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The map label for this gene is 21226663

Identifier: 21226663

GI number: 21226663

Start: 685292

End: 687724

Strand: Reverse

Name: 21226663

Synonym: MM_0561

Alternate gene names: NA

Gene position: 687724-685292 (Counterclockwise)

Preceding gene: 21226664

Following gene: 21226662

Centisome position: 16.79

GC content: 31.57

Gene sequence:

>2433_bases
ATGTGTATAAAGTTGATGAAAACATCGTTTTCTTCTTTGAATAATGGTTTTATTTTGAGGTCACACTTTCATCAATCGTT
GAAAGACCATTTGGAAGAAGTCACTTCTATAGCAACTCATATTTATGACTCCCAGAATAATGATAGTGAAAAACGAGATA
TTGTCAAAAAAATCTGTATGGCACATGACTTTGGCAAAGCTACTTCTTTTTTTCAAGAGTATCTTGATTTTCAAGAGGCA
AAAGAAAAGGGTGATTTTGGGAGAAAAAATAAAATCTTTGGACCTAACAAAAATCACGCTCTTTTGTCTGCTCTTTTTGC
TTACTGGTGGCTTCCAGAAGAGTACAACTTATTTGGCTATTTGATTATAAAAAGACATCATGGAAGTGTAAAAGATGCCC
GTGATGAATTTGACTTAACAGATGATTATAGTGTAATTGAGGAACAAATACAAGATATTCAAAAATTTAACCAGAAGGAA
CTTGAGAATATTTACGGTTTAAATTTGAATGATTTTTTTGAGTTTGTCAATGAAAGTAATCTTAAGTTAATTAAAAAACG
TTTCCGTAAAGTTTGGCAGTTAAATAACTTTTCTGTAGAGGACACTTTGGATTTTAATTATTTTTATTCTCTCCTACTTA
CTGCGGATAAAATGCAACTGGTATCCGAATTACCGACAATGCCAAATCAAAAACCTTGCTTGTTCGTTGAAAAATATAAA
GACCATATACGTTCTGATCTGCTAGTTGAAAACCCAGCCATTGCAGACTCTCAAATATTCAAAATAAGAGATGAGATATT
CAGAGAAATGAAAGAGGAGCTTGATAGAATTGATTTGAGTTCGGAGTCTTTTTTTTCGATCAATGTTCCAACAGGTTCTG
GAAAAACATTTCTCGCTTATTACTCTGCCCTTTATTTTGCTGACAAACTTAAAAACCTCTATGGTGAGCAATCACGAGTT
ATATATTCTCTTCCTTATATGAGTATAATTGATCAAAACTACGATGAGTTAATAAAAATTATCAAGTTTAACCAAAAAAC
TGATGAAGAACCGAAGGATACAGAGATATTAAAACATCATTCTCTTTCAGAAATAAAATATGAATCAGATGAGACAGAGT
ATAAAAATTATGACGCTAGATTTTGCTACGATAACTGGCAAAGCAGAATTATAACTACTACCTTTGTGCAGTTGTTTAAT
ACTATATTCAAGGTTGGAGATAATTCCATAGCACATCGTTTTAATCGTATTGTAAATTCAATAATAATCCTTGACGAGAT
TCAAGCAGTAGATGAAAAATACTATTCAATAATTCGTACCTTTTTTGAGTTACTAGCAAAGAAATATAACGTTAAGTTTA
TTTTTGTGACTGCAACAATGCCTTTGCTGATTGGAACGCATGAATTGGTGCCGAGAAAGAAAATCTATTTTGAGAGTCTT
GACCGAATCAGGATTTGTAATCACATTAAAGAAGATATATCAGTTAGTGATTTTAAAGATATACTGATAAAAGATATAGA
ATGCCGAAACGACAAAAGTTTCTTGATCGTGCTTAATACAATTAAATTATCAAAGGAAATATTTGAATTCCTTCAAAAAA
ATACCTCCCGAAGTTGCCTCTATCTTTCAACTGAGATATATCCAAAAGCAAGACTTGAGAAAATCCATCTTATTAAGGAT
TGTCGCAAAAAAGATCCTAGCAAAAAGTTTGTAGTTGTCTCAACACAGTTGATAGAGGCGGGCGTTGATATCGATCTGGA
CGTTGTTTACAGAGATTTCTCTCCTTTAAGTTCGATAAATCAAACAGCAGGAAGAGCCAATAGAAACGGAGTGGGTGAAA
ACTCTAGTGAGGTTCATGTCTATAGACTAAAGGATGATGAAAAAGGTCGTTATTTTCACAATTACATATATCCAGCGTTT
ATAACCGATATTACTAGAGAAATTCTTGAAGACAAAGAAATTGTCCAAGAAAAGGATATTTTTTCTCTTAATGAAGTTTA
TGCGAAAAAAATTAACCAAAAAATTTGTCAAGATAAATCGATTGAAATCCTTGAACATGTCAAAAACCTTGACTTTAAAA
AACTAAGAGACTCTTTTGAATTAATCAAGAATGAGTATGCGTTCAAGCGAGATATCGTTATCGAAGCAGATTCTGAATGT
TCTCTAATTATTAAAGAAATCTCTGAACTTAAAAGAGATAAGTTATTAACTAAAGATAAATGGGAATATAATTTTAAAGT
TAAAAATCTATTTCGTCGCCTGAATCAATATAAGATCTCTATATATGAAAGTACTTATTCGTTAATATCTGATGATCTTC
TTAAGATCAGTGGATTCGATACCGAATATCTTCCGCTAAAGTCTGGTACTAGAGAACTTTATTCACCTAGTATAGGTATA
GTTTCAGAAGCCAAATCTATTGAAATTTTATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGGAGTATATAAGTTATGAGAAGATTTTGTTTGCTTTCAGAGAGGATGATACTTGTAAAAAAGAGATAGCATGCAGTTT
AATGGGGAATCTAAAAAGGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATGGAGACTTGTTTTTGTATATAAACTACACTTGTCTACAGTATCCAGACGTCCGTCTGCGTATGCGTGATGGTTCAAA
GCTAAGAGGTTTCTTCGCAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 810; Mature: 810

Protein sequence:

>810_residues
MCIKLMKTSFSSLNNGFILRSHFHQSLKDHLEEVTSIATHIYDSQNNDSEKRDIVKKICMAHDFGKATSFFQEYLDFQEA
KEKGDFGRKNKIFGPNKNHALLSALFAYWWLPEEYNLFGYLIIKRHHGSVKDARDEFDLTDDYSVIEEQIQDIQKFNQKE
LENIYGLNLNDFFEFVNESNLKLIKKRFRKVWQLNNFSVEDTLDFNYFYSLLLTADKMQLVSELPTMPNQKPCLFVEKYK
DHIRSDLLVENPAIADSQIFKIRDEIFREMKEELDRIDLSSESFFSINVPTGSGKTFLAYYSALYFADKLKNLYGEQSRV
IYSLPYMSIIDQNYDELIKIIKFNQKTDEEPKDTEILKHHSLSEIKYESDETEYKNYDARFCYDNWQSRIITTTFVQLFN
TIFKVGDNSIAHRFNRIVNSIIILDEIQAVDEKYYSIIRTFFELLAKKYNVKFIFVTATMPLLIGTHELVPRKKIYFESL
DRIRICNHIKEDISVSDFKDILIKDIECRNDKSFLIVLNTIKLSKEIFEFLQKNTSRSCLYLSTEIYPKARLEKIHLIKD
CRKKDPSKKFVVVSTQLIEAGVDIDLDVVYRDFSPLSSINQTAGRANRNGVGENSSEVHVYRLKDDEKGRYFHNYIYPAF
ITDITREILEDKEIVQEKDIFSLNEVYAKKINQKICQDKSIEILEHVKNLDFKKLRDSFELIKNEYAFKRDIVIEADSEC
SLIIKEISELKRDKLLTKDKWEYNFKVKNLFRRLNQYKISIYESTYSLISDDLLKISGFDTEYLPLKSGTRELYSPSIGI
VSEAKSIEIL

Sequences:

>Translated_810_residues
MCIKLMKTSFSSLNNGFILRSHFHQSLKDHLEEVTSIATHIYDSQNNDSEKRDIVKKICMAHDFGKATSFFQEYLDFQEA
KEKGDFGRKNKIFGPNKNHALLSALFAYWWLPEEYNLFGYLIIKRHHGSVKDARDEFDLTDDYSVIEEQIQDIQKFNQKE
LENIYGLNLNDFFEFVNESNLKLIKKRFRKVWQLNNFSVEDTLDFNYFYSLLLTADKMQLVSELPTMPNQKPCLFVEKYK
DHIRSDLLVENPAIADSQIFKIRDEIFREMKEELDRIDLSSESFFSINVPTGSGKTFLAYYSALYFADKLKNLYGEQSRV
IYSLPYMSIIDQNYDELIKIIKFNQKTDEEPKDTEILKHHSLSEIKYESDETEYKNYDARFCYDNWQSRIITTTFVQLFN
TIFKVGDNSIAHRFNRIVNSIIILDEIQAVDEKYYSIIRTFFELLAKKYNVKFIFVTATMPLLIGTHELVPRKKIYFESL
DRIRICNHIKEDISVSDFKDILIKDIECRNDKSFLIVLNTIKLSKEIFEFLQKNTSRSCLYLSTEIYPKARLEKIHLIKD
CRKKDPSKKFVVVSTQLIEAGVDIDLDVVYRDFSPLSSINQTAGRANRNGVGENSSEVHVYRLKDDEKGRYFHNYIYPAF
ITDITREILEDKEIVQEKDIFSLNEVYAKKINQKICQDKSIEILEHVKNLDFKKLRDSFELIKNEYAFKRDIVIEADSEC
SLIIKEISELKRDKLLTKDKWEYNFKVKNLFRRLNQYKISIYESTYSLISDDLLKISGFDTEYLPLKSGTRELYSPSIGI
VSEAKSIEIL
>Mature_810_residues
MCIKLMKTSFSSLNNGFILRSHFHQSLKDHLEEVTSIATHIYDSQNNDSEKRDIVKKICMAHDFGKATSFFQEYLDFQEA
KEKGDFGRKNKIFGPNKNHALLSALFAYWWLPEEYNLFGYLIIKRHHGSVKDARDEFDLTDDYSVIEEQIQDIQKFNQKE
LENIYGLNLNDFFEFVNESNLKLIKKRFRKVWQLNNFSVEDTLDFNYFYSLLLTADKMQLVSELPTMPNQKPCLFVEKYK
DHIRSDLLVENPAIADSQIFKIRDEIFREMKEELDRIDLSSESFFSINVPTGSGKTFLAYYSALYFADKLKNLYGEQSRV
IYSLPYMSIIDQNYDELIKIIKFNQKTDEEPKDTEILKHHSLSEIKYESDETEYKNYDARFCYDNWQSRIITTTFVQLFN
TIFKVGDNSIAHRFNRIVNSIIILDEIQAVDEKYYSIIRTFFELLAKKYNVKFIFVTATMPLLIGTHELVPRKKIYFESL
DRIRICNHIKEDISVSDFKDILIKDIECRNDKSFLIVLNTIKLSKEIFEFLQKNTSRSCLYLSTEIYPKARLEKIHLIKD
CRKKDPSKKFVVVSTQLIEAGVDIDLDVVYRDFSPLSSINQTAGRANRNGVGENSSEVHVYRLKDDEKGRYFHNYIYPAF
ITDITREILEDKEIVQEKDIFSLNEVYAKKINQKICQDKSIEILEHVKNLDFKKLRDSFELIKNEYAFKRDIVIEADSEC
SLIIKEISELKRDKLLTKDKWEYNFKVKNLFRRLNQYKISIYESTYSLISDDLLKISGFDTEYLPLKSGTRELYSPSIGI
VSEAKSIEIL

Specific function: Unknown

COG id: COG1203

COG function: function code R; Predicted helicases

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 helicase C-terminal domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR014001
- InterPro:   IPR011545
- InterPro:   IPR001650
- InterPro:   IPR006474
- InterPro:   IPR014021 [H]

Pfam domain/function: PF00270 DEAD [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95477; Mature: 95477

Theoretical pI: Translated: 6.35; Mature: 6.35

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MCIKLMKTSFSSLNNGFILRSHFHQSLKDHLEEVTSIATHIYDSQNNDSEKRDIVKKICM
CCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AHDFGKATSFFQEYLDFQEAKEKGDFGRKNKIFGPNKNHALLSALFAYWWLPEEYNLFGY
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE
LIIKRHHGSVKDARDEFDLTDDYSVIEEQIQDIQKFNQKELENIYGLNLNDFFEFVNESN
EEEEECCCCCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCC
LKLIKKRFRKVWQLNNFSVEDTLDFNYFYSLLLTADKMQLVSELPTMPNQKPCLFVEKYK
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEHHHHH
DHIRSDLLVENPAIADSQIFKIRDEIFREMKEELDRIDLSSESFFSINVPTGSGKTFLAY
HHHHHCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHH
YSALYFADKLKNLYGEQSRVIYSLPYMSIIDQNYDELIKIIKFNQKTDEEPKDTEILKHH
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHC
SLSEIKYESDETEYKNYDARFCYDNWQSRIITTTFVQLFNTIFKVGDNSIAHRFNRIVNS
CHHHCCCCCCCCHHCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
IIILDEIQAVDEKYYSIIRTFFELLAKKYNVKFIFVTATMPLLIGTHELVPRKKIYFESL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHH
DRIRICNHIKEDISVSDFKDILIKDIECRNDKSFLIVLNTIKLSKEIFEFLQKNTSRSCL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE
YLSTEIYPKARLEKIHLIKDCRKKDPSKKFVVVSTQLIEAGVDIDLDVVYRDFSPLSSIN
EEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHH
QTAGRANRNGVGENSSEVHVYRLKDDEKGRYFHNYIYPAFITDITREILEDKEIVQEKDI
HHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
FSLNEVYAKKINQKICQDKSIEILEHVKNLDFKKLRDSFELIKNEYAFKRDIVIEADSEC
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCH
SLIIKEISELKRDKLLTKDKWEYNFKVKNLFRRLNQYKISIYESTYSLISDDLLKISGFD
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECEEHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHEECCCC
TEYLPLKSGTRELYSPSIGIVSEAKSIEIL
CCCCCCCCCCHHHHCCCCCEECCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MCIKLMKTSFSSLNNGFILRSHFHQSLKDHLEEVTSIATHIYDSQNNDSEKRDIVKKICM
CCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH
AHDFGKATSFFQEYLDFQEAKEKGDFGRKNKIFGPNKNHALLSALFAYWWLPEEYNLFGY
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEE
LIIKRHHGSVKDARDEFDLTDDYSVIEEQIQDIQKFNQKELENIYGLNLNDFFEFVNESN
EEEEECCCCCCCCHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCC
LKLIKKRFRKVWQLNNFSVEDTLDFNYFYSLLLTADKMQLVSELPTMPNQKPCLFVEKYK
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEHHHHH
DHIRSDLLVENPAIADSQIFKIRDEIFREMKEELDRIDLSSESFFSINVPTGSGKTFLAY
HHHHHCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHH
YSALYFADKLKNLYGEQSRVIYSLPYMSIIDQNYDELIKIIKFNQKTDEEPKDTEILKHH
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHC
SLSEIKYESDETEYKNYDARFCYDNWQSRIITTTFVQLFNTIFKVGDNSIAHRFNRIVNS
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IIILDEIQAVDEKYYSIIRTFFELLAKKYNVKFIFVTATMPLLIGTHELVPRKKIYFESL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECHHHHHCCHHHCCCHHHHHHHH
DRIRICNHIKEDISVSDFKDILIKDIECRNDKSFLIVLNTIKLSKEIFEFLQKNTSRSCL
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HHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
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SLIIKEISELKRDKLLTKDKWEYNFKVKNLFRRLNQYKISIYESTYSLISDDLLKISGFD
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEECEEHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHHHHHEECCCC
TEYLPLKSGTRELYSPSIGIVSEAKSIEIL
CCCCCCCCCCHHHHCCCCCEECCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]