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The map label for this gene is yhfA [H]

Identifier: 188586261

GI number: 188586261

Start: 1723496

End: 1724857

Strand: Reverse

Name: yhfA [H]

Synonym: Nther_1644

Alternate gene names: 188586261

Gene position: 1724857-1723496 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188586262

Following gene: 188586260

Centisome position: 54.49

GC content: 34.65

Gene sequence:

>1362_bases
ATGTCGGGCTTTCACTTGATGTATTTAGGGATAATAGCTTTAGTTATTTTAGCTATGTGTTTTCGTAAAAATGTAACACT
CATATGTATAATAGGAACTTTTATCATGGGGTTTGTTTATCACGACCTTTCAGTCCTTCAAGGTATTCAAACAATTTTTT
GGGCTTTTTTAACGGCTAGTTCAAAATTACTTGATTTGATTTTATTAATTGCTATGATGACTGCCATGATTTCTGCTATC
AGGTCTCTAGGAATAGATGAATTAATTGTGCGTCCTTTTCAATATATGATGATATCTCCTGGTACTTCTTACCTCGTTTT
GATAATTTCTATGTATTTGGCTTCGATATTTTTTTGGCCCACTCCGGCTACAGCTTTAATTGGCGCTATATTGGTACCAG
CTGCTATAAAAACCGGTTTATCTCTTATGGGAGCAGCTGTAGCTATCAATATTTCAGGCCATGGAATAGCTTTAAGTAGT
GACCCAATTATCCAGGGTGCTCCAGGTTTTAGTGAACGGGCTATTGGGTTAGCTCCGGGTTCAATAGTCTCTGAAGCAGT
ACTTTATTCCACCATAGCAGGAATTTTAGCTTCATTAGTAGCTTTCATTATGTATAGACAAGATTTTATAACTGGAAAAT
TTAAATCAAATACTAAATTGAATACAGAGCACTCTACTCAAAACTTAACTTGGAAAAGAGTTTTGATATCCGCCTTTGTA
TTAATAGCTTTGCTGAGTGTTTTGTACATTATGATTACCCAAAATATTAAGGGTCAAGAAGCGACTGCCCTTTTGGGTGG
TTTTGCATTAATCGTAACTATTGCTATAACCATTATGACTGGATCAAGTACTTTTTGGGATCAAATAGCCGATTATTTAA
ATCAAGGATTTATATTTGCCATGAAAATTTTCGGTAAAGTAATTCCTATAACGGGTTTTTTCTTTATAGGATCAGATCAA
AGCCAACAAATAATTGATGAAAACGCACCAATTCTATTGTATGATATAGCTGAATATTTTTCAGAGATAATTCCTTTAAC
ATCTATTACACTGTATTTTGGTAATATGTTTTTGGGAATTATTTCAGGTTTAGATGGTTCAGGATTTTCTGGAATCGCTT
TAACTGCGAATTTTGCTCAATCTATGGAAAGAATTGTGGATGTAGATTTGGAATCTCTAGCGGCTATAGGTCAGATGGGC
GCTATTTGGACAGGTGGGGGTACATTGATTTCTTGGGCCTTTGGCTTAGTTACTACGGCAGGAGTAGTGGGAGTAGATCC
TGTGGAATTAGCTAGAAAAAATTTCATTCCTGTTATGATAGGATTAATTTTTAGCACTTTATTTGCTTGTATAATTAATT
AA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGCTAAATTTAGACTTTCAAGAATCCTTTACCCGCATCTCACATATTTTTTAGTAGGGAGTATAAGGGGATAAGCATCAT
TTAAATAAGGAGTTCTAGAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTATATTGGCTAATAATAGAAATAGAGCAACTAAAAAGGGAGGTAAACTAATGCGCTTACAAAAATTCATGTCAAGGGC
TGGAATAGCATCTAGACGCA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 453; Mature: 452

Protein sequence:

>453_residues
MSGFHLMYLGIIALVILAMCFRKNVTLICIIGTFIMGFVYHDLSVLQGIQTIFWAFLTASSKLLDLILLIAMMTAMISAI
RSLGIDELIVRPFQYMMISPGTSYLVLIISMYLASIFFWPTPATALIGAILVPAAIKTGLSLMGAAVAINISGHGIALSS
DPIIQGAPGFSERAIGLAPGSIVSEAVLYSTIAGILASLVAFIMYRQDFITGKFKSNTKLNTEHSTQNLTWKRVLISAFV
LIALLSVLYIMITQNIKGQEATALLGGFALIVTIAITIMTGSSTFWDQIADYLNQGFIFAMKIFGKVIPITGFFFIGSDQ
SQQIIDENAPILLYDIAEYFSEIIPLTSITLYFGNMFLGIISGLDGSGFSGIALTANFAQSMERIVDVDLESLAAIGQMG
AIWTGGGTLISWAFGLVTTAGVVGVDPVELARKNFIPVMIGLIFSTLFACIIN

Sequences:

>Translated_453_residues
MSGFHLMYLGIIALVILAMCFRKNVTLICIIGTFIMGFVYHDLSVLQGIQTIFWAFLTASSKLLDLILLIAMMTAMISAI
RSLGIDELIVRPFQYMMISPGTSYLVLIISMYLASIFFWPTPATALIGAILVPAAIKTGLSLMGAAVAINISGHGIALSS
DPIIQGAPGFSERAIGLAPGSIVSEAVLYSTIAGILASLVAFIMYRQDFITGKFKSNTKLNTEHSTQNLTWKRVLISAFV
LIALLSVLYIMITQNIKGQEATALLGGFALIVTIAITIMTGSSTFWDQIADYLNQGFIFAMKIFGKVIPITGFFFIGSDQ
SQQIIDENAPILLYDIAEYFSEIIPLTSITLYFGNMFLGIISGLDGSGFSGIALTANFAQSMERIVDVDLESLAAIGQMG
AIWTGGGTLISWAFGLVTTAGVVGVDPVELARKNFIPVMIGLIFSTLFACIIN
>Mature_452_residues
SGFHLMYLGIIALVILAMCFRKNVTLICIIGTFIMGFVYHDLSVLQGIQTIFWAFLTASSKLLDLILLIAMMTAMISAIR
SLGIDELIVRPFQYMMISPGTSYLVLIISMYLASIFFWPTPATALIGAILVPAAIKTGLSLMGAAVAINISGHGIALSSD
PIIQGAPGFSERAIGLAPGSIVSEAVLYSTIAGILASLVAFIMYRQDFITGKFKSNTKLNTEHSTQNLTWKRVLISAFVL
IALLSVLYIMITQNIKGQEATALLGGFALIVTIAITIMTGSSTFWDQIADYLNQGFIFAMKIFGKVIPITGFFFIGSDQS
QQIIDENAPILLYDIAEYFSEIIPLTSITLYFGNMFLGIISGLDGSGFSGIALTANFAQSMERIVDVDLESLAAIGQMGA
IWTGGGTLISWAFGLVTTAGVVGVDPVELARKNFIPVMIGLIFSTLFACIIN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48732; Mature: 48600

Theoretical pI: Translated: 5.04; Mature: 5.04

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
4.0 %Met     (Mature Protein)
4.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSGFHLMYLGIIALVILAMCFRKNVTLICIIGTFIMGFVYHDLSVLQGIQTIFWAFLTAS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKLLDLILLIAMMTAMISAIRSLGIDELIVRPFQYMMISPGTSYLVLIISMYLASIFFWP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TPATALIGAILVPAAIKTGLSLMGAAVAINISGHGIALSSDPIIQGAPGFSERAIGLAPG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCH
SIVSEAVLYSTIAGILASLVAFIMYRQDFITGKFKSNTKLNTEHSTQNLTWKRVLISAFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LIALLSVLYIMITQNIKGQEATALLGGFALIVTIAITIMTGSSTFWDQIADYLNQGFIFA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHH
MKIFGKVIPITGFFFIGSDQSQQIIDENAPILLYDIAEYFSEIIPLTSITLYFGNMFLGI
HHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISGLDGSGFSGIALTANFAQSMERIVDVDLESLAAIGQMGAIWTGGGTLISWAFGLVTTA
HHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHC
GVVGVDPVELARKNFIPVMIGLIFSTLFACIIN
CCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
SGFHLMYLGIIALVILAMCFRKNVTLICIIGTFIMGFVYHDLSVLQGIQTIFWAFLTAS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKLLDLILLIAMMTAMISAIRSLGIDELIVRPFQYMMISPGTSYLVLIISMYLASIFFWP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
TPATALIGAILVPAAIKTGLSLMGAAVAINISGHGIALSSDPIIQGAPGFSERAIGLAPG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCH
SIVSEAVLYSTIAGILASLVAFIMYRQDFITGKFKSNTKLNTEHSTQNLTWKRVLISAFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LIALLSVLYIMITQNIKGQEATALLGGFALIVTIAITIMTGSSTFWDQIADYLNQGFIFA
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHH
MKIFGKVIPITGFFFIGSDQSQQIIDENAPILLYDIAEYFSEIIPLTSITLYFGNMFLGI
HHHHHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISGLDGSGFSGIALTANFAQSMERIVDVDLESLAAIGQMGAIWTGGGTLISWAFGLVTTA
HHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHC
GVVGVDPVELARKNFIPVMIGLIFSTLFACIIN
CCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377 [H]