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The map label for this gene is 218883817

Identifier: 218883817

GI number: 218883817

Start: 475598

End: 477163

Strand: Reverse

Name: 218883817

Synonym: DKAM_0506

Alternate gene names: NA

Gene position: 477163-475598 (Counterclockwise)

Preceding gene: 218883824

Following gene: 218883815

Centisome position: 34.95

GC content: 46.49

Gene sequence:

>1566_bases
TTGAATTGGTTCGATGACGAGGTAACAGATGCGGCTACGCAGGCCATCCTATATGGTACATCCACGGTTATACAAATAAT
TATCCAGGTAGCAACAATGATGATTATCTCGAGGAGTTTAGGGCCAGCCAACTACGGTGTATACACGCTTGCCCTTCTCC
CCTCCACGATTTTAACAATATTCTCGGATCCAGGCATCACGTCATCCATGCTTAGATACGTCTCCATAGCTAGAGCTAGA
AAAGAGCTTAAAGGAGTTGCCAGGGCTTACAGGGTTTCAATACTCTTCCTTACCCTGATAAACACGTTGATACTTGCCGT
GATAGCTTTATTCCCCGAGGAACTAGGGGTTCAATTAGCACAGAGGAGTGGACTGCGTGAACTAGTACTAGCCACAGCAC
CATACCCCCTTGCCACGGCTATTTATGGAGCCGTGCTAACGTATTACGCCAGCATGGAGAAAGCCAGTGTGAGAAGCATG
CTTCAAGTACTCGCCCCACTACTGAGACTCATGCTGGTCTCAATAGTATTACTCCTAGGGTTATCCGTGAAAGGAGTTAT
CATAGCCCATGTCACCACCTATATAGTCATGGCCATAGTCAGCCTACTGATCTCCTTTAAGGAGTTAAGGGGTTTAAGCA
GTAACGGGTCAATATTCAAGGTCAGCGAGTTCCTCACCCTTGCGTTCTCAATATATTTGGCAGGGATAGCTGGAGCTATT
GTTGGGAGACTAATTAGCTTCCTTATAGCATATACGACTAGTAATCTCGGCGAAACAGGAAATTACATGGTAGGTAATTA
TAATGCCTCAAGCGCTTTCCTCGGAGCCATCACATCAGTCCTGGGATCGTTAGCCACACCCCTTACCCCGTTTCTGGCGA
AGAAGCTTAATAATGGGTGGTTAAAGGAAACCAGTAACCTTGTGTTAAACGTGTTGCTAACCCTTACAATACCTGTAACA
GTATACGTGGTATTATTCGCGGACAGCATAATTTATTCTGTATATGGGAGAAACTACTCCACGGCCCCATTATTCTTCGC
GTACATGTCTATAAGTCTCCTCGCCTGGCCCCTGCAAACAGTGTATGGGAGCATATACTGGATTTATAATGATAAGAAGC
CATTAGCAGGCTACGGGCTAGCGTTAATGACTACCGGCACGGTATTCTCCATAGTCCTCTCAGGCATCATGGGTCTCCAG
GGCATCGCGCTTGCCCAGGGACTCTACCCACTCTTATCCTCCATGGTGTTAGCATACCACGGATACCTCAAGCATGGGGT
GAAGCCCTCAATAAGCAAAGCCTCAATATTGCTGGCTCTCTCCTTGATAACGGGCGTGTTCTCGAAATACATTGTAGGAT
GGATCCAGTTCTACATAATACAGGCTCTCCTGGGCTTCATACTCTACCTGGTATTATTCACGCTGTGCAGTGGATTCTTC
AATATTATTGAAGAGGTCGAGCTCGGCTTACTAGATTTGCTGGCAAGAAGGATACCGTTGATCGGCCCTGTACTCCGGTT
ACTTCTAAAACTATATAGGGAATTGGCCAGCGCAGCTAGAGTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGAATAGCATTAAACAATATAAACCATCATCAACAACTATAAACATATAAAAACAAAAACAATTCATGAGGGCTCTCACT
CTAATGGTGGGTGTCTATTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTGAGAAATGCTACCTGCTAAGATCCCCGAGCATTCTCGCTAGATCCCTTACAGCCTTCTCGACTACATCTGAATTGAC
CCTCATAGCCAGCGACACCG

Product: putative polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 521; Mature: 521

Protein sequence:

>521_residues
MNWFDDEVTDAATQAILYGTSTVIQIIIQVATMMIISRSLGPANYGVYTLALLPSTILTIFSDPGITSSMLRYVSIARAR
KELKGVARAYRVSILFLTLINTLILAVIALFPEELGVQLAQRSGLRELVLATAPYPLATAIYGAVLTYYASMEKASVRSM
LQVLAPLLRLMLVSIVLLLGLSVKGVIIAHVTTYIVMAIVSLLISFKELRGLSSNGSIFKVSEFLTLAFSIYLAGIAGAI
VGRLISFLIAYTTSNLGETGNYMVGNYNASSAFLGAITSVLGSLATPLTPFLAKKLNNGWLKETSNLVLNVLLTLTIPVT
VYVVLFADSIIYSVYGRNYSTAPLFFAYMSISLLAWPLQTVYGSIYWIYNDKKPLAGYGLALMTTGTVFSIVLSGIMGLQ
GIALAQGLYPLLSSMVLAYHGYLKHGVKPSISKASILLALSLITGVFSKYIVGWIQFYIIQALLGFILYLVLFTLCSGFF
NIIEEVELGLLDLLARRIPLIGPVLRLLLKLYRELASAARV

Sequences:

>Translated_521_residues
MNWFDDEVTDAATQAILYGTSTVIQIIIQVATMMIISRSLGPANYGVYTLALLPSTILTIFSDPGITSSMLRYVSIARAR
KELKGVARAYRVSILFLTLINTLILAVIALFPEELGVQLAQRSGLRELVLATAPYPLATAIYGAVLTYYASMEKASVRSM
LQVLAPLLRLMLVSIVLLLGLSVKGVIIAHVTTYIVMAIVSLLISFKELRGLSSNGSIFKVSEFLTLAFSIYLAGIAGAI
VGRLISFLIAYTTSNLGETGNYMVGNYNASSAFLGAITSVLGSLATPLTPFLAKKLNNGWLKETSNLVLNVLLTLTIPVT
VYVVLFADSIIYSVYGRNYSTAPLFFAYMSISLLAWPLQTVYGSIYWIYNDKKPLAGYGLALMTTGTVFSIVLSGIMGLQ
GIALAQGLYPLLSSMVLAYHGYLKHGVKPSISKASILLALSLITGVFSKYIVGWIQFYIIQALLGFILYLVLFTLCSGFF
NIIEEVELGLLDLLARRIPLIGPVLRLLLKLYRELASAARV
>Mature_521_residues
MNWFDDEVTDAATQAILYGTSTVIQIIIQVATMMIISRSLGPANYGVYTLALLPSTILTIFSDPGITSSMLRYVSIARAR
KELKGVARAYRVSILFLTLINTLILAVIALFPEELGVQLAQRSGLRELVLATAPYPLATAIYGAVLTYYASMEKASVRSM
LQVLAPLLRLMLVSIVLLLGLSVKGVIIAHVTTYIVMAIVSLLISFKELRGLSSNGSIFKVSEFLTLAFSIYLAGIAGAI
VGRLISFLIAYTTSNLGETGNYMVGNYNASSAFLGAITSVLGSLATPLTPFLAKKLNNGWLKETSNLVLNVLLTLTIPVT
VYVVLFADSIIYSVYGRNYSTAPLFFAYMSISLLAWPLQTVYGSIYWIYNDKKPLAGYGLALMTTGTVFSIVLSGIMGLQ
GIALAQGLYPLLSSMVLAYHGYLKHGVKPSISKASILLALSLITGVFSKYIVGWIQFYIIQALLGFILYLVLFTLCSGFF
NIIEEVELGLLDLLARRIPLIGPVLRLLLKLYRELASAARV

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56616; Mature: 56616

Theoretical pI: Translated: 9.78; Mature: 9.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNWFDDEVTDAATQAILYGTSTVIQIIIQVATMMIISRSLGPANYGVYTLALLPSTILTI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FSDPGITSSMLRYVSIARARKELKGVARAYRVSILFLTLINTLILAVIALFPEELGVQLA
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QRSGLRELVLATAPYPLATAIYGAVLTYYASMEKASVRSMLQVLAPLLRLMLVSIVLLLG
HHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LSVKGVIIAHVTTYIVMAIVSLLISFKELRGLSSNGSIFKVSEFLTLAFSIYLAGIAGAI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGRLISFLIAYTTSNLGETGNYMVGNYNASSAFLGAITSVLGSLATPLTPFLAKKLNNGW
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCH
LKETSNLVLNVLLTLTIPVTVYVVLFADSIIYSVYGRNYSTAPLFFAYMSISLLAWPLQT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VYGSIYWIYNDKKPLAGYGLALMTTGTVFSIVLSGIMGLQGIALAQGLYPLLSSMVLAYH
HHCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GYLKHGVKPSISKASILLALSLITGVFSKYIVGWIQFYIIQALLGFILYLVLFTLCSGFF
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIIEEVELGLLDLLARRIPLIGPVLRLLLKLYRELASAARV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNWFDDEVTDAATQAILYGTSTVIQIIIQVATMMIISRSLGPANYGVYTLALLPSTILTI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
FSDPGITSSMLRYVSIARARKELKGVARAYRVSILFLTLINTLILAVIALFPEELGVQLA
HCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QRSGLRELVLATAPYPLATAIYGAVLTYYASMEKASVRSMLQVLAPLLRLMLVSIVLLLG
HHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
LSVKGVIIAHVTTYIVMAIVSLLISFKELRGLSSNGSIFKVSEFLTLAFSIYLAGIAGAI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VGRLISFLIAYTTSNLGETGNYMVGNYNASSAFLGAITSVLGSLATPLTPFLAKKLNNGW
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCH
LKETSNLVLNVLLTLTIPVTVYVVLFADSIIYSVYGRNYSTAPLFFAYMSISLLAWPLQT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VYGSIYWIYNDKKPLAGYGLALMTTGTVFSIVLSGIMGLQGIALAQGLYPLLSSMVLAYH
HHCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GYLKHGVKPSISKASILLALSLITGVFSKYIVGWIQFYIIQALLGFILYLVLFTLCSGFF
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIIEEVELGLLDLLARRIPLIGPVLRLLLKLYRELASAARV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA