>1956_bases
ATGACATTTTGGCAGTTTGCATTTAAAAACGTCTCGCGGAACGCCAGAGCTTATTTCGCCTATTTTGTAAGCAGCGCGTT
TTCTATTGCAATTTTTTTCTCATTTGCAGTTTACTTATTTCATCCTAAATTGCATATGACCGACGTAAATTATGCTCTGA
ACATATTAATGACAATTTCAGAAGTTGTCATCGTATTCTTTTCATTTTTCTTTTTACTATATTCAATCGGTACTTTCCTA
AAAGTGCGAAAAAAGCAATTTGGGATTTTAACAGTACTTGGCATCTCTCAAAAACAATTAAAACGACTCATATTTATAGA
AAACATGTTAATTGGTGTTCTTTCTATATTTTTTGGCATTCAACTTGGACTTGTCTTTTCACAGTTCTTTTTATTAGTTA
CCGCCAAAATTACACATGTACCTGGTTTATATTTATATTGGCCTACAAGCGCCATTATTTTAACTATCATCATCTTTCTC
GGACTCTTTATTCTCGTATCATCTTTTACACCGATGCTCATTCGTACGAGAAAAGCTGTACGTCTTTTAAAAGAAGGAAC
AAAACAAAAAGAAAGAAAAGCATCTGTGCTCATCTCTCTATTTGGTGCGATATGTTTAATATCAGGATATGCGTTAGCCG
CAAATCCATTATACTTTCTATCGCTAGGTGACATCATTGGGCTTTTATATGCCATCTCTAGTATATTTGTCATCCCATCG
CTTATTGCAGCTGGAACATATTTTTTCTTCTCACAAATTAGCTTTTTACTCATTCGTATATTAAAAGCGCGAAGAACGTT
TTATATGAAACGCATTAATATGCTTTGGATTTCTGATTTAGCATCACGCATTCGAACGAATATTAATATGCTTTTTATTG
TAGCGATGCTATCAACACTCGCTTTTACAATGATTACATTCTTATACGGTTTTGGGAAATTTACAAAGTTTGATGCGATA
AGGGAAAACCCTTTTCCTTTTACATATTTATCACATACTGAAAATACGTTAGCGGATGAACATTTAAACTGGTTAGAGCA
GAAGTTGAATGAAGAACACTTTACTTATACAAAATTTAAAACGGATATATATGAAGTATCTTCAGCTGAAAATAATACGC
AACTCTATTACGCAATTAAACAAAGTGACTATAATGTACTTGCTAAGGCTTTAAATTGGGAAACACTCACGGTAAATAAA
AATGAATCTTATATTCTTATGAAAGACTTAGATGACCAAGTTATTGGAACACTTCACAATAAAGAACAGAAAAATACTCT
TACACTTACTCAAAACAATTTACAACTACAAGTGAAAGAATATAAAAGTTATAGCCCATTCCCAAACAGCTTAATATATC
AATTACTCATACTATCTGATGAAAATGTAGAAGCCTTATCGACCGTTTCCAAGCAAATGAGTGTATATAACTTCAAAGTT
ACAGATTGGGAAAAAGCACATAATATCGGTTCATCGTTTATAACAAAAATCCATAACGACAATGCAGCAATTCAAGCAGA
GCACCCTCCTTTCCATGCAAGTGAAGCGAGCGATTCTCTATATAAAACAAAACTAAATGTCGCTTCATTTTTCTTAATTG
GTACTTTCTTAGGTGTTATTTTCTTTATCGGAGCTGGCAGTGTTCTTTACTTCCGGATGTATACAGATTTAACAAACGAG
CAAGAAAAATATATAACGATTACGAAAATTGGCTTAACGGAAACTGAAATGAAACGTTCAGCGACAATTCAGCTTGCGAT
TCTTTTCTTCGTGCCTTACATTATGGCATCCATCCATACGATGTTCGCGACAAAGATGTTACAAGAAGTTTTACATCTCT
CGTTCTTCGCTGAGATTACAGTCGTTCTTATGATTTTTGGAACAGTTGAAATTTTATTTTTCCTTTTAATTCGTTCCTTT
TATATGCAAAAATTATCACAACACATTAAGTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TATCACAATATACTAATACACATTAAAAAGGTTATTACATGAAAAAGGCGGGATCTCTTCCCTCCTTTTTCATGCTCATT
ATATTAGGAGGTTTAGGTGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATAGAAAGGTGATTATGATGGAAGAAGTATTACACATAAAAAACGTCTCGAAAGTGTATGAAGGAAAAGTCCCTCAT
ACTGCTTTAAAAAATATAAA

Product: permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 651; Mature: 650

Protein sequence:

>651_residues
MTFWQFAFKNVSRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFL
KVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGIQLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFL
GLFILVSSFTPMLIRTRKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPLYFLSLGDIIGLLYAISSIFVIPS
LIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTLAFTMITFLYGFGKFTKFDAI
RENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKLNEEHFTYTKFKTDIYEVSSAENNTQLYYAIKQSDYNVLAKALNWETLTVNK
NESYILMKDLDDQVIGTLHNKEQKNTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLILSDENVEALSTVSKQMSVYNFKV
TDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNE
QEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHTMFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSF
YMQKLSQHIKF

Sequences:

>Translated_651_residues
MTFWQFAFKNVSRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFL
KVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGIQLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFL
GLFILVSSFTPMLIRTRKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPLYFLSLGDIIGLLYAISSIFVIPS
LIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTLAFTMITFLYGFGKFTKFDAI
RENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKLNEEHFTYTKFKTDIYEVSSAENNTQLYYAIKQSDYNVLAKALNWETLTVNK
NESYILMKDLDDQVIGTLHNKEQKNTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLILSDENVEALSTVSKQMSVYNFKV
TDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNE
QEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHTMFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSF
YMQKLSQHIKF
>Mature_650_residues
TFWQFAFKNVSRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTISEVVIVFFSFFFLLYSIGTFLK
VRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGIQLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFLG
LFILVSSFTPMLIRTRKAVRLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPLYFLSLGDIIGLLYAISSIFVIPSL
IAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTLAFTMITFLYGFGKFTKFDAIR
ENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKLNEEHFTYTKFKTDIYEVSSAENNTQLYYAIKQSDYNVLAKALNWETLTVNKN
ESYILMKDLDDQVIGTLHNKEQKNTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLILSDENVEALSTVSKQMSVYNFKVT
DWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVIFFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQ
EKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHTMFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFY
MQKLSQHIKF

Specific function: Part of the ABC transporter complex yxdLM which could be involved in peptide resistance [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74971; Mature: 74840

Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTFWQFAFKNVSRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTIS
CCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH
EVVIVFFSFFFLLYSIGTFLKVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFLGLFILVSSFTPMLIRTRKAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
RLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPLYFLSLGDIIGLLYAISSIFVIPS
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
AFTMITFLYGFGKFTKFDAIRENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKLNEEHFTYTKFK
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHH
TDIYEVSSAENNTQLYYAIKQSDYNVLAKALNWETLTVNKNESYILMKDLDDQVIGTLHN
HHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHCC
KEQKNTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLILSDENVEALSTVSKQMSVYNFKV
CCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEE
TDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVI
CCHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHT
HHHCCCHHEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFYMQKLSQHIKF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TFWQFAFKNVSRNARAYFAYFVSSAFSIAIFFSFAVYLFHPKLHMTDVNYALNILMTIS
CHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHH
EVVIVFFSFFFLLYSIGTFLKVRKKQFGILTVLGISQKQLKRLIFIENMLIGVLSIFFGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QLGLVFSQFFLLVTAKITHVPGLYLYWPTSAIILTIIIFLGLFILVSSFTPMLIRTRKAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH
RLLKEGTKQKERKASVLISLFGAICLISGYALAANPLYFLSLGDIIGLLYAISSIFVIPS
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIAAGTYFFFSQISFLLIRILKARRTFYMKRINMLWISDLASRIRTNINMLFIVAMLSTL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
AFTMITFLYGFGKFTKFDAIRENPFPFTYLSHTENTLADEHLNWLEQKLNEEHFTYTKFK
HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHH
TDIYEVSSAENNTQLYYAIKQSDYNVLAKALNWETLTVNKNESYILMKDLDDQVIGTLHN
HHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHCCCEEEEEECCCCEEEEECCCHHHHHHHCC
KEQKNTLTLTQNNLQLQVKEYKSYSPFPNSLIYQLLILSDENVEALSTVSKQMSVYNFKV
CCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEE
TDWEKAHNIGSSFITKIHNDNAAIQAEHPPFHASEASDSLYKTKLNVASFFLIGTFLGVI
CCHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFIGAGSVLYFRMYTDLTNEQEKYITITKIGLTETEMKRSATIQLAILFFVPYIMASIHT
HHHCCCHHEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MFATKMLQEVLHLSFFAEITVVLMIFGTVEILFFLLIRSFYMQKLSQHIKF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8867804; 9384377; 7952181 [H]