Definition | Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_012778 |
Length | 2,144,190 |
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The map label for this gene is 238916727
Identifier: 238916727
GI number: 238916727
Start: 800000
End: 801787
Strand: Reverse
Name: 238916727
Synonym: EUBELI_00789
Alternate gene names: NA
Gene position: 801787-800000 (Counterclockwise)
Preceding gene: 238916837
Following gene: 238916695
Centisome position: 37.39
GC content: 29.7
Gene sequence:
>1788_bases ATGAAACAAGCTATATCTTTCAAATCCATAAAAAGACACCACATTCTTTTATTTTTCATTATATTAATGCAATGCATTTA TCTGTCTTTTTCATTTGGGATTAATAAGAAAGGGTTTCATTCTGATGAGCTATGGAATTATGGTTTCGCCAACAGTTCTC AGGGAACTGATATTTTCAGGGAAAATAACCAGTTAAAGAATTTTGATAATTGGGAAAATTCATCCATTCTGTACGACTAC ATATCTGTTGATAAATCCGAAATATTTGACTATTCATCTGTTTATAAAAATTGTGCTGATGACTACCATCCTTTCTTAGG ATTTATGCTTCTTCATTTTATATGTGCACTTTTTCCCGGAACATGGTCTGCATGGTATTGTTTTGCACTTAATCTTATAT TTTTTGTAATCCAGCAGATATTTTTATTCAAATTAATAAGAAGAATAACTAACAATTCTTATTATGGAATTGCCGGTGTA TTATTCTTTGGTTTCACCACAGGTGCAGAGGACATTTTATTTTTCTTAAGGATATACTGTCCTGCAACAGCCATCAGTGT TGTTTTCATGTATTATCTGTCGGAATTATATAATCAGCGGAACAGCTCAAAAGTCCCTATTAATATATTAGTTAAAATTG CTATCACAACACTTATCGGTTGTTTAACCCTGCATGAATTTATTATCCTTGCTTTTATTGCTGCATTAATTTATGGACTT TTTTACCTGATTACAAAACATTTTAAATTAGCAATTAGTTTTGGAATATCAATGATTAGTTCTGCTTTGTTGTCAATTGC AATATTCCCTGCAACAATACCACATTTGTTTGATTCATCAGGGACTTTCGGCAGTCAGGTAGTAAAATATTCATTTGTAT TCCAATTTAAATTATATATGTCTTATATAACTAATGATTTATTTGGAGTTGCAACATCCCCTTGGCCATCAATGTTTTTA TGGTATTTGTTTTACGGATTGATTGTATTTCTATTCTTCTTCATTCCTTTTTGCTTTATATTCAGACATGAGAAATGGTT AAAGAATTTCTTTTTGCTTATAAAAAGAAAATGTATAGATTTCATTCATAAATTTAAGTTCTTTAACTTTGCATTATTTG CACTTATGATTGTATGCATATCAATGCTTGCCGTTAATGCTTATATGACTTCCATCGTTCACATGGGAAGAGTATCTAAC AGATATATAATGATTATCTATCCTTTATTTGCAGCATTTGTAGTATCTCTATTCTGCTATTGCTTAAATTGGATATTTAA AAATAAGAAATTAAAATATATTATGTGTTATGGCTTCGCTGTAATTTTTGCCACATTAAGCATTTTGATGGCACCACATA TATTCAGATTCAACTATCCTCATGAAGGCGTTGCAATTGAAGACATTGAAGAAAATTCCAATTGTATAATTATGTTAAGC TCACCATTTCTCTTAACTTGTACTACTTATACTCTTGGTAAAACAAACCACTTTTTTGCAACAACATATAACACAGCTTT AACAGCTGATTATAAAAATAGCGATATCAACTTTAAAGACGAACCTCTGTATTTATTAATTGACACATCATTATTTAATA ATAATGGTTTATCTGTAGGTGGTATAAGTCTGCCGTCTTCCAATATCACTTATGATATAGAAGCGATCTATGATAAAGAC ACTTACTTATCATTTTATAAAAATCTTGATATTGCATCCAACTTTGAAAAAGTAGGAACTGATTATAATTTATTTGGCAG AGAAGTAGAGATATATCGTCTTAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTATCATATTAATAGTTTTCAAAAATTGTATTTGGGTATTTTATTACATTGCACAACATGATATTATTTATATATTAACA ATTATAGAGGGAGAGAAACA
Downstream 100 bases:
>100_bases AATTTTCAAATAAAAACCCCTATATAATTACTATAAAAAAGTAACTATATAGGGGTTCTATTATAATATAATAATTAATC AATATCAGGACGCTTATATC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 595; Mature: 595
Protein sequence:
>595_residues MKQAISFKSIKRHHILLFFIILMQCIYLSFSFGINKKGFHSDELWNYGFANSSQGTDIFRENNQLKNFDNWENSSILYDY ISVDKSEIFDYSSVYKNCADDYHPFLGFMLLHFICALFPGTWSAWYCFALNLIFFVIQQIFLFKLIRRITNNSYYGIAGV LFFGFTTGAEDILFFLRIYCPATAISVVFMYYLSELYNQRNSSKVPINILVKIAITTLIGCLTLHEFIILAFIAALIYGL FYLITKHFKLAISFGISMISSALLSIAIFPATIPHLFDSSGTFGSQVVKYSFVFQFKLYMSYITNDLFGVATSPWPSMFL WYLFYGLIVFLFFFIPFCFIFRHEKWLKNFFLLIKRKCIDFIHKFKFFNFALFALMIVCISMLAVNAYMTSIVHMGRVSN RYIMIIYPLFAAFVVSLFCYCLNWIFKNKKLKYIMCYGFAVIFATLSILMAPHIFRFNYPHEGVAIEDIEENSNCIIMLS SPFLLTCTTYTLGKTNHFFATTYNTALTADYKNSDINFKDEPLYLLIDTSLFNNNGLSVGGISLPSSNITYDIEAIYDKD TYLSFYKNLDIASNFEKVGTDYNLFGREVEIYRLN
Sequences:
>Translated_595_residues MKQAISFKSIKRHHILLFFIILMQCIYLSFSFGINKKGFHSDELWNYGFANSSQGTDIFRENNQLKNFDNWENSSILYDY ISVDKSEIFDYSSVYKNCADDYHPFLGFMLLHFICALFPGTWSAWYCFALNLIFFVIQQIFLFKLIRRITNNSYYGIAGV LFFGFTTGAEDILFFLRIYCPATAISVVFMYYLSELYNQRNSSKVPINILVKIAITTLIGCLTLHEFIILAFIAALIYGL FYLITKHFKLAISFGISMISSALLSIAIFPATIPHLFDSSGTFGSQVVKYSFVFQFKLYMSYITNDLFGVATSPWPSMFL WYLFYGLIVFLFFFIPFCFIFRHEKWLKNFFLLIKRKCIDFIHKFKFFNFALFALMIVCISMLAVNAYMTSIVHMGRVSN RYIMIIYPLFAAFVVSLFCYCLNWIFKNKKLKYIMCYGFAVIFATLSILMAPHIFRFNYPHEGVAIEDIEENSNCIIMLS SPFLLTCTTYTLGKTNHFFATTYNTALTADYKNSDINFKDEPLYLLIDTSLFNNNGLSVGGISLPSSNITYDIEAIYDKD TYLSFYKNLDIASNFEKVGTDYNLFGREVEIYRLN >Mature_595_residues MKQAISFKSIKRHHILLFFIILMQCIYLSFSFGINKKGFHSDELWNYGFANSSQGTDIFRENNQLKNFDNWENSSILYDY ISVDKSEIFDYSSVYKNCADDYHPFLGFMLLHFICALFPGTWSAWYCFALNLIFFVIQQIFLFKLIRRITNNSYYGIAGV LFFGFTTGAEDILFFLRIYCPATAISVVFMYYLSELYNQRNSSKVPINILVKIAITTLIGCLTLHEFIILAFIAALIYGL FYLITKHFKLAISFGISMISSALLSIAIFPATIPHLFDSSGTFGSQVVKYSFVFQFKLYMSYITNDLFGVATSPWPSMFL WYLFYGLIVFLFFFIPFCFIFRHEKWLKNFFLLIKRKCIDFIHKFKFFNFALFALMIVCISMLAVNAYMTSIVHMGRVSN RYIMIIYPLFAAFVVSLFCYCLNWIFKNKKLKYIMCYGFAVIFATLSILMAPHIFRFNYPHEGVAIEDIEENSNCIIMLS SPFLLTCTTYTLGKTNHFFATTYNTALTADYKNSDINFKDEPLYLLIDTSLFNNNGLSVGGISLPSSNITYDIEAIYDKD TYLSFYKNLDIASNFEKVGTDYNLFGREVEIYRLN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69147; Mature: 69147
Theoretical pI: Translated: 8.18; Mature: 8.18
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.4 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 4.9 %Cys+Met (Translated Protein) 2.4 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 4.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKQAISFKSIKRHHILLFFIILMQCIYLSFSFGINKKGFHSDELWNYGFANSSQGTDIFR CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCHHHH ENNQLKNFDNWENSSILYDYISVDKSEIFDYSSVYKNCADDYHPFLGFMLLHFICALFPG CCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TWSAWYCFALNLIFFVIQQIFLFKLIRRITNNSYYGIAGVLFFGFTTGAEDILFFLRIYC CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHC PATAISVVFMYYLSELYNQRNSSKVPINILVKIAITTLIGCLTLHEFIILAFIAALIYGL CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FYLITKHFKLAISFGISMISSALLSIAIFPATIPHLFDSSGTFGSQVVKYSFVFQFKLYM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SYITNDLFGVATSPWPSMFLWYLFYGLIVFLFFFIPFCFIFRHEKWLKNFFLLIKRKCID HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIHKFKFFNFALFALMIVCISMLAVNAYMTSIVHMGRVSNRYIMIIYPLFAAFVVSLFCY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHH CLNWIFKNKKLKYIMCYGFAVIFATLSILMAPHIFRFNYPHEGVAIEDIEENSNCIIMLS HHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEC SPFLLTCTTYTLGKTNHFFATTYNTALTADYKNSDINFKDEPLYLLIDTSLFNNNGLSVG CCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEECCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCEEC GISLPSSNITYDIEAIYDKDTYLSFYKNLDIASNFEKVGTDYNLFGREVEIYRLN CEECCCCCCEEEEEEEECCHHHHHHHHCCCHHCCHHHHCCCCEECCCEEEEEEEC >Mature Secondary Structure MKQAISFKSIKRHHILLFFIILMQCIYLSFSFGINKKGFHSDELWNYGFANSSQGTDIFR CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCCCCCHHHH ENNQLKNFDNWENSSILYDYISVDKSEIFDYSSVYKNCADDYHPFLGFMLLHFICALFPG CCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC TWSAWYCFALNLIFFVIQQIFLFKLIRRITNNSYYGIAGVLFFGFTTGAEDILFFLRIYC CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHC PATAISVVFMYYLSELYNQRNSSKVPINILVKIAITTLIGCLTLHEFIILAFIAALIYGL CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FYLITKHFKLAISFGISMISSALLSIAIFPATIPHLFDSSGTFGSQVVKYSFVFQFKLYM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SYITNDLFGVATSPWPSMFLWYLFYGLIVFLFFFIPFCFIFRHEKWLKNFFLLIKRKCID HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FIHKFKFFNFALFALMIVCISMLAVNAYMTSIVHMGRVSNRYIMIIYPLFAAFVVSLFCY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHH CLNWIFKNKKLKYIMCYGFAVIFATLSILMAPHIFRFNYPHEGVAIEDIEENSNCIIMLS HHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEEEEC SPFLLTCTTYTLGKTNHFFATTYNTALTADYKNSDINFKDEPLYLLIDTSLFNNNGLSVG CCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEECCEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCEEC GISLPSSNITYDIEAIYDKDTYLSFYKNLDIASNFEKVGTDYNLFGREVEIYRLN CEECCCCCCEEEEEEEECCHHHHHHHHCCCHHCCHHHHCCCCEECCCEEEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA