Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is mepA [H]

Identifier: 226223608

GI number: 226223608

Start: 1021084

End: 1022445

Strand: Direct

Name: mepA [H]

Synonym: Lm4b_01010

Alternate gene names: 226223608

Gene position: 1021084-1022445 (Clockwise)

Preceding gene: 226223607

Following gene: 226223609

Centisome position: 35.06

GC content: 38.84

Gene sequence:

>1362_bases
ATGAAACACTCAGATAATTATTATTTAACAAAAGCGAGCATTCCTAAAGCGATAGCACATTTATCTATTCCGATGATGCT
TGGAATGTCTGTAGGGGTCATATATAACCTTATCAATGCGTTCTTTATAGGCTTGTTGCATGATACGTCGATGTTAACCG
CGGTGACACTTGGATTACCGATGTTCACCGTTTTGATGGCGATTGGTAATATGTTTGGAGTAGGTGGTGGAACGTATATT
TCGCGCTTGCTTGGGAAAGAAGAGGGAATAAAGGCAAAACAAGTATCCGCCTTTGTTTTATATGGAAGTTTAGTATTAGG
AATTATCTGCGCCATCTTACTTGGCTTTTTGATTAATCCAGTTACTCATTTTCTTGGGGCAGATGCAACGAGCTTTTTAC
ACACGAAAAATTATACGTTGGCGCTTTTAATTTGTAGCCCGTTTATTATTGCGAATTTTGCTTTAGAACAGGTGGTTCGG
TCTGAGGGAGCTTCGCGGGTTTCTATGAACGGAATGATAATTGCTACAGTTGTTAATTTAGTATTTGATCCATTGCTTAT
TTTGTATTTTGATTTTAATGTGGTGGGGGCCGCAGTTTCGGTAGGATTAGCAAGTTTATTTTCGCTGATTTACTATGCTT
GGTATTTAGAGAAGAAAAGTGAGTATTTATCGATTCGTTTTAAATGGTTTAAAGCAACAAAAGAAATCGTTCAAAATGTG
TTTAAAATTGGTGTTTCAGAGTTGCTTTTATCGTTATTCCTCATTGTGACAACACTCGTTTTAAATCATTATTCGATGAT
TTACGGGGAAGGAGTAGTTGCAGGTTTTGGCGTGGCGCTTCGGGTGGTGCAGCTCCCTGAATTTATTTGTATGGGACTTT
ACATGGGGATAATTCCGCTGTTAGCTTATAATTACGGTTCGGGTAATATTGCGCGGTTTGAAAAAGCAATACGGGCTACT
GCAATTAGTATCGGGCTTATTGTGCTCTTACTTTCGAGTCTGGTATTCCTCTTCCGTTTCCAAGTGATGCATCTATTTAG
TGACAGTCAAAGTGTGATAACGCTTGGTGTGCATATTATGGTTGCGATGTTGATATCTTCTCTTTTCAGTGGATTTACGG
GGCTGTTTACGAGTACTTTTCAAGCGATTGGGAAAGCGATTCCGGCTACGATTATGTCTGTTTCACAAGGCATCATTTTT
ATCCCAGTCATCATTTTAGGACAACATTATTTCGGACTTATGGGTGTGATTTGGTCCTTAACAGCGACTGAAATTCTGAC
ATGTATCATTGGTGTGACACTATTCACAATCCACAATGTCAAAATAGCTAGTAGCGCAAAAACGAAAGACTTAGCCGTTT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAATCTTTATTGATCTACTTAGTAAAATTGATGACAATACGGAATAAAAAAATTTAACTATATAGTTAGAGTTCTAACT
AATTTTGAGGGGGAACCAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGTTTGTGAGAAAAATTAGTTGACGAGAAGTTCTATATTATGGTATTATTCTCTAGGTAATCATATATCGTTCTTTGA
CAAATGTCAGAGGGGAGTAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 453; Mature: 453

Protein sequence:

>453_residues
MKHSDNYYLTKASIPKAIAHLSIPMMLGMSVGVIYNLINAFFIGLLHDTSMLTAVTLGLPMFTVLMAIGNMFGVGGGTYI
SRLLGKEEGIKAKQVSAFVLYGSLVLGIICAILLGFLINPVTHFLGADATSFLHTKNYTLALLICSPFIIANFALEQVVR
SEGASRVSMNGMIIATVVNLVFDPLLILYFDFNVVGAAVSVGLASLFSLIYYAWYLEKKSEYLSIRFKWFKATKEIVQNV
FKIGVSELLLSLFLIVTTLVLNHYSMIYGEGVVAGFGVALRVVQLPEFICMGLYMGIIPLLAYNYGSGNIARFEKAIRAT
AISIGLIVLLLSSLVFLFRFQVMHLFSDSQSVITLGVHIMVAMLISSLFSGFTGLFTSTFQAIGKAIPATIMSVSQGIIF
IPVIILGQHYFGLMGVIWSLTATEILTCIIGVTLFTIHNVKIASSAKTKDLAV

Sequences:

>Translated_453_residues
MKHSDNYYLTKASIPKAIAHLSIPMMLGMSVGVIYNLINAFFIGLLHDTSMLTAVTLGLPMFTVLMAIGNMFGVGGGTYI
SRLLGKEEGIKAKQVSAFVLYGSLVLGIICAILLGFLINPVTHFLGADATSFLHTKNYTLALLICSPFIIANFALEQVVR
SEGASRVSMNGMIIATVVNLVFDPLLILYFDFNVVGAAVSVGLASLFSLIYYAWYLEKKSEYLSIRFKWFKATKEIVQNV
FKIGVSELLLSLFLIVTTLVLNHYSMIYGEGVVAGFGVALRVVQLPEFICMGLYMGIIPLLAYNYGSGNIARFEKAIRAT
AISIGLIVLLLSSLVFLFRFQVMHLFSDSQSVITLGVHIMVAMLISSLFSGFTGLFTSTFQAIGKAIPATIMSVSQGIIF
IPVIILGQHYFGLMGVIWSLTATEILTCIIGVTLFTIHNVKIASSAKTKDLAV
>Mature_453_residues
MKHSDNYYLTKASIPKAIAHLSIPMMLGMSVGVIYNLINAFFIGLLHDTSMLTAVTLGLPMFTVLMAIGNMFGVGGGTYI
SRLLGKEEGIKAKQVSAFVLYGSLVLGIICAILLGFLINPVTHFLGADATSFLHTKNYTLALLICSPFIIANFALEQVVR
SEGASRVSMNGMIIATVVNLVFDPLLILYFDFNVVGAAVSVGLASLFSLIYYAWYLEKKSEYLSIRFKWFKATKEIVQNV
FKIGVSELLLSLFLIVTTLVLNHYSMIYGEGVVAGFGVALRVVQLPEFICMGLYMGIIPLLAYNYGSGNIARFEKAIRAT
AISIGLIVLLLSSLVFLFRFQVMHLFSDSQSVITLGVHIMVAMLISSLFSGFTGLFTSTFQAIGKAIPATIMSVSQGIIF
IPVIILGQHYFGLMGVIWSLTATEILTCIIGVTLFTIHNVKIASSAKTKDLAV

Specific function: Multidrug resistance efflux protein [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family. MepA subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 49270; Mature: 49270

Theoretical pI: Translated: 9.28; Mature: 9.28

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
4.0 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKHSDNYYLTKASIPKAIAHLSIPMMLGMSVGVIYNLINAFFIGLLHDTSMLTAVTLGLP
CCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MFTVLMAIGNMFGVGGGTYISRLLGKEEGIKAKQVSAFVLYGSLVLGIICAILLGFLINP
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTHFLGADATSFLHTKNYTLALLICSPFIIANFALEQVVRSEGASRVSMNGMIIATVVNL
HHHHHCCCHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHH
VFDPLLILYFDFNVVGAAVSVGLASLFSLIYYAWYLEKKSEYLSIRFKWFKATKEIVQNV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
FKIGVSELLLSLFLIVTTLVLNHYSMIYGEGVVAGFGVALRVVQLPEFICMGLYMGIIPL
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAYNYGSGNIARFEKAIRATAISIGLIVLLLSSLVFLFRFQVMHLFSDSQSVITLGVHIM
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
VAMLISSLFSGFTGLFTSTFQAIGKAIPATIMSVSQGIIFIPVIILGQHYFGLMGVIWSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TATEILTCIIGVTLFTIHNVKIASSAKTKDLAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKHSDNYYLTKASIPKAIAHLSIPMMLGMSVGVIYNLINAFFIGLLHDTSMLTAVTLGLP
CCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MFTVLMAIGNMFGVGGGTYISRLLGKEEGIKAKQVSAFVLYGSLVLGIICAILLGFLINP
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTHFLGADATSFLHTKNYTLALLICSPFIIANFALEQVVRSEGASRVSMNGMIIATVVNL
HHHHHCCCHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHH
VFDPLLILYFDFNVVGAAVSVGLASLFSLIYYAWYLEKKSEYLSIRFKWFKATKEIVQNV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
FKIGVSELLLSLFLIVTTLVLNHYSMIYGEGVVAGFGVALRVVQLPEFICMGLYMGIIPL
HHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAYNYGSGNIARFEKAIRATAISIGLIVLLLSSLVFLFRFQVMHLFSDSQSVITLGVHIM
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
VAMLISSLFSGFTGLFTSTFQAIGKAIPATIMSVSQGIIFIPVIILGQHYFGLMGVIWSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TATEILTCIIGVTLFTIHNVKIASSAKTKDLAV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA