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The map label for this gene is dagA [H]

Identifier: 190571492

GI number: 190571492

Start: 1186277

End: 1187614

Strand: Direct

Name: dagA [H]

Synonym: WPa_1108

Alternate gene names: 190571492

Gene position: 1186277-1187614 (Clockwise)

Preceding gene: 190571491

Following gene: 190571493

Centisome position: 80.02

GC content: 34.38

Gene sequence:

>1338_bases
ATGATTGTAAAAGCAACTGATCTATTAAACTCTCTTCTGTATATAAAGATATTCAACATTCCATTTATAATTCTTTGGGT
AATTGCAACTGGAGTTTTTTGTACGGTTCGGTTCAAATTCATTAACTTTAGATTATTCAAGTATGGAATACAGACGCTAT
TCAACCTAAAATGTAATGGTAATAACAATGGTATAATCACTCATATTCAAGCGTTTACAACAGTCATTTCAGGAACAGTT
GGCCTTGGAACAATATCAGGAGTTGCAATAGCTATTACAATAGGGGGCCCAAGTGCAATTTTTTGGATGATAATTACTGG
AATACTCGGTATGTCGATAAAGTTTGCTGAAGTAGTGCTTGCATTTACTCATCGCTCTGAAAACACAACTGGTGGGGCTT
TTTATTATATGGAACATGGACTTGCAAAGATTGGATTTATGAAGACTGGCAAATTCCTTGCATTTATCTACGCAGTTATG
CTGCTTGTTGCAATGATTCTAGGCGGCATACCATTTCAGGCAAATCAAATTGCAGCGTTGTCAAGTAACTTATTTGAATA
CAACACATCTGTTATTATCTCGCTATTTGTATTAATTGTAATACTGGGAGGAATAAAGCGAATTGCTTTAGTTGCAACAG
GTTTAGGGCCGATCATGATAATGTTATATATAGGCATGTGTATATATTTAATCTGTGTGAACGGAAATAATCTACTGAAT
GCTCTATCTATAATATTTCAAGATATCTTTAACAAATCAGCTATAGGAGGTGGAGTATTGAGTGGATTAATAGCAGGGGT
AAGAAGGTCAGTGTTTGCTAATGAAGCAGGTACTGGAACAGCAGCTATAGCACATTCGATTGTAAAAGAGAAAGACCCAG
TTAAAGTTGGAAGTGTTGCAATGATTGCACCATTTGTAGACACAATATTAGTCTCATTTTTGACTGGTATTGTGATAATT
ATCACCGATATGCATATCACTAATACTGTAGGTGATATTACGTTAGTTAGCTCAGCATTTTCAACAGCCTTGCCTTTATT
GAGCAAGCTAGCTCTTCCGCTGATAATGTTTTCCTTTGCATTTTCCACAATAATAGCTTACTATTACTACTGTGAAGTTG
CCCTGTTGTACTTATTTGGTAACAAAAAAGTACTGATATTGTTCCAAATTCTTATAGTGGGTTCAGTGTATATCAGTTGT
ATGTCAAAAAATATAGAATTTATATCTTATTTAGGCGATAGCCTGTTTATGTGCCTTATGATTCCAAATGCTGTTGCAAT
ATATCTACTGAGAAGGGAAGTCTTAAATACAATAGATTCTTATTACAAAAGGTATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTAGGTGCATTGTATATACTTACTATTCCAATAAGCACTGGACTTTATATATACTACACATATAAAACTCATTAGCT
ATATAAAAGTAGTGAGCAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACATGATTTATAGATTGCTTTGCATGATGTTATTTTGCCTATCGTTTAACGATGTATACGCTGCTTCAGTTTTTCATAAA
AGTTATGACACTGCATTAAA

Product: sodium/alanine symporter family protein

Products: Na (I) [Cytoplasm]; L-alanine [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 445; Mature: 445

Protein sequence:

>445_residues
MIVKATDLLNSLLYIKIFNIPFIILWVIATGVFCTVRFKFINFRLFKYGIQTLFNLKCNGNNNGIITHIQAFTTVISGTV
GLGTISGVAIAITIGGPSAIFWMIITGILGMSIKFAEVVLAFTHRSENTTGGAFYYMEHGLAKIGFMKTGKFLAFIYAVM
LLVAMILGGIPFQANQIAALSSNLFEYNTSVIISLFVLIVILGGIKRIALVATGLGPIMIMLYIGMCIYLICVNGNNLLN
ALSIIFQDIFNKSAIGGGVLSGLIAGVRRSVFANEAGTGTAAIAHSIVKEKDPVKVGSVAMIAPFVDTILVSFLTGIVII
ITDMHITNTVGDITLVSSAFSTALPLLSKLALPLIMFSFAFSTIIAYYYYCEVALLYLFGNKKVLILFQILIVGSVYISC
MSKNIEFISYLGDSLFMCLMIPNAVAIYLLRREVLNTIDSYYKRY

Sequences:

>Translated_445_residues
MIVKATDLLNSLLYIKIFNIPFIILWVIATGVFCTVRFKFINFRLFKYGIQTLFNLKCNGNNNGIITHIQAFTTVISGTV
GLGTISGVAIAITIGGPSAIFWMIITGILGMSIKFAEVVLAFTHRSENTTGGAFYYMEHGLAKIGFMKTGKFLAFIYAVM
LLVAMILGGIPFQANQIAALSSNLFEYNTSVIISLFVLIVILGGIKRIALVATGLGPIMIMLYIGMCIYLICVNGNNLLN
ALSIIFQDIFNKSAIGGGVLSGLIAGVRRSVFANEAGTGTAAIAHSIVKEKDPVKVGSVAMIAPFVDTILVSFLTGIVII
ITDMHITNTVGDITLVSSAFSTALPLLSKLALPLIMFSFAFSTIIAYYYYCEVALLYLFGNKKVLILFQILIVGSVYISC
MSKNIEFISYLGDSLFMCLMIPNAVAIYLLRREVLNTIDSYYKRY
>Mature_445_residues
MIVKATDLLNSLLYIKIFNIPFIILWVIATGVFCTVRFKFINFRLFKYGIQTLFNLKCNGNNNGIITHIQAFTTVISGTV
GLGTISGVAIAITIGGPSAIFWMIITGILGMSIKFAEVVLAFTHRSENTTGGAFYYMEHGLAKIGFMKTGKFLAFIYAVM
LLVAMILGGIPFQANQIAALSSNLFEYNTSVIISLFVLIVILGGIKRIALVATGLGPIMIMLYIGMCIYLICVNGNNLLN
ALSIIFQDIFNKSAIGGGVLSGLIAGVRRSVFANEAGTGTAAIAHSIVKEKDPVKVGSVAMIAPFVDTILVSFLTGIVII
ITDMHITNTVGDITLVSSAFSTALPLLSKLALPLIMFSFAFSTIIAYYYYCEVALLYLFGNKKVLILFQILIVGSVYISC
MSKNIEFISYLGDSLFMCLMIPNAVAIYLLRREVLNTIDSYYKRY

Specific function: Catalyzes the sodium-dependent uptake of extracellular D-alanine and glycine [H]

COG id: COG1115

COG function: function code E; Na+/alanine symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:alanine (SAF) symporter family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786188, Length=432, Percent_Identity=29.8611111111111, Blast_Score=145, Evalue=8e-36,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001463 [H]

Pfam domain/function: PF01235 Na_Ala_symp [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48479; Mature: 48479

Theoretical pI: Translated: 9.40; Mature: 9.40

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
3.6 %Met     (Translated Protein)
5.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
5.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIVKATDLLNSLLYIKIFNIPFIILWVIATGVFCTVRFKFINFRLFKYGIQTLFNLKCNG
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECC
NNNGIITHIQAFTTVISGTVGLGTISGVAIAITIGGPSAIFWMIITGILGMSIKFAEVVL
CCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
AFTHRSENTTGGAFYYMEHGLAKIGFMKTGKFLAFIYAVMLLVAMILGGIPFQANQIAAL
HHHHCCCCCCCCEEEEEHHCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
SSNLFEYNTSVIISLFVLIVILGGIKRIALVATGLGPIMIMLYIGMCIYLICVNGNNLLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHH
ALSIIFQDIFNKSAIGGGVLSGLIAGVRRSVFANEAGTGTAAIAHSIVKEKDPVKVGSVA
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH
MIAPFVDTILVSFLTGIVIIITDMHITNTVGDITLVSSAFSTALPLLSKLALPLIMFSFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSTIIAYYYYCEVALLYLFGNKKVLILFQILIVGSVYISCMSKNIEFISYLGDSLFMCLM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IPNAVAIYLLRREVLNTIDSYYKRY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MIVKATDLLNSLLYIKIFNIPFIILWVIATGVFCTVRFKFINFRLFKYGIQTLFNLKCNG
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECC
NNNGIITHIQAFTTVISGTVGLGTISGVAIAITIGGPSAIFWMIITGILGMSIKFAEVVL
CCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
AFTHRSENTTGGAFYYMEHGLAKIGFMKTGKFLAFIYAVMLLVAMILGGIPFQANQIAAL
HHHHCCCCCCCCEEEEEHHCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHH
SSNLFEYNTSVIISLFVLIVILGGIKRIALVATGLGPIMIMLYIGMCIYLICVNGNNLLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHH
ALSIIFQDIFNKSAIGGGVLSGLIAGVRRSVFANEAGTGTAAIAHSIVKEKDPVKVGSVA
HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHH
MIAPFVDTILVSFLTGIVIIITDMHITNTVGDITLVSSAFSTALPLLSKLALPLIMFSFA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSTIIAYYYYCEVALLYLFGNKKVLILFQILIVGSVYISCMSKNIEFISYLGDSLFMCLM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IPNAVAIYLLRREVLNTIDSYYKRY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Na (I) [Periplasm]; L-alanine [Periplasm] [C]

Specific reaction: Na (I) [Periplasm] + L-alanine [Periplasm] = Na (I) [Cytoplasm] + L-alanine [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1447975 [H]