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The map label for this gene is 46447398

Identifier: 46447398

GI number: 46447398

Start: 2110399

End: 2117607

Strand: Reverse

Name: 46447398

Synonym: pc1764

Alternate gene names: NA

Gene position: 2117607-2110399 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46447399

Following gene: 46447397

Centisome position: 87.71

GC content: 34.71

Gene sequence:

>7209_bases
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TGAATTGGGGGTGGGGGATATTAGGTCCTAAAGAACCTAAAGATTCAGATGACATGGATGATGGAGCTGAGTCAAATTTA
GATACTGATACTGAGGAAGAGCAAAGCGAGAATTTAGACTGGTCTGAAACGGTTGCAATAAACTCGAGAGAGTCTCTAGC
AGAAGAGATCCCATTTTTAAATTCACAAGAAACAGAACTAGATCCTTTTGATACAATTTCCTCTCTTAATAATGAAAATT
CTGAGCAAATATCTGCTGCTAAGTCAACTGCTGAAAAAGCAAATGAAATCACTGCCACTCGTATTTGGAATGCTATTACA
ACTGTTAGTTCTGCTTTACAGACCATTGGTTCATCTGTGAAAGCAGGGACATTTGCTGCCTTAAAAAAAGGCGGTGAAAT
GTATGTTTCAAGTTATGCGAAAAATTTAGATAAAGAAGTTCTTGTTGCAGTAGCTTATGAGCGAATTCATGCTTCGGGAG
TCGGTTCTGAATATATTGCTTTTTCACAATTTGTGACTAAAATTCTTTACGAGCCAATTACCAATTTAATTCCCTCTACT
ATCGATATAGATAAACAACTTATCAAAGACCTTTTAGATATTAATTTAGCCATTGCTTTTTCAAATCTTGCTGTGAATGT
ACAAAAAGAGGGAAAATCAATTAAAAATTTTGGGAATCAACCTGTTTTAGTTAGCATCATTTCTTTATTTGCTCAAAAAA
TTTCCGAACCTGTCGCTGAAGTAAAAATGGCACAAGTTGAAGAAAAGTATCGTGAGCATAGACAAAAACACGCTAAATTA
ATCAAAGAAATTTTTCCAAATATTGATGATGATTCAGAAAAGAAAGCTCTTTTAAATCAGTGGGCAAATGGACAGCTTTC
AGGATCTCTTTCTGATACATCGTTATTTCCTGAATTTCAAGGTTTATCAGAAGAAGTTCTCGAAGGTTATATCATGCAAG
GTGCGGACGATTCGACAAGAATTGGAAGCCGGTGGAATCAGGCGAGAATTTTAGCATTCAGTATGGAAAAAGAGATAGAA
CGTCGACAAGAACTAAAAGCTATCTTTAAACCAGCTGTTGATGATCTCATCAAATACTGTTTTCCAAACAAAGTGAAAGA
TTTGGTGATTCCAAAGCTCAATTTATCAACCATAGGCATGGGATCTTTACAAGAAAAACTTGAGGGTTTTATTTACAATT
CCCTAATGGATGTATTAACCAATCAATTGGTTGAAGCTTATAATCCACTGGAAAAAGATCTTACACTTAGACAAGGAAGA
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AGGAAAAAAATTTATACAGACCGATCCAAAAGTGATTAGTTTGGTAGAAGATATTTTAAATACACCTAGCCTAGCTGTTC
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ATGTTGCATACGAATGATCCCAACCTACTTAAGGTGGGTTATTTTACCCAAGGTGTTTTGAGAAATTTAACTCTATCTTT
ATTAGCTCAAGGAGCAGAATTAGTTATCCCTGAAGGTCAAACAATTGATGAAGGTCAATTTATTAAGGAATTAATAGACC
GGATTCTAGCAAAAATTAAAACGATTGAAGGGGGAAAAGTTATCTCTGACGAATTCTTAAAAGATTTTGCACGTAAATTA
CCTTTACCTGAACTTTTAATAGAAAAATTGCTGATACCACGGCTCATAGAGAAAGCAAAAAGTTTGCAGAATGTACTCAC
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TTATTTTCAAATATTCATCAAGCTTTTCAAAAAGCTTTTCCTGTATTAAATGCAGAAAAAATTGAAGAAATGAAAACGGC
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TGAGTGATTTAGCAGTCATTCGATCGCTCAAATTGAAATTGGATGACAAATTAGCTTCATCTGCCGCTTTAATTGATTTG
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TTCTGAAGCGATGGTGATGGAAAAAACGCTTCAAAATGCGAATAAAGAGCATGATTATCTGTTGAAGGTTTTACAAGAAA
AGGAAAAGGCCGTTCAAAACGAAAAACCTTCCATTAATCAAGCACAATGGGATCAAGCATTAATTCAGAAAGGTTTTATT
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GTTCCAAGTTCTGGTTAATGAATTGTCAGGCTTAATTGGTCTGGGCCAAAAAGAAAAATTAGAGCTCCCAGTCGCCATTC
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ATTTTAACTATTGTTGAAGCAAAATCTAATCAACAGATGTTGGCTTCAATGGGAACAGGAAGCCAGTTGTTAGCTCAACT
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TAAAGTTGGGTAACATTATAGACCCTTCTGAAGGTCAAATTGTTGCTATGGAACAAGCCTTAACTGATGAAATGCAAAAG
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AAGAGCTTTATGAATTAAATCTGGATAAGAAATCGAAAGAATTGGTTTTAGAGCTTCATCACATGTCCATTCAGTTAGGG
AAAGAACACCTTACTACCGAATTGTTGGTTTCAGCGTTTGAAAGAGCTTTAAATCAAACGTTAGATGAACAAGAACAAGA
ATTTTTGAAAGCTTCTTTAGAAAATCAAAAAATACTTGGACACATCAAGAAGATTCTCTTGACTCCTGAACGTTTAGCGG
AATTATTAAACGATGCTATTCCTGGAGCAAGCAGCTTGCATACTCTAATGGCTCCTCAAATCCAAGAGATGTTATCTGGC
ACGGGAACTGTTTTTCAAGGTAATTGGAGTATACTTGAGCGTTATATAGAAGGAACTTTATTAAAGGTTTTTGTTAAAAT
TGCAGAAACTAATGAAGGAGAAAATTCTTTAGCTGTTATTGGTGAAAAATTAAACAATTTTATTCAAGATCCAACGCTAA
TTCAAGGTCGTTCCAAAGAAGAAGCGGCTAGCTTGGTGACAGAAAAAATATTAAAAAATATTTTAGGCGTTCAATCTGAG
CAAGATATTATTGGTATTCCAGCAGTTTTGCAAAAAATGGCTTATCAAATTCTTAAAGAACAGGCTTATGAACACTTAAG
TCCCGTTCTTTTGCCTATGATAGAAAAAGAGCAAAATAAAGAAATACTTAAGCATGCCTCAGGCTCCAAGCTGCTTGGAA
ATCTCGCCCGAGCTTTTTCAAAAGATGTATTTAAAGTTTTTCCTTCCGTTTTTAGAAGCTTGCGCCCAACAGCCAATCTT
ATTTTTAAGGATTTAGCCGGACGTGAACCGACAAGTGCTGAACTTGATGAATTTACACACAAAATTGCAGAGTTGACAGA
GCATGCTCGCGAGCAAATGATCACGAATAAAGCTGTAGTAGATGCCTATTTACAAACGGCGCATCTTCATATAGAAAATG
AAGTTGAATTTACAAATCTCATTCAAATTATTGATCAAAAAAGTTACAGGGATCAACTTTTTATACTTTTGGAAGAGTTA
TTTGATGTATTAATAACCCCTGAGCAAGTCACTAACTCCTTGCAAAAAGGTTTACCTCAAATGAATGGAATTATTGCTCA
ACAGTTAGCGAATCAACTTGAATCAACAACGCATTTAGATAACCCAGCCTATCAAAATTTGAGCGGATTTGCCTCAAATT
ATGTGGAATCTATGTTTTTACGATTGTTCGTAAAAATAGCTCAGAAAAATCCTCCAAGTAGAGGTAAGGATAGTTTAATT
GTTTTAACTGAAAAACTGTTGGCAGTTGTTGAGCGCAAATACCAAGAAGCTAAAACTAGGCAGATCGAAGTTGTTGCGCA
AGAACTCAATGACGAAGTTTTTAAAGAAATTTTAGGATTAGATTCTGAGGAGGCTTTTGAAGGAATTCCAGAACCTTTAA
GAAAAGTAGTGTATGATGCTGTTAAAGATCAGCTTAACCAATTAGTTCTGCAAATTCATCACCATGTTTCTGAAACAGCA
GATCAGCAAAATCAGACTATTCTTCATACCAAAGAATCATTAAAAAAATACGGTGTGGAAGCTCAAACAGGTAAAGCTTA
TGTCGATATTATAGTAGAGGATATATCTCAGGAGGTAATGAGAGCTATTCTTTCTATCATCAATGAAGCAGGACCTAATG
GAAACCGTTTGATTAATAAAGCGACGACTGGAATAAATAGTTATTTAGAAGATTTATCAAAAGCTAATTTTGAAGTCGCT
AAAATATTGCTCAATTATGCAAAAGCACCAGCCTTCCAACAAATGGTTGGAGAGAAAATTGAAAAAGTTTCAGCTTCGGA
TGTTCTAATCGAAGATAAACAAAAAGTGGCTGCTCTTGTAGGTAATCTCGTTTTAGGAAATCTGCATCAGCTATTTGAAC
GAGTTATTCATTTTGAAGAACAGCAGGGTGCGCAATTCAATCGTAATTTGATGAGTAATCTTTTCAGCGTAGTTGGTAAA
CATATTGAACTATATAACAAAGCTAAAAAAATAGCAAAAGTTGCAGGTAGAAACCACATTAGCCATGAAGATTTTGTAAA
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GTTTGAACGAACGCTTAACAATTGAACAGCAAAACCTTTTGAAGATCGAGTTAGCAAATATGGTGGCTTTACAAGAAAAA
GGGGACGAGGCTATATCCATCAACAAATTGGTTGGAGTCATCGAAAAAATACGTGGCGTCCCTCAAGGTGCTCAACCTCT
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TTATTAAAGCTCAAAGACAAACACATTTTCACGATCCTGCGACTAAAACATTGATGAAAATGTTATTTCCAAATGGTAAA
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TCAGTCGTTTGTTGAAACTGTGCTTGATGAGGCAAATGTTAAAAAAATTATTTCAAGCGCACTAGCAATTACTCAAGAAA
CTTTAAATAAAGAAATTGTTTTAGATACAACTCCTCCTGAAGATCCTTCTTTAGAACAATTGAATGATGCATCCGCAGAG
TTAATAGCGGCTGTATTAGAAATGATTGAATTGCCTGCAGTCGTAAAAAATAAATTGAGAAATTCTAAAACGGGTAAAAT
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TGGGGCTTAATCTCAAAAATGCCTTGGATATCTTATTTAATTTTATTTTCTTTAAAATAATTGGGTCTGTTCTTGAATTT
ATTTATGACAAAACAGGGCTTAAAAAGTTAATGAAAAAAATTCTTTATAATTTCTTATCTCTAGATGCCAATCGCGAGAG
AATTTTAGATTTCTTAACTTGTACACCAGATAATCAACCGGTGGATTCTCATCCTTTACATCTAGAAGCGTTGGTTTACA
ATTTAGCGAAGGAAATACAATTAACTGTAGAAAAAGCTTTAAGAGAAGATGCTTTTTCTTTTCCAGTTGAAGAAAATAGT
GTTTCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATTATTTTTTTTTGAGTATCGATTTACTAATATAATTTTATTTGTTAAAATATAGTTATGTTAAAAATTATAAAATTA
TAAATAATTTTTAGGTTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGCTTGTTTTAATAAAGATTTTAGCTAAATGGGTAATTTATTTTATAGGAGGCTAGGCTAGCCTCCTTTTCATTTAAAAT
TTTTTTAAAAGAAAAAAATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 2402; Mature: 2401

Protein sequence:

>2402_residues
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VS

Sequences:

>Translated_2402_residues
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VS
>Mature_2401_residues
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S

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 269403; Mature: 269271

Theoretical pI: Translated: 5.28; Mature: 5.28

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.6 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAPINSVTPSSHRSQSDQSNTNDVNNDTTEARTDEKAQNVLNGQTYRGGFFNPLNWGWGI
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
LGPKEPKDSDDMDDGAESNLDTDTEEEQSENLDWSETVAINSRESLAEEIPFLNSQETEL
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCC
DPFDTISSLNNENSEQISAAKSTAEKANEITATRIWNAITTVSSALQTIGSSVKAGTFAA
CHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCHHHHHH
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HHCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
IDIDKQLIKDLLDINLAIAFSNLAVNVQKEGKSIKNFGNQPVLVSIISLFAQKISEPVAE
CHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHEEEHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VKMAQVEEKYREHRQKHAKLIKEIFPNIDDDSEKKALLNQWANGQLSGSLSDTSLFPEFQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHC
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CCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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CCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
ERVIQDRIGDVNIEGLIDAPAALILNLGKKFIQTDPKVISLVEDILNTPSLAVQPQTTSA
HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCHHHH
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LDANRERILDFLTCTPDNQPVDSHPLHLEALVYNLAKEIQLTVEKALREDAFSFPVEENS
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VS
CC
>Mature Secondary Structure 
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CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
LGPKEPKDSDDMDDGAESNLDTDTEEEQSENLDWSETVAINSRESLAEEIPFLNSQETEL
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHEECCCHHHHHHHCCCCCCCCCCC
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GLSEEVLEGYIMQGADDSTRIGSRWNQARILAFSMEKEIERRQELKAIFKPAVDDLIKYC
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CCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC
VS
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA