Definition Vibrio splendidus LGP32 chromosome 1, complete genome.
Accession NC_011753
Length 3,299,303

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The map label for this gene is 218709363

Identifier: 218709363

GI number: 218709363

Start: 1479567

End: 1481633

Strand: Direct

Name: 218709363

Synonym: VS_1372

Alternate gene names: NA

Gene position: 1479567-1481633 (Clockwise)

Preceding gene: 218709362

Following gene: 218709364

Centisome position: 44.84

GC content: 44.03

Gene sequence:

>2067_bases
ATGCTAGATAGAGTCGCCATAATATCGGGTGATGGGGTAACAGATATTATCATCATCACAACGTTAGCTTTGTTCTTCTT
TTTCGCAGTGCGTGAAGTAAAGGCTACCTGGAATGCAATCTCGCAGCTTAAAACAATCGCAGGCCTTAAAAGCAATCATT
CTTCAGACCTAGTAGAGCCTGAAAGCTTATCAGAGCCTCAACTTAAATGGTTGGCTGAGCACCTAATTTATACGCCTACC
GAAAATGGTCTGAAAGTTGAGAGCAAAGAAGGGCTTTGGTTAACGAAGTCACCTCTGTCTCATATGCTTCCACCTTGTGA
TTCGACCCGCTATAAGTTGGTTCCAGCACTCTTAACTAGTATCGGTATTACTGGCACGTTTCTAGGGATCACGCTTGGGT
TGAGTCAATTCAGCATGGCTGGTGACTCCAAAGCATTATTGAACTCTGCTGCTGAGCTTCTGGAAGGTATGAAAACCGCT
TTTTACACCTCTCTAGCTGGTTTGAGTAGCTCGGCGGTGTTTATGGCATTGATGAAAGTGTCTTCAAGCCGCCTTTCAAA
AGCTCAAGAGACATTCCTGAAAGCAATTTCAAATCAGTATTTCGAGGCGAGCCCAGTCTACTATTTGAAGAATATGTCGA
ATGAAGGACAGCAGGAAGTTGTTGCTGCACAACTACGCTCAGCTACAGCCATAGAAAATATGAGCCAACAGTTTAGGGAG
ACGGCAGCTTCGCTGAGTAAGCTCGGGGATTCATTCAATGGTGATGCTATTGCTGACAAAGTATCAGAGGCTGTTAAGGG
CTCAATAAAAGACCAACTAACTCCAGCCGTGCAAGCCATTACGGGGGAGCTTTCGGCGCTAAGAGATATCAAAGAGCAGT
CGCAAAAAGAGTTAGTCGAATTACTTGTCGATAAGATGAAATCAGAGTTGATTGACCCTGTATCGGAAGAGCTTAAGAAA
ACGAGTGATGCAGTGTCTCAAAGCAACGAAGTCTCTGCTCAGCTCAATGCTAATGTTGAGAAAGTTGTAACCAGTACTGC
GCAAACCGTTGAGACAATCAACGAGTTCCAGAAAGATACAATGGACAAGTTGCAACAGTTTGCGGAATCATTAAAACAAA
TTCTTGCGAGTTTTAAAGACGATACCCAAGGAGCGATGTCTACCATCGCGAAAGAAGTCCAAACGTTGCTTGATGGAGCT
TCGAAAGGTTTAGAAGAACAAAGGGATGCATTTGAGCTAAGTGCGGGGAGAGCGTCGGCAGCCTTTGAAGGAATCAAAAC
TTCAATGGATGGAGCGCTAAACGAAAGGCAACAAAAAGAGCAAGTGCTATTCGATGGTGTGGAGACTCGAATCAATGCGC
TAATCGAAGGTTCAAGTGCTGCATTTAAGCAGCAAACGGATGTGTTAGAGGCTGTAGGCGAACAGGCAAGCAGTTTGATG
ACTTCAGCAAAGCAAGAGCTAGAGTCGGGCTTAGGTGATATTGATGAAAAAGTTAAGTCAATGTCGACAACCGTTCAGAA
AGAGCTAGAAACTTTCCGGTTGCAGTATCAACAGAATCTAACTGCTTACTTCGAGCAGCAAAATTCATCACTGGAAGACA
GCTTGAGCAAACAGCGTAACGGTCTAAATGAGGTTGTAGAGAACTTCCGTAAAGTCTTTGAGAGTGAATACCAAGCTCGC
CACAATCTACTTCAAGAGCTAACGGCTCAGTATGAAAAACTAGAAGCTTCTGCTCAAACGGTTGAGCGTGTAGCTAAAGC
TATCGGGTTAAATGAAGTGTCAAGAATGGCAGAACTACAAGATGCTGCGCAAACAATGGGAAGACAGATAGCTCTGTTGA
AGAAAGAGTATGCAACGGCGTCAGCGTCGTTTACCGATGTGACTGAGAACCTTCCTAAAGCAATGGACGAATATTTCTCG
CGGGCGAATGAGAGCTTTGAAACTTTCTTCAATGACTTCGACCAATCAGCAAGTACGATTCACAACAAATTGTCGCAAGC
AGCTGGTTATCTGATTAACGCTCAAGTTCAAAATCGAGAATTTGAAGCAGATAGAGTGGAGGTTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGGTGTGGTTCGAGAAGATGCAGAGCATCTACCAGCACGCATTGCAGAACAGATTTTTACTTCAAGTGAAATAAGTCAG
TTTTTAAGGAAAAGTTAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAGGAGCTTATCCCACTCCCCAAGAACCGCTGATGCGGAAGAGTCTGGTGTATGGCTCTCCGTCGGAGATTTGATGTCA
GTCCTACTGATGATCTTCGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 688; Mature: 688

Protein sequence:

>688_residues
MLDRVAIISGDGVTDIIIITTLALFFFFAVREVKATWNAISQLKTIAGLKSNHSSDLVEPESLSEPQLKWLAEHLIYTPT
ENGLKVESKEGLWLTKSPLSHMLPPCDSTRYKLVPALLTSIGITGTFLGITLGLSQFSMAGDSKALLNSAAELLEGMKTA
FYTSLAGLSSSAVFMALMKVSSSRLSKAQETFLKAISNQYFEASPVYYLKNMSNEGQQEVVAAQLRSATAIENMSQQFRE
TAASLSKLGDSFNGDAIADKVSEAVKGSIKDQLTPAVQAITGELSALRDIKEQSQKELVELLVDKMKSELIDPVSEELKK
TSDAVSQSNEVSAQLNANVEKVVTSTAQTVETINEFQKDTMDKLQQFAESLKQILASFKDDTQGAMSTIAKEVQTLLDGA
SKGLEEQRDAFELSAGRASAAFEGIKTSMDGALNERQQKEQVLFDGVETRINALIEGSSAAFKQQTDVLEAVGEQASSLM
TSAKQELESGLGDIDEKVKSMSTTVQKELETFRLQYQQNLTAYFEQQNSSLEDSLSKQRNGLNEVVENFRKVFESEYQAR
HNLLQELTAQYEKLEASAQTVERVAKAIGLNEVSRMAELQDAAQTMGRQIALLKKEYATASASFTDVTENLPKAMDEYFS
RANESFETFFNDFDQSASTIHNKLSQAAGYLINAQVQNREFEADRVEV

Sequences:

>Translated_688_residues
MLDRVAIISGDGVTDIIIITTLALFFFFAVREVKATWNAISQLKTIAGLKSNHSSDLVEPESLSEPQLKWLAEHLIYTPT
ENGLKVESKEGLWLTKSPLSHMLPPCDSTRYKLVPALLTSIGITGTFLGITLGLSQFSMAGDSKALLNSAAELLEGMKTA
FYTSLAGLSSSAVFMALMKVSSSRLSKAQETFLKAISNQYFEASPVYYLKNMSNEGQQEVVAAQLRSATAIENMSQQFRE
TAASLSKLGDSFNGDAIADKVSEAVKGSIKDQLTPAVQAITGELSALRDIKEQSQKELVELLVDKMKSELIDPVSEELKK
TSDAVSQSNEVSAQLNANVEKVVTSTAQTVETINEFQKDTMDKLQQFAESLKQILASFKDDTQGAMSTIAKEVQTLLDGA
SKGLEEQRDAFELSAGRASAAFEGIKTSMDGALNERQQKEQVLFDGVETRINALIEGSSAAFKQQTDVLEAVGEQASSLM
TSAKQELESGLGDIDEKVKSMSTTVQKELETFRLQYQQNLTAYFEQQNSSLEDSLSKQRNGLNEVVENFRKVFESEYQAR
HNLLQELTAQYEKLEASAQTVERVAKAIGLNEVSRMAELQDAAQTMGRQIALLKKEYATASASFTDVTENLPKAMDEYFS
RANESFETFFNDFDQSASTIHNKLSQAAGYLINAQVQNREFEADRVEV
>Mature_688_residues
MLDRVAIISGDGVTDIIIITTLALFFFFAVREVKATWNAISQLKTIAGLKSNHSSDLVEPESLSEPQLKWLAEHLIYTPT
ENGLKVESKEGLWLTKSPLSHMLPPCDSTRYKLVPALLTSIGITGTFLGITLGLSQFSMAGDSKALLNSAAELLEGMKTA
FYTSLAGLSSSAVFMALMKVSSSRLSKAQETFLKAISNQYFEASPVYYLKNMSNEGQQEVVAAQLRSATAIENMSQQFRE
TAASLSKLGDSFNGDAIADKVSEAVKGSIKDQLTPAVQAITGELSALRDIKEQSQKELVELLVDKMKSELIDPVSEELKK
TSDAVSQSNEVSAQLNANVEKVVTSTAQTVETINEFQKDTMDKLQQFAESLKQILASFKDDTQGAMSTIAKEVQTLLDGA
SKGLEEQRDAFELSAGRASAAFEGIKTSMDGALNERQQKEQVLFDGVETRINALIEGSSAAFKQQTDVLEAVGEQASSLM
TSAKQELESGLGDIDEKVKSMSTTVQKELETFRLQYQQNLTAYFEQQNSSLEDSLSKQRNGLNEVVENFRKVFESEYQAR
HNLLQELTAQYEKLEASAQTVERVAKAIGLNEVSRMAELQDAAQTMGRQIALLKKEYATASASFTDVTENLPKAMDEYFS
RANESFETFFNDFDQSASTIHNKLSQAAGYLINAQVQNREFEADRVEV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 75593; Mature: 75593

Theoretical pI: Translated: 4.50; Mature: 4.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLDRVAIISGDGVTDIIIITTLALFFFFAVREVKATWNAISQLKTIAGLKSNHSSDLVEP
CCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
ESLSEPQLKWLAEHLIYTPTENGLKVESKEGLWLTKSPLSHMLPPCDSTRYKLVPALLTS
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCEEECCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
IGITGTFLGITLGLSQFSMAGDSKALLNSAAELLEGMKTAFYTSLAGLSSSAVFMALMKV
HCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
SSSRLSKAQETFLKAISNQYFEASPVYYLKNMSNEGQQEVVAAQLRSATAIENMSQQFRE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TAASLSKLGDSFNGDAIADKVSEAVKGSIKDQLTPAVQAITGELSALRDIKEQSQKELVE
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLVDKMKSELIDPVSEELKKTSDAVSQSNEVSAQLNANVEKVVTSTAQTVETINEFQKDT
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MDKLQQFAESLKQILASFKDDTQGAMSTIAKEVQTLLDGASKGLEEQRDAFELSAGRASA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCHHH
AFEGIKTSMDGALNERQQKEQVLFDGVETRINALIEGSSAAFKQQTDVLEAVGEQASSLM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TSAKQELESGLGDIDEKVKSMSTTVQKELETFRLQYQQNLTAYFEQQNSSLEDSLSKQRN
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHC
GLNEVVENFRKVFESEYQARHNLLQELTAQYEKLEASAQTVERVAKAIGLNEVSRMAELQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
DAAQTMGRQIALLKKEYATASASFTDVTENLPKAMDEYFSRANESFETFFNDFDQSASTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
HNKLSQAAGYLINAQVQNREFEADRVEV
HHHHHHHHCCEEECHHHCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
ESLSEPQLKWLAEHLIYTPTENGLKVESKEGLWLTKSPLSHMLPPCDSTRYKLVPALLTS
CCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCEEECCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
IGITGTFLGITLGLSQFSMAGDSKALLNSAAELLEGMKTAFYTSLAGLSSSAVFMALMKV
HCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
SSSRLSKAQETFLKAISNQYFEASPVYYLKNMSNEGQQEVVAAQLRSATAIENMSQQFRE
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TAASLSKLGDSFNGDAIADKVSEAVKGSIKDQLTPAVQAITGELSALRDIKEQSQKELVE
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLVDKMKSELIDPVSEELKKTSDAVSQSNEVSAQLNANVEKVVTSTAQTVETINEFQKDT
HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MDKLQQFAESLKQILASFKDDTQGAMSTIAKEVQTLLDGASKGLEEQRDAFELSAGRASA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCHHH
AFEGIKTSMDGALNERQQKEQVLFDGVETRINALIEGSSAAFKQQTDVLEAVGEQASSLM
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TSAKQELESGLGDIDEKVKSMSTTVQKELETFRLQYQQNLTAYFEQQNSSLEDSLSKQRN
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GLNEVVENFRKVFESEYQARHNLLQELTAQYEKLEASAQTVERVAKAIGLNEVSRMAELQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
DAAQTMGRQIALLKKEYATASASFTDVTENLPKAMDEYFSRANESFETFFNDFDQSASTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH
HNKLSQAAGYLINAQVQNREFEADRVEV
HHHHHHHHCCEEECHHHCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA