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The map label for this gene is 239616427

Identifier: 239616427

GI number: 239616427

Start: 21224

End: 24001

Strand: Direct

Name: 239616427

Synonym: Kole_0016

Alternate gene names: NA

Gene position: 21224-24001 (Clockwise)

Preceding gene: 239616426

Following gene: 239616428

Centisome position: 0.92

GC content: 41.32

Gene sequence:

>2778_bases
GTGGAAAATAAAGCTTACAACAGCACTTTCAAAGCTCAACTTTTTATCTATTATATGATGAGTGTGGTGATACCACTTTT
CGTTGTTAAGAACTTCACCCACGAACCTTCAACAGGCAAACATCTTCTTTATGTAATAGGTTTCACGATTATTATTCTGT
CCGCGCTTTTTAGCAATAAAAAAATCACAATTAAATACTCTTACGTTCATCTGGCTGCTCTGGGATTTGGTATCACAGCT
ATTCTATCCCTTATCTCTGTCAGTGCTGAGAACCCCCAGTACTTCCGCTACTCTCTCGATGTTGCTTTGTTCGCACTCTT
TGTCGTTCTAACATCTTTCTACATCTCAAAAGAATTCGATACAAGATTAAAAATAGAATTTGCCATGTTTTTCTTCATCA
TCGGTGCTTTTGTTGTTGCGATTGACGCGCTCCTTAACTATTATGCTGGTTTCGATCTCTTTCTCGGAAAGGTGGGGGCC
CCATTCCAGAGAGCTTCGGCACGTTCAACTATAGGAAATCCGAATTTTGTTTCCGATTATATGGGGCTTACCATTCCAAT
GATCATCTACTTCCTTGTAAATCCATACCCGCTGAAAAAAGTTGTGAAATCTCGTATGGGGATAATCCTATTGAAGAGTT
CCATGCTGCTCTTCCTCGCTCCTATGATCGCTGCGGTATTCGTTGCCGAAACGCGAACGGTCATGACGGGAATATTGTTG
GGAAACCTGTTGTTCATCATTGTTTATCTGCTTTTATCAAGGAAATTCCAGCATGAAGAAGATCCAGCGCTTGTAAAACT
ATCACGAATTTTCATTGTTGCGGCACTGGTTCTTGCAATAGTTCTCTCAATTCTATACCTCACTCCTTCTCCTCTAACCG
GTAAGGGTAAGTTGAATATAACCCGGAGACTCGAATACGTATTAACTTCTTCCAAATCGTGGAAAGAGAGATTTTCCGCG
TGGTTTAATTCCATCTACCAGTGGATAGATCCTTCACATCCTTCAAGGATCATTTTTGGAACGGGAATTGGGACGTTCCA
GCTTTATCATCTTCTCTATTCACCTTACGTTATTCAGGAACATCCAGATTATACAGTTGTATGGAATAACTTCAAGAGAA
CCCACAACGATTATGTTCAAGCTCTCAGCGAAACAGGGATTCTCGGTTTTTCCATGGTAGTGCTCTTTTTGATCTTCATG
GTGTCACGTTACTTCCGAACTATGTTAAGGCTAAAAAACAAAACGGATATTCTCATGTACGGAGCATTTGGCGCGGCGAT
ATTCTCATTAGCCATGCATACGATGTTTGAATTTCCACTCCATATGCAGCCCAACCTGATGGCCGGGGTTTTCATAATGT
CCATTACTATGGGAACATACTTCAATGATGACCTAAAAGAACTGCAGATCTCAAGAACTGCTCTGGCGATACCCTTTGTA
ATACTCAGTGGAACCATTATTTTCTTAAAGACCACTGCTTATCTCGGTGAAGGCTTTTTCCGCAAAGGGCAGGTCGCCCA
GCAATATTATTATGCATACGCAAGAGAGGCTATCAAGAGAAACCCGGTTGTTATAAAGAACAAACTGAAAGATCTGGAAA
ATTACCGCGGTGAATTTGCTTACCTTAAGAATGTCGGAAATTACTATGCTGCCAGAGAAAAAGAGCTCAGAAGTAAATTC
GGCGGACTCTCTCAGGTAGAGTTCTTGAAAGCAATAGAATCAGAAAGAAAAAAGGAATTTGACGCCATCAGAGCGAATCT
AATGCGGGAACTTCAGACAGCAGAAGCTCTTCAAAGTAAAACGCGTGCATACTACAACAGGGCAGTCGATTACTTCGAAC
GTTCTTACAGGATTTACCCGGTTTTCGGAAAACCTCTATGGTATCTTGCTGCCTTTGGTATCAAACCCGAAAGGGTTTAT
TCCCTTTCCTCTGATAAAGAGAAAGTGATTCAAACATTGATGGGAGAGGATCCATACGCTGCCCTCATAGTAGATGAGTT
CAAAGGAGATCTCAGGGTTATACCGTTACCCGAGAGAAATATCCGTACCATTCCTTTCAAAGAATTTGTGAAAGCACACA
AAGAAAAACTCGCAGAACTTTCAGACAAGCTATATCTTTCTTTCCTTGCGCAGATCCAGGCGGTTCTCGACTCGATAGAT
TACTATGAGTCATCGATGATATTCTTCAGTGAGCGTCAGACCCCAAAAATCGTTGGAGGCCTTTATAAAAAGGTTTACGA
AGAGCTAAAAAGATATGGTTCTTTCCTTTTGGTGCGCGAGAAATTATATTCTGATACCATCGATTTGGCTGATCTTTTAA
TGCAAATAGAGAGGTTCAAAAATTATGCAAAGACACAGATGTACTACTGGTACGATCTGGCCGTAACGCTTCTCCCCGGT
ACGTGGAACCGCTACAGTGACTGGGAAGGAATTTACGGTGAGTACATGACGGCGGTAGTATCAGTAGGCGGAGATACAAC
GGCTGTTTCCAATAGAATTCTTGAAATAGCCAAAAAACATGCCTTTGCATGCGAAGGAATGTGGGAAGGAGGATATTATG
GTATTCCGGATGATACTCTTGGAATCGCTTTGAAGTACGCCGGGAACCTAAAGGAAAAGCATCAGAAAGAGTACGAAAGG
TTCATGAGAGAACTATCAGAAATCTATCATGGCGTTTACGTGAAGACAAAAGAAGGACTCTCTAAATTCCGTTCTGAGGA
GTTGAAAAAGAGAGCTGAAAAGTTCATAGAACTTTACGAAAAAATCAGCACTAATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCAAAGGATCTCAACATATTCTCTTCTCATCGGGTTTATCATAATGACTCTTCTGGATAATTTGCTCGGTTGATTTTGT
AGATGTCAGAGGTGATTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTAAATTCTGATAAAATCAGGAATACAGGCGTATAAACCATGATATAATTAAAATAACCAAAAGACGGAGGTGTACTATG
AAGCCGAAGTTTTATGTTAC

Product: O-antigen polymerase

Products: NA

Alternate protein names: O-Antigen Polymerase Family

Number of amino acids: Translated: 925; Mature: 925

Protein sequence:

>925_residues
MENKAYNSTFKAQLFIYYMMSVVIPLFVVKNFTHEPSTGKHLLYVIGFTIIILSALFSNKKITIKYSYVHLAALGFGITA
ILSLISVSAENPQYFRYSLDVALFALFVVLTSFYISKEFDTRLKIEFAMFFFIIGAFVVAIDALLNYYAGFDLFLGKVGA
PFQRASARSTIGNPNFVSDYMGLTIPMIIYFLVNPYPLKKVVKSRMGIILLKSSMLLFLAPMIAAVFVAETRTVMTGILL
GNLLFIIVYLLLSRKFQHEEDPALVKLSRIFIVAALVLAIVLSILYLTPSPLTGKGKLNITRRLEYVLTSSKSWKERFSA
WFNSIYQWIDPSHPSRIIFGTGIGTFQLYHLLYSPYVIQEHPDYTVVWNNFKRTHNDYVQALSETGILGFSMVVLFLIFM
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SLSSDKEKVIQTLMGEDPYAALIVDEFKGDLRVIPLPERNIRTIPFKEFVKAHKEKLAELSDKLYLSFLAQIQAVLDSID
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TWNRYSDWEGIYGEYMTAVVSVGGDTTAVSNRILEIAKKHAFACEGMWEGGYYGIPDDTLGIALKYAGNLKEKHQKEYER
FMRELSEIYHGVYVKTKEGLSKFRSEELKKRAEKFIELYEKISTN

Sequences:

>Translated_925_residues
MENKAYNSTFKAQLFIYYMMSVVIPLFVVKNFTHEPSTGKHLLYVIGFTIIILSALFSNKKITIKYSYVHLAALGFGITA
ILSLISVSAENPQYFRYSLDVALFALFVVLTSFYISKEFDTRLKIEFAMFFFIIGAFVVAIDALLNYYAGFDLFLGKVGA
PFQRASARSTIGNPNFVSDYMGLTIPMIIYFLVNPYPLKKVVKSRMGIILLKSSMLLFLAPMIAAVFVAETRTVMTGILL
GNLLFIIVYLLLSRKFQHEEDPALVKLSRIFIVAALVLAIVLSILYLTPSPLTGKGKLNITRRLEYVLTSSKSWKERFSA
WFNSIYQWIDPSHPSRIIFGTGIGTFQLYHLLYSPYVIQEHPDYTVVWNNFKRTHNDYVQALSETGILGFSMVVLFLIFM
VSRYFRTMLRLKNKTDILMYGAFGAAIFSLAMHTMFEFPLHMQPNLMAGVFIMSITMGTYFNDDLKELQISRTALAIPFV
ILSGTIIFLKTTAYLGEGFFRKGQVAQQYYYAYAREAIKRNPVVIKNKLKDLENYRGEFAYLKNVGNYYAAREKELRSKF
GGLSQVEFLKAIESERKKEFDAIRANLMRELQTAEALQSKTRAYYNRAVDYFERSYRIYPVFGKPLWYLAAFGIKPERVY
SLSSDKEKVIQTLMGEDPYAALIVDEFKGDLRVIPLPERNIRTIPFKEFVKAHKEKLAELSDKLYLSFLAQIQAVLDSID
YYESSMIFFSERQTPKIVGGLYKKVYEELKRYGSFLLVREKLYSDTIDLADLLMQIERFKNYAKTQMYYWYDLAVTLLPG
TWNRYSDWEGIYGEYMTAVVSVGGDTTAVSNRILEIAKKHAFACEGMWEGGYYGIPDDTLGIALKYAGNLKEKHQKEYER
FMRELSEIYHGVYVKTKEGLSKFRSEELKKRAEKFIELYEKISTN
>Mature_925_residues
MENKAYNSTFKAQLFIYYMMSVVIPLFVVKNFTHEPSTGKHLLYVIGFTIIILSALFSNKKITIKYSYVHLAALGFGITA
ILSLISVSAENPQYFRYSLDVALFALFVVLTSFYISKEFDTRLKIEFAMFFFIIGAFVVAIDALLNYYAGFDLFLGKVGA
PFQRASARSTIGNPNFVSDYMGLTIPMIIYFLVNPYPLKKVVKSRMGIILLKSSMLLFLAPMIAAVFVAETRTVMTGILL
GNLLFIIVYLLLSRKFQHEEDPALVKLSRIFIVAALVLAIVLSILYLTPSPLTGKGKLNITRRLEYVLTSSKSWKERFSA
WFNSIYQWIDPSHPSRIIFGTGIGTFQLYHLLYSPYVIQEHPDYTVVWNNFKRTHNDYVQALSETGILGFSMVVLFLIFM
VSRYFRTMLRLKNKTDILMYGAFGAAIFSLAMHTMFEFPLHMQPNLMAGVFIMSITMGTYFNDDLKELQISRTALAIPFV
ILSGTIIFLKTTAYLGEGFFRKGQVAQQYYYAYAREAIKRNPVVIKNKLKDLENYRGEFAYLKNVGNYYAAREKELRSKF
GGLSQVEFLKAIESERKKEFDAIRANLMRELQTAEALQSKTRAYYNRAVDYFERSYRIYPVFGKPLWYLAAFGIKPERVY
SLSSDKEKVIQTLMGEDPYAALIVDEFKGDLRVIPLPERNIRTIPFKEFVKAHKEKLAELSDKLYLSFLAQIQAVLDSID
YYESSMIFFSERQTPKIVGGLYKKVYEELKRYGSFLLVREKLYSDTIDLADLLMQIERFKNYAKTQMYYWYDLAVTLLPG
TWNRYSDWEGIYGEYMTAVVSVGGDTTAVSNRILEIAKKHAFACEGMWEGGYYGIPDDTLGIALKYAGNLKEKHQKEYER
FMRELSEIYHGVYVKTKEGLSKFRSEELKKRAEKFIELYEKISTN

Specific function: Unknown

COG id: COG3307

COG function: function code M; Lipid A core - O-antigen ligase and related enzymes

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 106639; Mature: 106639

Theoretical pI: Translated: 9.67; Mature: 9.67

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.0 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MENKAYNSTFKAQLFIYYMMSVVIPLFVVKNFTHEPSTGKHLLYVIGFTIIILSALFSNK
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KITIKYSYVHLAALGFGITAILSLISVSAENPQYFRYSLDVALFALFVVLTSFYISKEFD
EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
TRLKIEFAMFFFIIGAFVVAIDALLNYYAGFDLFLGKVGAPFQRASARSTIGNPNFVSDY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHH
MGLTIPMIIYFLVNPYPLKKVVKSRMGIILLKSSMLLFLAPMIAAVFVAETRTVMTGILL
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GNLLFIIVYLLLSRKFQHEEDPALVKLSRIFIVAALVLAIVLSILYLTPSPLTGKGKLNI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEH
TRRLEYVLTSSKSWKERFSAWFNSIYQWIDPSHPSRIIFGTGIGTFQLYHLLYSPYVIQE
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHCCEEEEC
HPDYTVVWNNFKRTHNDYVQALSETGILGFSMVVLFLIFMVSRYFRTMLRLKNKTDILMY
CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
GAFGAAIFSLAMHTMFEFPLHMQPNLMAGVFIMSITMGTYFNDDLKELQISRTALAIPFV
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHCCEEEEEEHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEHHHHHHHHHHHCCHHH
YLKNVGNYYAAREKELRSKFGGLSQVEFLKAIESERKKEFDAIRANLMRELQTAEALQSK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TRAYYNRAVDYFERSYRIYPVFGKPLWYLAAFGIKPERVYSLSSDKEKVIQTLMGEDPYA
HHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHCCCCHHHEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCE
ALIVDEFKGDLRVIPLPERNIRTIPFKEFVKAHKEKLAELSDKLYLSFLAQIQAVLDSID
EEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YYESSMIFFSERQTPKIVGGLYKKVYEELKRYGSFLLVREKLYSDTIDLADLLMQIERFK
HHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHH
NYAKTQMYYWYDLAVTLLPGTWNRYSDWEGIYGEYMTAVVSVGGDTTAVSNRILEIAKKH
HHHHHHHEEEEEEEHEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AFACEGMWEGGYYGIPDDTLGIALKYAGNLKEKHQKEYERFMRELSEIYHGVYVKTKEGL
HHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEHHHH
SKFRSEELKKRAEKFIELYEKISTN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MENKAYNSTFKAQLFIYYMMSVVIPLFVVKNFTHEPSTGKHLLYVIGFTIIILSALFSNK
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
KITIKYSYVHLAALGFGITAILSLISVSAENPQYFRYSLDVALFALFVVLTSFYISKEFD
EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
TRLKIEFAMFFFIIGAFVVAIDALLNYYAGFDLFLGKVGAPFQRASARSTIGNPNFVSDY
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHH
MGLTIPMIIYFLVNPYPLKKVVKSRMGIILLKSSMLLFLAPMIAAVFVAETRTVMTGILL
HHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GNLLFIIVYLLLSRKFQHEEDPALVKLSRIFIVAALVLAIVLSILYLTPSPLTGKGKLNI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEH
TRRLEYVLTSSKSWKERFSAWFNSIYQWIDPSHPSRIIFGTGIGTFQLYHLLYSPYVIQE
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HPDYTVVWNNFKRTHNDYVQALSETGILGFSMVVLFLIFMVSRYFRTMLRLKNKTDILMY
CCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEE
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHEEEEEEEHEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
AFACEGMWEGGYYGIPDDTLGIALKYAGNLKEKHQKEYERFMRELSEIYHGVYVKTKEGL
HHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEHHHH
SKFRSEELKKRAEKFIELYEKISTN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA