| Definition | Leptospira biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Paris)' chromosome chromosome I, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_010602 |
| Length | 3,599,677 |
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The map label for this gene is 183221240
Identifier: 183221240
GI number: 183221240
Start: 1945178
End: 1948339
Strand: Reverse
Name: 183221240
Synonym: LEPBI_I1855
Alternate gene names: NA
Gene position: 1948339-1945178 (Counterclockwise)
Preceding gene: 183221241
Following gene: 183221239
Centisome position: 54.13
GC content: 37.63
Gene sequence:
>3162_bases ATGGATTCATGGGGCAAGATTTCTTTTGATTTTTATACGTTTGGTTCGCTTGTTGGAGTCATTTTTACTTTTTACAATGC ACAATTATTTTTAACGGTAAAGGAAAAATCGGAAGCAACGTTTAATTTAGGAATGGGAACCCTTTGGTTAGGAATTTTCC ATTTTGGTTATCTCATTAATTTTTCCTTTATGGGACCTGCCTCTGCCTATATGAGATGGTTTGTGATCACAGGAGCAATG GCGGGCTCTGTCTACTTAACTGGGTTTTTCTTAAGTTATCCTGAAATTTATTACCCACGACTCAAAAAATCGATCTTTCG AATCTTGAGTGGAGTTGTTATTTTAGTAACAGCTTATTTTGTCTTTGTCAGTTTCAAAGCAGGTCGACTGTTTTTTTTCA GTGGTCATTATTGGGATTTTCCACTTCCTCTTTTTTATAAAGCCTACGCTCTCATTGTCCTCGTATTCTTTGTCACCTTT ACAGTCCTTGCTTTGATCCAATTATTCAAGATGCCGAAAGAGAATCGATTTACTTTGATTAGTATTTTAATCTCCTTCGT TTTGGTCACTATGATCCCTGGTTTTTTGAATGTTTTGTCAAGAGACGGGGCAATCGGGCGTGGATTGTACCAAACCATCA CTGATCTTGTTTTGGTTGTTGGATTATTTGTAGCAAATGTGGTGTATATCAACAATACAAAAGATAAAACCACCATCATT TCCCGAATCATTGGAATCTCTCTCGCATCCTTTTTGTTGATTTTACAATTAGTTGCTTATTCTGTGATCCAACAAACGGA ATCTAATTATGATTTGGTGCATACGGCTAGGGCTAAAAATTATATTTTTGGTTTGGAAACAGACCAAGTTCCGAGTTTTC ACTATTCATATGATATTAAAAACAAAACATTTATCACTCATAAAGGTTTAGAAGAAACCAAATTAGAACCAAAGGAGTAT GTGACAGAGTTTTGGAATGTTTGGGTTTTGGAGATGATCCTTTCCTTTGAATCATCCTCTGATTGGAAAGAAAAAACAAA GGAACTCATTTTGGATTTACCGGAAATGAACAGAGGGTATTCGAAAGAAATCACACGTTTGCTTTCAGATGATTCCATCA AAAGTCCAAAAGATTTGATTGGCGAAATCGAATCAGAAAAGCGAAAGATCCTTTACACACGCAACAAATTGAAAGAGATA CCCATCGCAGGCTTTACAGAAAAGGCCAATGACTTAGTAAAAAAAGAAGAGGGTGCACTTTCTGGATTTTATGCAGAAGC AAGATCGGTTTTATTTTCTTCGCTTTCGGAGGAAAAAAAATATAAATCCCTCGACCTGATGTTTTCTCCGATGCCAAACC ACGGTGAAAGAAATTACCGGGGCCAAGTCAAGTTTGAATCCAAGGAACCAAATTTTTCATTTTACGTCAGTTATCTCATC GTCGATAAAAAAAATGCAATTGTCCACGAAGTGGGTTATCCATATAACGATTATCGTAGTTTCCAACATGAAGTTACTTT GCCTTGGATCATTGGTTTAATTGCTCTTGCCATCCTTGTGATTTTTGGATACAGGTTATTTTTTCTCATCGCCCTGATCC GACCCATTGAACAGATCATAGAAGGGTTAACAGAAGTGAATTCTGGTAATTTAGAATACAGGCTGACTGTGCATGTAGAA GATGATATTGGATTTATGGCAAGGTCATTCAATCGAATGGTTCGTTCCATCCAAGCTGCTCGAAAAAAATTACAACAATA CGCAGAACAATTGGAAGTAAAAGTGCAGGAAAGGACAAAAGAGTTGGAGAATACTCTTAAAGAAGTTCAATCTTTGAAAC ACCAACAAGATGGAGATTATTTCCTCACTTCTCTTTTATTACAACCATTTAACGTCAATCATGCGATGCATGAAAATGTG CGGGTGGATTTTTTATTAGAACAAAAAAAGAAATTCACCTTCAAACAATACGAGAAAGAAATTGGTGGTGACTTGAACAT CGCAAACCAAATCATTTTAAATAATCGGTCATATACTGTATTTTTAAATGCCGATGCCATGGGGAAATCGATGCAAGGGG CAGGGGGGGCACTTGTCTTAGGTTCTGTGTTTGAATCGATCATCACAAGAACCCAACTTTTGAGTGAAGCAAGGAATACC TATCCGGAACGATGGATCAAAAATACATTTCTCGAGCTTCATAAAATTTTTGAAGGTTTTGACGGATCAATGCTTGTCTC TCTTGTGTTAGGTGTTGTTGACAACGAAACAGGATTACTTTATTTCATCAATGCGGAACACCCTTGGATCGTTTTGTACA GAGATGGGATCGCAAGTTTTATCGAAAATGAATTGATGTTTCGTAAATTAGGCACCTCAGGTGTACAAGGAAATTTATAC ATCAAAACCTTTCAATTGGAAGCAGGAGATATATTAATTGCAGGTTCAGACGGTCGTGATGACCTCCTCATTTCCCATAC GGCCGATGGGAAAAGAATCATCAATGAAGATGAAAGATTGTTCCTCAAAATGGTGGAAGCAGGAAAAGGGGAACTTGATT TAATTTATGATGAGATGGCAAAGTTTGGTGCCCTTACAGATGATCTTTCCTTACTTCGAGTTTCGTTCATTGAAGAAAAA GAACGTTATAAAATCGAAAAAGAAAAATTAAAAGAAATCCAATCTCTTTTAGCCAAGGCAAAGGAAGCGAGTGATTCCTC TGATTTACAAGAAGCGGTGACCTATTTGGAAAAAGCGCATTCTTTGGAAGAGAACATCCCTGAGATCAAAAAGAAATTCA TCCAGTTGTATCTGAAACTTAAGGATTATGGGAAGGCAAAAAAGATGGCAAAGGATTATAGCCTACTTCGCCCGATGGAT ACAGAAATCATGTACATCACCGCATTTTGCGCAAGGAAGGTTGCCGATATCAAAACTGCCATTGATTTTGGAGAAAGGGT ACGCCTACGCGATCCAAACCATGTCAAAAACCTGATCAATTTGGGACAAACCTATTTAGCGGATAAAAATTATGCACGCG CGGAGAATATCCTCGGTTCCGCTTTGGCTCTGGATCCCGAAAATCCTAGTTTGATCCGGCTCATCGAACACATTCACAAG AAACAATTGAAACAAGAGGAAACCAGACAGAGTCTAAACTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCTCATTCTACTTTTTCTGATTTTATACTTCCTTTACCAAATGTTGAAGAAAAGAAATACGAAGTTGACATGATTTAAAA TTCTGTTAGGGTTTCCAACC
Downstream 100 bases:
>100_bases CACGTGGATGATTCAGTAAGATTTGAGATTTTTCATAGTTTTTTTGAGTTTACGAAGGAAGAATGGAATCGCTTGGTTCC TTCTGATTCTTTGTTCCAAG
Product: putative histidine kinase sensor protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1053; Mature: 1053
Protein sequence:
>1053_residues MDSWGKISFDFYTFGSLVGVIFTFYNAQLFLTVKEKSEATFNLGMGTLWLGIFHFGYLINFSFMGPASAYMRWFVITGAM AGSVYLTGFFLSYPEIYYPRLKKSIFRILSGVVILVTAYFVFVSFKAGRLFFFSGHYWDFPLPLFYKAYALIVLVFFVTF TVLALIQLFKMPKENRFTLISILISFVLVTMIPGFLNVLSRDGAIGRGLYQTITDLVLVVGLFVANVVYINNTKDKTTII SRIIGISLASFLLILQLVAYSVIQQTESNYDLVHTARAKNYIFGLETDQVPSFHYSYDIKNKTFITHKGLEETKLEPKEY VTEFWNVWVLEMILSFESSSDWKEKTKELILDLPEMNRGYSKEITRLLSDDSIKSPKDLIGEIESEKRKILYTRNKLKEI PIAGFTEKANDLVKKEEGALSGFYAEARSVLFSSLSEEKKYKSLDLMFSPMPNHGERNYRGQVKFESKEPNFSFYVSYLI VDKKNAIVHEVGYPYNDYRSFQHEVTLPWIIGLIALAILVIFGYRLFFLIALIRPIEQIIEGLTEVNSGNLEYRLTVHVE DDIGFMARSFNRMVRSIQAARKKLQQYAEQLEVKVQERTKELENTLKEVQSLKHQQDGDYFLTSLLLQPFNVNHAMHENV RVDFLLEQKKKFTFKQYEKEIGGDLNIANQIILNNRSYTVFLNADAMGKSMQGAGGALVLGSVFESIITRTQLLSEARNT YPERWIKNTFLELHKIFEGFDGSMLVSLVLGVVDNETGLLYFINAEHPWIVLYRDGIASFIENELMFRKLGTSGVQGNLY IKTFQLEAGDILIAGSDGRDDLLISHTADGKRIINEDERLFLKMVEAGKGELDLIYDEMAKFGALTDDLSLLRVSFIEEK ERYKIEKEKLKEIQSLLAKAKEASDSSDLQEAVTYLEKAHSLEENIPEIKKKFIQLYLKLKDYGKAKKMAKDYSLLRPMD TEIMYITAFCARKVADIKTAIDFGERVRLRDPNHVKNLINLGQTYLADKNYARAENILGSALALDPENPSLIRLIEHIHK KQLKQEETRQSLN
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 120901; Mature: 120901
Theoretical pI: Translated: 7.21; Mature: 7.21
Prosite motif: PS50885 HAMP ; PS50005 TPR L=RR ; PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDSWGKISFDFYTFGSLVGVIFTFYNAQLFLTVKEKSEATFNLGMGTLWLGIFHFGYLIN CCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHH FSFMGPASAYMRWFVITGAMAGSVYLTGFFLSYPEIYYPRLKKSIFRILSGVVILVTAYF EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFVSFKAGRLFFFSGHYWDFPLPLFYKAYALIVLVFFVTFTVLALIQLFKMPKENRFTLI HHHHHCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH SILISFVLVTMIPGFLNVLSRDGAIGRGLYQTITDLVLVVGLFVANVVYINNTKDKTTII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHH SRIIGISLASFLLILQLVAYSVIQQTESNYDLVHTARAKNYIFGLETDQVPSFHYSYDIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHCCEEEECCCCCCCCEEEEEECC NKTFITHKGLEETKLEPKEYVTEFWNVWVLEMILSFESSSDWKEKTKELILDLPEMNRGY CCEEEEECCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCH SKEITRLLSDDSIKSPKDLIGEIESEKRKILYTRNKLKEIPIAGFTEKANDLVKKEEGAL HHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCH SGFYAEARSVLFSSLSEEKKYKSLDLMFSPMPNHGERNYRGQVKFESKEPNFSFYVSYLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEE VDKKNAIVHEVGYPYNDYRSFQHEVTLPWIIGLIALAILVIFGYRLFFLIALIRPIEQII EECCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EGLTEVNSGNLEYRLTVHVEDDIGFMARSFNRMVRSIQAARKKLQQYAEQLEVKVQERTK HHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELENTLKEVQSLKHQQDGDYFLTSLLLQPFNVNHAMHENVRVDFLLEQKKKFTFKQYEKE HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH IGGDLNIANQIILNNRSYTVFLNADAMGKSMQGAGGALVLGSVFESIITRTQLLSEARNT CCCCCCCCCEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC YPERWIKNTFLELHKIFEGFDGSMLVSLVLGVVDNETGLLYFINAEHPWIVLYRDGIASF CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCHHHHH IENELMFRKLGTSGVQGNLYIKTFQLEAGDILIAGSDGRDDLLISHTADGKRIINEDERL HHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCHHHCCHHHH FLKMVEAGKGELDLIYDEMAKFGALTDDLSLLRVSFIEEKERYKIEKEKLKEIQSLLAKA HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEASDSSDLQEAVTYLEKAHSLEENIPEIKKKFIQLYLKLKDYGKAKKMAKDYSLLRPMD HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TEIMYITAFCARKVADIKTAIDFGERVRLRDPNHVKNLINLGQTYLADKNYARAENILGS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHH ALALDPENPSLIRLIEHIHKKQLKQEETRQSLN HEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MDSWGKISFDFYTFGSLVGVIFTFYNAQLFLTVKEKSEATFNLGMGTLWLGIFHFGYLIN CCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHH FSFMGPASAYMRWFVITGAMAGSVYLTGFFLSYPEIYYPRLKKSIFRILSGVVILVTAYF EECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFVSFKAGRLFFFSGHYWDFPLPLFYKAYALIVLVFFVTFTVLALIQLFKMPKENRFTLI HHHHHCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH SILISFVLVTMIPGFLNVLSRDGAIGRGLYQTITDLVLVVGLFVANVVYINNTKDKTTII HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCHHHHHH SRIIGISLASFLLILQLVAYSVIQQTESNYDLVHTARAKNYIFGLETDQVPSFHYSYDIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEHHHCCEEEECCCCCCCCEEEEEECC NKTFITHKGLEETKLEPKEYVTEFWNVWVLEMILSFESSSDWKEKTKELILDLPEMNRGY CCEEEEECCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCH SKEITRLLSDDSIKSPKDLIGEIESEKRKILYTRNKLKEIPIAGFTEKANDLVKKEEGAL HHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCH SGFYAEARSVLFSSLSEEKKYKSLDLMFSPMPNHGERNYRGQVKFESKEPNFSFYVSYLI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEE VDKKNAIVHEVGYPYNDYRSFQHEVTLPWIIGLIALAILVIFGYRLFFLIALIRPIEQII EECCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EGLTEVNSGNLEYRLTVHVEDDIGFMARSFNRMVRSIQAARKKLQQYAEQLEVKVQERTK HHHHHCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ELENTLKEVQSLKHQQDGDYFLTSLLLQPFNVNHAMHENVRVDFLLEQKKKFTFKQYEKE HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH IGGDLNIANQIILNNRSYTVFLNADAMGKSMQGAGGALVLGSVFESIITRTQLLSEARNT CCCCCCCCCEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC YPERWIKNTFLELHKIFEGFDGSMLVSLVLGVVDNETGLLYFINAEHPWIVLYRDGIASF CHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCEEEEECCHHHHH IENELMFRKLGTSGVQGNLYIKTFQLEAGDILIAGSDGRDDLLISHTADGKRIINEDERL HHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEECCCCCCCEEEEECCCCCHHHCCHHHH FLKMVEAGKGELDLIYDEMAKFGALTDDLSLLRVSFIEEKERYKIEKEKLKEIQSLLAKA HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KEASDSSDLQEAVTYLEKAHSLEENIPEIKKKFIQLYLKLKDYGKAKKMAKDYSLLRPMD HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC TEIMYITAFCARKVADIKTAIDFGERVRLRDPNHVKNLINLGQTYLADKNYARAENILGS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCHHHHHHHHCCHHHHCCCCHHHHHHHHHH ALALDPENPSLIRLIEHIHKKQLKQEETRQSLN HEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA