| Definition | Bacillus anthracis str. Sterne chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005945 |
| Length | 5,228,663 |
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The map label for this gene is pip [H]
Identifier: 49183388
GI number: 49183388
Start: 388645
End: 391470
Strand: Direct
Name: pip [H]
Synonym: BAS0360
Alternate gene names: 49183388
Gene position: 388645-391470 (Clockwise)
Preceding gene: 49183387
Following gene: 49183390
Centisome position: 7.43
GC content: 34.85
Gene sequence:
>2826_bases ATGAAACAAATTTGGCGTATTTATAAGACAGATTTACGAAATGTAGCCAAACATTGGGCTGCAATTGTTATTGTTGTAGG GTTAATGATTTTACCATCGTTATATGCATGGTTTAACATTAAAGCTTCCTGGGATCCGTATGGAAATACAAAAGAGGTTC CCATTGCAGTTTCTAACCAAGATGCAGGCTCTAATTTAAGAGGGAAAGATATTAATATCGGGAACGAGATTGTAGATTCT CTGAAGAAAAACAAAAATCTTGGTTGGAAATTTGTAGATGAAAAGCAAGCAATTTACGGAGTTGAACGCGGGGATTACTA TGCGAGCATTACAATCCCAAAAGACTTCTCTGAAAAGATTGCAACGGTTCTGGATGAAAATCCACAGAAACCAGAACTTG ATTACTATGTAAATGAAAAGGTAAACGCGATTGCACCAAAAATTACAGCAAAAGGTGCATCAGGTATTACAGAAGAAATT AGTAAAAACTTTGTTAAAACAGCAAATGGTGAGATTTTTAAAATCTTCAATGACCTTGGAATCGATTTAGAAACAAACTT ACCAAGTATTGAGAAAGTAAAAGATCTTGTATTTAAGTTAGAAGCGCAGTTCCCAGAAATGAATACACTGATGGATAAGG CGTTAGATGATGCGACTCGAGCAGAGGATCTAGTAAAAGTAGCGCAAAAAGAGTTGCCAGTTGTAGAAAGTGTTATTAAT GATGGGCAAGAAGCGTTAACAAATTTAGATAAGTTCTTTGCAAACAATGATCAAACATTGCAAAATGCACCTGGGACGAT ACGAAATCATTTAACAGCGGCTAAAAATGTAATGGATAAAGCTAATGCTTTTACGGATTTTTTAATGCATCCAGGAATAG ACTTTTCTGGTATGAAAGGATTGCCTGAGTTTCCAGCGCGTCCGGATCTTTCAAAGTTGAACGATGAAGGTTATAAAAAT ATTGCAAGAAATATTAATCAAACAGTGAATAACGTTTTAAACTCGGCACGTGCAGGAACAACATACGGTAAAAGTGTTGT AAACGGATTGCAAAATGGTCAATTTGATCCAGAAAAGGCAAAACAAGATCTTAATGCGGTTTCTGAAAATCTTCAAGGTC GTACAGATAGTATTGCATATCTTATTAATGTATTTACTGAACTACAAAAATCAGCGACGACTGATTTTGGTCAAAGCTTT TTCCAAGGCCGTGTGGATCGCTTAACTAAGCTTAAAAGCGGTATGGAAAATGCAAACAACGGTATTAAAGACATTGTAAA TGTTATTGGCACAGGACAAGAAGTAAAGAAAGATGTAACAGATGTAGCAAATCAAAAATTAGATGCAGCAAATGGATTAA TTGATCAAGCAGAAAAAGATTATAATGAAACATTTGTAGCAGATTATAAAAAAGCAGTTAGCACAGTCGATCAAGCTAAA GCTGATGCAAATGAAGCGTATGATAGTGTGAAAAATGAATATGATAAGTTCAAAAATGGTGTTGAAGATGCTAAAGCAAA CATATCAAATAAAGGTGTAACTGATTTAGAATGGGCAAAAGTATCTTTAAACGATTTAAATGGTCAATTACAAGCTACTA ATAATCTAATTGGTGATGCGATTCCGGTTTTAGAAAGCACAAATAAGGTATTAGCAGATGTAAATAGCGGAAAAAACCTT AATGGCGGAATTGCAAAATTGAACAAAATACAAAATTCTGTTCAAAAAGGTATAGATGCAACGAATAAGGCAACTACACT AATTAACAATGGACAGAAGCCTACAAAAGAGGTTGTAGAAAGTATTAATGAAGCAACTCAAAATGCTTCAGCTCAATTAG GAGATTTCTTAGCAACATATGATTCAGAAATCGTTCCAAACTTTAACACAGCAATTGAACGTACGAAACGTATGTCTAAA AACACATCTCAAATTTTAAAAGAAGCAGACAAAAAGCTTCCAGATGTTAAAAAATTACTAGAAGATTCATCAAAAGGTTT AGTAGACGGTAGAAAGAAATTAGCAGATATTAAAGCTGAAATGCCAGCTACTGAGAAAAAGATTAAAGAATTAGCAGATA AAATTCGTGATTTTGAATCTGAAGAGGATTTAAAAGACATCATCCGTTTGTTGAAAAACGATGTTGAGAAGCAAAGTGAT TACTTTGCAAATCCAGTAAATTTAAAAGAGAATAAATTATTTGCAATGCCGAACTATGGTTCAGCAATGTCACCATTCTA TACAGTGCTTGCATTATGGGTAGGCGCATTATTAATGGTTTCGTTATTAACAGTAGAAGTACATGAAGAGGGCGCGAATT ATAAGAGCCATGAAATTTACTTCGGACGTTTATTAACATTCTTAACGATGGGTCTTTCACAGGCGTTTATCGTATCGATG GGAGATATATTCTTACTCGGTACGTACGTAGTCGATAAGTTCTGGTTTGTATTATTTAGTTTATTTATAGGTGGAGTATT TGTTTGTATCGTGTACTCACTCGTTTCTATTTTCGGAAACGTAGGGAAATCGATGGCGATCATTTTACTTGTACTGCAAG TAGCAGGATCGGGCGGAACATTCCCAATTCAAATGACACCGGCGTTCTTCCAAGCGATTTATCCGTTCTTACCGTTCACA TACGCAATTAGTGCAATTCGTGAAACAGTAGGCGGAATGCTATGGGATATTGTAACGCGAGATTTACTTGTGTTAAGTGC TTTCGTAGTAGTTATGATTGTTGCTGCGTTATTACTGAAAACACCAATTAACAAATCAAGTGAAAAATTCGTTGAGAATG CAAAAGGAAGTAAAATCATTCACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCGTTTTCGGTTAATCCACGATATAGAAAGTGATATAATTGCAAAATGTATGTATCATTTTCTAAAGAAGGAAAAATAT ATAATTAGGTGATAACTTCT
Downstream 100 bases:
>100_bases CATAAAAGGTTCCTACCGATAGAGGTAGGAACCTTTTTGTTTAATCAAATTTTAATTTCTTTAATGCTTCTGCGAATGGG TTATTTAATGGTTCTTCCTC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 941; Mature: 941
Protein sequence:
>941_residues MKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQDAGSNLRGKDINIGNEIVDS LKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKIATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEI SKNFVKTANGEIFKIFNDLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDLVKVAQKELPVVESVIN DGQEALTNLDKFFANNDQTLQNAPGTIRNHLTAAKNVMDKANAFTDFLMHPGIDFSGMKGLPEFPARPDLSKLNDEGYKN IARNINQTVNNVLNSARAGTTYGKSVVNGLQNGQFDPEKAKQDLNAVSENLQGRTDSIAYLINVFTELQKSATTDFGQSF FQGRVDRLTKLKSGMENANNGIKDIVNVIGTGQEVKKDVTDVANQKLDAANGLIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTVDQAK ADANEAYDSVKNEYDKFKNGVEDAKANISNKGVTDLEWAKVSLNDLNGQLQATNNLIGDAIPVLESTNKVLADVNSGKNL NGGIAKLNKIQNSVQKGIDATNKATTLINNGQKPTKEVVESINEATQNASAQLGDFLATYDSEIVPNFNTAIERTKRMSK NTSQILKEADKKLPDVKKLLEDSSKGLVDGRKKLADIKAEMPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVEKQSD YFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEEGANYKSHEIYFGRLLTFLTMGLSQAFIVSM GDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPAFFQAIYPFLPFT YAISAIRETVGGMLWDIVTRDLLVLSAFVVVMIVAALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH
Sequences:
>Translated_941_residues MKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQDAGSNLRGKDINIGNEIVDS LKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKIATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEI SKNFVKTANGEIFKIFNDLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDLVKVAQKELPVVESVIN DGQEALTNLDKFFANNDQTLQNAPGTIRNHLTAAKNVMDKANAFTDFLMHPGIDFSGMKGLPEFPARPDLSKLNDEGYKN IARNINQTVNNVLNSARAGTTYGKSVVNGLQNGQFDPEKAKQDLNAVSENLQGRTDSIAYLINVFTELQKSATTDFGQSF FQGRVDRLTKLKSGMENANNGIKDIVNVIGTGQEVKKDVTDVANQKLDAANGLIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTVDQAK ADANEAYDSVKNEYDKFKNGVEDAKANISNKGVTDLEWAKVSLNDLNGQLQATNNLIGDAIPVLESTNKVLADVNSGKNL NGGIAKLNKIQNSVQKGIDATNKATTLINNGQKPTKEVVESINEATQNASAQLGDFLATYDSEIVPNFNTAIERTKRMSK NTSQILKEADKKLPDVKKLLEDSSKGLVDGRKKLADIKAEMPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVEKQSD YFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEEGANYKSHEIYFGRLLTFLTMGLSQAFIVSM GDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPAFFQAIYPFLPFT YAISAIRETVGGMLWDIVTRDLLVLSAFVVVMIVAALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH >Mature_941_residues MKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQDAGSNLRGKDINIGNEIVDS LKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKIATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEI SKNFVKTANGEIFKIFNDLGIDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDLVKVAQKELPVVESVIN DGQEALTNLDKFFANNDQTLQNAPGTIRNHLTAAKNVMDKANAFTDFLMHPGIDFSGMKGLPEFPARPDLSKLNDEGYKN IARNINQTVNNVLNSARAGTTYGKSVVNGLQNGQFDPEKAKQDLNAVSENLQGRTDSIAYLINVFTELQKSATTDFGQSF FQGRVDRLTKLKSGMENANNGIKDIVNVIGTGQEVKKDVTDVANQKLDAANGLIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTVDQAK ADANEAYDSVKNEYDKFKNGVEDAKANISNKGVTDLEWAKVSLNDLNGQLQATNNLIGDAIPVLESTNKVLADVNSGKNL NGGIAKLNKIQNSVQKGIDATNKATTLINNGQKPTKEVVESINEATQNASAQLGDFLATYDSEIVPNFNTAIERTKRMSK NTSQILKEADKKLPDVKKLLEDSSKGLVDGRKKLADIKAEMPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVEKQSD YFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEEGANYKSHEIYFGRLLTFLTMGLSQAFIVSM GDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGNVGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPAFFQAIYPFLPFT YAISAIRETVGGMLWDIVTRDLLVLSAFVVVMIVAALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH
Specific function: Required for phage infection [H]
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 ABC transmembrane type-2 domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 103898; Mature: 103898
Theoretical pI: Translated: 5.33; Mature: 5.33
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCCEEECCC DAGSNLRGKDINIGNEIVDSLKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKI CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHH ATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEISKNFVKTANGEIFKIFNDLG HHHHCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHHC IDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDLVKVAQKELPVVESVIN CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DGQEALTNLDKFFANNDQTLQNAPGTIRNHLTAAKNVMDKANAFTDFLMHPGIDFSGMKG CCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC LPEFPARPDLSKLNDEGYKNIARNINQTVNNVLNSARAGTTYGKSVVNGLQNGQFDPEKA CCCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH KQDLNAVSENLQGRTDSIAYLINVFTELQKSATTDFGQSFFQGRVDRLTKLKSGMENANN HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC GIKDIVNVIGTGQEVKKDVTDVANQKLDAANGLIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTVDQAK CHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ADANEAYDSVKNEYDKFKNGVEDAKANISNKGVTDLEWAKVSLNDLNGQLQATNNLIGDA HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH IPVLESTNKVLADVNSGKNLNGGIAKLNKIQNSVQKGIDATNKATTLINNGQKPTKEVVE HHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHH SINEATQNASAQLGDFLATYDSEIVPNFNTAIERTKRMSKNTSQILKEADKKLPDVKKLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH EDSSKGLVDGRKKLADIKAEMPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVEKQSD HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEEGANYKSHEIY HCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH FGRLLTFLTMGLSQAFIVSMGDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPAFFQAIYPFLPFTYAISAIRETVGGMLWDIVTR HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DLLVLSAFVVVMIVAALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKQIWRIYKTDLRNVAKHWAAIVIVVGLMILPSLYAWFNIKASWDPYGNTKEVPIAVSNQ CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCCEEECCC DAGSNLRGKDINIGNEIVDSLKKNKNLGWKFVDEKQAIYGVERGDYYASITIPKDFSEKI CCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEECCHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHH ATVLDENPQKPELDYYVNEKVNAIAPKITAKGASGITEEISKNFVKTANGEIFKIFNDLG HHHHCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHEEHHHHHC IDLETNLPSIEKVKDLVFKLEAQFPEMNTLMDKALDDATRAEDLVKVAQKELPVVESVIN CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DGQEALTNLDKFFANNDQTLQNAPGTIRNHLTAAKNVMDKANAFTDFLMHPGIDFSGMKG CCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC LPEFPARPDLSKLNDEGYKNIARNINQTVNNVLNSARAGTTYGKSVVNGLQNGQFDPEKA CCCCCCCCCHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH KQDLNAVSENLQGRTDSIAYLINVFTELQKSATTDFGQSFFQGRVDRLTKLKSGMENANN HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC GIKDIVNVIGTGQEVKKDVTDVANQKLDAANGLIDQAEKDYNETFVADYKKAVSTVDQAK CHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ADANEAYDSVKNEYDKFKNGVEDAKANISNKGVTDLEWAKVSLNDLNGQLQATNNLIGDA HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH IPVLESTNKVLADVNSGKNLNGGIAKLNKIQNSVQKGIDATNKATTLINNGQKPTKEVVE HHHHHHCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHHHH SINEATQNASAQLGDFLATYDSEIVPNFNTAIERTKRMSKNTSQILKEADKKLPDVKKLL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH EDSSKGLVDGRKKLADIKAEMPATEKKIKELADKIRDFESEEDLKDIIRLLKNDVEKQSD HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFANPVNLKENKLFAMPNYGSAMSPFYTVLALWVGALLMVSLLTVEVHEEGANYKSHEIY HCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH FGRLLTFLTMGLSQAFIVSMGDIFLLGTYVVDKFWFVLFSLFIGGVFVCIVYSLVSIFGN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VGKSMAIILLVLQVAGSGGTFPIQMTPAFFQAIYPFLPFTYAISAIRETVGGMLWDIVTR HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH DLLVLSAFVVVMIVAALLLKTPINKSSEKFVENAKGSKIIH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8366036 [H]