Definition | Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 chromosome, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_011374 |
Length | 874,478 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 209554118
Identifier: 209554118
GI number: 209554118
Start: 651433
End: 654174
Strand: Reverse
Name: 209554118
Synonym: UUR10_0544
Alternate gene names: NA
Gene position: 654174-651433 (Counterclockwise)
Preceding gene: 209554084
Following gene: 209554274
Centisome position: 74.81
GC content: 21.92
Gene sequence:
>2742_bases ATGAGATTAAAAAATAAAAATAAATACTGAAACTTACTTATTGCTTCATTAATATCAATACCTATTATCAGCACCATTTC TGCATGTAGTTTTAGTGAAACCAGATATAAATTAAAAGTTTTAGATTATTTTTTAAAAACAGAAAATGACGATTATTATA TTGCTTATGAATTTAATAAATTAACAAATGAAGATATGCAAAAAATGCCAAAAGTTATTTTTTCAACAAGTATTATTAAT AGTTCAAACCAAAAAATTGCTTTTTATGTTGATATAAAACCAATTATTATAAATAATCGTATTTATATTCGCTTACCCCA ACGTCCTAAACCTAATGAAAAAATTATTATAAATTCAAGTCAAGAATTTGTTGGCGTTCAAGTGATTCAAACTAATAAAA TGTTAACTGAATCTATTGATTTTAATTTTAATAAAAAAGATGATTTAATCAAAGTTGTTGACCAGAGTGCCCGATTTACT AACATTAAAAAAACAGAAGTTGAATTCGAAATTAAGCTTTTAAATTTAAATCTTAATGATATTAAAGATAAAAATATTGA AATTGAATTAACAAATAAAAAAACAAATAAAACCTTTAAATTGCATTTTCTAAAATATCAATTTAATCACTTAACACATC AAAATAAAAAACCAGTATTAACTATTACTGCTAATTTAAATGCTGATGCAAATAACCAATTAGATGATGGTGAATATTTT ATTTCTAAATTAGTTTTAGACCAAAAAAAACTTGAAATTAACCAAAATGTTTATAAACCAAGTGGGTTACAGTTAGATGG AAGTATTAATAATCAAAGACCAACTTATTTATTAATTCCATCTGTTTTTTCAAAATGAACAAAAATAAATGTTTTAGATA CTAAAGTGATTAAAAATGATGGAATTCCACAACAATTACAACTTTCATATGATCATTTTATTAACCCATATAATTTTAAA GATAATATGTTAAGTGCAGATATTGAACTTATATCAACTAAAAATAATAAAACTATTATTTTAAAATCATTAAAGTTTAA TCACGATAAAAACAATATTGTTTTTGATTTAGCCAATAATTTAGAATTACAAACTCTTATTTTAAAAACTCCTTTTTTTA AAATTAAATCATTAACAATAATGAATGATAAGCAAACTTTGCCATTAAGTATTAGAGAAAAACAGCTTGATTTAACTAAT AAACATCTTTCTAAAATCATTAAATTTACATTTAATGATACTGATCCACAAAATATGCTTATGAAATTTCAATTAGATAG TGATTCGCCAATAGTGCAAAATACTAAAAAAGTTTTATTAACAATTAAAAAAATAAATACAGATCAGCAAGAAGATATAA AGACTTTTAGTTTTGATATTTTAGAAAACAAAATAACAACAGGTTCTTTTTATGATGTAAAAAATAAATATTTTCTATTA AATCTAAATAAAACTTTGAATGCTAAATCAATAGGTCAAATTTTTGAAAATGATTCTAATTATATAATTACTAAATTAAT TGCGGTTAATAATGAAGCATCAATCAATGAAATACCAATTAAAATTGATGATTTACAAAATAAACAATTTACATTAAAAT TTGCTGAATACCAATCAAATGTAATTAAATTTAATGCTAAAAATGATCCTGAATTACATCTTAATATCAAACATTTTAAA CAACTTAATCTTACAAAAATTAATAAAATTAAATTGACTTTAAAAGACGGTAAGCAAATTATTTTTAATCGTTTAAATAA TGAATTTAGTTTCCAACAAGCAGGATTTAAATTAAAAATTAACCAAAACACATTTCCAAATTATTTAAAACAACATCAAT ATGTAATTAAAAGCATTAGTTTAATAAATGATGATCAATCTGTGATTGAGTTATTATCAAAACACAATCATGAAGCTATT TTTGAGATTCCTCTTATAGCATCCCTTGATACTTGAGAATATGACAAAATCCATAATATATTAAAAATTAAAATGAAATT AGATACTTTAAGTTTACATCAAAGCTTAAATCCATCAGATTATGCTTTAAATTTTTATAATCTTGATACTAATATTATTA ACCGAAAATTTACACTTAGTCCCCAAACTGTTTTATCTTCAAAAGTTAATAATTCAAATGTAATTGAATTAATTTATGAT TTAGATAAAGATCAAAATATTTATGGAGGTTTAAATCCTGATAGCATTTATCAAATTAGTTCGTTAATGATAAATGCTAA ACCAGTGATTATTAATACTTCTTTAACAATGATTCAAATTAGCACTCCAGATCCTAAGATAGAAAAAATTATTGCTAGTT ATGATTCAGTAACCAAAAAAACAAAAATATCATTGCAGTTTTCTAATAATTGATGATATAACAAGAATGCGGATCATAAA CTGTTTGCCATTATTTCGTCTTTAAAGCCTAAAAATAATAAAAATGCTGATTGAACATTTTCATTATCTAGAGTGTTTAA CAATCCTGAAGCAATTAATTCAAACAAGGACACAGATTTTGTTTTAGATAAAGCAACTAAAACTTTAACATATGTAATAA ATCGTCCATATATTTACTATGAAGATCAAAATGATCATGAGTCACTTGATTGGTATTATGATGATTTAGTACTTAATAAA GTAACAATTATTTATAATGATTTAACTACAGATGTTATTAATTCTTCTTCTAAAGATGATCAAAATTTAACTATTAAACT ACCAAACAAAATTAATTCTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTAATTTAACTAAAAATAGCATTAATTTTTATTTAAATTTAACTTAATTACAACCGGTATAAAATATAAATATTTATTTG TTTAGTGGATTGAATAAACT
Downstream 100 bases:
>100_bases CGATATTTTTTTTTTTTTTTTTAAAACTTAATTTTTATAAATAAATGAATTCTATATGATTCATTTGCTTTGCCTTGTCT AAAAGATTAAAAAAGGATTA
Product: putative lipoprotein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 913; Mature: 913
Protein sequence:
>913_residues MRLKNKNKYWNLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKLTNEDMQKMPKVIFSTSIIN SSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQEFVGVQVIQTNKMLTESIDFNFNKKDDLIKVVDQSARFT NIKKTEVEFEIKLLNLNLNDIKDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTHQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYF ISKLVLDQKKLEINQNVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSKWTKINVLDTKVIKNDGIPQQLQLSYDHFINPYNFK DNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLANNLELQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTN KHLSKIIKFTFNDTDPQNMLMKFQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLL NLNKTLNAKSIGQIFENDSNYIITKLIAVNNEASINEIPIKIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVIKFNAKNDPELHLNIKHFK QLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQNTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAI FEIPLIASLDTWEYDKIHNILKIKMKLDTLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYD LDKDQNIYGGLNPDSIYQISSLMINAKPVIINTSLTMIQISTPDPKIEKIIASYDSVTKKTKISLQFSNNWWYNKNADHK LFAIISSLKPKNNKNADWTFSLSRVFNNPEAINSNKDTDFVLDKATKTLTYVINRPYIYYEDQNDHESLDWYYDDLVLNK VTIIYNDLTTDVINSSSKDDQNLTIKLPNKINS
Sequences:
>Translated_913_residues MRLKNKNKY*NLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKLTNEDMQKMPKVIFSTSIIN SSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQEFVGVQVIQTNKMLTESIDFNFNKKDDLIKVVDQSARFT NIKKTEVEFEIKLLNLNLNDIKDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTHQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYF ISKLVLDQKKLEINQNVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSK*TKINVLDTKVIKNDGIPQQLQLSYDHFINPYNFK DNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLANNLELQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTN KHLSKIIKFTFNDTDPQNMLMKFQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLL NLNKTLNAKSIGQIFENDSNYIITKLIAVNNEASINEIPIKIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVIKFNAKNDPELHLNIKHFK QLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQNTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAI FEIPLIASLDT*EYDKIHNILKIKMKLDTLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYD LDKDQNIYGGLNPDSIYQISSLMINAKPVIINTSLTMIQISTPDPKIEKIIASYDSVTKKTKISLQFSNN**YNKNADHK LFAIISSLKPKNNKNAD*TFSLSRVFNNPEAINSNKDTDFVLDKATKTLTYVINRPYIYYEDQNDHESLDWYYDDLVLNK VTIIYNDLTTDVINSSSKDDQNLTIKLPNKINS >Mature_913_residues MRLKNKNKY*NLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKLTNEDMQKMPKVIFSTSIIN SSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQEFVGVQVIQTNKMLTESIDFNFNKKDDLIKVVDQSARFT NIKKTEVEFEIKLLNLNLNDIKDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTHQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYF ISKLVLDQKKLEINQNVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSK*TKINVLDTKVIKNDGIPQQLQLSYDHFINPYNFK DNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLANNLELQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTN KHLSKIIKFTFNDTDPQNMLMKFQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLL NLNKTLNAKSIGQIFENDSNYIITKLIAVNNEASINEIPIKIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVIKFNAKNDPELHLNIKHFK QLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQNTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAI FEIPLIASLDT*EYDKIHNILKIKMKLDTLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYD LDKDQNIYGGLNPDSIYQISSLMINAKPVIINTSLTMIQISTPDPKIEKIIASYDSVTKKTKISLQFSNN**YNKNADHK LFAIISSLKPKNNKNAD*TFSLSRVFNNPEAINSNKDTDFVLDKATKTLTYVINRPYIYYEDQNDHESLDWYYDDLVLNK VTIIYNDLTTDVINSSSKDDQNLTIKLPNKINS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 104929; Mature: 104929
Theoretical pI: Translated: 9.65; Mature: 9.65
Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MRLKNKNKYNLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEECCC TNEDMQKMPKVIFSTSIINSSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQ CCHHHHHHHHHHEEHEEECCCCCEEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCC EFVGVQVIQTNKMLTESIDFNFNKKDDLIKVVDQSARFTNIKKTEVEFEIKLLNLNLNDI CEEEEEEEECCCEEEHHCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCC KDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTHQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYFI CCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHH SKLVLDQKKLEINQNVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSKTKINVLDTKVIKNDGI HHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCCCC PQQLQLSYDHFINPYNFKDNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLANNLE CHHEEECHHHCCCCCCCCCCEEECCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCE LQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTNKHLSKIIKFTFNDTDPQNMLMK EEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEECHHCCHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEE FQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLLNL EEECCCCCHHHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHEEEEEEHHCCCCCCCEEECCCEEEEEEC NKTLNAKSIGQIFENDSNYIITKLIAVNNEASINEIPIKIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVI CCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCCEECCEEEECCCCCEEEEEEEECCCCEE KFNAKNDPELHLNIKHFKQLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQ EEECCCCCEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHCCEEEEECC NTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAIFEIPLIASLDTEYDKIHNILKI CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHCCEEEE KMKLDTLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYDLDK EEEEEEEEHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHCCEEEECCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCC DQNIYGGLNPDSIYQISSLMINAKPVIINTSLTMIQISTPDPKIEKIIASYDSVTKKTKI CCCEECCCCCHHHHEEEHEEEECCEEEEECCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEE SLQFSNNYNKNADHKLFAIISSLKPKNNKNADTFSLSRVFNNPEAINSNKDTDFVLDKAT EEEECCCCCCCCCCCHHEEHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECCC KTLTYVINRPYIYYEDQNDHESLDWYYDDLVLNKVTIIYNDLTTDVINSSSKDDQNLTIK CEEEEEECCCEEEECCCCCCCCCCEEEHHEEEEEEEEEEECCHHHHHCCCCCCCCEEEEE LPNKINS CCCCCCC >Mature Secondary Structure MRLKNKNKYNLLIASLISIPIISTISACSFSETRYKLKVLDYFLKTENDDYYIAYEFNKL CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHEEEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEECCC TNEDMQKMPKVIFSTSIINSSNQKIAFYVDIKPIIINNRIYIRLPQRPKPNEKIIINSSQ CCHHHHHHHHHHEEHEEECCCCCEEEEEEEEEEEEECCEEEEECCCCCCCCCEEEEECCC EFVGVQVIQTNKMLTESIDFNFNKKDDLIKVVDQSARFTNIKKTEVEFEIKLLNLNLNDI CEEEEEEEECCCEEEHHCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCC KDKNIEIELTNKKTNKTFKLHFLKYQFNHLTHQNKKPVLTITANLNADANNQLDDGEYFI CCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEEHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCHHHHH SKLVLDQKKLEINQNVYKPSGLQLDGSINNQRPTYLLIPSVFSKTKINVLDTKVIKNDGI HHHHHCCHHHCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEEEECCCCC PQQLQLSYDHFINPYNFKDNMLSADIELISTKNNKTIILKSLKFNHDKNNIVFDLANNLE CHHEEECHHHCCCCCCCCCCEEECCEEEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCE LQTLILKTPFFKIKSLTIMNDKQTLPLSIREKQLDLTNKHLSKIIKFTFNDTDPQNMLMK EEEEEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEECHHCCHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEE FQLDSDSPIVQNTKKVLLTIKKINTDQQEDIKTFSFDILENKITTGSFYDVKNKYFLLNL EEECCCCCHHHCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHEEEEEEHHCCCCCCCEEECCCEEEEEEC NKTLNAKSIGQIFENDSNYIITKLIAVNNEASINEIPIKIDDLQNKQFTLKFAEYQSNVI CCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCCEECCEEEECCCCCEEEEEEEECCCCEE KFNAKNDPELHLNIKHFKQLNLTKINKIKLTLKDGKQIIFNRLNNEFSFQQAGFKLKINQ EEECCCCCEEEEEHHHHCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHCCCCCCHHHCCEEEEECC NTFPNYLKQHQYVIKSISLINDDQSVIELLSKHNHEAIFEIPLIASLDTEYDKIHNILKI CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHCCEEEE KMKLDTLSLHQSLNPSDYALNFYNLDTNIINRKFTLSPQTVLSSKVNNSNVIELIYDLDK EEEEEEEEHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHCCEEEECCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCC DQNIYGGLNPDSIYQISSLMINAKPVIINTSLTMIQISTPDPKIEKIIASYDSVTKKTKI CCCEECCCCCHHHHEEEHEEEECCEEEEECCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEE SLQFSNNYNKNADHKLFAIISSLKPKNNKNADTFSLSRVFNNPEAINSNKDTDFVLDKAT EEEECCCCCCCCCCCHHEEHHHCCCCCCCCCCEEEEHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECCC KTLTYVINRPYIYYEDQNDHESLDWYYDDLVLNKVTIIYNDLTTDVINSSSKDDQNLTIK CEEEEEECCCEEEECCCCCCCCCCEEEHHEEEEEEEEEEECCHHHHHCCCCCCCCEEEEE LPNKINS CCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA