Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 187933346

Identifier: 187933346

GI number: 187933346

Start: 2593970

End: 2595940

Strand: Reverse

Name: 187933346

Synonym: CLL_A2502

Alternate gene names: NA

Gene position: 2595940-2593970 (Counterclockwise)

Preceding gene: 187935191

Following gene: 187935672

Centisome position: 68.31

GC content: 23.34

Gene sequence:

>1971_bases
ATGTTTGATTCTAATGATATATGTGCATATGAAAAAAAATCCATATACGAAGAATTAAAGGAGTTTTATAGTGAAAAACC
AGGTTGTCCTTATAGTTATCAAGATTTTGAAATTGGTGGGGTTAGAGAATTTAAGGTTATTTATAATAAGATAAGTCCGT
TAAAAATAAATCAAAAAGCAAAACTAGCTAATGAGCTTATTAATTTAATTTTTGATTATATAAAAGAAGATAAAAAAGAA
ATATTTGAAAATATTAAAGGTTATATGGTACTAAATCCTATAAGTGATTATTATGAGGAGTTTGTTAAAAGTTTTAAGGC
TTTTGTAGAGACATTTAAAGAATATAAGGAAGGTTTAACTAATTTTTTAAAAGAATTAATTTATAAGGGAAGAACTCATG
ATGAGATAAAATTGGCAATTATGATGTTGTGTGTTATAAAACTTGATAAAAGGGAACAACTATTAAAAGTTTTTTCTATA
GATAATGAATATATTTTTTATGTTATAAAAGTTTATGAAACTATGGATGGGTGTAACAATAAAATATTCAATTTAGCTAT
TAAGTCTATAGGATATGGAAAAGCAATATGTATACATGAATTACAGCCTGTAAGCGATAAGATAATTGAGTGGCTAATAT
TAGATGGATTAGAACAGAATTTTGGTTATTTGGATTCACTAGAGTATACAATGTTATCTGTAAATCTACTTAAGTTTTTA
AAATCAGGAAGAATAAACAAAGGTAATATTAAAAGATTATCTAAATCATTTGGTGAACTATTTTCAGAGTATACAATTAA
TAATATAGATAATGGATTTAAGGTATGTTTTGAATATTTTAAATTAGTTGATAAGTACGGAGATGATATATATAGTTTAT
ATGGTGTTATAAGTGGGATATATTCCATAGATACTTTTATATTTGAAGAATATGGTGCTGATGGAATGAGTAGAATAACA
TCTTTAGTACCACAATATCATAAAATTTCTGATTTTGCTGATGAAATATATAAAAAAGGTATTTGGAAAGATGTAATTTT
TAAAGAACTAAGTAATATAGATTTAGAAATTGAAATTTTAATAGATGCAATGGAAAAAACCGAGTTTAAGATTTCTAATG
AAGAATTTATAGCTCTTATAGAAAGAGATTACGAGAATCCAGCATTATATAGATATGGGCTTGAAAAAGGAAATAAAGAA
TTGAAGGAAAATATATATAATATAGCATATGATAAACTTCCAATTATAAAGATTTTAAATAGAGATAAAGAAATTATAGA
TTTAGATGATCTTATAATTAAGCCAATGTACCACCTCTGCTTTTATTTTTTAGTTAAGGGAATTAAATATGATGAATTTC
CTAAGGAATATAAGAAAATAAATTTTGATGCTTTAAAAGCTAGTTTAATAGAAACTCGTAATAAATCTATTAATAATCTT
ATGCTAATTAAAAATGAATTTTCTGATGAAGATAAAAAAATAATAGAAGAGCAATTAACAGAAGAAACTTTAAAAAAGTC
GTTAACATCTTTAATAGACAATTTTACTAATAAAAAGAAAGAATATTTAGAATTAAGTAAAGTGGAGATAATACCTCATG
TTAAGGATATATATATTATGACAACATATATAGCAGATACTAAATATAGAGATTTAAGTGTTATAGATAATAGTTGTGTA
GAGGATGAAATATTATATTTAATTAGAGAAAAAGATAGTAAGTATGATGAAAATGCTATAAATATAGTTACAGAAAAGGG
ATATGTATTAGGATATGTACCTAAAGCAGATAGCTTGATATTGAAAAATATGATTGATAATGGAAAATATTTTTATGGAG
TAATTGAAAAGATAAGTGAAAATTTTGATAGAATCGATATTATGATTTATATGAGCTATAAAGATGTTATAGATGAAATA
ACTAACACAATATCATTATTATATAATAAAAATGGGAAGTATTTACAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATATATGATAGGAGATATGAGAAAAATAATAACGCAAAAAATAATGATATAGCATTATCATATCTATTTTTTTGTATT
TGAAGGGAATGAGAATTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAATGGTGTATCGAATTTTTTACGATACACCATTTTTTCTTAACAACCAAGTTTCCATTCTGTTAAGGCTTTAGCTAA
CTGATCAGGACAAGAAGTTT

Product: hiran domain family

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 656; Mature: 656

Protein sequence:

>656_residues
MFDSNDICAYEKKSIYEELKEFYSEKPGCPYSYQDFEIGGVREFKVIYNKISPLKINQKAKLANELINLIFDYIKEDKKE
IFENIKGYMVLNPISDYYEEFVKSFKAFVETFKEYKEGLTNFLKELIYKGRTHDEIKLAIMMLCVIKLDKREQLLKVFSI
DNEYIFYVIKVYETMDGCNNKIFNLAIKSIGYGKAICIHELQPVSDKIIEWLILDGLEQNFGYLDSLEYTMLSVNLLKFL
KSGRINKGNIKRLSKSFGELFSEYTINNIDNGFKVCFEYFKLVDKYGDDIYSLYGVISGIYSIDTFIFEEYGADGMSRIT
SLVPQYHKISDFADEIYKKGIWKDVIFKELSNIDLEIEILIDAMEKTEFKISNEEFIALIERDYENPALYRYGLEKGNKE
LKENIYNIAYDKLPIIKILNRDKEIIDLDDLIIKPMYHLCFYFLVKGIKYDEFPKEYKKINFDALKASLIETRNKSINNL
MLIKNEFSDEDKKIIEEQLTEETLKKSLTSLIDNFTNKKKEYLELSKVEIIPHVKDIYIMTTYIADTKYRDLSVIDNSCV
EDEILYLIREKDSKYDENAINIVTEKGYVLGYVPKADSLILKNMIDNGKYFYGVIEKISENFDRIDIMIYMSYKDVIDEI
TNTISLLYNKNGKYLQ

Sequences:

>Translated_656_residues
MFDSNDICAYEKKSIYEELKEFYSEKPGCPYSYQDFEIGGVREFKVIYNKISPLKINQKAKLANELINLIFDYIKEDKKE
IFENIKGYMVLNPISDYYEEFVKSFKAFVETFKEYKEGLTNFLKELIYKGRTHDEIKLAIMMLCVIKLDKREQLLKVFSI
DNEYIFYVIKVYETMDGCNNKIFNLAIKSIGYGKAICIHELQPVSDKIIEWLILDGLEQNFGYLDSLEYTMLSVNLLKFL
KSGRINKGNIKRLSKSFGELFSEYTINNIDNGFKVCFEYFKLVDKYGDDIYSLYGVISGIYSIDTFIFEEYGADGMSRIT
SLVPQYHKISDFADEIYKKGIWKDVIFKELSNIDLEIEILIDAMEKTEFKISNEEFIALIERDYENPALYRYGLEKGNKE
LKENIYNIAYDKLPIIKILNRDKEIIDLDDLIIKPMYHLCFYFLVKGIKYDEFPKEYKKINFDALKASLIETRNKSINNL
MLIKNEFSDEDKKIIEEQLTEETLKKSLTSLIDNFTNKKKEYLELSKVEIIPHVKDIYIMTTYIADTKYRDLSVIDNSCV
EDEILYLIREKDSKYDENAINIVTEKGYVLGYVPKADSLILKNMIDNGKYFYGVIEKISENFDRIDIMIYMSYKDVIDEI
TNTISLLYNKNGKYLQ
>Mature_656_residues
MFDSNDICAYEKKSIYEELKEFYSEKPGCPYSYQDFEIGGVREFKVIYNKISPLKINQKAKLANELINLIFDYIKEDKKE
IFENIKGYMVLNPISDYYEEFVKSFKAFVETFKEYKEGLTNFLKELIYKGRTHDEIKLAIMMLCVIKLDKREQLLKVFSI
DNEYIFYVIKVYETMDGCNNKIFNLAIKSIGYGKAICIHELQPVSDKIIEWLILDGLEQNFGYLDSLEYTMLSVNLLKFL
KSGRINKGNIKRLSKSFGELFSEYTINNIDNGFKVCFEYFKLVDKYGDDIYSLYGVISGIYSIDTFIFEEYGADGMSRIT
SLVPQYHKISDFADEIYKKGIWKDVIFKELSNIDLEIEILIDAMEKTEFKISNEEFIALIERDYENPALYRYGLEKGNKE
LKENIYNIAYDKLPIIKILNRDKEIIDLDDLIIKPMYHLCFYFLVKGIKYDEFPKEYKKINFDALKASLIETRNKSINNL
MLIKNEFSDEDKKIIEEQLTEETLKKSLTSLIDNFTNKKKEYLELSKVEIIPHVKDIYIMTTYIADTKYRDLSVIDNSCV
EDEILYLIREKDSKYDENAINIVTEKGYVLGYVPKADSLILKNMIDNGKYFYGVIEKISENFDRIDIMIYMSYKDVIDEI
TNTISLLYNKNGKYLQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 77237; Mature: 77237

Theoretical pI: Translated: 4.80; Mature: 4.80

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFDSNDICAYEKKSIYEELKEFYSEKPGCPYSYQDFEIGGVREFKVIYNKISPLKINQKA
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEECHHH
KLANELINLIFDYIKEDKKEIFENIKGYMVLNPISDYYEEFVKSFKAFVETFKEYKEGLT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NFLKELIYKGRTHDEIKLAIMMLCVIKLDKREQLLKVFSIDNEYIFYVIKVYETMDGCNN
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHCCCCC
KIFNLAIKSIGYGKAICIHELQPVSDKIIEWLILDGLEQNFGYLDSLEYTMLSVNLLKFL
HHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSGRINKGNIKRLSKSFGELFSEYTINNIDNGFKVCFEYFKLVDKYGDDIYSLYGVISGI
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
YSIDTFIFEEYGADGMSRITSLVPQYHKISDFADEIYKKGIWKDVIFKELSNIDLEIEIL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
IDAMEKTEFKISNEEFIALIERDYENPALYRYGLEKGNKELKENIYNIAYDKLPIIKILN
EEHHHHCCEEECCHHHHHEEHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHC
RDKEIIDLDDLIIKPMYHLCFYFLVKGIKYDEFPKEYKKINFDALKASLIETRNKSINNL
CCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCE
MLIKNEFSDEDKKIIEEQLTEETLKKSLTSLIDNFTNKKKEYLELSKVEIIPHVKDIYIM
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEE
TTYIADTKYRDLSVIDNSCVEDEILYLIREKDSKYDENAINIVTEKGYVLGYVPKADSLI
EEECCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCEEEEECCCCHHHH
LKNMIDNGKYFYGVIEKISENFDRIDIMIYMSYKDVIDEITNTISLLYNKNGKYLQ
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFDSNDICAYEKKSIYEELKEFYSEKPGCPYSYQDFEIGGVREFKVIYNKISPLKINQKA
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEECHHH
KLANELINLIFDYIKEDKKEIFENIKGYMVLNPISDYYEEFVKSFKAFVETFKEYKEGLT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NFLKELIYKGRTHDEIKLAIMMLCVIKLDKREQLLKVFSIDNEYIFYVIKVYETMDGCNN
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEHHHHHCCCCC
KIFNLAIKSIGYGKAICIHELQPVSDKIIEWLILDGLEQNFGYLDSLEYTMLSVNLLKFL
HHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KSGRINKGNIKRLSKSFGELFSEYTINNIDNGFKVCFEYFKLVDKYGDDIYSLYGVISGI
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHH
YSIDTFIFEEYGADGMSRITSLVPQYHKISDFADEIYKKGIWKDVIFKELSNIDLEIEIL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
IDAMEKTEFKISNEEFIALIERDYENPALYRYGLEKGNKELKENIYNIAYDKLPIIKILN
EEHHHHCCEEECCHHHHHEEHHCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHC
RDKEIIDLDDLIIKPMYHLCFYFLVKGIKYDEFPKEYKKINFDALKASLIETRNKSINNL
CCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCE
MLIKNEFSDEDKKIIEEQLTEETLKKSLTSLIDNFTNKKKEYLELSKVEIIPHVKDIYIM
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHEEE
TTYIADTKYRDLSVIDNSCVEDEILYLIREKDSKYDENAINIVTEKGYVLGYVPKADSLI
EEECCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCEEEEECCCCHHHH
LKNMIDNGKYFYGVIEKISENFDRIDIMIYMSYKDVIDEITNTISLLYNKNGKYLQ
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA