| Definition | Yersinia pestis CO92 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003143 |
| Length | 4,653,728 |
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The map label for this gene is 218928119
Identifier: 218928119
GI number: 218928119
Start: 1037479
End: 1046811
Strand: Reverse
Name: 218928119
Synonym: YPO0947
Alternate gene names: NA
Gene position: 1046811-1037479 (Counterclockwise)
Preceding gene: 218928120
Following gene: 218928112
Centisome position: 22.49
GC content: 37.22
Gene sequence:
>9333_bases ATGCCAAATGGAAACGAAATGGCTGGGTTTTATATAGATAAGCTGTCACTCTCTCAACGGCTTTCTATTGTTTCTGAAAC ATATGATCGGGTTAATAAAAACAATAAAAAAGAAAAATTAAAATACTCTTATGATGATATTGAAATGATCAAGAAAAGAT TTGTTAAATATATCGACGCGCAACTTTACAGTTTAATTAGAGAAGGGTTATCTGTACCGGCCACTTTAACGCAAGAAGAA AAAATAAAAATTACTGACCTGGCAATTGATGCGGCTCTTTTCAATGACTATGAAAGATTCAATGAGTTAATTATATATAT TAGTTCATTAGGTATATCTGTGACACCTCCACTACCACAAGAAGAGGGAGGGAGCAGATTGTATATCTACTTTAGTGGTG ACATTCATGCTTATATGGATGTGTGGCGAGGTGATTTATTATTAGGGAGTGGAACTGAACTTTCTGATATACAAAGTATC ACTGGTCTGCGATTTATGATTGATATGGCAGAATCACTGAAACTTAATATTATTAATCCAGCGGATAAGGCGATGGTGGA TTTAATCAATCACCTTCGGTATGAAATGATTTCATATGCCAGTTCATTTTGTGCAACCTACAGTGCTGAGCGTGGTGGGA CGGTTTACTTATCATCACCAGATGGCCTACGGATAAATAACTATTTTTGGAACAGTGAGCTGCCTGTACTGCGTGCATTG CAGAAGAAAGGATTGATAGGCGATATCCGTATTCTTCATAAACCTTTAGAGTTTTATAAAGATACACCACTGGATGAGCT GGGGGATTTGCTGACAGCAAAAGATATTTCAATGACTGTGGAGTATCAGTTTCTTCCTGTTTGGTTGCAAGAAAAATTAT TGGTCGACATCTATCAACAATGGCTAGATGAGGAGTTTCAGCCCAGTTTATTGGCTGTTAGAAAAGAGATTATTAATACA 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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
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Product: putative virulence determinant
Products: NA
Alternate protein names: RTX xin RtxA; RTX-Family Protein; RTX-Like xin; Autotransporter Adhesin; FG-GAP Repeat Containing RTX-Family Protein; Xin Protein RtxA; Mcf Protein; FG-GAP Repeat And RTX-Family Protein; Xin RtxA; Virulence Determinant; Xin RtxA Protein; Rtx xin RtxA
Number of amino acids: Translated: 3110; Mature: 3109
Protein sequence:
>3110_residues MPNGNEMAGFYIDKLSLSQRLSIVSETYDRVNKNNKKEKLKYSYDDIEMIKKRFVKYIDAQLYSLIREGLSVPATLTQEE KIKITDLAIDAALFNDYERFNELIIYISSLGISVTPPLPQEEGGSRLYIYFSGDIHAYMDVWRGDLLLGSGTELSDIQSI TGLRFMIDMAESLKLNIINPADKAMVDLINHLRYEMISYASSFCATYSAERGGTVYLSSPDGLRINNYFWNSELPVLRAL QKKGLIGDIRILHKPLEFYKDTPLDELGDLLTAKDISMTVEYQFLPVWLQEKLLVDIYQQWLDEEFQPSLLAVRKEIINT IDIDRHAPEVELLRYFLRKIHEQLDEITEFKVLKEAERIDSIKKKLAVGSEIESWLDNVPAIDVNERKIILESLLQKESL LFSNVRDIKKSIIPLDFNSDVININTSLLKNTFIPFNLLRESWDVIISDRSLVEGTLTIHFSVGRKIMIKVDANRNQLKQ MATLERFLLANFTPRNTPQDLKIIDNVIMSGDVVLAERRDDKGWHNDQQMIEKVKLSEFDYFLKSNDLGVKINDNGFVLY LISDPEDNRDVIIKPNDDYNLKSIKDFIENNYLFFDDVPEYLIVKKNVENKECIFAHDEGETYQVAYRDGEAWVLLSKMN TSDQIKNLNEITMSVNLNNAESRSVALILSLLNKHARLVSILPDTHPKVMENFLDIDSLLKNSTHPFEHPLYRKLLNSIS NDINKYMESLNEIKDSYHLLPFDVRPGQYMNTWSKIDRDTVIEYSFKQNDKNHHLQFIVLLQDDSLSKRVGEIIASYNNN KSIVLQFDARSSEARIAYGTQNNITEMGKFELSFVTHGTTDGVYSFSVANVIEIYKLTINSFALPPPVKIRLVICSIADN GQGAQGFNGTHPALGIVNMMHQEGFDIPILAYTTKVGVSVEHPGELVVFNSEKPGEVLKNIDDYQVLYHYKNNILLTDGV PVVELLLKDVRNKIKSVDQLIESYSQYLVPFFSDDNGVVDRELLELTINDFDTYSKFENFLDIIRQRPELRNSDNWQLVV ANNATGFLITTLDEPVVKYPDIVKVNEWDLPAIANIDKTATASQYDMQIVFQCENNPTVNRAATRLAGKHAKNSIIIQLD VDNNHRAFIIDDNTHAEWREISHNELVTKLKIQPENGKIRWQVVGHGRSEGGNDKHPTLAGQRPEQLTARLNQFSDYLQT EHQINISPQQVSLVGCAMSSSDRYTSFAHKFMSHLNENGIRTNVSASTKAIEVDPQGHKHDVDTPDIDSYNNKYLSSIKG TEKLYWNRWGEITTERKKDINGRLNNIDSLLDKLITRQLSVNQLNKKQQRKLAEIFPQLTDKKLNKGELLLTLHDSWRMQ ALKYDLLFLQKISDRPDFDTELWRVTDRWRITETDGNTLQDVRIKSGSQHKTDLATYPHSITSDPDLKTSAPELKTSNPK ARTAIFGRFGYGMQGYGFISALRLSADYQRWMSNGDLTEKQEEEIQLQLAMAWGGIGANLATDGLQYAFGKWGIGYLQKL VSKGGRLSPALLSQLTLLKRNPALLLAPGFLKDLRKLALNQFAHGAARFSMPLLSALTSGIDIYQAYHAFSQLATETDPH VRRDLIASGVFSTINATIGLGVAFAMAMGGTAATAAGPAGIALAFTMIIVGDIYSAVSQIERIRDIVPDMTGSQRFENGL RLFLKFGLTPGLDNQIRYNQTMESVYQRQRDYYEALLASKQGVDTLFYSRGEAVLKAIPFIKRDERSQTERDLEKISIFS GDPFTNAKIYTTYAEMGKHEYYELDKINDVDDYVIADFFEDNNRSVVKLQNKNLHQAFSELDIDSTYSPFILSADVDRNG LNDFIVINEKYNTTIASRKNSVGMTVIDDYVSRWHYELYTWLAQPDGSYLKIDTRLEWEKLFHAIEVDKFNEVVFPVLGD FNGDNVFELVIFHDDKMTTYHYDSLDFNQSGKDNHNVINIGDFIEPVRLAFEGEKSKNYPYSLVGDINNDGFDDILLLNK SGDMLHLMGNSSGVFRQHKTKLSSELTSLLSSSNLHRSQLQLTDLNKDGGLDLVIILNDGIYYQALGDKIDGEYHFDTPS MVNKITIKNEGGDSVRYQQNRLSQIDKHKIIAISPSDQGENRLISLSDSGELLAHPLREIKENDVAALFDLGGGDDVAKG YHKKKNIFTIGSGFKQYQGGENADTFILTSAVASKSHILSGGEGNDTVALGEVLGNEIDSIIDISNGYYSQVNGGVEKQV ALLYDFENILGHENVNDTIIGNDVDNYLNGMGGDDKIWGNGGNDLLALQSGLAQGGTGLDSYHILKSTHEKSLQIRIEEV SENNNTDMQISNIFLEHKLNQIKSIELDNIDVLININNDNGFMTQIRLVGVYNINNNQKQQVLNFTIQTVDGFTMVPLWP SYLNEITEFSPNMVAYYSSLVDRNYKELVGKGDPDDIVVRFSLDNGYQQQQVTHLQRVEGEKDIVLRQAILPDFIRLSPQ EHSMLMGFLPRYELLGDNKDNLLQVLSGEGLLEGRGGQDTYLIQEKEGSPTDIIINNFDDSLASDNLVLSSWLLCDVIVE RSDDDLLLRYRDQPEKHQSIRLVNYMNDERYRHLKITDKSGQSQYRDPVTGTFIDYQINLDKNGHPFIAAQQAPVVSSGN DEVVITSATFLPGNYIDTGDGNDAIIYIRGHEGTMLKGGGGDDTYYYSAGSGAINIADTSGLDHLYLDKHILLHTLSAER RENNLVLNIADNTSGRIIFVDWYLADENKVEFIWVEDSQITFDELFSLRPYSDEYYQLCQHLKSMGLSLTVRQLADLDSQ DGYNTLNQLRTIKAWVTKNPIYDVADLDYLVAMSSIAWRGNARNTDPLPLIEQKIDAFFQPLIAERISLTEEHVTWIQRE EFDTVDIAKWVKNYHLRSQNEINYLLEQLGLLKESPLSDKALDFTFKNRIDLAQADIELCQQECGINRQSLINLAMKYHV TGRGHFELLISNIQVLKEYGVVVSESEQPLVLRKPIDLRQYFNQKNLTKDHVGRLAEHDMSFDELTLLLDKNIPIEQAFT QRLQTQLGPLKLFNDERVFNKGDVFDQDISQLAEAMGGLESTESYSLPLERQTVMAITTHQFVSDSIAAY
Sequences:
>Translated_3110_residues MPNGNEMAGFYIDKLSLSQRLSIVSETYDRVNKNNKKEKLKYSYDDIEMIKKRFVKYIDAQLYSLIREGLSVPATLTQEE KIKITDLAIDAALFNDYERFNELIIYISSLGISVTPPLPQEEGGSRLYIYFSGDIHAYMDVWRGDLLLGSGTELSDIQSI TGLRFMIDMAESLKLNIINPADKAMVDLINHLRYEMISYASSFCATYSAERGGTVYLSSPDGLRINNYFWNSELPVLRAL QKKGLIGDIRILHKPLEFYKDTPLDELGDLLTAKDISMTVEYQFLPVWLQEKLLVDIYQQWLDEEFQPSLLAVRKEIINT IDIDRHAPEVELLRYFLRKIHEQLDEITEFKVLKEAERIDSIKKKLAVGSEIESWLDNVPAIDVNERKIILESLLQKESL LFSNVRDIKKSIIPLDFNSDVININTSLLKNTFIPFNLLRESWDVIISDRSLVEGTLTIHFSVGRKIMIKVDANRNQLKQ MATLERFLLANFTPRNTPQDLKIIDNVIMSGDVVLAERRDDKGWHNDQQMIEKVKLSEFDYFLKSNDLGVKINDNGFVLY LISDPEDNRDVIIKPNDDYNLKSIKDFIENNYLFFDDVPEYLIVKKNVENKECIFAHDEGETYQVAYRDGEAWVLLSKMN TSDQIKNLNEITMSVNLNNAESRSVALILSLLNKHARLVSILPDTHPKVMENFLDIDSLLKNSTHPFEHPLYRKLLNSIS NDINKYMESLNEIKDSYHLLPFDVRPGQYMNTWSKIDRDTVIEYSFKQNDKNHHLQFIVLLQDDSLSKRVGEIIASYNNN KSIVLQFDARSSEARIAYGTQNNITEMGKFELSFVTHGTTDGVYSFSVANVIEIYKLTINSFALPPPVKIRLVICSIADN GQGAQGFNGTHPALGIVNMMHQEGFDIPILAYTTKVGVSVEHPGELVVFNSEKPGEVLKNIDDYQVLYHYKNNILLTDGV 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