| Definition | Clostridium botulinum B str. Eklund 17B, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010674 |
| Length | 3,800,327 |
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The map label for this gene is 187933682
Identifier: 187933682
GI number: 187933682
Start: 3396964
End: 3398319
Strand: Reverse
Name: 187933682
Synonym: CLL_A3245
Alternate gene names: NA
Gene position: 3398319-3396964 (Counterclockwise)
Preceding gene: 187935357
Following gene: 187934897
Centisome position: 89.42
GC content: 23.3
Gene sequence:
>1356_bases ATGAAGGAAAAAATAAAGAATATAATAAGTAAAAAAATAGTTAATAAGGACAAACTACCATTTATAGTATTGATAGGCAT ATTCATTCTTATACATATAAAAATGAATATAAATTTTGGAGATGATCTTGTTTATAGAACTCAATTTAGCACTCCTTGGG AAGGAATGGTTTCATTTTATAAAACGTGGGCATCGCCGTCATTACTTTCTTTAATTCAATTTTATCTAGTTAGATTGCCT GATATTGTTTTTAAAATATGTAATATATTGATGATTTTATTATCAGCATATTCTATATCAAAAATTACAAAGGATAAGGA AGCAAAATATACAAATTGGATAATAGTATTTTTTATAATATTATATCCATTTATGCAGATGGCTACAGCTGGATGGATAG TTACATCAGTTTCGTATATTTTCCCAACTGCTTTTGGTTTATATTCATTTGTATATTTAAGATATATATTAGATGGTAAA AAAATAAGCAAGTTAAATTATTGTTTATTTTTCATTTCATTAATATTAGGTTTAGGACAATTACAAATGGCTTGCATTAT TTTTGGTATATATTTTGTATTAAATATATTTTTTGCAATTAATAAAAGAGTTTACAAGTTTGCTATATTTCAAAACATAA TAGCGTTTCTTTTTTGTATATATCATGCAACTGCACCAGGAAATATGAATAGAAGTATTCACGAAACAGCTACATGGTTT TCAGATTTTGGTATGATATCAACAGTAAACAAAATAAAATTAGGGTTTACATCTACATTAGGAAATTTAACATTATCATC AAATATATTTTTTCTATGTTTTGTTTTTTTACTTGTTGTTGGAGTTTATTATAAGTATAATGATGTGCTATATAGGTTAA TTTCACTTATTCCACTATTAGCTTTAATGATATTTGGGATGTTTAAAAGTATTTTTAAAGATATTTTTCCTGATTTAGTA AATTTGATGAATAATGGTTCGAATGATTTTTTACAAATTAACGCATATAATTTTTATTCTAAAATTAATTATTTGACTAT AATATTAGGTGTTATTATAGTAGGCTGTATATTAATTTCGATGTATTTAATATTTGAAAATACTTTAAAGATGCTTATTG TTGAAATAATTTTTTTAGCAGGTTTTAGTTCTAGAATGATTATGAGTTTTTCACCTACAATTTATGCATCTAGTACACGT ACGTTTATATTTTTATATTTTTCTATTATATTATGTGCTGTATTTATATTTAATCAAATTAGCAAAAATACAACAGAGAA GAAACAAAAAGATTTGTTAATGTATATAGGTATTGTTTCGGCAATTAGCTATTTACAATTATTAGTTATGCTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAGAACGATGGAAGAAGGAACTTAAAGATGGAGATCATTATTATAATGTTAATTTAACATTGGATAGGGAAGATTTTTCT TTAAGGTAAGGTGAAAGAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GGAGAAGATTATGACAAAAGAGATAAATCAAAAAAATGTTATAATATTATTTGTATTATTTGCATTATTAGGTAGTATAT TTTCACTAAGTATTTACTAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 451; Mature: 451
Protein sequence:
>451_residues MKEKIKNIISKKIVNKDKLPFIVLIGIFILIHIKMNINFGDDLVYRTQFSTPWEGMVSFYKTWASPSLLSLIQFYLVRLP DIVFKICNILMILLSAYSISKITKDKEAKYTNWIIVFFIILYPFMQMATAGWIVTSVSYIFPTAFGLYSFVYLRYILDGK KISKLNYCLFFISLILGLGQLQMACIIFGIYFVLNIFFAINKRVYKFAIFQNIIAFLFCIYHATAPGNMNRSIHETATWF SDFGMISTVNKIKLGFTSTLGNLTLSSNIFFLCFVFLLVVGVYYKYNDVLYRLISLIPLLALMIFGMFKSIFKDIFPDLV NLMNNGSNDFLQINAYNFYSKINYLTIILGVIIVGCILISMYLIFENTLKMLIVEIIFLAGFSSRMIMSFSPTIYASSTR TFIFLYFSIILCAVFIFNQISKNTTEKKQKDLLMYIGIVSAISYLQLLVML
Sequences:
>Translated_451_residues MKEKIKNIISKKIVNKDKLPFIVLIGIFILIHIKMNINFGDDLVYRTQFSTPWEGMVSFYKTWASPSLLSLIQFYLVRLP DIVFKICNILMILLSAYSISKITKDKEAKYTNWIIVFFIILYPFMQMATAGWIVTSVSYIFPTAFGLYSFVYLRYILDGK KISKLNYCLFFISLILGLGQLQMACIIFGIYFVLNIFFAINKRVYKFAIFQNIIAFLFCIYHATAPGNMNRSIHETATWF SDFGMISTVNKIKLGFTSTLGNLTLSSNIFFLCFVFLLVVGVYYKYNDVLYRLISLIPLLALMIFGMFKSIFKDIFPDLV NLMNNGSNDFLQINAYNFYSKINYLTIILGVIIVGCILISMYLIFENTLKMLIVEIIFLAGFSSRMIMSFSPTIYASSTR TFIFLYFSIILCAVFIFNQISKNTTEKKQKDLLMYIGIVSAISYLQLLVML >Mature_451_residues MKEKIKNIISKKIVNKDKLPFIVLIGIFILIHIKMNINFGDDLVYRTQFSTPWEGMVSFYKTWASPSLLSLIQFYLVRLP DIVFKICNILMILLSAYSISKITKDKEAKYTNWIIVFFIILYPFMQMATAGWIVTSVSYIFPTAFGLYSFVYLRYILDGK KISKLNYCLFFISLILGLGQLQMACIIFGIYFVLNIFFAINKRVYKFAIFQNIIAFLFCIYHATAPGNMNRSIHETATWF SDFGMISTVNKIKLGFTSTLGNLTLSSNIFFLCFVFLLVVGVYYKYNDVLYRLISLIPLLALMIFGMFKSIFKDIFPDLV NLMNNGSNDFLQINAYNFYSKINYLTIILGVIIVGCILISMYLIFENTLKMLIVEIIFLAGFSSRMIMSFSPTIYASSTR TFIFLYFSIILCAVFIFNQISKNTTEKKQKDLLMYIGIVSAISYLQLLVML
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 52070; Mature: 52070
Theoretical pI: Translated: 9.80; Mature: 9.80
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.6 %Cys (Translated Protein) 4.0 %Met (Translated Protein) 5.5 %Cys+Met (Translated Protein) 1.6 %Cys (Mature Protein) 4.0 %Met (Mature Protein) 5.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKEKIKNIISKKIVNKDKLPFIVLIGIFILIHIKMNINFGDDLVYRTQFSTPWEGMVSFY CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHH KTWASPSLLSLIQFYLVRLPDIVFKICNILMILLSAYSISKITKDKEAKYTNWIIVFFII HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH LYPFMQMATAGWIVTSVSYIFPTAFGLYSFVYLRYILDGKKISKLNYCLFFISLILGLGQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQMACIIFGIYFVLNIFFAINKRVYKFAIFQNIIAFLFCIYHATAPGNMNRSIHETATWF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH SDFGMISTVNKIKLGFTSTLGNLTLSSNIFFLCFVFLLVVGVYYKYNDVLYRLISLIPLL HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALMIFGMFKSIFKDIFPDLVNLMNNGSNDFLQINAYNFYSKINYLTIILGVIIVGCILIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MYLIFENTLKMLIVEIIFLAGFSSRMIMSFSPTIYASSTRTFIFLYFSIILCAVFIFNQI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKNTTEKKQKDLLMYIGIVSAISYLQLLVML HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC >Mature Secondary Structure MKEKIKNIISKKIVNKDKLPFIVLIGIFILIHIKMNINFGDDLVYRTQFSTPWEGMVSFY CHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHH KTWASPSLLSLIQFYLVRLPDIVFKICNILMILLSAYSISKITKDKEAKYTNWIIVFFII HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHH LYPFMQMATAGWIVTSVSYIFPTAFGLYSFVYLRYILDGKKISKLNYCLFFISLILGLGQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LQMACIIFGIYFVLNIFFAINKRVYKFAIFQNIIAFLFCIYHATAPGNMNRSIHETATWF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHH SDFGMISTVNKIKLGFTSTLGNLTLSSNIFFLCFVFLLVVGVYYKYNDVLYRLISLIPLL HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ALMIFGMFKSIFKDIFPDLVNLMNNGSNDFLQINAYNFYSKINYLTIILGVIIVGCILIS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MYLIFENTLKMLIVEIIFLAGFSSRMIMSFSPTIYASSTRTFIFLYFSIILCAVFIFNQI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKNTTEKKQKDLLMYIGIVSAISYLQLLVML HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA