| Definition | Clostridium botulinum A2 str. Kyoto chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_012563 |
| Length | 4,155,278 |
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The map label for this gene is pip [H]
Identifier: 226948266
GI number: 226948266
Start: 1184366
End: 1186534
Strand: Direct
Name: pip [H]
Synonym: CLM_1146
Alternate gene names: 226948266
Gene position: 1184366-1186534 (Clockwise)
Preceding gene: 226948264
Following gene: 226948267
Centisome position: 28.5
GC content: 27.34
Gene sequence:
>2169_bases ATGAATAGATTTAAAAACATAATTAAGGTATATAAGAGAGATATTAAAAGCTTAAATAAGAATTTTATTGCAATAATCAT AATATTAGGGGTTTGTGTATTACCCTCACTTTATGCTTGGGTCAATATTAAAGCTTGTTGGGATCCTTATGAAAACACAA GTACAGTACCTATAGCTGTAATTAATAATGATAAAGGTACAGATTTTGGAGGTAAAGAGCTCAATGTAGGAAATGAGATG GTGAAAAAACTTAAGAGTAATGATAAAATTGGATGGAAGTTTACTAATAAAAAGGAAGCGGATATGGGTGTTATAGATGG TACATATTATGCCAGTATAGAAATACCAAAGGATTTTTCAGCAGATATAGTTAGTGTTTTATCAGATAATCCTAAACATC CAGAAATAATTTATAAAGTTGATACAAAAGAAAATCCTGTTGCAGCGAAAATAACTGGAATGGCTAAAAATACATTAATA AATGAGATAACTACCACTTTTATTACTACTGTAAATAAAACTGTATTTTCTTCTATAAATGAAATAGGTAGAAATCTTGA AAAAAATAAGAATGAAATAATAAAACTTAAAGAATCTATTATTTCAATGAATCGAAACATGGATTTAATTTTAGCAGGAT TGGAAAGCGTAAATACTAATTCTAAAAATCTAAATGAATATTTAAGTGTAGTTAGAACTACTTTCCCAGAAATAACCAAG GGGTTAGAAAATATTAATTCTAAATCCTCAAATACAAATGAAACAATAAATCAAACTAATAATATATTTAATAATTCCTT AAATAATATAAATGTTATATTAAAGCAGGCTATATCGACTAATAATCGTGTTCAATCAGTATTAGATAATTTAATAGTTT TAAATAATGAATCTTCAAATAACGAAGCAAATAGCTCTATAGCAAATTTAATTATGGATATAGATAGTGCAAATAAAAAT ATTGATTCTATGATAGAATTCCTTGAAAAAATAAATAACACAAAGCCAAATACTGAAGTGTCAAAATTTATAGTATCCCT TAATAATGTTAAAGGAGCTTTAAATGAAGAAAAACAAAAATTAATAAAGATACAAGAAATTGCTTCAAATTCTAGTAAAG TAAATGAAAATTCAATAAATGAATTAAAAAGAAACATATCTAATACAAATAAGCAAATTGAAAGTGTAATGAATGTTTTT AATTCAAATACAAGACAGGAATTAAGCACTATAATTAATAATTTTAAAAATTCTATTCAAGATGCTAGTAAACTTATAAA GGCAGGTAATGGATTAAATACACAAATAGAAAATTTATTAGCAACATCTACAAAGGGAGCTGATTTATCAGCAAAGCTAA GTAAAGAATTAATTGATAAGTTAACAGAATATAAAGGGATAATAGGTCAACTAAGTAAAAAATTAGAGCTGGTTAGTAAT GATGATTTAATACAAATAATAAGTGTACTTCAAAATAATCCTATGCTAATGTCACAGACCGCAGCATATCCTTTTAATAT TAAGGAAGAAGCAGTATATACTATACCTAATTATGGGTCTGCAATGACTCCAGTATATAGTGTGTTAGCCCTTTGGGTTG GAACTTTAATACTGGTATCTTTGTTAAAAACAGAGGTGGTAGATTTTGAAGGCAGTGAGAATATAACTATAAGACAAAAA TACTTTGGTAAAATGCTTACATTTATAACTTTAGCTGCTATGCAAGGGTTTATAGTAGCTGTTGGAAATAAGGCTATACT AGGAGTTTATACAGTTAGTTTTCCCCTTATGCTTGCGTTTTCTGTAGTGTCATCTATTGTATTTGCTATAATAACTTATA CTTTGGTAGCTATATTTGGTAAGTTCGGTAATGCTCTGGCAATAGTATTTATGATATTACAATTAGCAGGTAGTGGTGGA ACTTATCCAATACAAGTCGATCCATTAATATTTAGAATACTACAACCATTTTTCCCATTTACCTATAGTATAGGGGGTTT TAGAGAGGCAATAGGAGGACCTCTTGTATCTAGTGTAATATTAGATTTTATAATGCTTATATTAATGGGGGGCATATTTG TTTTAATAGGATTTTTCTTAAAATCTCCGTTACATCATAAAATTAGTAAGTTTGACGAAGACTTTAAGGCTTCAGGAATA TCAGAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCTGTTTCACGGCTGTTTATGACTTAAATATAAAATTTGTTAGTTATGATATATTCATCTACTTTGGTTTTTATAAAGAA TTAGGAGGAAATAATTTGGA
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAGAGAAAATAAAGAGGTGAGCATATGAAAAAGGTATTTAGAATATTTTCAAGAGATTTAAAAAATATAGTTAAACATC CTGCAGCCATTATAGTAGTA
Product: putative phage infection protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 722; Mature: 722
Protein sequence:
>722_residues MNRFKNIIKVYKRDIKSLNKNFIAIIIILGVCVLPSLYAWVNIKACWDPYENTSTVPIAVINNDKGTDFGGKELNVGNEM VKKLKSNDKIGWKFTNKKEADMGVIDGTYYASIEIPKDFSADIVSVLSDNPKHPEIIYKVDTKENPVAAKITGMAKNTLI NEITTTFITTVNKTVFSSINEIGRNLEKNKNEIIKLKESIISMNRNMDLILAGLESVNTNSKNLNEYLSVVRTTFPEITK GLENINSKSSNTNETINQTNNIFNNSLNNINVILKQAISTNNRVQSVLDNLIVLNNESSNNEANSSIANLIMDIDSANKN IDSMIEFLEKINNTKPNTEVSKFIVSLNNVKGALNEEKQKLIKIQEIASNSSKVNENSINELKRNISNTNKQIESVMNVF NSNTRQELSTIINNFKNSIQDASKLIKAGNGLNTQIENLLATSTKGADLSAKLSKELIDKLTEYKGIIGQLSKKLELVSN DDLIQIISVLQNNPMLMSQTAAYPFNIKEEAVYTIPNYGSAMTPVYSVLALWVGTLILVSLLKTEVVDFEGSENITIRQK YFGKMLTFITLAAMQGFIVAVGNKAILGVYTVSFPLMLAFSVVSSIVFAIITYTLVAIFGKFGNALAIVFMILQLAGSGG TYPIQVDPLIFRILQPFFPFTYSIGGFREAIGGPLVSSVILDFIMLILMGGIFVLIGFFLKSPLHHKISKFDEDFKASGI SE
Sequences:
>Translated_722_residues MNRFKNIIKVYKRDIKSLNKNFIAIIIILGVCVLPSLYAWVNIKACWDPYENTSTVPIAVINNDKGTDFGGKELNVGNEM VKKLKSNDKIGWKFTNKKEADMGVIDGTYYASIEIPKDFSADIVSVLSDNPKHPEIIYKVDTKENPVAAKITGMAKNTLI NEITTTFITTVNKTVFSSINEIGRNLEKNKNEIIKLKESIISMNRNMDLILAGLESVNTNSKNLNEYLSVVRTTFPEITK GLENINSKSSNTNETINQTNNIFNNSLNNINVILKQAISTNNRVQSVLDNLIVLNNESSNNEANSSIANLIMDIDSANKN IDSMIEFLEKINNTKPNTEVSKFIVSLNNVKGALNEEKQKLIKIQEIASNSSKVNENSINELKRNISNTNKQIESVMNVF NSNTRQELSTIINNFKNSIQDASKLIKAGNGLNTQIENLLATSTKGADLSAKLSKELIDKLTEYKGIIGQLSKKLELVSN DDLIQIISVLQNNPMLMSQTAAYPFNIKEEAVYTIPNYGSAMTPVYSVLALWVGTLILVSLLKTEVVDFEGSENITIRQK YFGKMLTFITLAAMQGFIVAVGNKAILGVYTVSFPLMLAFSVVSSIVFAIITYTLVAIFGKFGNALAIVFMILQLAGSGG TYPIQVDPLIFRILQPFFPFTYSIGGFREAIGGPLVSSVILDFIMLILMGGIFVLIGFFLKSPLHHKISKFDEDFKASGI SE >Mature_722_residues MNRFKNIIKVYKRDIKSLNKNFIAIIIILGVCVLPSLYAWVNIKACWDPYENTSTVPIAVINNDKGTDFGGKELNVGNEM VKKLKSNDKIGWKFTNKKEADMGVIDGTYYASIEIPKDFSADIVSVLSDNPKHPEIIYKVDTKENPVAAKITGMAKNTLI NEITTTFITTVNKTVFSSINEIGRNLEKNKNEIIKLKESIISMNRNMDLILAGLESVNTNSKNLNEYLSVVRTTFPEITK GLENINSKSSNTNETINQTNNIFNNSLNNINVILKQAISTNNRVQSVLDNLIVLNNESSNNEANSSIANLIMDIDSANKN IDSMIEFLEKINNTKPNTEVSKFIVSLNNVKGALNEEKQKLIKIQEIASNSSKVNENSINELKRNISNTNKQIESVMNVF NSNTRQELSTIINNFKNSIQDASKLIKAGNGLNTQIENLLATSTKGADLSAKLSKELIDKLTEYKGIIGQLSKKLELVSN DDLIQIISVLQNNPMLMSQTAAYPFNIKEEAVYTIPNYGSAMTPVYSVLALWVGTLILVSLLKTEVVDFEGSENITIRQK YFGKMLTFITLAAMQGFIVAVGNKAILGVYTVSFPLMLAFSVVSSIVFAIITYTLVAIFGKFGNALAIVFMILQLAGSGG TYPIQVDPLIFRILQPFFPFTYSIGGFREAIGGPLVSSVILDFIMLILMGGIFVLIGFFLKSPLHHKISKFDEDFKASGI SE
Specific function: Required for phage infection [H]
COG id: COG1511
COG function: function code S; Predicted membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 ABC transmembrane type-2 domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013525 - InterPro: IPR017501 - InterPro: IPR017500 [H]
Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 79925; Mature: 79925
Theoretical pI: Translated: 9.09; Mature: 9.09
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNRFKNIIKVYKRDIKSLNKNFIAIIIILGVCVLPSLYAWVNIKACWDPYENTSTVPIAV CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCEEEEE INNDKGTDFGGKELNVGNEMVKKLKSNDKIGWKFTNKKEADMGVIDGTYYASIEIPKDFS EECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCEECCEEEEEEECCCCCH ADIVSVLSDNPKHPEIIYKVDTKENPVAAKITGMAKNTLINEITTTFITTVNKTVFSSIN HHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EIGRNLEKNKNEIIKLKESIISMNRNMDLILAGLESVNTNSKNLNEYLSVVRTTFPEITK HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEECHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLENINSKSSNTNETINQTNNIFNNSLNNINVILKQAISTNNRVQSVLDNLIVLNNESSN HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCEEECCCCCC NEANSSIANLIMDIDSANKNIDSMIEFLEKINNTKPNTEVSKFIVSLNNVKGALNEEKQK CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH LIKIQEIASNSSKVNENSINELKRNISNTNKQIESVMNVFNSNTRQELSTIINNFKNSIQ HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH DASKLIKAGNGLNTQIENLLATSTKGADLSAKLSKELIDKLTEYKGIIGQLSKKLELVSN HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC DDLIQIISVLQNNPMLMSQTAAYPFNIKEEAVYTIPNYGSAMTPVYSVLALWVGTLILVS CCHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLKTEVVDFEGSENITIRQKYFGKMLTFITLAAMQGFIVAVGNKAILGVYTVSFPLMLAF HHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHH SVVSSIVFAIITYTLVAIFGKFGNALAIVFMILQLAGSGGTYPIQVDPLIFRILQPFFPF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHH TYSIGGFREAIGGPLVSSVILDFIMLILMGGIFVLIGFFLKSPLHHKISKFDEDFKASGI HHCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHCCCC SE CC >Mature Secondary Structure MNRFKNIIKVYKRDIKSLNKNFIAIIIILGVCVLPSLYAWVNIKACWDPYENTSTVPIAV CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCEEEEE INNDKGTDFGGKELNVGNEMVKKLKSNDKIGWKFTNKKEADMGVIDGTYYASIEIPKDFS EECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCCEECCEEEEEEECCCCCH ADIVSVLSDNPKHPEIIYKVDTKENPVAAKITGMAKNTLINEITTTFITTVNKTVFSSIN HHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EIGRNLEKNKNEIIKLKESIISMNRNMDLILAGLESVNTNSKNLNEYLSVVRTTFPEITK HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHEEECHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLENINSKSSNTNETINQTNNIFNNSLNNINVILKQAISTNNRVQSVLDNLIVLNNESSN HHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCEEECCCCCC NEANSSIANLIMDIDSANKNIDSMIEFLEKINNTKPNTEVSKFIVSLNNVKGALNEEKQK CHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHH LIKIQEIASNSSKVNENSINELKRNISNTNKQIESVMNVFNSNTRQELSTIINNFKNSIQ HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH DASKLIKAGNGLNTQIENLLATSTKGADLSAKLSKELIDKLTEYKGIIGQLSKKLELVSN HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC DDLIQIISVLQNNPMLMSQTAAYPFNIKEEAVYTIPNYGSAMTPVYSVLALWVGTLILVS CCHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLKTEVVDFEGSENITIRQKYFGKMLTFITLAAMQGFIVAVGNKAILGVYTVSFPLMLAF HHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCEEEEHHHHHHHHHHHH SVVSSIVFAIITYTLVAIFGKFGNALAIVFMILQLAGSGGTYPIQVDPLIFRILQPFFPF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHH TYSIGGFREAIGGPLVSSVILDFIMLILMGGIFVLIGFFLKSPLHHKISKFDEDFKASGI HHCCCHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCHHHHCCCC SE CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8366036 [H]