Definition Desulfurococcus kamchatkensis 1221n chromosome, complete genome.
Accession NC_011766
Length 1,365,223

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The map label for this gene is 218883872

Identifier: 218883872

GI number: 218883872

Start: 523466

End: 526678

Strand: Reverse

Name: 218883872

Synonym: DKAM_0561

Alternate gene names: NA

Gene position: 526678-523466 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218883873

Following gene: 218883871

Centisome position: 38.58

GC content: 47.93

Gene sequence:

>3213_bases
GTGGCGCTTCCGAGGCTCAAAGAAGTTGTTGAGCTCAGCACGCTGGCATCGAAAGTATACCGGTACCTTGAACCACAGGA
GTATATCGGCAGGCTGGCCCCTAGTCTCGGCATGATACTGCAAAAAGACCTCGGCATAGCTGACATAGAAGTTAGCGAAG
AGTTCCTAGATTCTGCAACATTCCTCGCGACAACGTACTTCCGGGAGCCGCTGGTAGACGCGTTGAGAGTTGTAAACGTA
AGCCTGCAAGGGGTCTCGGGAGCCGTACCTGTCCTCTCGCTTACTCACGCAATGGGCCTCGGGAAGACCCATTTCTTAAC
GCTGCTGTACCACTTGTACACCAAGGTGCCTATTATATGGAATAGCATCAAAGAAAGGTTGCCTGAAGAGTCTAGGCTTC
TCACCGAAAAAGCTAACTACAGGGTCGATACTGCTAGGAGAACCCTAGTTGTAGCTATAGATCTAAAGCACGTACCAAGA
GAACGCATGCCATACGATGCGCTGTTCTTCAACACGCTGAAGATATTCGAAAAATACAAGAAGGGATTTCTCGAGGCAGA
AATACACAAGGCCGAGCTGAGCAATTTCGAAAAGCTCCTACGGGAAATCAGCAGGTACGAGCCAAAGGATGCGGCAAGGG
AGTTTGTTAAGGCGTTGTCGGAACTTGCAGTTAGCATACCCTTACTGATCATAGTCGACGAGGTTTATGCAGCCGCCTTT
GAAGCCTTCGCAGGGGCTTCCGGAGAGTACGTTGATAGTGTGAGAAAGGTCTTAATGTTTCTTACATCGCTCATTGACGA
GCTCGGAGGAACGTTCCCGGCAGTACTTGTGTACGCTTCAGCCATGCAAGACGTTCAAAGATGGAGGGGCATAATCGGGC
TGCGCGTTGGTGATGAAAGAGAGCTACTTAAGAAGGCCGTAGAGTACTTTGAGGATAGAACTCGTAGAGTCGCACCTATT
AACGTGAGAGATGTAAGCGAAGAAGAAGCTCTGGAAATTGTAAAGAAAAGAGCCGTTAGGTTAAAAGCCCCGATAAGTGA
AGTGCTGTCTGATGATGTGATCGAAGAGATTCGACGCGCGCTGTCCGAAATCGTGGGAGATTCTGAAGCTACAAAGTTTA
TTGAGGACCTCAAAAAGACATATCCGTTCTCACCGGTGTATAGAGAGCTTGTTAGAAAGCTCATAGTTCCAGCTTATAGT
GCTGACTTCGCCTCAGAGAGATTACAGCATCTACGTGACCTAATCAAGATCAGCTCTGTTATTCTCGGAAGGGTGCTGGA
AAGCGGCGAGGACGCGTACCTGATAAGCATAGCCCATGTTGAACACGACGACATTAAGCACTTGCTGGATGAAGGTTATG
CAAATGAGTGGCGTAGAAACACGCTTTCGTGGAACAGGTTTCTAGAGCTCGTGGAAGCCGAAACCAAGGATCACGACCTA
GTTAAGATGGTTAAAGGCGCTATATCATCGGTGTACCTCAAATCCGTTACTAACAACATGTGGGACTTACTACTAATGAT
GACCAAGAGCCCAGATGCTCTTCTACCGGGAGAGCTTGATAGGAGGGCTTTACCTCAGAGAAAGCTCATACTATCCCTAG
TGGGCATTGTTGACATAGCCAAGCTCGGCAGGTATCCCGAGGTATTAGAGAGGCTTAACGTAGCGCCATACATACATAGC
GTTGAGCGGGGCGAAAGCAGGTATTACTACGCGTCGTTGTTCGGAAACCCATACCAGCTACTTAAGGACACTCGCGAAGG
CGAAATTCGCAGGCTTAGAGATGAGGAAGGGAGGCTAAAGGTTGGAGATGCCATCGAGTACGTGAGGGAGAGGCTTAAGG
AGTATGCACTAGTGAGCGAGTTCAAACAAAACGCCCCGCTGAGCATGGAATTCGTGAAGGTCGGGGACTTTGAAGAAGTC
ACCGCCCATTTCACTGAATACTTGAACAAGAACGAGTTTACCATACTGGTGGTCTCCCCAATAGACATGGCCAATAAGTT
ACTTGTAGAGAAGGCAAGGTTTGAAGACATTCTAGAGGGCATCAAAAGATCTATAAGTAAAAACATGGGCAAAATAAAAA
GTCCAAATATGTTTGCCGTAGTAGTCCCTTACGTAAATGAGGAGACCTTGGAAAGACTAGTCAGCTCACTAGCGGAAATC
AGAGCCAGCGAGATAGTTGTCAACATGCTAAAGTCCGATATGGGCATGAGCAAGTTTGCTGAGCATACAGCAGAGCGCCA
CAGGTCTCTGCTTGAGCTCGTGAGAAAGCCCGAAGAGGAGTTCAAGCGTATCGTCATGGAGATAGTAGCTCGGTTTAGAG
AAAAACTCGAGATCTATGCCCAGCAGCTCAGCAGTGCCGCAGTGCAGAACTTTACTTCGGACTTTATCAGCCTCTTCAAA
AAAGTTGTGACGTTCGATCCCTCCACGGGCAATATCGAGATACATGACCTTGCGATTTCGATCGATAAGCAGCCTGAAAC
GCTCGGCGGAGTATTTGCATCGCTACCTGTGTGGATTACTAATGCCGTTGGAGGGAGGCTGAAGGTGGCTGGCGCAACGG
AGATTAGTGCCAGCATTGCAGAGTGGATTAAGAGCATAGTTAGCACCGACAGGGTGAGGAAGGAGCTGCGCGAGAGAGGG
GAATACAGGTACTCAATAAGCTCAATTGTAGACGGCCTCGCTAGGGGGTGGCGCGACATACCGATAAAACCCAAATCCTT
GGAGAGCGTGGAAAGTGCTATTAAGAACCTCCTTCGTGGTAGAGTTATTCAGACAGACGACAAAGAATTTAAACTAATCG
AAGTAGATGTTGAGAAGGACGACCTTATCATAAGGCCGAAGGAAGTACCACCCCCGCTACCGCCGCCTAAAGGCGTAGGT
ATTGGTATTACAGGATTTGAAACGTCAGGGGTAGATAACGTTAACATGGCCTTAGGAGGTATTGCTCGCAATAAAGAACT
TGTGCGACTGCTAAGCGTTGAAATACAAGTAGGCTCTGATGCCAAAATAGAGGTCAGGGGTTCTCTAGATAAAATCTCAG
GGCTCCTTGAAGTCCTCATCAAATACCTCAACCGTTACAGGAATAGTATTACTTCTTGCAGACTAGTAGTACAGCTAGCT
AAATTATATGAAAAGGATGAAGCCTTGCAAATGGTTAAGAGCATGGGACTGTCGCCTGGTGGGGTTAGGCTTATAGAAAG
TCGAGAGCAGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CACACTGCTAGAAGCAGCGAGCTCGAGCTCGTTGGGCTTTCTGAGCTCACTCGTGAATTTGCAGACAAGGTGTTGGTGAC
AATATATCGGGGTGTCTAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTCGAGGCGCTAAGTACGTGAACGCGGTTTTAGAAACAACAACGCTACTCATGAACAAGCTTCGCGCCCTTCTCAACATA
CTTCTTCAATACGTTAACTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1070; Mature: 1069

Protein sequence:

>1070_residues
MALPRLKEVVELSTLASKVYRYLEPQEYIGRLAPSLGMILQKDLGIADIEVSEEFLDSATFLATTYFREPLVDALRVVNV
SLQGVSGAVPVLSLTHAMGLGKTHFLTLLYHLYTKVPIIWNSIKERLPEESRLLTEKANYRVDTARRTLVVAIDLKHVPR
ERMPYDALFFNTLKIFEKYKKGFLEAEIHKAELSNFEKLLREISRYEPKDAAREFVKALSELAVSIPLLIIVDEVYAAAF
EAFAGASGEYVDSVRKVLMFLTSLIDELGGTFPAVLVYASAMQDVQRWRGIIGLRVGDERELLKKAVEYFEDRTRRVAPI
NVRDVSEEEALEIVKKRAVRLKAPISEVLSDDVIEEIRRALSEIVGDSEATKFIEDLKKTYPFSPVYRELVRKLIVPAYS
ADFASERLQHLRDLIKISSVILGRVLESGEDAYLISIAHVEHDDIKHLLDEGYANEWRRNTLSWNRFLELVEAETKDHDL
VKMVKGAISSVYLKSVTNNMWDLLLMMTKSPDALLPGELDRRALPQRKLILSLVGIVDIAKLGRYPEVLERLNVAPYIHS
VERGESRYYYASLFGNPYQLLKDTREGEIRRLRDEEGRLKVGDAIEYVRERLKEYALVSEFKQNAPLSMEFVKVGDFEEV
TAHFTEYLNKNEFTILVVSPIDMANKLLVEKARFEDILEGIKRSISKNMGKIKSPNMFAVVVPYVNEETLERLVSSLAEI
RASEIVVNMLKSDMGMSKFAEHTAERHRSLLELVRKPEEEFKRIVMEIVARFREKLEIYAQQLSSAAVQNFTSDFISLFK
KVVTFDPSTGNIEIHDLAISIDKQPETLGGVFASLPVWITNAVGGRLKVAGATEISASIAEWIKSIVSTDRVRKELRERG
EYRYSISSIVDGLARGWRDIPIKPKSLESVESAIKNLLRGRVIQTDDKEFKLIEVDVEKDDLIIRPKEVPPPLPPPKGVG
IGITGFETSGVDNVNMALGGIARNKELVRLLSVEIQVGSDAKIEVRGSLDKISGLLEVLIKYLNRYRNSITSCRLVVQLA
KLYEKDEALQMVKSMGLSPGGVRLIESREQ

Sequences:

>Translated_1070_residues
MALPRLKEVVELSTLASKVYRYLEPQEYIGRLAPSLGMILQKDLGIADIEVSEEFLDSATFLATTYFREPLVDALRVVNV
SLQGVSGAVPVLSLTHAMGLGKTHFLTLLYHLYTKVPIIWNSIKERLPEESRLLTEKANYRVDTARRTLVVAIDLKHVPR
ERMPYDALFFNTLKIFEKYKKGFLEAEIHKAELSNFEKLLREISRYEPKDAAREFVKALSELAVSIPLLIIVDEVYAAAF
EAFAGASGEYVDSVRKVLMFLTSLIDELGGTFPAVLVYASAMQDVQRWRGIIGLRVGDERELLKKAVEYFEDRTRRVAPI
NVRDVSEEEALEIVKKRAVRLKAPISEVLSDDVIEEIRRALSEIVGDSEATKFIEDLKKTYPFSPVYRELVRKLIVPAYS
ADFASERLQHLRDLIKISSVILGRVLESGEDAYLISIAHVEHDDIKHLLDEGYANEWRRNTLSWNRFLELVEAETKDHDL
VKMVKGAISSVYLKSVTNNMWDLLLMMTKSPDALLPGELDRRALPQRKLILSLVGIVDIAKLGRYPEVLERLNVAPYIHS
VERGESRYYYASLFGNPYQLLKDTREGEIRRLRDEEGRLKVGDAIEYVRERLKEYALVSEFKQNAPLSMEFVKVGDFEEV
TAHFTEYLNKNEFTILVVSPIDMANKLLVEKARFEDILEGIKRSISKNMGKIKSPNMFAVVVPYVNEETLERLVSSLAEI
RASEIVVNMLKSDMGMSKFAEHTAERHRSLLELVRKPEEEFKRIVMEIVARFREKLEIYAQQLSSAAVQNFTSDFISLFK
KVVTFDPSTGNIEIHDLAISIDKQPETLGGVFASLPVWITNAVGGRLKVAGATEISASIAEWIKSIVSTDRVRKELRERG
EYRYSISSIVDGLARGWRDIPIKPKSLESVESAIKNLLRGRVIQTDDKEFKLIEVDVEKDDLIIRPKEVPPPLPPPKGVG
IGITGFETSGVDNVNMALGGIARNKELVRLLSVEIQVGSDAKIEVRGSLDKISGLLEVLIKYLNRYRNSITSCRLVVQLA
KLYEKDEALQMVKSMGLSPGGVRLIESREQ
>Mature_1069_residues
ALPRLKEVVELSTLASKVYRYLEPQEYIGRLAPSLGMILQKDLGIADIEVSEEFLDSATFLATTYFREPLVDALRVVNVS
LQGVSGAVPVLSLTHAMGLGKTHFLTLLYHLYTKVPIIWNSIKERLPEESRLLTEKANYRVDTARRTLVVAIDLKHVPRE
RMPYDALFFNTLKIFEKYKKGFLEAEIHKAELSNFEKLLREISRYEPKDAAREFVKALSELAVSIPLLIIVDEVYAAAFE
AFAGASGEYVDSVRKVLMFLTSLIDELGGTFPAVLVYASAMQDVQRWRGIIGLRVGDERELLKKAVEYFEDRTRRVAPIN
VRDVSEEEALEIVKKRAVRLKAPISEVLSDDVIEEIRRALSEIVGDSEATKFIEDLKKTYPFSPVYRELVRKLIVPAYSA
DFASERLQHLRDLIKISSVILGRVLESGEDAYLISIAHVEHDDIKHLLDEGYANEWRRNTLSWNRFLELVEAETKDHDLV
KMVKGAISSVYLKSVTNNMWDLLLMMTKSPDALLPGELDRRALPQRKLILSLVGIVDIAKLGRYPEVLERLNVAPYIHSV
ERGESRYYYASLFGNPYQLLKDTREGEIRRLRDEEGRLKVGDAIEYVRERLKEYALVSEFKQNAPLSMEFVKVGDFEEVT
AHFTEYLNKNEFTILVVSPIDMANKLLVEKARFEDILEGIKRSISKNMGKIKSPNMFAVVVPYVNEETLERLVSSLAEIR
ASEIVVNMLKSDMGMSKFAEHTAERHRSLLELVRKPEEEFKRIVMEIVARFREKLEIYAQQLSSAAVQNFTSDFISLFKK
VVTFDPSTGNIEIHDLAISIDKQPETLGGVFASLPVWITNAVGGRLKVAGATEISASIAEWIKSIVSTDRVRKELRERGE
YRYSISSIVDGLARGWRDIPIKPKSLESVESAIKNLLRGRVIQTDDKEFKLIEVDVEKDDLIIRPKEVPPPLPPPKGVGI
GITGFETSGVDNVNMALGGIARNKELVRLLSVEIQVGSDAKIEVRGSLDKISGLLEVLIKYLNRYRNSITSCRLVVQLAK
LYEKDEALQMVKSMGLSPGGVRLIESREQ

Specific function: Unknown

COG id: COG1483

COG function: function code R; Predicted ATPase (AAA+ superfamily)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 121226; Mature: 121095

Theoretical pI: Translated: 6.40; Mature: 6.40

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MALPRLKEVVELSTLASKVYRYLEPQEYIGRLAPSLGMILQKDLGIADIEVSEEFLDSAT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
FLATTYFREPLVDALRVVNVSLQGVSGAVPVLSLTHAMGLGKTHFLTLLYHLYTKVPIIW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NSIKERLPEESRLLTEKANYRVDTARRTLVVAIDLKHVPRERMPYDALFFNTLKIFEKYK
HHHHHHCCHHHHHHHHHCCCEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
KGFLEAEIHKAELSNFEKLLREISRYEPKDAAREFVKALSELAVSIPLLIIVDEVYAAAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EAFAGASGEYVDSVRKVLMFLTSLIDELGGTFPAVLVYASAMQDVQRWRGIIGLRVGDER
HHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCHH
ELLKKAVEYFEDRTRRVAPINVRDVSEEEALEIVKKRAVRLKAPISEVLSDDVIEEIRRA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LSEIVGDSEATKFIEDLKKTYPFSPVYRELVRKLIVPAYSADFASERLQHLRDLIKISSV
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILGRVLESGEDAYLISIAHVEHDDIKHLLDEGYANEWRRNTLSWNRFLELVEAETKDHDL
HHHHHHHCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCHHH
VKMVKGAISSVYLKSVTNNMWDLLLMMTKSPDALLPGELDRRALPQRKLILSLVGIVDIA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
KLGRYPEVLERLNVAPYIHSVERGESRYYYASLFGNPYQLLKDTREGEIRRLRDEEGRLK
HHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCEE
VGDAIEYVRERLKEYALVSEFKQNAPLSMEFVKVGDFEEVTAHFTEYLNKNEFTILVVSP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECC
IDMANKLLVEKARFEDILEGIKRSISKNMGKIKSPNMFAVVVPYVNEETLERLVSSLAEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
RASEIVVNMLKSDMGMSKFAEHTAERHRSLLELVRKPEEEFKRIVMEIVARFREKLEIYA
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NAVGGRLKVAGATEISASIAEWIKSIVSTDRVRKELRERGEYRYSISSIVDGLARGWRDI
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IGITGFETSGVDNVNMALGGIARNKELVRLLSVEIQVGSDAKIEVRGSLDKISGLLEVLI
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KYLNRYRNSITSCRLVVQLAKLYEKDEALQMVKSMGLSPGGVRLIESREQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
ALPRLKEVVELSTLASKVYRYLEPQEYIGRLAPSLGMILQKDLGIADIEVSEEFLDSAT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
FLATTYFREPLVDALRVVNVSLQGVSGAVPVLSLTHAMGLGKTHFLTLLYHLYTKVPIIW
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HHCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCEE
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECC
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHH
RASEIVVNMLKSDMGMSKFAEHTAERHRSLLELVRKPEEEFKRIVMEIVARFREKLEIYA
HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH
NAVGGRLKVAGATEISASIAEWIKSIVSTDRVRKELRERGEYRYSISSIVDGLARGWRDI
HCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCCC
PIKPKSLESVESAIKNLLRGRVIQTDDKEFKLIEVDVEKDDLIIRPKEVPPPLPPPKGVG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCE
IGITGFETSGVDNVNMALGGIARNKELVRLLSVEIQVGSDAKIEVRGSLDKISGLLEVLI
EEEECCCCCCCCCHHHHHHCHHCHHHHHHHHHHEEEECCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHH
KYLNRYRNSITSCRLVVQLAKLYEKDEALQMVKSMGLSPGGVRLIESREQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA