Definition | Eubacterium eligens ATCC 27750 plasmid unnamed, complete sequence. |
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Accession | NC_012780 |
Length | 626,744 |
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The map label for this gene is 238922315
Identifier: 238922315
GI number: 238922315
Start: 515405
End: 518347
Strand: Reverse
Name: 238922315
Synonym: EUBELI_20551
Alternate gene names: NA
Gene position: 518347-515405 (Counterclockwise)
Preceding gene: 238922316
Following gene: 238922314
Centisome position: 82.7
GC content: 34.35
Gene sequence:
>2943_bases ATGGAGTGTGCCAGTAGTATAGCCATACATACGGAAAGGGGGATGCGTATGTCTGTATTTGAAATTACATTTTTAAGTGT AAGAAGGCGTATGCCGCAGATAATAAAGGCAGCATGTACGACTCTGGCAGCAGTATTTTTTGTAACAGCCGTTCTTATAT TTCAGGATAATATGTATCAGTGGCAGATGTCATCGAACAAATCCAGATTCGGAGACTGGTTTTTATATGAAATCACATCA AAGGAGCCTAACCAGTCATTGAGTGAACATGCATATCTTAATGATCCTGTCAAAATAATGACCAGTGTCAGTATGTTTAA TTCTGACTGGAAAAGGACGGGATATATTGTCGGAAGCTTTGATAAGGATTTCATTAATCAGGTCAGAATCAGTCTTGATG AAGGAAGACTGCCAGAAAATGATGACGAGATAGCTATGGACTGGAATACATTGTTATCACTTGGATATACTGGTGAAATA GGTGAGACTGTAACTATCAGATATTGTGAGGAAAACAGTATATATGATGAAAGTGCCAGACAGGAAAAAGAATTTATGCT TGTTGGTATATTGGCTAATTATACAAATATATGGAAGAACGGGAAGAATATACCGGGAGCTGTTGTAACGCCGGATGCTT TAGAAATATTTAACTATAAATATCGTAATGTGTATTTTTATTCTTTAAATGATTCTGTGAAAACATCAGATTATGCAACT GTTTATAAGAAGATAAAGGAAGATGCAAAAACAGAGACTGTATATAATTCGGCAGTATATGATTATCAGCCGTGGAGTTC AGCTAAAGTATACATGTATATGTATCTGGTTGTAATGATAATAGGAATTCTTGCACTTTCATATCAGCTTATTGAATACA GAGGAAGAAGACGCCCGGCTTATGAGCGTTTCAGAAAGCTTGGAATGAATAAGGCGTCACTTCGGAGTATGTATATTATT GAAAATGCCCTGATAATTATTCCAGCGGGAATAATGGGACTTATACTGGCTTTACTTACAGGCTTTGGAATAGGAAAGGC TCTTGAAATTCATAATGGCTTCACATTTTATAAGGTCACATTAAATGTAATTATAAAAAGTGTTTTGTCAGTAATTATAG CAATAATAGTTGAAGAAATAGCAGGTATTATTGCAAACAGCCGTAAAAATCACATTTTAAATAAAAAACGGAAAAAGAAA AACAGCCAGAATGTAAATATATATAACGCCACTGGTAAAAAATCAAAAATTAAGCCGTCTAATTTATTAATTACAGTAAG CTCAAGATTTATCAGAAAAGATGGAATATTTATGGCTGCCGGGCTTAGAATATTCGCATTATGCATATGTGCTGTACTTG TATTTTCAGCATTAATGATAAAGAAAGTATATATTGCGTACAAGGATAATGAGCAGATACCGGATATATATGGATATCTG GATCCTTCAGATTCAGAATATGAAATGTATATATATTACTATAGTTATATAAAGGGTTATTATAATATTCCAATACCAGA TGGAGAATATTACAGTGAAGAGAGGAATGCTCTTCTGTCCAGTGAAAAAAGAAACAGATACAACATAAGCTTTAATGAAT TAAAAAGTAAGCTGACAAAAGAATCTGATAGCCTTGATGCAAATAATCATCAGGATCTAATACGTTTTAATATGCTGCAT GTTAATTATTCTAATAAATATTGTAAGAGAGGCAATACTAATTTACTCACAGGCTTTTCGGAAGAGTTTCTTACAGAGCT TGAAAAGATAGGTGGAATAAAGTCGGTAGATTATTCAGCATATGAATCAGAGCGTACATGGTTCTGGGATAATCAGGATT TTCATAAGATGGGAATGGATACTATTTCACCCGATAATTATAATATAACGAGAGAATCACCCGTTACGGATTATGGTTAC CGTTATATATATTCCACAGAGTATGTTAATCCTACCAGAGAATTATATAACAAGCTTGAGAAGTACATTGATAAGGAATA CAGGAATTATGATGATTTCGTTAATGGAAAACAGGTTGTAGTCTTTTTGAGAAATACACCAGATGGAACTTATGATGACA CATTACAGGCAGGAGATATCTTGAATTATAATTATTATCCGTTGTCTGTAATGCCTAATATAAGGTTTACAAATAATGTG GCATATGGGAGATATACATATCCGTTTGACAGGGCATTTTATGATACATATAATAATTCAGGAAAGATTAACCTTTATTC AGAATTTAATGGAACGCTTAAAGGAAGTGCAACATTTAACATGCACAGTGAAGGAGATTCTGAGGATTGGATAAATGGGT ATGAGTCAATATTTGGTGCGTGTGTATCACCTCAGGTTGCGGCTGTCATTAAGGTAACAGACGATGTGAAAGAAGATTTT AACGGAATCATGCCTGATTATGGATATTATACAGCACTTGCGGGAATGTCACTGGCACAGCAGGCAGTTGATAACCAGAG AAGCTTCATGGAGAGGATAACCGGTGATAAAATGACCGGTTATCTGGAATTCGGACTTAAGTATAACCAGCTGAACATTA ATTATGATTTGTCATCAACATTTTCAGCAACGAATAATAAGGTGGCTGTATATTTTGATAATAATGAATTATCGTATTCT TCTAATGTCGATGCAAAGAATATATACAGAACCCAGCTTATTAACAATATTCTCCAGTATGGAATAACCATTGCCGCAGT TATAGTAATACAGCTTCTTATAATGGCAATAATTGTAAGAAACAGAATAGAAAGAAGAAAAGCAAGCTATAAGCTGCTGC ATGGCATTGGAATGAGACAGGGAACAATAGTGAAAATGTGCATGATTGAGGCAGTACGGGAATCTGTATGGTGTATATTC ACAATGCCACTTATACTTATACTGGAGCTTCTTATGTATATGCGAAAGAATCTGGTTGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATGTTATCCAAGGCAAGCCAGAAGCACAACCAGACAATAATTATGGTTACGCATGACAGACAGATGGCGGATTATGCAGA TAAGATAATAACTATTGTTG
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAAATATTATCGTGTATCATTAGAAAAAGAGCCACTTGTTGGCTCTTTTTTTACGAAAAGGACAGGTAGTTAATATGAA TCAGACATATATGAAGGAGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 980; Mature: 980
Protein sequence:
>980_residues MECASSIAIHTERGMRMSVFEITFLSVRRRMPQIIKAACTTLAAVFFVTAVLIFQDNMYQWQMSSNKSRFGDWFLYEITS KEPNQSLSEHAYLNDPVKIMTSVSMFNSDWKRTGYIVGSFDKDFINQVRISLDEGRLPENDDEIAMDWNTLLSLGYTGEI GETVTIRYCEENSIYDESARQEKEFMLVGILANYTNIWKNGKNIPGAVVTPDALEIFNYKYRNVYFYSLNDSVKTSDYAT VYKKIKEDAKTETVYNSAVYDYQPWSSAKVYMYMYLVVMIIGILALSYQLIEYRGRRRPAYERFRKLGMNKASLRSMYII ENALIIIPAGIMGLILALLTGFGIGKALEIHNGFTFYKVTLNVIIKSVLSVIIAIIVEEIAGIIANSRKNHILNKKRKKK NSQNVNIYNATGKKSKIKPSNLLITVSSRFIRKDGIFMAAGLRIFALCICAVLVFSALMIKKVYIAYKDNEQIPDIYGYL DPSDSEYEMYIYYYSYIKGYYNIPIPDGEYYSEERNALLSSEKRNRYNISFNELKSKLTKESDSLDANNHQDLIRFNMLH VNYSNKYCKRGNTNLLTGFSEEFLTELEKIGGIKSVDYSAYESERTWFWDNQDFHKMGMDTISPDNYNITRESPVTDYGY RYIYSTEYVNPTRELYNKLEKYIDKEYRNYDDFVNGKQVVVFLRNTPDGTYDDTLQAGDILNYNYYPLSVMPNIRFTNNV AYGRYTYPFDRAFYDTYNNSGKINLYSEFNGTLKGSATFNMHSEGDSEDWINGYESIFGACVSPQVAAVIKVTDDVKEDF NGIMPDYGYYTALAGMSLAQQAVDNQRSFMERITGDKMTGYLEFGLKYNQLNINYDLSSTFSATNNKVAVYFDNNELSYS SNVDAKNIYRTQLINNILQYGITIAAVIVIQLLIMAIIVRNRIERRKASYKLLHGIGMRQGTIVKMCMIEAVRESVWCIF TMPLILILELLMYMRKNLVE
Sequences:
>Translated_980_residues MECASSIAIHTERGMRMSVFEITFLSVRRRMPQIIKAACTTLAAVFFVTAVLIFQDNMYQWQMSSNKSRFGDWFLYEITS KEPNQSLSEHAYLNDPVKIMTSVSMFNSDWKRTGYIVGSFDKDFINQVRISLDEGRLPENDDEIAMDWNTLLSLGYTGEI GETVTIRYCEENSIYDESARQEKEFMLVGILANYTNIWKNGKNIPGAVVTPDALEIFNYKYRNVYFYSLNDSVKTSDYAT VYKKIKEDAKTETVYNSAVYDYQPWSSAKVYMYMYLVVMIIGILALSYQLIEYRGRRRPAYERFRKLGMNKASLRSMYII ENALIIIPAGIMGLILALLTGFGIGKALEIHNGFTFYKVTLNVIIKSVLSVIIAIIVEEIAGIIANSRKNHILNKKRKKK NSQNVNIYNATGKKSKIKPSNLLITVSSRFIRKDGIFMAAGLRIFALCICAVLVFSALMIKKVYIAYKDNEQIPDIYGYL DPSDSEYEMYIYYYSYIKGYYNIPIPDGEYYSEERNALLSSEKRNRYNISFNELKSKLTKESDSLDANNHQDLIRFNMLH VNYSNKYCKRGNTNLLTGFSEEFLTELEKIGGIKSVDYSAYESERTWFWDNQDFHKMGMDTISPDNYNITRESPVTDYGY RYIYSTEYVNPTRELYNKLEKYIDKEYRNYDDFVNGKQVVVFLRNTPDGTYDDTLQAGDILNYNYYPLSVMPNIRFTNNV AYGRYTYPFDRAFYDTYNNSGKINLYSEFNGTLKGSATFNMHSEGDSEDWINGYESIFGACVSPQVAAVIKVTDDVKEDF NGIMPDYGYYTALAGMSLAQQAVDNQRSFMERITGDKMTGYLEFGLKYNQLNINYDLSSTFSATNNKVAVYFDNNELSYS SNVDAKNIYRTQLINNILQYGITIAAVIVIQLLIMAIIVRNRIERRKASYKLLHGIGMRQGTIVKMCMIEAVRESVWCIF TMPLILILELLMYMRKNLVE >Mature_980_residues MECASSIAIHTERGMRMSVFEITFLSVRRRMPQIIKAACTTLAAVFFVTAVLIFQDNMYQWQMSSNKSRFGDWFLYEITS KEPNQSLSEHAYLNDPVKIMTSVSMFNSDWKRTGYIVGSFDKDFINQVRISLDEGRLPENDDEIAMDWNTLLSLGYTGEI GETVTIRYCEENSIYDESARQEKEFMLVGILANYTNIWKNGKNIPGAVVTPDALEIFNYKYRNVYFYSLNDSVKTSDYAT VYKKIKEDAKTETVYNSAVYDYQPWSSAKVYMYMYLVVMIIGILALSYQLIEYRGRRRPAYERFRKLGMNKASLRSMYII ENALIIIPAGIMGLILALLTGFGIGKALEIHNGFTFYKVTLNVIIKSVLSVIIAIIVEEIAGIIANSRKNHILNKKRKKK NSQNVNIYNATGKKSKIKPSNLLITVSSRFIRKDGIFMAAGLRIFALCICAVLVFSALMIKKVYIAYKDNEQIPDIYGYL DPSDSEYEMYIYYYSYIKGYYNIPIPDGEYYSEERNALLSSEKRNRYNISFNELKSKLTKESDSLDANNHQDLIRFNMLH VNYSNKYCKRGNTNLLTGFSEEFLTELEKIGGIKSVDYSAYESERTWFWDNQDFHKMGMDTISPDNYNITRESPVTDYGY RYIYSTEYVNPTRELYNKLEKYIDKEYRNYDDFVNGKQVVVFLRNTPDGTYDDTLQAGDILNYNYYPLSVMPNIRFTNNV AYGRYTYPFDRAFYDTYNNSGKINLYSEFNGTLKGSATFNMHSEGDSEDWINGYESIFGACVSPQVAAVIKVTDDVKEDF NGIMPDYGYYTALAGMSLAQQAVDNQRSFMERITGDKMTGYLEFGLKYNQLNINYDLSSTFSATNNKVAVYFDNNELSYS SNVDAKNIYRTQLINNILQYGITIAAVIVIQLLIMAIIVRNRIERRKASYKLLHGIGMRQGTIVKMCMIEAVRESVWCIF TMPLILILELLMYMRKNLVE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 113128; Mature: 113128
Theoretical pI: Translated: 7.44; Mature: 7.44
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 3.6 %Met (Translated Protein) 4.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 3.6 %Met (Mature Protein) 4.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MECASSIAIHTERGMRMSVFEITFLSVRRRMPQIIKAACTTLAAVFFVTAVLIFQDNMYQ CCCCCCEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE WQMSSNKSRFGDWFLYEITSKEPNQSLSEHAYLNDPVKIMTSVSMFNSDWKRTGYIVGSF EEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECC DKDFINQVRISLDEGRLPENDDEIAMDWNTLLSLGYTGEIGETVTIRYCEENSIYDESAR CHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCEEEEHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHH QEKEFMLVGILANYTNIWKNGKNIPGAVVTPDALEIFNYKYRNVYFYSLNDSVKTSDYAT HHHHEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCHHHHHCEEEEEEEEEEECCCCCCCHHHH VYKKIKEDAKTETVYNSAVYDYQPWSSAKVYMYMYLVVMIIGILALSYQLIEYRGRRRPA HHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH YERFRKLGMNKASLRSMYIIENALIIIPAGIMGLILALLTGFGIGKALEIHNGFTFYKVT HHHHHHHCCCHHHHHHHHEECCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCEEEEHHH LNVIIKSVLSVIIAIIVEEIAGIIANSRKNHILNKKRKKKNSQNVNIYNATGKKSKIKPS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCC NLLITVSSRFIRKDGIFMAAGLRIFALCICAVLVFSALMIKKVYIAYKDNEQIPDIYGYL CEEEEEEHHHHHHCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHCCC DPSDSEYEMYIYYYSYIKGYYNIPIPDGEYYSEERNALLSSEKRNRYNISFNELKSKLTK CCCCCCEEEEEEEEEECCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC ESDSLDANNHQDLIRFNMLHVNYSNKYCKRGNTNLLTGFSEEFLTELEKIGGIKSVDYSA CCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC YESERTWFWDNQDFHKMGMDTISPDNYNITRESPVTDYGYRYIYSTEYVNPTRELYNKLE CCCCCCEECCCCCHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHH KYIDKEYRNYDDFVNGKQVVVFLRNTPDGTYDDTLQAGDILNYNYYPLSVMPNIRFTNNV HHHHHHHCCHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEECCCEEEEEECCCCEEECCE AYGRYTYPFDRAFYDTYNNSGKINLYSEFNGTLKGSATFNMHSEGDSEDWINGYESIFGA ECCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCEEECCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH CVSPQVAAVIKVTDDVKEDFNGIMPDYGYYTALAGMSLAQQAVDNQRSFMERITGDKMTG HCCCCEEEEEEECHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE YLEFGLKYNQLNINYDLSSTFSATNNKVAVYFDNNELSYSSNVDAKNIYRTQLINNILQY EEEECEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH GITIAAVIVIQLLIMAIIVRNRIERRKASYKLLHGIGMRQGTIVKMCMIEAVRESVWCIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TMPLILILELLMYMRKNLVE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MECASSIAIHTERGMRMSVFEITFLSVRRRMPQIIKAACTTLAAVFFVTAVLIFQDNMYQ CCCCCCEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE WQMSSNKSRFGDWFLYEITSKEPNQSLSEHAYLNDPVKIMTSVSMFNSDWKRTGYIVGSF EEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECC DKDFINQVRISLDEGRLPENDDEIAMDWNTLLSLGYTGEIGETVTIRYCEENSIYDESAR CHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCEEEEHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCHHHH QEKEFMLVGILANYTNIWKNGKNIPGAVVTPDALEIFNYKYRNVYFYSLNDSVKTSDYAT HHHHEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCHHHHHCEEEEEEEEEEECCCCCCCHHHH VYKKIKEDAKTETVYNSAVYDYQPWSSAKVYMYMYLVVMIIGILALSYQLIEYRGRRRPA HHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH YERFRKLGMNKASLRSMYIIENALIIIPAGIMGLILALLTGFGIGKALEIHNGFTFYKVT HHHHHHHCCCHHHHHHHHEECCEEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCEEEEHHH LNVIIKSVLSVIIAIIVEEIAGIIANSRKNHILNKKRKKKNSQNVNIYNATGKKSKIKPS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCC NLLITVSSRFIRKDGIFMAAGLRIFALCICAVLVFSALMIKKVYIAYKDNEQIPDIYGYL CEEEEEEHHHHHHCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHCCC DPSDSEYEMYIYYYSYIKGYYNIPIPDGEYYSEERNALLSSEKRNRYNISFNELKSKLTK CCCCCCEEEEEEEEEECCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC ESDSLDANNHQDLIRFNMLHVNYSNKYCKRGNTNLLTGFSEEFLTELEKIGGIKSVDYSA CCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC YESERTWFWDNQDFHKMGMDTISPDNYNITRESPVTDYGYRYIYSTEYVNPTRELYNKLE CCCCCCEECCCCCHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHH KYIDKEYRNYDDFVNGKQVVVFLRNTPDGTYDDTLQAGDILNYNYYPLSVMPNIRFTNNV HHHHHHHCCHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEECCCEEEEEECCCCEEECCE AYGRYTYPFDRAFYDTYNNSGKINLYSEFNGTLKGSATFNMHSEGDSEDWINGYESIFGA ECCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCEEECCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHH CVSPQVAAVIKVTDDVKEDFNGIMPDYGYYTALAGMSLAQQAVDNQRSFMERITGDKMTG HCCCCEEEEEEECHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEE YLEFGLKYNQLNINYDLSSTFSATNNKVAVYFDNNELSYSSNVDAKNIYRTQLINNILQY EEEECEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH GITIAAVIVIQLLIMAIIVRNRIERRKASYKLLHGIGMRQGTIVKMCMIEAVRESVWCIF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TMPLILILELLMYMRKNLVE HHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA