Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46446413

Identifier: 46446413

GI number: 46446413

Start: 959785

End: 961752

Strand: Direct

Name: 46446413

Synonym: pc0779

Alternate gene names: NA

Gene position: 959785-961752 (Clockwise)

Preceding gene: 46446412

Following gene: 46446415

Centisome position: 39.75

GC content: 31.81

Gene sequence:

>1968_bases
GTGAATGTTTTAGAAAAGAGAGTGGAAAATCAAGTTCAATTTTGGTCACTTTTAGGTCCATTTTTAATTCTTCTCTCGAT
AGCTGTTTTACTTTTTAAGGTCTCTTCACATTGGTATTTTCCTTTAAGTGCTTTAATTGGAATTCCTCTATGTGTCAAAT
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GAGCAATTTTGGCACGTTGGAATGGCTTTAGCAATGGCCTTTTCTTTCATTGTTTTGACCCTGTCTTTAGAAGAGGTTGA
GGGGTTGGTTGATAAATTACAACTTGAGTCTCAAAGCCGTTTAGACAATTTTTTACGTTTAGAAGAAAAGCTAAAGACAA
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GATGAAAAACAGACATTTTATAAGCTCGCTTTACTTTCTAAAGATGAACTTTCTCACTTCAAAAGTGAACATGACAAACT
TTTACAGGAACTATTTTACAAAAAGCAGTCAATTGCTCAGTTGAATGAAAAATTGCATGATTCAGAAATGCATTTACAAG
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AGAATACTTAAAACAGTGTGAAGATTCTCAAAAAGAAATCGAAAGCCACCAGATTTTAATTAAAAATTTTCATGATCAAT
ACCAATGTTTAGAAAATGAGAAAAATGATATTCAATCCCATCTAATATCTGTGCAAACTCAATTGGAGCGAACAACTTTT
CTTATTCAGCAAAATGAATCATTTATTCAAATACAAACCCATAAAATTCAACAATTGGAACAATTGTTGGAGCAAAGAGA
AACTGAAATTCAGTTGCATGCAGAAACAAAGATTTCATTGCAAAATCAACTTGTTGGAGAAGAAATTTTAAAAAAACATG
GGGAAGATTTAAAGTACAAGTTAGAGCAGCTTCAAACTCAACATGATCAAGAAAAAGACACACTTGAACAACAGCACCTA
TTTCAACAAAACCAACTACGGGGGCAGTTAAATCAATTAATGCAAGAAATTGATGATTTAAATAGTCAAACCTTAAATTA
CCAGGCTCAAGGCGAGAAAATTCAAAAAATTCAAGTGCAGCTTCAGTTGTCTCAAGAATTAAATCAAGAATTAGAGCAAG
ATTTAGAGGAGCTTCGTAAAAAGCTTTTAACTTACAAACAAGAGCTAGATGAAAGCAATCAGCATCTGATCGAAATAGAT
TTATTAAAACAAAGTAAGCTCGGATTAGAACAAGAATTAGGTCTGATCACTGAGCAATTGAAACAGAGTCAACAAGAAGT
AGATCAGTTAAAAACTGTAGAAAACCAATTGATTTTAATGACAGAAAATAATCAGTTGCTAGAAAAAACTGTCGATCAAC
TTAAAAAAGAATTTTTAGAGTTACAAGAAAAAACAAGCTCTTTTCAATTATCTGAACAGCATAAAAATTTTACGGAAATT
CAATTTCGCAAAATGGAAGGCCTTTATCTTCAACTTAGAAAGCAATTTCAAGAAAAATCAATGGTCCTTGACAAAACACG
ACAAGAGCTCTTTTTGACTCAAGAAAAAATGACTAGCTTATACAAGTCTATCGAAGAAGAACAGATTTTTGATTTTTCCG
AAAATGAAAGGTTTTTACAAAAAGATTTACATATTTTATCGGTAGAGTATGAGAAAGCCATTTCAGATTATAAGGATGAA
ATAGACGAAATGTCAGATTTGATCTCCATTTTATTGAAACAATGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGTTTGATTCAATAGAACTACAGCTTCAAATTATTTTAGATTAAAGTTTTAATTTTATGCGTACGCAATTAGCAGTTAA
TGAAATGAAGGAATCTCATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTTATCTCAAAACTTGGGGTTGGTTTATTCATTTAGAATCCCTATAAACTATCAGCAGCTTTACACCAAATAGTGAGAG
GTTGATTTGAGACTGAATCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 655; Mature: 655

Protein sequence:

>655_residues
MNVLEKRVENQVQFWSLLGPFLILLSIAVLLFKVSSHWYFPLSALIGIPLCVKWKIKGMAAALGCLLSFSVVGYLSIDLD
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LIQQNESFIQIQTHKIQQLEQLLEQRETEIQLHAETKISLQNQLVGEEILKKHGEDLKYKLEQLQTQHDQEKDTLEQQHL
FQQNQLRGQLNQLMQEIDDLNSQTLNYQAQGEKIQKIQVQLQLSQELNQELEQDLEELRKKLLTYKQELDESNQHLIEID
LLKQSKLGLEQELGLITEQLKQSQQEVDQLKTVENQLILMTENNQLLEKTVDQLKKEFLELQEKTSSFQLSEQHKNFTEI
QFRKMEGLYLQLRKQFQEKSMVLDKTRQELFLTQEKMTSLYKSIEEEQIFDFSENERFLQKDLHILSVEYEKAISDYKDE
IDEMSDLISILLKQC

Sequences:

>Translated_655_residues
MNVLEKRVENQVQFWSLLGPFLILLSIAVLLFKVSSHWYFPLSALIGIPLCVKWKIKGMAAALGCLLSFSVVGYLSIDLD
EQFWHVGMALAMAFSFIVLTLSLEEVEGLVDKLQLESQSRLDNFLRLEEKLKTMEHTWFVEKESIQGQVISLTNDLTQIQ
DEKQTFYKLALLSKDELSHFKSEHDKLLQELFYKKQSIAQLNEKLHDSEMHLQEYINTDSASTISKLKQNISNLEEEKEL
IDSQFQELKKDHEHLLEVFYKSQQNEKEYLKQCEDSQKEIESHQILIKNFHDQYQCLENEKNDIQSHLISVQTQLERTTF
LIQQNESFIQIQTHKIQQLEQLLEQRETEIQLHAETKISLQNQLVGEEILKKHGEDLKYKLEQLQTQHDQEKDTLEQQHL
FQQNQLRGQLNQLMQEIDDLNSQTLNYQAQGEKIQKIQVQLQLSQELNQELEQDLEELRKKLLTYKQELDESNQHLIEID
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QFRKMEGLYLQLRKQFQEKSMVLDKTRQELFLTQEKMTSLYKSIEEEQIFDFSENERFLQKDLHILSVEYEKAISDYKDE
IDEMSDLISILLKQC
>Mature_655_residues
MNVLEKRVENQVQFWSLLGPFLILLSIAVLLFKVSSHWYFPLSALIGIPLCVKWKIKGMAAALGCLLSFSVVGYLSIDLD
EQFWHVGMALAMAFSFIVLTLSLEEVEGLVDKLQLESQSRLDNFLRLEEKLKTMEHTWFVEKESIQGQVISLTNDLTQIQ
DEKQTFYKLALLSKDELSHFKSEHDKLLQELFYKKQSIAQLNEKLHDSEMHLQEYINTDSASTISKLKQNISNLEEEKEL
IDSQFQELKKDHEHLLEVFYKSQQNEKEYLKQCEDSQKEIESHQILIKNFHDQYQCLENEKNDIQSHLISVQTQLERTTF
LIQQNESFIQIQTHKIQQLEQLLEQRETEIQLHAETKISLQNQLVGEEILKKHGEDLKYKLEQLQTQHDQEKDTLEQQHL
FQQNQLRGQLNQLMQEIDDLNSQTLNYQAQGEKIQKIQVQLQLSQELNQELEQDLEELRKKLLTYKQELDESNQHLIEID
LLKQSKLGLEQELGLITEQLKQSQQEVDQLKTVENQLILMTENNQLLEKTVDQLKKEFLELQEKTSSFQLSEQHKNFTEI
QFRKMEGLYLQLRKQFQEKSMVLDKTRQELFLTQEKMTSLYKSIEEEQIFDFSENERFLQKDLHILSVEYEKAISDYKDE
IDEMSDLISILLKQC

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77494; Mature: 77494

Theoretical pI: Translated: 4.64; Mature: 4.64

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNVLEKRVENQVQFWSLLGPFLILLSIAVLLFKVSSHWYFPLSALIGIPLCVKWKIKGMA
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCEEEEEHHHHH
AALGCLLSFSVVGYLSIDLDEQFWHVGMALAMAFSFIVLTLSLEEVEGLVDKLQLESQSR
HHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDNFLRLEEKLKTMEHTWFVEKESIQGQVISLTNDLTQIQDEKQTFYKLALLSKDELSHF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHH
KSEHDKLLQELFYKKQSIAQLNEKLHDSEMHLQEYINTDSASTISKLKQNISNLEEEKEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDSQFQELKKDHEHLLEVFYKSQQNEKEYLKQCEDSQKEIESHQILIKNFHDQYQCLENE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KNDIQSHLISVQTQLERTTFLIQQNESFIQIQTHKIQQLEQLLEQRETEIQLHAETKISL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEHHHHHHH
QNQLVGEEILKKHGEDLKYKLEQLQTQHDQEKDTLEQQHLFQQNQLRGQLNQLMQEIDDL
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NSQTLNYQAQGEKIQKIQVQLQLSQELNQELEQDLEELRKKLLTYKQELDESNQHLIEID
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEE
LLKQSKLGLEQELGLITEQLKQSQQEVDQLKTVENQLILMTENNQLLEKTVDQLKKEFLE
EHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LQEKTSSFQLSEQHKNFTEIQFRKMEGLYLQLRKQFQEKSMVLDKTRQELFLTQEKMTSL
HHHHHHCCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YKSIEEEQIFDFSENERFLQKDLHILSVEYEKAISDYKDEIDEMSDLISILLKQC
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
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YKSIEEEQIFDFSENERFLQKDLHILSVEYEKAISDYKDEIDEMSDLISILLKQC
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA