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The map label for this gene is 209695474

Identifier: 209695474

GI number: 209695474

Start: 2166942

End: 2169395

Strand: Direct

Name: 209695474

Synonym: VSAL_I2024

Alternate gene names: NA

Gene position: 2166942-2169395 (Clockwise)

Preceding gene: 209695473

Following gene: 209695475

Centisome position: 65.17

GC content: 39.93

Gene sequence:

>2454_bases
ATGTCATTTCCGGTAGTTAGGGCACTTTTAGGGCACTACCGTCGCCACCCATTACAAATATTTTTAGTATGGCTTGGTTT
AACACTTGGCGTATCGCTTCTTGTGGGTGTATTAGCCATTAATCACCATGCAAAGATAAGCTATAGCGAAGGCGAGAAAC
TCTTTTCTAATCCTTTTCCTAATCGTATTCGCTCTATTCAAGAAAACATCACGATTCCTCAAGCGTTCTATATTAATTTA
CGTCGAGCGGGCTACACCTCCTGTATGCCGGTTCAAACTCAGCATTTAGAAACAACCAATGATATTGATATCTCGTTGGT
TGGTATTGATCCTGTCGCATTAATGCAGATTTCAAAAAATAGCGTAGCAAGCAATGAGAATTTGTTGTCGTTAATGCGTC
CGCCGTTTCCTGTTCTTATTAGCCAACCTTTAGCGTCTTATTTTAGCTTAAGTGATGGCGATTATATTGAACTTGAAAAT
CAAGCTAATCTTGGTCCTGTCATCGTTGATAAATTTAATCGACTTTCTGGATCTCGACTTTTTTCTGATATTTCATTAAC
TCGAATGCTGGGTCATAAGGCAGGTTTTGATGTTTTACTGTGCGGTGAAATGTCCGAAAAAGAAGCCGATAGATTAGAAC
GAATGCTACCAAGAGGGTTGCAGCTCGATACACATAAAGAATCTGGTTTAACCGCATTAACAAAAGCATTTCATACCAAC
CTATTTGCGATGGGTATGCTTTCTTTTGTTGTTGGTTTATTTATTTTTTACCAAGCAATGTCGCTTTCTTTTATTCAACG
TCAGCCTTTAGTTGGAACATTAAGACAAATTGGCGTATCAACAAAAGAGTTGATATTTGCGATGAGTGCCGAGGTGATGT
TGTGGGTACTTATTGGTTGGTTAAGCGGTAATTTCTTTGGGGTATTGCTTGCTAATGAGTTAATGCCTACGGTTTCTAAT
AGCTTATATTCACTCTACAACGCGGATGTTGATTTGCTAATTACGTGGAGTTGGAGCTGGAGTTATCAAAGCTTATGGAT
GGCGATTCTTGGCTGTATTTTAGCGTGTGGTTGGCCGTTATACCGCTTGCTTAGTATCGAACCTATTCGATTAACTGCTC
GTTTATCATTGGTTCGTTTTGCAGGGAAAGAATTTGAAGTTCAGGCCATTATTGCCTGCGTATTTTGTGTTGCAGCGTAT
TTAATTCATTTATTGCCTCATAGCCATGAGTATGGATTTATTCTTATTGGTTTCTTAATGGTGGGGGTTGGATTATTGAC
TCCATTTATTATTTTAAAATTATTTGATTGGCTTTCTTACAAATTACCGTCGCCTAAAGCGCGATGGTTTTTTGCCGATT
CGTCTGCAAGTTTAAGTTATCGAGGCGTCGCTGCGATGGCATTTATGTTAGCCCTTGCGTCTAATATTGGTGTTGAAACG
ATGGTGGGTAGCTTTAGGGCAACGACTAACGATTGGCTTGAACAACGCTTAGCTGCCGATATTTATATACAACCGAGTAA
GGCTTCTGCGAGTCGAATTACTTATTGGCTAGAGAAACAACCAGAAGTTGAAGAAGTATGGCGTCAATGGAAAATTGATT
ATCAGACCGAGTATGGCAATTTAGAGATTTTAAGTACAGGTTCATCGCCTGGTGAGAAAAATGCATTAACCATGAAAGTG
GCCATTCCTGAATATTGGGATTCATTACACCACTCTCGCAGTTTGCTGATTAGTGAATCAATGGCTCTGAAATGGGATTT
AAAACCGGGAGATTACTTGGATCTACCGGCTCCGGTTGGTGACAATTGGCAAATATCTGGGGTTTATTATGATTATGGAA
ATCAGTACAACCAGTTAATGCTTACGCACAATGCTTGGCTAAAGGCCTTTGGTGGGCAAGGAACCACCGGTATTGGTGTT
GTGCTTACTGATGAAAGCAAACGAACTCAATTGATTGGCCGAGTGCTTAAAAAATACAGATTACCAGTCGAACAAGTCGT
TGATAATAACAATATTCAAACACAAGCGATGAAGGTGTTTGATCGGACTTTTATCGTAACGGGAACCTTAGGTAATTTAA
CGTTAGTTATTGCTGTGTTTGGTCTGTTTTTTGCTACTTTAGTCGGGGAAACCTCTCGTCAGCGGCAAACGGCGTTGTTA
CGTTGCTTGGGCCTTTCAGGCAAAGAACTCATTATGCTCGGTGGATTGCAATTATTGGCTATTGGATTGTTGACGATTTT
AATTGCGTTGCCTCTTGGCATTCTCTTATCTCAATTACTCATTGATATCGTAATGAAATATGCATTTGGTTGGACGATGG
AAATTAATTATTTCCCTATGGAATATTTAGCTACTTTTGGATGGGCTTTGCTTGCTCTAACGGTTGCAGGTTCGGCAACG
GTATGGCGAGTGACTAGACGACAAGCGATTACGTCTTTAAGAGAGTCTTTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTTTCTCGTGATCTTCATTGCACTTTATTATTGGTTACTCACAGTGAAAAAGTAGCGAATCATATGGATGGGCTTATTAA
ACTGCAAGGAGGAAAATTAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGCGATGAATAAAGAGAAAAAAACCAGCCTAAAGGTGTCACTGTTTATTCTTATCGTTGTATTTTCTTTTTCTGCTGCT
TATTACATAAATTGGCATGA

Product: predicted permease

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 817; Mature: 816

Protein sequence:

>817_residues
MSFPVVRALLGHYRRHPLQIFLVWLGLTLGVSLLVGVLAINHHAKISYSEGEKLFSNPFPNRIRSIQENITIPQAFYINL
RRAGYTSCMPVQTQHLETTNDIDISLVGIDPVALMQISKNSVASNENLLSLMRPPFPVLISQPLASYFSLSDGDYIELEN
QANLGPVIVDKFNRLSGSRLFSDISLTRMLGHKAGFDVLLCGEMSEKEADRLERMLPRGLQLDTHKESGLTALTKAFHTN
LFAMGMLSFVVGLFIFYQAMSLSFIQRQPLVGTLRQIGVSTKELIFAMSAEVMLWVLIGWLSGNFFGVLLANELMPTVSN
SLYSLYNADVDLLITWSWSWSYQSLWMAILGCILACGWPLYRLLSIEPIRLTARLSLVRFAGKEFEVQAIIACVFCVAAY
LIHLLPHSHEYGFILIGFLMVGVGLLTPFIILKLFDWLSYKLPSPKARWFFADSSASLSYRGVAAMAFMLALASNIGVET
MVGSFRATTNDWLEQRLAADIYIQPSKASASRITYWLEKQPEVEEVWRQWKIDYQTEYGNLEILSTGSSPGEKNALTMKV
AIPEYWDSLHHSRSLLISESMALKWDLKPGDYLDLPAPVGDNWQISGVYYDYGNQYNQLMLTHNAWLKAFGGQGTTGIGV
VLTDESKRTQLIGRVLKKYRLPVEQVVDNNNIQTQAMKVFDRTFIVTGTLGNLTLVIAVFGLFFATLVGETSRQRQTALL
RCLGLSGKELIMLGGLQLLAIGLLTILIALPLGILLSQLLIDIVMKYAFGWTMEINYFPMEYLATFGWALLALTVAGSAT
VWRVTRRQAITSLRESL

Sequences:

>Translated_817_residues
MSFPVVRALLGHYRRHPLQIFLVWLGLTLGVSLLVGVLAINHHAKISYSEGEKLFSNPFPNRIRSIQENITIPQAFYINL
RRAGYTSCMPVQTQHLETTNDIDISLVGIDPVALMQISKNSVASNENLLSLMRPPFPVLISQPLASYFSLSDGDYIELEN
QANLGPVIVDKFNRLSGSRLFSDISLTRMLGHKAGFDVLLCGEMSEKEADRLERMLPRGLQLDTHKESGLTALTKAFHTN
LFAMGMLSFVVGLFIFYQAMSLSFIQRQPLVGTLRQIGVSTKELIFAMSAEVMLWVLIGWLSGNFFGVLLANELMPTVSN
SLYSLYNADVDLLITWSWSWSYQSLWMAILGCILACGWPLYRLLSIEPIRLTARLSLVRFAGKEFEVQAIIACVFCVAAY
LIHLLPHSHEYGFILIGFLMVGVGLLTPFIILKLFDWLSYKLPSPKARWFFADSSASLSYRGVAAMAFMLALASNIGVET
MVGSFRATTNDWLEQRLAADIYIQPSKASASRITYWLEKQPEVEEVWRQWKIDYQTEYGNLEILSTGSSPGEKNALTMKV
AIPEYWDSLHHSRSLLISESMALKWDLKPGDYLDLPAPVGDNWQISGVYYDYGNQYNQLMLTHNAWLKAFGGQGTTGIGV
VLTDESKRTQLIGRVLKKYRLPVEQVVDNNNIQTQAMKVFDRTFIVTGTLGNLTLVIAVFGLFFATLVGETSRQRQTALL
RCLGLSGKELIMLGGLQLLAIGLLTILIALPLGILLSQLLIDIVMKYAFGWTMEINYFPMEYLATFGWALLALTVAGSAT
VWRVTRRQAITSLRESL
>Mature_816_residues
SFPVVRALLGHYRRHPLQIFLVWLGLTLGVSLLVGVLAINHHAKISYSEGEKLFSNPFPNRIRSIQENITIPQAFYINLR
RAGYTSCMPVQTQHLETTNDIDISLVGIDPVALMQISKNSVASNENLLSLMRPPFPVLISQPLASYFSLSDGDYIELENQ
ANLGPVIVDKFNRLSGSRLFSDISLTRMLGHKAGFDVLLCGEMSEKEADRLERMLPRGLQLDTHKESGLTALTKAFHTNL
FAMGMLSFVVGLFIFYQAMSLSFIQRQPLVGTLRQIGVSTKELIFAMSAEVMLWVLIGWLSGNFFGVLLANELMPTVSNS
LYSLYNADVDLLITWSWSWSYQSLWMAILGCILACGWPLYRLLSIEPIRLTARLSLVRFAGKEFEVQAIIACVFCVAAYL
IHLLPHSHEYGFILIGFLMVGVGLLTPFIILKLFDWLSYKLPSPKARWFFADSSASLSYRGVAAMAFMLALASNIGVETM
VGSFRATTNDWLEQRLAADIYIQPSKASASRITYWLEKQPEVEEVWRQWKIDYQTEYGNLEILSTGSSPGEKNALTMKVA
IPEYWDSLHHSRSLLISESMALKWDLKPGDYLDLPAPVGDNWQISGVYYDYGNQYNQLMLTHNAWLKAFGGQGTTGIGVV
LTDESKRTQLIGRVLKKYRLPVEQVVDNNNIQTQAMKVFDRTFIVTGTLGNLTLVIAVFGLFFATLVGETSRQRQTALLR
CLGLSGKELIMLGGLQLLAIGLLTILIALPLGILLSQLLIDIVMKYAFGWTMEINYFPMEYLATFGWALLALTVAGSATV
WRVTRRQAITSLRESL

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91532; Mature: 91401

Theoretical pI: Translated: 7.85; Mature: 7.85

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSFPVVRALLGHYRRHPLQIFLVWLGLTLGVSLLVGVLAINHHAKISYSEGEKLFSNPFP
CCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHCCCCC
NRIRSIQENITIPQAFYINLRRAGYTSCMPVQTQHLETTNDIDISLVGIDPVALMQISKN
HHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHEECCC
SVASNENLLSLMRPPFPVLISQPLASYFSLSDGDYIELENQANLGPVIVDKFNRLSGSRL
CCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHH
FSDISLTRMLGHKAGFDVLLCGEMSEKEADRLERMLPRGLQLDTHKESGLTALTKAFHTN
HHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHH
LFAMGMLSFVVGLFIFYQAMSLSFIQRQPLVGTLRQIGVSTKELIFAMSAEVMLWVLIGW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSGNFFGVLLANELMPTVSNSLYSLYNADVDLLITWSWSWSYQSLWMAILGCILACGWPL
HCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
YRLLSIEPIRLTARLSLVRFAGKEFEVQAIIACVFCVAAYLIHLLPHSHEYGFILIGFLM
HHHHCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
VGVGLLTPFIILKLFDWLSYKLPSPKARWFFADSSASLSYRGVAAMAFMLALASNIGVET
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MVGSFRATTNDWLEQRLAADIYIQPSKASASRITYWLEKQPEVEEVWRQWKIDYQTEYGN
HHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCEEECCCC
LEILSTGSSPGEKNALTMKVAIPEYWDSLHHSRSLLISESMALKWDLKPGDYLDLPAPVG
EEEEECCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEECCCCCCCCCCCCCC
DNWQISGVYYDYGNQYNQLMLTHNAWLKAFGGQGTTGIGVVLTDESKRTQLIGRVLKKYR
CCEEEEEEEEECCCCCCEEEEEEHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHC
LPVEQVVDNNNIQTQAMKVFDRTFIVTGTLGNLTLVIAVFGLFFATLVGETSRQRQTALL
CCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHH
RCLGLSGKELIMLGGLQLLAIGLLTILIALPLGILLSQLLIDIVMKYAFGWTMEINYFPM
HHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCH
EYLATFGWALLALTVAGSATVWRVTRRQAITSLRESL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SFPVVRALLGHYRRHPLQIFLVWLGLTLGVSLLVGVLAINHHAKISYSEGEKLFSNPFP
CCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCHHHCCCCC
NRIRSIQENITIPQAFYINLRRAGYTSCMPVQTQHLETTNDIDISLVGIDPVALMQISKN
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SVASNENLLSLMRPPFPVLISQPLASYFSLSDGDYIELENQANLGPVIVDKFNRLSGSRL
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FSDISLTRMLGHKAGFDVLLCGEMSEKEADRLERMLPRGLQLDTHKESGLTALTKAFHTN
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LSGNFFGVLLANELMPTVSNSLYSLYNADVDLLITWSWSWSYQSLWMAILGCILACGWPL
HCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
YRLLSIEPIRLTARLSLVRFAGKEFEVQAIIACVFCVAAYLIHLLPHSHEYGFILIGFLM
HHHHCCCCEEHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHH
VGVGLLTPFIILKLFDWLSYKLPSPKARWFFADSSASLSYRGVAAMAFMLALASNIGVET
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
MVGSFRATTNDWLEQRLAADIYIQPSKASASRITYWLEKQPEVEEVWRQWKIDYQTEYGN
HHHHHCCCHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHEEEEECCCCCHHHHHHHCCCCEEECCCC
LEILSTGSSPGEKNALTMKVAIPEYWDSLHHSRSLLISESMALKWDLKPGDYLDLPAPVG
EEEEECCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEECCCCCCCCCCCCCC
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RCLGLSGKELIMLGGLQLLAIGLLTILIALPLGILLSQLLIDIVMKYAFGWTMEINYFPM
HHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCH
EYLATFGWALLALTVAGSATVWRVTRRQAITSLRESL
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA