Definition Leptospira biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Paris)' chromosome chromosome I, complete sequence.
Accession NC_010602
Length 3,599,677

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The map label for this gene is 183221369

Identifier: 183221369

GI number: 183221369

Start: 2067351

End: 2068859

Strand: Direct

Name: 183221369

Synonym: LEPBI_I1987

Alternate gene names: NA

Gene position: 2067351-2068859 (Clockwise)

Preceding gene: 183221368

Following gene: 183221424

Centisome position: 57.43

GC content: 28.5

Gene sequence:

>1509_bases
ATGAATAGAAAAGATTTCAATTTATTGTTTATCTTCTTTGTATCAATTTTATGTCTACAATTGTTTCTTTCGGCTAAAAA
CAGTTTTATATCCGATTCATTGGCAAAAGCCTTTCAAATTGAATCTGCAAAAACACTCAAGTCAGACATTATTTATCCAG
CAAACTTGTTAGATGCTGAAAAAAATCATCATCCAGTATTATTTATAATCAAAAATAAAGAAGAATTAAAATCGGTATTT
TCCCAAACATTTGCATCGATTTATGCGTTTATTTTTTATTTTATACCCGTTCAATTAATGTTATTTTTTAATGGTTTCTT
TCTTTTGCTAAGTGCGTATACTCTAAATCGATATGCAAATATTTCTATAAAAGTAAGTCTCCTTCTTTTTGTTTGCTCCA
TTGTTCTCACTCAGGTAATTGATTTATCCGAGGTTCCCTTTACTCTGTTCTATGTTAGTTTTTGTTATGCTATATGGACA
AAATCAATACAACAAAAGAATGAATTTCTCACTGCAATCACGCTCTTATTATTTGTTTTAGGAAGTTTTCTACGTTTAGA
AATTCTTCTGTTATCAAGTTTAGTATTTTTAAATTCCATGATTCAAACTTCATTAGACAAAAGTTTCAAAAATGGATTCC
TTTATCTAATCTCCTACACTCTTGCAATTTCTATATTCCTTATTTGGAATTATCATGAATTTGGCCACCCTTTTGGTATC
CGATATTTATTCAACTATAGCACTGGAAGTAACTTAACTCTGATATCAAGAGTTTCCAATTTGTTTCATATCCTATTTTC
AGGTAACCCTACCTTAGGTTTTAAATTTGGATTCTTTTTATTTTCTCCTTATTTTATCTATCTTTGTATAAAATATTGGA
AACAGATGTACCCCAAAAAAGAGAATTATATTATATCATTTCATTTTATTGTTTTTTTAATTTATCCCATACTAGTTGGT
CTTTCCGCTCCGAATGACGGTATCACCATTACTGGAAGATATGCCCTTTTTACAATTATCCCTGGTATTTTCATTCTCAA
TCATTTTTGGGATAAAATCAAATCAGACAAATTTTTTCTTACTCTTTTGTTATTTTCATTTTTCCTTAATATCTTTGTTT
TAAAAATTTCAAAAGAAAGTTTCAAAATGATTAAAAAAACGAACAAAATTTATGAGTCTTTCAAAGCCGACTTATGGATT
TTTTATGATCAGAATATTAGTGGTACAGCAGGAGTGCATTTACTCACGCAAAAAAGTTTATCATTTCAAGAATTCTCAGA
TATTGAAAAAAGAAAACAATTACTTGAGGTATTGAAAAAAAATCAAATCAAGTCCGTTTATACCTTTGATTTTTCAAAAA
CAGTTCCAAATTCCTTTATGAATTTAAAAAGAGAGATTGAATTATCTAACGTGGATTTTGTTAAATTTTGGGAGTTGGAA
GGATATACATGTCATTCTTACCAAGAAGTTGCCTTTATTGGCTACCGGCAGTGCTCACTTAAAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACACACTTAAAAATTTTACCTTCGATTACCAGAGAATCGACATTCAAACTTACCGTATTTGGTTGGGAACTATTGCTGAG
AAGGAATCGAAGTGAATCAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GATGGTTTTTGAAATATACAGATAATATCAATTTTAGCCAACGCTTATCAAGATGGAATCACTCACTGTAGGTTGTAGGT
TTTCATTATTTGAGTGACCA

Product: putative signal peptide

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 502; Mature: 502

Protein sequence:

>502_residues
MNRKDFNLLFIFFVSILCLQLFLSAKNSFISDSLAKAFQIESAKTLKSDIIYPANLLDAEKNHHPVLFIIKNKEELKSVF
SQTFASIYAFIFYFIPVQLMLFFNGFFLLLSAYTLNRYANISIKVSLLLFVCSIVLTQVIDLSEVPFTLFYVSFCYAIWT
KSIQQKNEFLTAITLLLFVLGSFLRLEILLLSSLVFLNSMIQTSLDKSFKNGFLYLISYTLAISIFLIWNYHEFGHPFGI
RYLFNYSTGSNLTLISRVSNLFHILFSGNPTLGFKFGFFLFSPYFIYLCIKYWKQMYPKKENYIISFHFIVFLIYPILVG
LSAPNDGITITGRYALFTIIPGIFILNHFWDKIKSDKFFLTLLLFSFFLNIFVLKISKESFKMIKKTNKIYESFKADLWI
FYDQNISGTAGVHLLTQKSLSFQEFSDIEKRKQLLEVLKKNQIKSVYTFDFSKTVPNSFMNLKREIELSNVDFVKFWELE
GYTCHSYQEVAFIGYRQCSLKE

Sequences:

>Translated_502_residues
MNRKDFNLLFIFFVSILCLQLFLSAKNSFISDSLAKAFQIESAKTLKSDIIYPANLLDAEKNHHPVLFIIKNKEELKSVF
SQTFASIYAFIFYFIPVQLMLFFNGFFLLLSAYTLNRYANISIKVSLLLFVCSIVLTQVIDLSEVPFTLFYVSFCYAIWT
KSIQQKNEFLTAITLLLFVLGSFLRLEILLLSSLVFLNSMIQTSLDKSFKNGFLYLISYTLAISIFLIWNYHEFGHPFGI
RYLFNYSTGSNLTLISRVSNLFHILFSGNPTLGFKFGFFLFSPYFIYLCIKYWKQMYPKKENYIISFHFIVFLIYPILVG
LSAPNDGITITGRYALFTIIPGIFILNHFWDKIKSDKFFLTLLLFSFFLNIFVLKISKESFKMIKKTNKIYESFKADLWI
FYDQNISGTAGVHLLTQKSLSFQEFSDIEKRKQLLEVLKKNQIKSVYTFDFSKTVPNSFMNLKREIELSNVDFVKFWELE
GYTCHSYQEVAFIGYRQCSLKE
>Mature_502_residues
MNRKDFNLLFIFFVSILCLQLFLSAKNSFISDSLAKAFQIESAKTLKSDIIYPANLLDAEKNHHPVLFIIKNKEELKSVF
SQTFASIYAFIFYFIPVQLMLFFNGFFLLLSAYTLNRYANISIKVSLLLFVCSIVLTQVIDLSEVPFTLFYVSFCYAIWT
KSIQQKNEFLTAITLLLFVLGSFLRLEILLLSSLVFLNSMIQTSLDKSFKNGFLYLISYTLAISIFLIWNYHEFGHPFGI
RYLFNYSTGSNLTLISRVSNLFHILFSGNPTLGFKFGFFLFSPYFIYLCIKYWKQMYPKKENYIISFHFIVFLIYPILVG
LSAPNDGITITGRYALFTIIPGIFILNHFWDKIKSDKFFLTLLLFSFFLNIFVLKISKESFKMIKKTNKIYESFKADLWI
FYDQNISGTAGVHLLTQKSLSFQEFSDIEKRKQLLEVLKKNQIKSVYTFDFSKTVPNSFMNLKREIELSNVDFVKFWELE
GYTCHSYQEVAFIGYRQCSLKE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58715; Mature: 58715

Theoretical pI: Translated: 9.55; Mature: 9.55

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.4 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
2.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNRKDFNLLFIFFVSILCLQLFLSAKNSFISDSLAKAFQIESAKTLKSDIIYPANLLDAE
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCC
KNHHPVLFIIKNKEELKSVFSQTFASIYAFIFYFIPVQLMLFFNGFFLLLSAYTLNRYAN
CCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEC
ISIKVSLLLFVCSIVLTQVIDLSEVPFTLFYVSFCYAIWTKSIQQKNEFLTAITLLLFVL
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GSFLRLEILLLSSLVFLNSMIQTSLDKSFKNGFLYLISYTLAISIFLIWNYHEFGHPFGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHCCCEEE
RYLFNYSTGSNLTLISRVSNLFHILFSGNPTLGFKFGFFLFSPYFIYLCIKYWKQMYPKK
EEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ENYIISFHFIVFLIYPILVGLSAPNDGITITGRYALFTIIPGIFILNHFWDKIKSDKFFL
CCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
TLLLFSFFLNIFVLKISKESFKMIKKTNKIYESFKADLWIFYDQNISGTAGVHLLTQKSL
HHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCC
SFQEFSDIEKRKQLLEVLKKNQIKSVYTFDFSKTVPNSFMNLKREIELSNVDFVKFWELE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHCCHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEEC
GYTCHSYQEVAFIGYRQCSLKE
CCEECCCHHHHHEEECCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNRKDFNLLFIFFVSILCLQLFLSAKNSFISDSLAKAFQIESAKTLKSDIIYPANLLDAE
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHCCC
KNHHPVLFIIKNKEELKSVFSQTFASIYAFIFYFIPVQLMLFFNGFFLLLSAYTLNRYAN
CCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEC
ISIKVSLLLFVCSIVLTQVIDLSEVPFTLFYVSFCYAIWTKSIQQKNEFLTAITLLLFVL
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GSFLRLEILLLSSLVFLNSMIQTSLDKSFKNGFLYLISYTLAISIFLIWNYHEFGHPFGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHCCCEEE
RYLFNYSTGSNLTLISRVSNLFHILFSGNPTLGFKFGFFLFSPYFIYLCIKYWKQMYPKK
EEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
ENYIISFHFIVFLIYPILVGLSAPNDGITITGRYALFTIIPGIFILNHFWDKIKSDKFFL
CCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHH
TLLLFSFFLNIFVLKISKESFKMIKKTNKIYESFKADLWIFYDQNISGTAGVHLLTQKSL
HHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCC
SFQEFSDIEKRKQLLEVLKKNQIKSVYTFDFSKTVPNSFMNLKREIELSNVDFVKFWELE
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHCCHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEEC
GYTCHSYQEVAFIGYRQCSLKE
CCEECCCHHHHHEEECCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA