| Definition | Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010718 |
| Length | 3,165,557 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 188586573
Identifier: 188586573
GI number: 188586573
Start: 2068381
End: 2069910
Strand: Reverse
Name: 188586573
Synonym: Nther_1960
Alternate gene names: NA
Gene position: 2069910-2068381 (Counterclockwise)
Preceding gene: 188586574
Following gene: 188586572
Centisome position: 65.39
GC content: 40.59
Gene sequence:
>1530_bases TTGGCAGATATTTTAGCCACTGTACCTGCAATTTTGGATGCTTCATATTTGTTAATTGTGGCAGCTGGTGTGTTTGGAGG TATTTTGGTAGGTGCTCTTCCAGGACTTACTCCTACTATGGGGGTAGCTTTGCTAGTTCCTTTTACATTCTATCTGCCCG CAGAACAGGGCTTATTAATGTTGGGTTCAGTATATGTAGGCAGTGTATACGGTGGGGCAATAACAGCAATTTTAATAAAT ATTCCAGGAGCGCCAGCTTCAATAGCTACAATAATGGATGGTCATCCCATGGCAAACAAAGGTGAAGGTGAAAAGGCCAT TCATCTGGCCACTCTTTCTTCTTTTATAGGTGGCGTATTTGGTGTGATATTACTATTATTTTTTGCTCCTGCTTTGGCAA GGGTCTCACTAAACTTTGGGCCTGCTGAGCATTTTTGGATAGCTGTTTTTGGAATCACAGTGATAGCTGGCTTATCTAAA GGAAGTATTTGGAAGGGAATTATGGGAGGCGCTGCGGGTTTATGGTTGAGCACAATTGGCATTGGTGAAATAACGGGTAC AGCTCGGTTCACCTTTGAGTCGGCTCATTTGACAGGTGGCATTGGCTTAGTCTCTATGTTAATTGGCTTATTTGCATTTC CCCAGGCTTTGGTCTTTGTAGAGCGCTTGTTTCAAAGTAAAGAAACACGAAAGTTTAATGAAAATGTGTTTCATAAAAGC AGATCCTTCCTGAAAGGGATAAAAGACATAATTAAGTACAAGAAGAATGTGATTATGGGTTCGATAATAGGTGGCTTGGT AGGATTAGTGCCTGGAGCTGGTGGTCAAATTGCTGGTTTAGTTGCTTACAACGAAGTGAAGCGTTATTCCCCGGAAAAGG ATAAGTTCGGCACAGGACATGAAGGAGGAATAATTACTACCGAAAGTGCTAATAACGCCATGGTTGGTTGTTCTCTTGTT CCCCTTTTGACCCTGGGGATTCCAGGGAGCCCCACGGCGGCAGTTCTATTAGGCGGATTACTCATGAATGGTCTCTGGCC AGGACCTGAAATGTTTCAGGAAAACGCTTCAATTACCTATACTTTTATTTTAGGAATGGTAGCAGCCCAATTTTTTATGT TATTTATTGGGGGCTTTGGAGGACGTTTTTTCAAAAGAGTGATGTATGTATCACCTGGGATTATGGCTCCTTTAATTTTA GTGTTTTGCGTTTTAGGTTCATTTGCAGAAAGAAACAATTTTAGTGATGTGTGGTTTATGTTAATAGTTGGTGTTTTGAT GTATTTTGGTATGAAATTTGGTTTTAGCCCGGCACCGGTTGGTTTAGGATTTATCCTGGGTGAATATGCCGAAAGAGGAT TTTTATTAGCAAATCGGGCTAGTGTCAGTGAAGGATCATTAATGCTGCATTTTCTAGACAGCCCCATAGTTATTGTTTTA ATGCTATTGACAGCAATCTCAATTATAACTACTGCAGTATTAGAAATCAGTAAAAAACAAAAGAAGTTGAAGGAGGTTGA GCAAAAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases GTTTGGACTGTCACAAGTAATAAAAGATTCAAATATTATATTGGTGACCTCAAATTTGGTTGAGATATCAAACTTGTGAC TGCAGAAAGGAGGGAGAGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases GATCCAGAGGAATTCAATATTATAAATTGGAATTACTGCTCTGTGGTCTGGCACTAGTGATTGCCGGTTTATTGATCATG GAAGCCTTAAAGTATCCAGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: ORFZ2 [H]
Number of amino acids: Translated: 509; Mature: 508
Protein sequence:
>509_residues MADILATVPAILDASYLLIVAAGVFGGILVGALPGLTPTMGVALLVPFTFYLPAEQGLLMLGSVYVGSVYGGAITAILIN IPGAPASIATIMDGHPMANKGEGEKAIHLATLSSFIGGVFGVILLLFFAPALARVSLNFGPAEHFWIAVFGITVIAGLSK GSIWKGIMGGAAGLWLSTIGIGEITGTARFTFESAHLTGGIGLVSMLIGLFAFPQALVFVERLFQSKETRKFNENVFHKS RSFLKGIKDIIKYKKNVIMGSIIGGLVGLVPGAGGQIAGLVAYNEVKRYSPEKDKFGTGHEGGIITTESANNAMVGCSLV PLLTLGIPGSPTAAVLLGGLLMNGLWPGPEMFQENASITYTFILGMVAAQFFMLFIGGFGGRFFKRVMYVSPGIMAPLIL VFCVLGSFAERNNFSDVWFMLIVGVLMYFGMKFGFSPAPVGLGFILGEYAERGFLLANRASVSEGSLMLHFLDSPIVIVL MLLTAISIITTAVLEISKKQKKLKEVEQK
Sequences:
>Translated_509_residues MADILATVPAILDASYLLIVAAGVFGGILVGALPGLTPTMGVALLVPFTFYLPAEQGLLMLGSVYVGSVYGGAITAILIN IPGAPASIATIMDGHPMANKGEGEKAIHLATLSSFIGGVFGVILLLFFAPALARVSLNFGPAEHFWIAVFGITVIAGLSK GSIWKGIMGGAAGLWLSTIGIGEITGTARFTFESAHLTGGIGLVSMLIGLFAFPQALVFVERLFQSKETRKFNENVFHKS RSFLKGIKDIIKYKKNVIMGSIIGGLVGLVPGAGGQIAGLVAYNEVKRYSPEKDKFGTGHEGGIITTESANNAMVGCSLV PLLTLGIPGSPTAAVLLGGLLMNGLWPGPEMFQENASITYTFILGMVAAQFFMLFIGGFGGRFFKRVMYVSPGIMAPLIL VFCVLGSFAERNNFSDVWFMLIVGVLMYFGMKFGFSPAPVGLGFILGEYAERGFLLANRASVSEGSLMLHFLDSPIVIVL MLLTAISIITTAVLEISKKQKKLKEVEQK >Mature_508_residues ADILATVPAILDASYLLIVAAGVFGGILVGALPGLTPTMGVALLVPFTFYLPAEQGLLMLGSVYVGSVYGGAITAILINI PGAPASIATIMDGHPMANKGEGEKAIHLATLSSFIGGVFGVILLLFFAPALARVSLNFGPAEHFWIAVFGITVIAGLSKG SIWKGIMGGAAGLWLSTIGIGEITGTARFTFESAHLTGGIGLVSMLIGLFAFPQALVFVERLFQSKETRKFNENVFHKSR SFLKGIKDIIKYKKNVIMGSIIGGLVGLVPGAGGQIAGLVAYNEVKRYSPEKDKFGTGHEGGIITTESANNAMVGCSLVP LLTLGIPGSPTAAVLLGGLLMNGLWPGPEMFQENASITYTFILGMVAAQFFMLFIGGFGGRFFKRVMYVSPGIMAPLILV FCVLGSFAERNNFSDVWFMLIVGVLMYFGMKFGFSPAPVGLGFILGEYAERGFLLANRASVSEGSLMLHFLDSPIVIVLM LLTAISIITTAVLEISKKQKKLKEVEQK
Specific function: Unknown
COG id: COG3333
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002823 [H]
Pfam domain/function: PF01970 DUF112 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 53829; Mature: 53698
Theoretical pI: Translated: 9.34; Mature: 9.34
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.9 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.7 %Met (Mature Protein) 4.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MADILATVPAILDASYLLIVAAGVFGGILVGALPGLTPTMGVALLVPFTFYLPAEQGLLM CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEE LGSVYVGSVYGGAITAILINIPGAPASIATIMDGHPMANKGEGEKAIHLATLSSFIGGVF HHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH GVILLLFFAPALARVSLNFGPAEHFWIAVFGITVIAGLSKGSIWKGIMGGAAGLWLSTIG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHCC IGEITGTARFTFESAHLTGGIGLVSMLIGLFAFPQALVFVERLFQSKETRKFNENVFHKS CCCCCCCEEEEEECCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RSFLKGIKDIIKYKKNVIMGSIIGGLVGLVPGAGGQIAGLVAYNEVKRYSPEKDKFGTGH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC EGGIITTESANNAMVGCSLVPLLTLGIPGSPTAAVLLGGLLMNGLWPGPEMFQENASITY CCCEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCHH TFILGMVAAQFFMLFIGGFGGRFFKRVMYVSPGIMAPLILVFCVLGSFAERNNFSDVWFM HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH LIVGVLMYFGMKFGFSPAPVGLGFILGEYAERGFLLANRASVSEGSLMLHFLDSPIVIVL HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHH MLLTAISIITTAVLEISKKQKKLKEVEQK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure ADILATVPAILDASYLLIVAAGVFGGILVGALPGLTPTMGVALLVPFTFYLPAEQGLLM CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEE LGSVYVGSVYGGAITAILINIPGAPASIATIMDGHPMANKGEGEKAIHLATLSSFIGGVF HHHHHHHHHHHHEEEEEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH GVILLLFFAPALARVSLNFGPAEHFWIAVFGITVIAGLSKGSIWKGIMGGAAGLWLSTIG HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHCC IGEITGTARFTFESAHLTGGIGLVSMLIGLFAFPQALVFVERLFQSKETRKFNENVFHKS CCCCCCCEEEEEECCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RSFLKGIKDIIKYKKNVIMGSIIGGLVGLVPGAGGQIAGLVAYNEVKRYSPEKDKFGTGH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC EGGIITTESANNAMVGCSLVPLLTLGIPGSPTAAVLLGGLLMNGLWPGPEMFQENASITY CCCEEEECCCCCCEEHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCHH TFILGMVAAQFFMLFIGGFGGRFFKRVMYVSPGIMAPLILVFCVLGSFAERNNFSDVWFM HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH LIVGVLMYFGMKFGFSPAPVGLGFILGEYAERGFLLANRASVSEGSLMLHFLDSPIVIVL HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHH MLLTAISIITTAVLEISKKQKKLKEVEQK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8672817 [H]