Definition | Wolbachia endosymbiont of Culex quinquefasciatus Pel, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_010981 |
Length | 1,482,455 |
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The map label for this gene is 190570885
Identifier: 190570885
GI number: 190570885
Start: 491755
End: 499743
Strand: Reverse
Name: 190570885
Synonym: WPa_0462
Alternate gene names: NA
Gene position: 499743-491755 (Counterclockwise)
Preceding gene: 190570886
Following gene: 190570883
Centisome position: 33.71
GC content: 32.82
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: ankyrin repeat domain protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 2662; Mature: 2662
Protein sequence:
>2662_residues MLKARDYLKSEVTDPVKEEQNAEQSTKSFHPKLRVRRQYNPNDNNLRLLSLISLYKNYPALINDIKDLLNDVDINYVDKD GDTFLHAAVSEGHQDIVELLLNVPDIDPKIKNNKGDTPLDIAVRSGNQIIIGELQKYSELGSSNQQVSSVEQQPRSDDTL KELQTREPVSIFQEINKAKDQSKKRNLEGLLNKLRSSYSDDLKIGVALKAGDCFFDSVAQGLNELKDKGLVENSERFNVK SLRKDCADYARENNKGETFRKYLKDIKNMAKGTDSPAIWERPEIEGQMISNKYDVVLYFYSTNEENGQKITVTKITPGSD DPEVFIEGENLDQLHIDSNEKVVRIVNYKKHFVPLLSRLEKDIEKAIEVSREEVYGVENKKSYSLIQDIGNFNPEENNDP NISEQAESQAQHPKIAEQQLDPLEGRAKRADNEPGPSSQIGQDSQSSGQQTRTRSKKPRSELIEMFLSEVTKEFDDSFEK LLKEVPSGHPAPSYDEFFIYFFLGSTITIPDRLIAKIGIKSVHFNLNFTDKGSKIIKLLFEINKDPQDRRLVLRTIIADG VKTLSGQYYSNDNIQEIVEKLNLAGDDANSYKVDARIFHITLSKDTGRVLRTSEDQKTKQDLEKALQKIQANVIEGVELQ DKAKEFESIELQNKDDSSKFENALENLSKKINAVEEGVKELFKGFIEVCKKNKKHFPKVAGRNKNDHNRYKESRFHGFIY GALVLNFKSKYYLNCYAERSSGRGGGADLVLISRKDEYKNRNLGAVPVIVELKVDQSASTTDVKKEVESNIFSNVRTFSD EAIVACASLWIEKSKTRLGESELIAKRYNIPKVEGLITLLLENLNDSDLDNIIKEELERLHHSIPSMGKINGNPNYLSRL ILGEILTNNDKLRKFAFIYKDKEKFTTFLLQRDGVDQIIILNVVESVLIKLEKTVTFNDKVVISDSGYIYQIDIGINPEQ TKKFFDEKSSTEKYLQLLQIRKWNFQEYKNEQKYNGELIEFGSVNYVNLNKEVELKVIEDEQLTNNLNEALFPIRELITL VDGNQDWSKISKNKAGNIDKTTKSNLMAVIHGLFIGKQNIAKKSNQIIKVLAKTSLAYKRDLDLAISIASKDRNTYQENE VVAICTSEPDTFIERGLRSLIQKMRAKVQVVSFNVKANSKNDLINIKSKNYDIEHTSIGEEDIIEDFFDAIYEGKVNELV DLLKNRVTSERIKLRKREYNDAFKLTLELEEFEMSDLLLKYAIDDKQKHLMLNGADKNGITLLDNAAENDKWNIVEYLIN KGGESDYVLEPYMFRLIEEQKWEKVKFLIDKEVDVNATDGKDMTPLHHAVRDNNAKMVSFLIDKGADVDAEDKGKNTPLH YACRDGNYDIVYLLLDRDAKSISNEDGKEPDYYLDYDNPESEQIRELFEERFSNSDSQNPSSDEESHAPEEYHSSSDEID SDDSQAYFEHLFNKEPDPDSDLTPSSSDELDIEYDSVRCLSSDSGRKKREAESECLFTWEDVDEFNEEKDKKRDLSKIKI DSERFVSYIKDLPEGKQSQLIQLAGETGNAQGLVSKLISNQKIMNHLSRVGRVSGMTMHGMMAKNVLADFLNSNYQGVAI NVGFIAGGQGFAKVAEAASLKGLKLAEEGKLLVGQSLKAASPFLARGTSAFVVYDLVNQIKAFKNGTEEALVGVVGDSIY LGVDAAEIGVEVAEAFGVLEGVSSVTGPIGATIGAVVFVGTDIYMAVKRVDKIDQIIHLTGDEKFVEGLRAFIGMKPEQY IEELMEKKQLYNQLVKQGLGYLKQHSDIQSYVFPTTDKLDSKVLLDRKRTGIRWSRARPDDLNEGRVFCLPQGNDEPAPD YGSYLCENAIGIFANKTGDHTLINLGEGKDYAKGFLNSPNIFVVNNGSKEYYGGNKDDIFVLQAEYIKGHLSGEGGINTL DTTLFALQEEQLNIQLEIGEIADYFRDNWLKICEINKVIGRANKAETITVSCDGCNSNVRLIDGQSGNEEIKDRINIIDD SCDYQMQIVVRPNTAVYNRALKGSFDYLVPLNSSGSAEVSFIYGPERFNVNNTFWFAYQAVDIKSIDVKYINVFNRTEHE VKFNFVESNKEFNVTISYSENPAYRLGKSGEIRIGNKGNLYMLESSDKSSEEVIRDYLPVANRVSKMSFFIQSVLSNETV VIGSGNHEVIHSNPAYRSHLVGNGGENVYVIDSETTEVIIHDVDEENSIDTIDLRNVVRQVRGELSNQDNFQLKVLKSAN DLLLEATVVEVKPTEDSSVSKMRKHEYCTVRLKDGVNWYNKTHVIVDNAPMKINLDNNEWSLKPQPLMFERDKEIIVVTN QDIEQGSEIITPRKGGNYKFVRSNDNDLMITNAFDLTITKNDLCTITLSKFYETPRMKTLFIKFADKEIILKEHQEEIST ARDVNVVKKEHKDQVYNDVFNPEVMMLSDQPVTHRHRHSRHREQARHRRSTTSSSTRPTGWINDLFGWVKSSISGLLSSK PESTKSPISQVDAKMDVNGTIILLDMLIRKVTGQKYVSTADQSISPLEAQGYALNITKGFEKVLNKTAIKSGISLTNLNF DPVVVQSAIIGKIINGKFSEIAKTLYSFAKEACPEFKQTDKFLDHLKSSLKEEKETVMLQQKVEKPSKDLSQEVSRKVEL SKKPNTFLNGTSVVRGISRAIN
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: COG0666
COG function: function code R; FOG: Ankyrin repeat
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 18 ANK repeats [H]
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI32967601, Length=131, Percent_Identity=32.0610687022901, Blast_Score=74, Evalue=2e-12,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002110 - InterPro: IPR020683 - InterPro: IPR007685 [H]
Pfam domain/function: PF00023 Ank; PF04607 RelA_SpoT [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 301368; Mature: 301368
Theoretical pI: Translated: 5.21; Mature: 5.21
Prosite motif: PS50088 ANK_REPEAT ; PS50297 ANK_REP_REGION ; PS00018 EF_HAND_1 ; PS50802 OTU
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLKARDYLKSEVTDPVKEEQNAEQSTKSFHPKLRVRRQYNPNDNNLRLLSLISLYKNYPA CCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHH LINDIKDLLNDVDINYVDKDGDTFLHAAVSEGHQDIVELLLNVPDIDPKIKNNKGDTPLD HHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCEEHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEE IAVRSGNQIIIGELQKYSELGSSNQQVSSVEQQPRSDDTLKELQTREPVSIFQEINKAKD EEEECCCEEEEHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH QSKKRNLEGLLNKLRSSYSDDLKIGVALKAGDCFFDSVAQGLNELKDKGLVENSERFNVK HHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH SLRKDCADYARENNKGETFRKYLKDIKNMAKGTDSPAIWERPEIEGQMISNKYDVVLYFY HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEEEEEE STNEENGQKITVTKITPGSDDPEVFIEGENLDQLHIDSNEKVVRIVNYKKHFVPLLSRLE ECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEEECCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHH KDIEKAIEVSREEVYGVENKKSYSLIQDIGNFNPEENNDPNISEQAESQAQHPKIAEQQL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHC DPLEGRAKRADNEPGPSSQIGQDSQSSGQQTRTRSKKPRSELIEMFLSEVTKEFDDSFEK CCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLKEVPSGHPAPSYDEFFIYFFLGSTITIPDRLIAKIGIKSVHFNLNFTDKGSKIIKLLF HHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCEECCHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHH EINKDPQDRRLVLRTIIADGVKTLSGQYYSNDNIQEIVEKLNLAGDDANSYKVDARIFHI HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEE TLSKDTGRVLRTSEDQKTKQDLEKALQKIQANVIEGVELQDKAKEFESIELQNKDDSSKF EECCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHH ENALENLSKKINAVEEGVKELFKGFIEVCKKNKKHFPKVAGRNKNDHNRYKESRFHGFIY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEE GALVLNFKSKYYLNCYAERSSGRGGGADLVLISRKDEYKNRNLGAVPVIVELKVDQSAST EEEHEEECCCEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCH TDVKKEVESNIFSNVRTFSDEAIVACASLWIEKSKTRLGESELIAKRYNIPKVEGLITLL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH LENLNDSDLDNIIKEELERLHHSIPSMGKINGNPNYLSRLILGEILTNNDKLRKFAFIYK HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEHEEEE DKEKFTTFLLQRDGVDQIIILNVVESVLIKLEKTVTFNDKVVISDSGYIYQIDIGINPEQ 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QSKKRNLEGLLNKLRSSYSDDLKIGVALKAGDCFFDSVAQGLNELKDKGLVENSERFNVK HHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH SLRKDCADYARENNKGETFRKYLKDIKNMAKGTDSPAIWERPEIEGQMISNKYDVVLYFY HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCEEEEEEEE STNEENGQKITVTKITPGSDDPEVFIEGENLDQLHIDSNEKVVRIVNYKKHFVPLLSRLE ECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCEEEECCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHH KDIEKAIEVSREEVYGVENKKSYSLIQDIGNFNPEENNDPNISEQAESQAQHPKIAEQQL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHC DPLEGRAKRADNEPGPSSQIGQDSQSSGQQTRTRSKKPRSELIEMFLSEVTKEFDDSFEK CCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LLKEVPSGHPAPSYDEFFIYFFLGSTITIPDRLIAKIGIKSVHFNLNFTDKGSKIIKLLF HHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCEECCHHHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHH EINKDPQDRRLVLRTIIADGVKTLSGQYYSNDNIQEIVEKLNLAGDDANSYKVDARIFHI HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEE TLSKDTGRVLRTSEDQKTKQDLEKALQKIQANVIEGVELQDKAKEFESIELQNKDDSSKF EECCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHH 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IQKMRAKVQVVSFNVKANSKNDLINIKSKNYDIEHTSIGEEDIIEDFFDAIYEGKVNELV HHHHHCEEEEEEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH DLLKNRVTSERIKLRKREYNDAFKLTLELEEFEMSDLLLKYAIDDKQKHLMLNGADKNGI HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCE TLLDNAAENDKWNIVEYLINKGGESDYVLEPYMFRLIEEQKWEKVKFLIDKEVDVNATDG EEEECCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCC KDMTPLHHAVRDNNAKMVSFLIDKGADVDAEDKGKNTPLHYACRDGNYDIVYLLLDRDAK CCCCHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCEEEEEEEECCCCH SISNEDGKEPDYYLDYDNPESEQIRELFEERFSNSDSQNPSSDEESHAPEEYHSSSDEID HCCCCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHCCCHHHCCCCCCCC SDDSQAYFEHLFNKEPDPDSDLTPSSSDELDIEYDSVRCLSSDSGRKKREAESECLFTWE CCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCEEEECCCCCCCHHHCCCCEEEEEH DVDEFNEEKDKKRDLSKIKIDSERFVSYIKDLPEGKQSQLIQLAGETGNAQGLVSKLISN HHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHCC QKIMNHLSRVGRVSGMTMHGMMAKNVLADFLNSNYQGVAINVGFIAGGQGFAKVAEAASL HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHC 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NPAYRLGKSGEIRIGNKGNLYMLESSDKSSEEVIRDYLPVANRVSKMSFFIQSVLSNETV CCCEECCCCCCEEECCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE VIGSGNHEVIHSNPAYRSHLVGNGGENVYVIDSETTEVIIHDVDEENSIDTIDLRNVVRQ EEECCCCEEEECCCCHHHHCCCCCCCEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHH VRGELSNQDNFQLKVLKSANDLLLEATVVEVKPTEDSSVSKMRKHEYCTVRLKDGVNWYN HHHHCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCCC KTHVIVDNAPMKINLDNNEWSLKPQPLMFERDKEIIVVTNQDIEQGSEIITPRKGGNYKF CEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEECCCCEEEEECCCCCCCCCEECCCCCCCEEE VRSNDNDLMITNAFDLTITKNDLCTITLSKFYETPRMKTLFIKFADKEIILKEHQEEIST EEECCCCEEEEEEEEEEEECCCEEEEEHHHHHCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH ARDVNVVKKEHKDQVYNDVFNPEVMMLSDQPVTHRHRHSRHREQARHRRSTTSSSTRPTG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC WINDLFGWVKSSISGLLSSKPESTKSPISQVDAKMDVNGTIILLDMLIRKVTGQKYVSTA HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHC DQSISPLEAQGYALNITKGFEKVLNKTAIKSGISLTNLNFDPVVVQSAIIGKIINGKFSE CCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHH 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