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The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 226950525

GI number: 226950525

Start: 3521154

End: 3522710

Strand: Reverse

Name: mviN [H]

Synonym: CLM_3501

Alternate gene names: 226950525

Gene position: 3522710-3521154 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226950526

Following gene: 226950524

Centisome position: 84.78

GC content: 26.78

Gene sequence:

>1557_bases
ATGAAGGAAAACAAAGCTTTAAAAAGTTCTGTTTTTGTTATGCTATTAATAATATTAGGAAAAGTCTTTGCACTAATAAG
AGATTCTTTAATAGCAGCAAAATTTGGAGCTACTGATATAACAGATATATACAATTTTTCATTGGGTATAGTGTACCTTT
TAACTACTATAAGCTATGGGTTAACTACCACCTTTATACCAATTCATACGGAGAATTTGGAAAATGGAAACAAGAAAGAA
AGTAATAAATTTGTAAATAATGTGCTTAATACTTTTTCCATAGGAACTATTATCTTAACTATATTAATGATAATATTTGC
AAAATATATAATCTATATTTTTGCTCCAGGATTTCAGAAAGACTTAATTGTTTTCAATACTTCTATTAAAATAACTAGAA
TAATGTTATTATCTTTGATTTTCATAAGTTTACAAAGTGTTATTACAGGAGTATTGCAATCCCATAAACAATTTTTGGAA
CCCGCGGCTATGGCAATGGTATCTAATATAGTCTATATTATATATCTAGTTTTTTTAGCTAGTAACTATGGAATGGTAGG
TTTTGCGGTAGCTATAGTATTAGGTTTTTTTGCACAATTCATAATAAATATACCTAAATATAAAAAAATGGGTTATAAAT
ATAGTACATATATTAATCTAGAAGATAACAAAACTAGACAAATGTTCAAACTTACAATGCCTGTTATAATAAGCACTTCT
GTTATTCAATTAAATTCTGTTATAAATAGAGCTTTTGCTACTACTATTTTTGGAGGAGCAGCTACTATATTGGACAATGC
AAATAAAATAAATACATTGGCCTATGAAGTATTCGCTATAGGAATAGCAATGATAGTTTATCCAACGCTATCTGAATTAG
TTGCTAAAAATGATAAAAAACAATATAAAGTGGAATTAGGAAGAGCTATAAATATAATACTTGTAATAATGGTACCAGCA
GCAGTTGGAATTGCAACCCTTAGGGAGCCACTTATAAATGTAATTTTTAAAAGGGGAGCCTTTAGTGAAAATGCTGCTTC
TTTAACGGCACGAGCATTACTTTTATATACTCCAGCTATGATAGCTTATGGGGTAAGAGATATACTAAATAAAGCTTTCT
ATGCTATAAAAGATACCAAAACGCCTATGATTAATAGTTTTATAGGTATAATAATAAATGTAGTAATAAATAGTTTATTA
ATAAACTATTTAGGTGTGAGTGGGCTTACATTAGCAACTAGTATATCTGCATTTGTTATAACTATAATTATGTTATTAGA
TTTAAATAAAAAGCTAAATGGTATAGATATTAAAAATATAATCATATCCTTTTTAAAGGTAATTTTATCTGCTTTGATTA
TGGGGATAATAGTTGCTGTTATAAATAAATTTACTTTATTAAGCTTAGGAAATGAAACTAAAGGAAGTGCGATATCGATT
TTAATTTGTATGGTTATTGGTGGGATATCTTATACTTTAGCCATATATTTATTAAAAGTTAAGGAGATACAAGATATAGT
AGAACCATTACTAAAAATATTAAAACTTAAAAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTATATAATACTGTAATTAATAAATACTCTATGGAGAGTTTTTGTAAATCCTATTATGAATGTTATAAAAATCTGATTT
AGTATTTTGGAGTGGATTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAGTCAATTATATTGTAAAGGGAATTTAATTTTGATATAGTATAAACAGTATTTTAATAATTTGTTTATGATAAATTGT
TAAAGTACAATATATGTATA

Product: integral membrane protein MviN

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 518; Mature: 518

Protein sequence:

>518_residues
MKENKALKSSVFVMLLIILGKVFALIRDSLIAAKFGATDITDIYNFSLGIVYLLTTISYGLTTTFIPIHTENLENGNKKE
SNKFVNNVLNTFSIGTIILTILMIIFAKYIIYIFAPGFQKDLIVFNTSIKITRIMLLSLIFISLQSVITGVLQSHKQFLE
PAAMAMVSNIVYIIYLVFLASNYGMVGFAVAIVLGFFAQFIINIPKYKKMGYKYSTYINLEDNKTRQMFKLTMPVIISTS
VIQLNSVINRAFATTIFGGAATILDNANKINTLAYEVFAIGIAMIVYPTLSELVAKNDKKQYKVELGRAINIILVIMVPA
AVGIATLREPLINVIFKRGAFSENAASLTARALLLYTPAMIAYGVRDILNKAFYAIKDTKTPMINSFIGIIINVVINSLL
INYLGVSGLTLATSISAFVITIIMLLDLNKKLNGIDIKNIIISFLKVILSALIMGIIVAVINKFTLLSLGNETKGSAISI
LICMVIGGISYTLAIYLLKVKEIQDIVEPLLKILKLKK

Sequences:

>Translated_518_residues
MKENKALKSSVFVMLLIILGKVFALIRDSLIAAKFGATDITDIYNFSLGIVYLLTTISYGLTTTFIPIHTENLENGNKKE
SNKFVNNVLNTFSIGTIILTILMIIFAKYIIYIFAPGFQKDLIVFNTSIKITRIMLLSLIFISLQSVITGVLQSHKQFLE
PAAMAMVSNIVYIIYLVFLASNYGMVGFAVAIVLGFFAQFIINIPKYKKMGYKYSTYINLEDNKTRQMFKLTMPVIISTS
VIQLNSVINRAFATTIFGGAATILDNANKINTLAYEVFAIGIAMIVYPTLSELVAKNDKKQYKVELGRAINIILVIMVPA
AVGIATLREPLINVIFKRGAFSENAASLTARALLLYTPAMIAYGVRDILNKAFYAIKDTKTPMINSFIGIIINVVINSLL
INYLGVSGLTLATSISAFVITIIMLLDLNKKLNGIDIKNIIISFLKVILSALIMGIIVAVINKFTLLSLGNETKGSAISI
LICMVIGGISYTLAIYLLKVKEIQDIVEPLLKILKLKK
>Mature_518_residues
MKENKALKSSVFVMLLIILGKVFALIRDSLIAAKFGATDITDIYNFSLGIVYLLTTISYGLTTTFIPIHTENLENGNKKE
SNKFVNNVLNTFSIGTIILTILMIIFAKYIIYIFAPGFQKDLIVFNTSIKITRIMLLSLIFISLQSVITGVLQSHKQFLE
PAAMAMVSNIVYIIYLVFLASNYGMVGFAVAIVLGFFAQFIINIPKYKKMGYKYSTYINLEDNKTRQMFKLTMPVIISTS
VIQLNSVINRAFATTIFGGAATILDNANKINTLAYEVFAIGIAMIVYPTLSELVAKNDKKQYKVELGRAINIILVIMVPA
AVGIATLREPLINVIFKRGAFSENAASLTARALLLYTPAMIAYGVRDILNKAFYAIKDTKTPMINSFIGIIINVVINSLL
INYLGVSGLTLATSISAFVITIIMLLDLNKKLNGIDIKNIIISFLKVILSALIMGIIVAVINKFTLLSLGNETKGSAISI
LICMVIGGISYTLAIYLLKVKEIQDIVEPLLKILKLKK

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=429, Percent_Identity=25.6410256410256, Blast_Score=152, Evalue=6e-38,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57125; Mature: 57125

Theoretical pI: Translated: 10.22; Mature: 10.22

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
3.3 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKENKALKSSVFVMLLIILGKVFALIRDSLIAAKFGATDITDIYNFSLGIVYLLTTISYG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LTTTFIPIHTENLENGNKKESNKFVNNVLNTFSIGTIILTILMIIFAKYIIYIFAPGFQK
HHEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
DLIVFNTSIKITRIMLLSLIFISLQSVITGVLQSHKQFLEPAAMAMVSNIVYIIYLVFLA
CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNYGMVGFAVAIVLGFFAQFIINIPKYKKMGYKYSTYINLEDNKTRQMFKLTMPVIISTS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VIQLNSVINRAFATTIFGGAATILDNANKINTLAYEVFAIGIAMIVYPTLSELVAKNDKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
QYKVELGRAINIILVIMVPAAVGIATLREPLINVIFKRGAFSENAASLTARALLLYTPAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IAYGVRDILNKAFYAIKDTKTPMINSFIGIIINVVINSLLINYLGVSGLTLATSISAFVI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
TIIMLLDLNKKLNGIDIKNIIISFLKVILSALIMGIIVAVINKFTLLSLGNETKGSAISI
HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHH
LICMVIGGISYTLAIYLLKVKEIQDIVEPLLKILKLKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKENKALKSSVFVMLLIILGKVFALIRDSLIAAKFGATDITDIYNFSLGIVYLLTTISYG
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LTTTFIPIHTENLENGNKKESNKFVNNVLNTFSIGTIILTILMIIFAKYIIYIFAPGFQK
HHEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
DLIVFNTSIKITRIMLLSLIFISLQSVITGVLQSHKQFLEPAAMAMVSNIVYIIYLVFLA
CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SNYGMVGFAVAIVLGFFAQFIINIPKYKKMGYKYSTYINLEDNKTRQMFKLTMPVIISTS
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
VIQLNSVINRAFATTIFGGAATILDNANKINTLAYEVFAIGIAMIVYPTLSELVAKNDKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
QYKVELGRAINIILVIMVPAAVGIATLREPLINVIFKRGAFSENAASLTARALLLYTPAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IAYGVRDILNKAFYAIKDTKTPMINSFIGIIINVVINSLLINYLGVSGLTLATSISAFVI
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
TIIMLLDLNKKLNGIDIKNIIISFLKVILSALIMGIIVAVINKFTLLSLGNETKGSAISI
HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHH
LICMVIGGISYTLAIYLLKVKEIQDIVEPLLKILKLKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9823893 [H]