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The map label for this gene is 226949031

Identifier: 226949031

GI number: 226949031

Start: 2004417

End: 2005775

Strand: Reverse

Name: 226949031

Synonym: CLM_1945

Alternate gene names: NA

Gene position: 2005775-2004417 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226949035

Following gene: 226949028

Centisome position: 48.27

GC content: 31.86

Gene sequence:

>1359_bases
TTGGAAACTCAAAAAAATAACAAATATTCATTTAGTGAATTATTTAAATTTATTTGCCCATCCTTAATAGGTTTTATACT
GTTTATAATACCTATTTCTTATGATGGAGAAATAACAATACCTATTGCTGTACTTTCAAAAATTGTTTTAGCTGGGTTAG
GTAGCATATTACCTCAACTTATGGCAATCATCATATGCATTACTTTTATTTGTACAGCAATTACAAAAATATTTAAACCT
AAAGCTATTTTAGAAAATAAATTTTTTAACAATTTATTCAACGTATCCCCTGTATGGGTACTAGCTAGAATATTAGGCTT
TATATTTATTGTTTCTACCTTTTTTAAAATAGGACCTGAATGGATGTGGTCAGAAAACACAGGTGGTTTATTACTTTATG
ATTTGCTTCCTATATTATTTTCAGTATTTATATTTGCAGGGATGTTACTTCCTTTATTGTTAGACTTTGGTTTACTAGAA
TTTGTTGGGGCATTACTTACTAAGGTAATGAGGCCAATATTTAATTTGCCAGGACGTTCTTCTATAGATTGCATGGCTTC
TTGGCTTGGTGATGGTACTATTGGTGTATTACTTACTAGCAAACAATACGAGGAGGGTTACTATAGTGAAAGAGAAGCTG
CAGTTATAGGGACAACCTTCTCAGCAGTTTCTATAACTTTTAGTTTAGTTGTAATATCTCAGGTTAAGCTTGCTCATATG
TTTGTGCCTTTTTATTTAACAGTTTGCTTAGCAGGTATAATTGCAGCTATCTTAATTCCTCGCATACCACCACTTTCAAG
AAAACCAGATGCTTATTTAAATGGTGGAGAAAGCAAAAGTTCTGAAGCTCTTCCAGAAGGATATACACCTTTTACATGGG
GGCTTGAAAAAGCTGTTGCTAAAGCCGGCTCCAATGATGATCCTTTTAATTTTATAAAACAGGGCTTACAAAATGTATTG
GATATGCTTTTAGGTGTAACTCCTGTAGTTATGGCTATGGGAACATCTGCTCTTATATTAGCTGAATATACCCCGCTTTT
TAAATGGCTAGGTCTACCTTTTATACCACTACTAAACTTATTAAAAATACCAGAAGCCGCTTTAGCATCACAAACTATTG
TAGTTGGTTTTGCAGATATGTTTTTACCTTCAGTTATTGCGGCCACTATACAAAGCGAAATGACAAGATTTATAATAGCT
TGCCTTTCAGTTACTCAATTAATTTATATGTCTGAAGTAGGAGGACTATTATTAGGTTCTAAAATACCTGTTTCATTAAA
AGATTTGGTTATTATATTTCTTGAAAGAACATTAGTAACCTTACCTATTATTACTTTAATAGCTCATATATTATTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATATTTCTGGATTTCTTCTGCTGATTAAACTTGTTTTTTTTATATTTATACATTATAATTTAAACTAACATTACTATAA
ATTGCAAAGGAGATGAGGTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAACATATTTAAAATAAATATTAAAAACATCCTAATGGCAATTTAGTAGGTTTATATTTTAAAACACTATTAGAATAAT
TTTAAAATAAGCACTTATTC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORF A [H]

Number of amino acids: Translated: 452; Mature: 452

Protein sequence:

>452_residues
METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQLMAIIICITFICTAITKIFKP
KAILENKFFNNLFNVSPVWVLARILGFIFIVSTFFKIGPEWMWSENTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLE
FVGALLTKVMRPIFNLPGRSSIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAVIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHM
FVPFYLTVCLAGIIAAILIPRIPPLSRKPDAYLNGGESKSSEALPEGYTPFTWGLEKAVAKAGSNDDPFNFIKQGLQNVL
DMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNLLKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIA
CLSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLIAHILF

Sequences:

>Translated_452_residues
METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQLMAIIICITFICTAITKIFKP
KAILENKFFNNLFNVSPVWVLARILGFIFIVSTFFKIGPEWMWSENTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLE
FVGALLTKVMRPIFNLPGRSSIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAVIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHM
FVPFYLTVCLAGIIAAILIPRIPPLSRKPDAYLNGGESKSSEALPEGYTPFTWGLEKAVAKAGSNDDPFNFIKQGLQNVL
DMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNLLKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIA
CLSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLIAHILF
>Mature_452_residues
METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQLMAIIICITFICTAITKIFKP
KAILENKFFNNLFNVSPVWVLARILGFIFIVSTFFKIGPEWMWSENTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLE
FVGALLTKVMRPIFNLPGRSSIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAVIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHM
FVPFYLTVCLAGIIAAILIPRIPPLSRKPDAYLNGGESKSSEALPEGYTPFTWGLEKAVAKAGSNDDPFNFIKQGLQNVL
DMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNLLKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIA
CLSVTQLIYMSEVGGLLLGSKIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLIAHILF

Specific function: Unknown

COG id: COG3314

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR011642 [H]

Pfam domain/function: PF07670 Gate [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49593; Mature: 49593

Theoretical pI: Translated: 5.90; Mature: 5.90

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQL
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MAIIICITFICTAITKIFKPKAILENKFFNNLFNVSPVWVLARILGFIFIVSTFFKIGPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
WMWSENTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLEFVGALLTKVMRPIFNLPGRS
CEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
SIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAVIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHM
CHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVPFYLTVCLAGIIAAILIPRIPPLSRKPDAYLNGGESKSSEALPEGYTPFTWGLEKAVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
KAGSNDDPFNFIKQGLQNVLDMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNL
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIACLSVTQLIYMSEVGGLLLGS
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCC
KIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLIAHILF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
>Mature Secondary Structure
METQKNNKYSFSELFKFICPSLIGFILFIIPISYDGEITIPIAVLSKIVLAGLGSILPQL
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MAIIICITFICTAITKIFKPKAILENKFFNNLFNVSPVWVLARILGFIFIVSTFFKIGPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
WMWSENTGGLLLYDLLPILFSVFIFAGMLLPLLLDFGLLEFVGALLTKVMRPIFNLPGRS
CEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
SIDCMASWLGDGTIGVLLTSKQYEEGYYSEREAAVIGTTFSAVSITFSLVVISQVKLAHM
CHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FVPFYLTVCLAGIIAAILIPRIPPLSRKPDAYLNGGESKSSEALPEGYTPFTWGLEKAVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
KAGSNDDPFNFIKQGLQNVLDMLLGVTPVVMAMGTSALILAEYTPLFKWLGLPFIPLLNL
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
LKIPEAALASQTIVVGFADMFLPSVIAATIQSEMTRFIIACLSVTQLIYMSEVGGLLLGS
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCC
KIPVSLKDLVIIFLERTLVTLPIITLIAHILF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA