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The map label for this gene is mepA [H]

Identifier: 187934934

GI number: 187934934

Start: 1575628

End: 1576953

Strand: Reverse

Name: mepA [H]

Synonym: CLL_A1516

Alternate gene names: 187934934

Gene position: 1576953-1575628 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187933303

Following gene: 187935705

Centisome position: 41.5

GC content: 26.62

Gene sequence:

>1326_bases
ATGAAAAAAAATACTTTATATTTAAAATTTATGAAATTTGTAACTTTAAATGTTCTGGGGATGATAGGTCTTTCTTGCTA
TATACTTGCTGATACCTATTTTATTTCAAATGGACTTGGTGCAAATGGACTAGCAGCCCTTAATCTTGCTATTTCTGTAT
ATAGTTTTATTCATGCTACTGGGCTAATGATAGGCATTGGTGGTTCTACAAAATTTACAATATTAAAGACTCAAAATGAA
AACATCAAAGCAAATGAAGTTTTTACTCATTGTATAATTTTGGGTATTGTTATTGGAATTATTTTTGCTTTTACCGGAAT
CTTAGGTTCTGAATACTTAAGTAGATTTTTAGGTGCAAATGAAGAAACATTTTATATGACAAACACTTACCTGAAAACTA
TATTTTTATTTTCACCATGTTTTATTTTGAATAATATTTTAATTGCTTTTATACGTAATGATAATTCCCCAAAACTTGCA
ATGGGAGGAATGATCCTTGGAAGCCTTTCTAATATTATTCTTGATTATATTTTTGTATTTCCATTAAACTTAGGAATGTT
TGGCGCTGCCTTTGCAACAGGACTTGCTCCAATAATTAGTATAGTATTATTATCATTACATTTTTTTAAAAATAAAAATA
ATTTTTCCATTAAAAGATGCGAATTTGATTTAACAATATTTAAAAATATCATTAATCTTGGACTTTCTTCACTTGTAACA
GAAATATCATCTGGAATTGTCCTTATAATATTTAATATTGTGATTTTAAATATTGCAGGTAATATAGGCGTTGCAGCTTA
TGGAATTATAGCCAATTTAGCTCTTGTAGCAATAGGTATATTTACTGGAATAGCTCAAGGAATGCAACCTCTTGTTAGTA
ATAGCTATGGTAACAAAAATTATCTACAGCTAAAACAATTATTAAAATATTCAATTACTTTATCACTTATAGTTTCAGTA
GTAATTTATTTTACAATCACTCTGTTTTCTAGTGAACTAATTTCACTTTTTAACAGTGAAAATAATTTACTATTAAAGAC
TTATGCAACAACAGGACTTTCACTATATTTTATTGGATTTATCTTTGTTGGAATTAATATTGTTATAATTTCATTTTTAA
ATTCTATTGAAAGTTCTAAAGTAGCATTTATTATCTCATTAATAAGAGGATTTATTGCTATTATTCCATTAGTGCTTATA
CTATCATCACTTTTGGGCTTAACTGGTGTATGGCTTGTATTTCCAAGTGTTGAAGCTATAACTACACTAATAGCTATAAT
TTTATTAAGAAATTCAAGTATAACCATTGTTCAAAATAACGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CCGCCGGGTAAAAATGCTTTTACAAACATTCGTATTTCATACCATTAGGCCATTGAAGGTATGAACATTCGAATGTTTTT
TTATTTGGAGGGATTAATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTAATATTTAATAAATTCTTGATACTTTGCAAATGGATAAACTATTTCTATATAAAATAATAAAAATAAATTTTAAGCAA
ATAATAATAGTGAAAACTTT

Product: mate efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 441; Mature: 441

Protein sequence:

>441_residues
MKKNTLYLKFMKFVTLNVLGMIGLSCYILADTYFISNGLGANGLAALNLAISVYSFIHATGLMIGIGGSTKFTILKTQNE
NIKANEVFTHCIILGIVIGIIFAFTGILGSEYLSRFLGANEETFYMTNTYLKTIFLFSPCFILNNILIAFIRNDNSPKLA
MGGMILGSLSNIILDYIFVFPLNLGMFGAAFATGLAPIISIVLLSLHFFKNKNNFSIKRCEFDLTIFKNIINLGLSSLVT
EISSGIVLIIFNIVILNIAGNIGVAAYGIIANLALVAIGIFTGIAQGMQPLVSNSYGNKNYLQLKQLLKYSITLSLIVSV
VIYFTITLFSSELISLFNSENNLLLKTYATTGLSLYFIGFIFVGINIVIISFLNSIESSKVAFIISLIRGFIAIIPLVLI
LSSLLGLTGVWLVFPSVEAITTLIAIILLRNSSITIVQNNE

Sequences:

>Translated_441_residues
MKKNTLYLKFMKFVTLNVLGMIGLSCYILADTYFISNGLGANGLAALNLAISVYSFIHATGLMIGIGGSTKFTILKTQNE
NIKANEVFTHCIILGIVIGIIFAFTGILGSEYLSRFLGANEETFYMTNTYLKTIFLFSPCFILNNILIAFIRNDNSPKLA
MGGMILGSLSNIILDYIFVFPLNLGMFGAAFATGLAPIISIVLLSLHFFKNKNNFSIKRCEFDLTIFKNIINLGLSSLVT
EISSGIVLIIFNIVILNIAGNIGVAAYGIIANLALVAIGIFTGIAQGMQPLVSNSYGNKNYLQLKQLLKYSITLSLIVSV
VIYFTITLFSSELISLFNSENNLLLKTYATTGLSLYFIGFIFVGINIVIISFLNSIESSKVAFIISLIRGFIAIIPLVLI
LSSLLGLTGVWLVFPSVEAITTLIAIILLRNSSITIVQNNE
>Mature_441_residues
MKKNTLYLKFMKFVTLNVLGMIGLSCYILADTYFISNGLGANGLAALNLAISVYSFIHATGLMIGIGGSTKFTILKTQNE
NIKANEVFTHCIILGIVIGIIFAFTGILGSEYLSRFLGANEETFYMTNTYLKTIFLFSPCFILNNILIAFIRNDNSPKLA
MGGMILGSLSNIILDYIFVFPLNLGMFGAAFATGLAPIISIVLLSLHFFKNKNNFSIKRCEFDLTIFKNIINLGLSSLVT
EISSGIVLIIFNIVILNIAGNIGVAAYGIIANLALVAIGIFTGIAQGMQPLVSNSYGNKNYLQLKQLLKYSITLSLIVSV
VIYFTITLFSSELISLFNSENNLLLKTYATTGLSLYFIGFIFVGINIVIISFLNSIESSKVAFIISLIRGFIAIIPLVLI
LSSLLGLTGVWLVFPSVEAITTLIAIILLRNSSITIVQNNE

Specific function: Multidrug resistance efflux protein [H]

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family. MepA subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48073; Mature: 48073

Theoretical pI: Translated: 9.32; Mature: 9.32

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKNTLYLKFMKFVTLNVLGMIGLSCYILADTYFISNGLGANGLAALNLAISVYSFIHAT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLMIGIGGSTKFTILKTQNENIKANEVFTHCIILGIVIGIIFAFTGILGSEYLSRFLGAN
CEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
EETFYMTNTYLKTIFLFSPCFILNNILIAFIRNDNSPKLAMGGMILGSLSNIILDYIFVF
CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PLNLGMFGAAFATGLAPIISIVLLSLHFFKNKNNFSIKRCEFDLTIFKNIINLGLSSLVT
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EISSGIVLIIFNIVILNIAGNIGVAAYGIIANLALVAIGIFTGIAQGMQPLVSNSYGNKN
HHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
YLQLKQLLKYSITLSLIVSVVIYFTITLFSSELISLFNSENNLLLKTYATTGLSLYFIGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHH
IFVGINIVIISFLNSIESSKVAFIISLIRGFIAIIPLVLILSSLLGLTGVWLVFPSVEAI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
TTLIAIILLRNSSITIVQNNE
HHHHHHHHHCCCCEEEEECCC
>Mature Secondary Structure
MKKNTLYLKFMKFVTLNVLGMIGLSCYILADTYFISNGLGANGLAALNLAISVYSFIHAT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLMIGIGGSTKFTILKTQNENIKANEVFTHCIILGIVIGIIFAFTGILGSEYLSRFLGAN
CEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
EETFYMTNTYLKTIFLFSPCFILNNILIAFIRNDNSPKLAMGGMILGSLSNIILDYIFVF
CCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PLNLGMFGAAFATGLAPIISIVLLSLHFFKNKNNFSIKRCEFDLTIFKNIINLGLSSLVT
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EISSGIVLIIFNIVILNIAGNIGVAAYGIIANLALVAIGIFTGIAQGMQPLVSNSYGNKN
HHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCH
YLQLKQLLKYSITLSLIVSVVIYFTITLFSSELISLFNSENNLLLKTYATTGLSLYFIGF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHH
IFVGINIVIISFLNSIESSKVAFIISLIRGFIAIIPLVLILSSLLGLTGVWLVFPSVEAI
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHH
TTLIAIILLRNSSITIVQNNE
HHHHHHHHHCCCCEEEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA