Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yueF [H]

Identifier: 46447158

GI number: 46447158

Start: 1828303

End: 1829448

Strand: Reverse

Name: yueF [H]

Synonym: pc1524

Alternate gene names: 46447158

Gene position: 1829448-1828303 (Counterclockwise)

Preceding gene: 46447161

Following gene: 46447157

Centisome position: 75.77

GC content: 31.15

Gene sequence:

>1146_bases
ATGGAAAATGATAAGCCTTTTGTAGAAAAGAGAGTCGTTAAAAGAATATTTTCTCCGTGGTATTATAACCAATATTTTAA
ATATTCTTTCGGAATTTTACTTGGTTTATTAATTATCTTGGTATTTTCGTATGTCGCTACTACTTTATCACCTATTTTTA
ACTTTGTTTCTTCTCTTTTTATTCCCATTGTTTTTTCTTTTTTATTTTACTATCTCTTAAGACCTTTAGTTTGTTTTTTT
GAACATTTAAAAATGTCGCGCTTCTTTAGTATTTTATTGACCTATGTCTTGATTGGAATCGTATTAGTAATCTTTTTTGC
TTATTTGCTTCCTATTTTAGCTACGCAAATTGTAGCTTTTGCTAATACCTCGGTAGAAACTTTGGAAAAAGTTAAAAACT
CTTCCCAAACCTTTGTTTTACCAACTGGATTTAAACTTGATTTAGAGGGAGAAATTGAACGGAGGCTACTAAATTTAATC
CAATACGCGACAGCAATTTTGAGTCAAAATTTATTAGATATTGTAGGATATCTTACACGTTTAGCCACAATTTTAGCAGT
CATCCCCTTCATAGTCTTTTATTTGTTAAAAGACGATCATGATTTTGCTTCGGGATTTTTACAGCATCTTCCTCAAGATT
TTGGACAAAATGTGCGCAATATTTTAAAAAATATAGATGAAACGCTATCCAATTATATTAATGGACTCGTATTAATTTCT
TTTAGTGTTGGAAGTATGTTATTTATAGGCTATTTAATCATTGGGTTAAAGTACGCTTTGATCTTATCGATTATGGCTTT
AGTTTTAACAACGATTCCTTATTTGGGGCCTTTTTTAGCTATTACGCCCGCTGTATTAACAGGGTTATCACATAGCCCTA
CAATGACTTTAAAAGTCATTGCAGTATTCGCTATTGTTCAACAAACGGAATCAAATATTGTGTCTCCACAAATTATGGGA
CAAAGGCTAAATATTCATCCTTTAACTCTCATTTTACTTCTTTTAGCAGCAGGATCTCTGTATGGGTTAATAGGATTATT
ATTAGCCACACCTTTCTACGCCATTTTAAAAGTATTAGCCGAAAATTTTTATAAAATATACCTTCTTCGTTATCCAAAGA
TGCAGGCTAAACTATACCAGCCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGAGCTTGAAAACGCATTGCTTTAAATAAGTAAAGGCAGTTAGATAAATAGCAGACGAAGAAAGAAATAAAAAAAGCATT
TGTAAAAATTCAGGAATCTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAAGGGATATTGATCAAAAAAAGATAATTAGGTGAAAAAATTTCCAAATCTGTAGCATAAAAGAGTATTGATCTATCGTT
GGAAGTCCTGACTGCTCCCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 381; Mature: 381

Protein sequence:

>381_residues
MENDKPFVEKRVVKRIFSPWYYNQYFKYSFGILLGLLIILVFSYVATTLSPIFNFVSSLFIPIVFSFLFYYLLRPLVCFF
EHLKMSRFFSILLTYVLIGIVLVIFFAYLLPILATQIVAFANTSVETLEKVKNSSQTFVLPTGFKLDLEGEIERRLLNLI
QYATAILSQNLLDIVGYLTRLATILAVIPFIVFYLLKDDHDFASGFLQHLPQDFGQNVRNILKNIDETLSNYINGLVLIS
FSVGSMLFIGYLIIGLKYALILSIMALVLTTIPYLGPFLAITPAVLTGLSHSPTMTLKVIAVFAIVQQTESNIVSPQIMG
QRLNIHPLTLILLLLAAGSLYGLIGLLLATPFYAILKVLAENFYKIYLLRYPKMQAKLYQP

Sequences:

>Translated_381_residues
MENDKPFVEKRVVKRIFSPWYYNQYFKYSFGILLGLLIILVFSYVATTLSPIFNFVSSLFIPIVFSFLFYYLLRPLVCFF
EHLKMSRFFSILLTYVLIGIVLVIFFAYLLPILATQIVAFANTSVETLEKVKNSSQTFVLPTGFKLDLEGEIERRLLNLI
QYATAILSQNLLDIVGYLTRLATILAVIPFIVFYLLKDDHDFASGFLQHLPQDFGQNVRNILKNIDETLSNYINGLVLIS
FSVGSMLFIGYLIIGLKYALILSIMALVLTTIPYLGPFLAITPAVLTGLSHSPTMTLKVIAVFAIVQQTESNIVSPQIMG
QRLNIHPLTLILLLLAAGSLYGLIGLLLATPFYAILKVLAENFYKIYLLRYPKMQAKLYQP
>Mature_381_residues
MENDKPFVEKRVVKRIFSPWYYNQYFKYSFGILLGLLIILVFSYVATTLSPIFNFVSSLFIPIVFSFLFYYLLRPLVCFF
EHLKMSRFFSILLTYVLIGIVLVIFFAYLLPILATQIVAFANTSVETLEKVKNSSQTFVLPTGFKLDLEGEIERRLLNLI
QYATAILSQNLLDIVGYLTRLATILAVIPFIVFYLLKDDHDFASGFLQHLPQDFGQNVRNILKNIDETLSNYINGLVLIS
FSVGSMLFIGYLIIGLKYALILSIMALVLTTIPYLGPFLAITPAVLTGLSHSPTMTLKVIAVFAIVQQTESNIVSPQIMG
QRLNIHPLTLILLLLAAGSLYGLIGLLLATPFYAILKVLAENFYKIYLLRYPKMQAKLYQP

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=347, Percent_Identity=28.2420749279539, Blast_Score=113, Evalue=2e-26,
Organism=Escherichia coli, GI87082271, Length=338, Percent_Identity=24.2603550295858, Blast_Score=72, Evalue=4e-14,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 43185; Mature: 43185

Theoretical pI: Translated: 9.50; Mature: 9.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MENDKPFVEKRVVKRIFSPWYYNQYFKYSFGILLGLLIILVFSYVATTLSPIFNFVSSLF
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPIVFSFLFYYLLRPLVCFFEHLKMSRFFSILLTYVLIGIVLVIFFAYLLPILATQIVAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANTSVETLEKVKNSSQTFVLPTGFKLDLEGEIERRLLNLIQYATAILSQNLLDIVGYLTR
HCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LATILAVIPFIVFYLLKDDHDFASGFLQHLPQDFGQNVRNILKNIDETLSNYINGLVLIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSVGSMLFIGYLIIGLKYALILSIMALVLTTIPYLGPFLAITPAVLTGLSHSPTMTLKVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
AVFAIVQQTESNIVSPQIMGQRLNIHPLTLILLLLAAGSLYGLIGLLLATPFYAILKVLA
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ENFYKIYLLRYPKMQAKLYQP
HHHHHHHHHCCCHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MENDKPFVEKRVVKRIFSPWYYNQYFKYSFGILLGLLIILVFSYVATTLSPIFNFVSSLF
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPIVFSFLFYYLLRPLVCFFEHLKMSRFFSILLTYVLIGIVLVIFFAYLLPILATQIVAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ANTSVETLEKVKNSSQTFVLPTGFKLDLEGEIERRLLNLIQYATAILSQNLLDIVGYLTR
HCCCHHHHHHHHCCCCEEEECCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LATILAVIPFIVFYLLKDDHDFASGFLQHLPQDFGQNVRNILKNIDETLSNYINGLVLIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSVGSMLFIGYLIIGLKYALILSIMALVLTTIPYLGPFLAITPAVLTGLSHSPTMTLKVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH
AVFAIVQQTESNIVSPQIMGQRLNIHPLTLILLLLAAGSLYGLIGLLLATPFYAILKVLA
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ENFYKIYLLRYPKMQAKLYQP
HHHHHHHHHCCCHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]