| Definition | Nostoc sp. PCC 7120, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003272 |
| Length | 6,413,771 |
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The map label for this gene is 17228826
Identifier: 17228826
GI number: 17228826
Start: 1579924
End: 1582785
Strand: Direct
Name: 17228826
Synonym: alr1331
Alternate gene names: NA
Gene position: 1579924-1582785 (Clockwise)
Preceding gene: 17228825
Following gene: 17228827
Centisome position: 24.63
GC content: 41.96
Gene sequence:
>2862_bases ATGGGCAAGCGCTTCTGGCAAACTTGGCAAGAATTTAGGCAGTCATTTTCAGTATCAGACAGCCTGAGTACAGGCATCGA AACTGGTAAGGCATTGTTGGAAGCTGCCAATACTCTCAAAGAAGAGGGTGATAGTATAGAAATCTTGCAATCAGTCCTGC AAAACTCATCTTCTTTATTAGATGTGTTGTGTTCGCCAATGGCGCAGGTGATAGGTGCGGGGTTGCCATTTGTGCCAATT GGCATTGCTTTGTTAAAATTTGCCCGTGACATAAATCAGCAAGACCCATCTTTAGAAGACTGCTTTTTTATAGTTAGTCA AGCGGCTTATTTGGAAAGCGCTAAGGAAATTTTAAGTTTAAACATATATCAGAATTTTAATTGGGATGCCAAGCTAGATA TTAAAGCCATCAGTCAGCAAATAGAAAAGCTTAATGATGTTGAATTTAATTCTGATACTGCGAGTAAAGCAATCAGATGT TTCCATGAATCACCTTTAGCTGAAGCCTTCAATCAGGTCTTATTAGCTAGATTAGCAGCAGCCAATATTTCCCCAGGACT AGCGGAAATTTTAACCCAACGTGTGGCTCGGAACACTCACCGCTACATCATTAAAGCTTGGATAGAAGCGGGTGAGGCGA TAAAAACTTTAATTCAGCCTTCCTTGGGTGATTGGCAGAGAGAACAAGAAAGGTTCCAGAGTATTGATAGTTATTTAAAA ACTCATATTGAGCAGAAACCTTTTGAATTAGTTTTTGATGAAAAGTTCGCCTTTAAAGATATTTATGTACCTATCAAAGC CAAGCCTGTAGATGCAAATGGCAAGATAGATGAAGAAAAAGATTCCTTCAATTTAGAAACTTGGGCGAAAACGATTCTGT GGAAGCCAGATAACTTGGAACAGGTAATGTTTATCCAAGGAGGCCCAGGTAGGGGTAAAAGCGTTTTCTGCCGAATGTTT GCTTATGCAGTGTGGCGACAGTTACACCCAATTTGGACACCGATTTTAATTCGCTTGAGAGATATCGATACTTTTGAATC ACGGTTAGAAAATACTATCAAAGCTGAATTAAAACTGGGTTTTATTCAAGGTGATGCTAACTGGTTGACTAATGCCAATA CTCGATTTCTGTTTATTCTTGATGGTTTTGATGAACTACATATTGAAACGAGAAATAACCTCAACTTGGGCGACTTTATT AAGCAAGTAGCTGGATTTCAGAAAGAATGCAAAGATTATAGTGAAATGGGGCATCGAGTTATTATTACTGGTAGGTCGAT GGCTTTACAAGGTATTGCTAATTTACCCCGCAATTTAGAGCGCGTGGAGATTGTCGAGATGGATGGACAACTCCAACAGC AATGGTTAAATAAGTGGGAAGCCTTACAAATAAATAAAGGTAAAACCATCGCATTTGAGCAGTTTTTACAAAGTGATAAA TGCCCCGATGAAGTTAAGAAATTAGCTCAGGAACCGTTACTGCTCTACTTATTAGCGGCAATGTATCGAGATTGGAAGTT AGACATTCATAAGTTAGAGCAAGCAAGTGATAATCGCACCGCTAAAATTATCATTTACCAAGAAGCTGTAAATTGGGTAC TGACTAAACAGCGTTCTGACGCAGATGGGACTGATTTAAATATTGAGTTCACTAAACAAAAGCCGGAGGATTTAAAACGC ATCCTCATGGAAGCTGCGGTTTGTGTTGTGCAGTCTGGTGGTGAATTTGCTTCTATGTCTATGTTAGAAGCACGTTTACA AGAAGATGAAGCGGCGAAGGCTTTAATTGAAAAAGCGAAAGAGAAACTGGGGAATGAGGCACTGAAAACAGCTTTGGCTG CGTTTTACATTCGTCCGGCGGAAAAACAAGAGGGTGGGGTTGAGTTCTTCCATAAAAGTTTCGGTGAGTTTCTCTTTGCT GAACGCCTGAAAGCACGGCTTAAGGCTTGGACGCAATATTACGATGGGGATGAGGGGAGACAACCAATTATTTCTGAAGC TGTGATGAATTGGGAAGTCTATGATTTACTTGGTTACGGTGGGTTAACTAGGGAAATTGTAGACTACCTGATGGGGTTGT TAACCGAGAGTCAAGATTTCCGGTGGGTGGAATTATTTAAGCGGTTAGACAAGTTTTATAGTAAATGGTGTCAAGGGAAA TTTATTGACACGGCTGAGGAGACTTTACCCCAGAAGAAGTTGCGACAGTTGCAAAGATATGGGATTACTGGGTTAGGTCA GCGTCAGGTAGATGTTTACGCTGGGTTGAATGTGATGATTCTGCTGTTGGAGTTACACCGTTATGCTCAAGAGCGAGATG ATCTGAAAGCAGAAATTGTCTTTTATCCATCTGGGAAACCGCAGGAAAATAGGCGCACAATCCAATTGCTTCGCATCATT AATTATAGTGATGGCTTGAATTTAAGCAACTTTATCAAGATAGTTGGCAAATTTCTCAGAGGCGCATACCTCAGTGGCGC ATACCTCAGTGGCGCAGACCTCAGTGGTGCAGACCTCAGTGGCGCAGACTTCAGCGACGCATACCTCAGTGGCGCAGACC TCGGCGACACATCCCTCAGAGGCGCATTTCTCAGAGAGGCAGACTTCAGAGGTGCATATCTAGATGCCGCAGACCTAAGT GGCGCAGACCTCACAGAGGCAGACCTCACAGAGGCAAACCTAAGTGGCGCATACCTCAGTGGTGCATACCTCAGCAATGC AGACCTTAGTGGTGCATACCTCAGTGATGAATTTTGGGGAGATGTCAAATGGGATGAAAAGACAAACTGGGAGAATGTAC GAGGATTGGATACAGCAATTAATGTGCCAGAAGCGTTAAAGCAACAGTTAGGACTGAGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ACTCTGGAAGTCCTTACTCAGGAATCAGCGCTCTCTACTTTGCACTCCCCAAAATGCTACACTAAGCTCGAATTAACGGT AGTTACACGGGTGTGAGTGG
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTTGTGATTAATGTCCTGTGCAACTTGCTCTCAATATATAAGGTTGGGTTGGGCTGTTGCTTCACCCAAAGAGATTTTG ATTTACGTGGGAGAATAACG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 953; Mature: 952
Protein sequence:
>953_residues MGKRFWQTWQEFRQSFSVSDSLSTGIETGKALLEAANTLKEEGDSIEILQSVLQNSSSLLDVLCSPMAQVIGAGLPFVPI GIALLKFARDINQQDPSLEDCFFIVSQAAYLESAKEILSLNIYQNFNWDAKLDIKAISQQIEKLNDVEFNSDTASKAIRC FHESPLAEAFNQVLLARLAAANISPGLAEILTQRVARNTHRYIIKAWIEAGEAIKTLIQPSLGDWQREQERFQSIDSYLK THIEQKPFELVFDEKFAFKDIYVPIKAKPVDANGKIDEEKDSFNLETWAKTILWKPDNLEQVMFIQGGPGRGKSVFCRMF AYAVWRQLHPIWTPILIRLRDIDTFESRLENTIKAELKLGFIQGDANWLTNANTRFLFILDGFDELHIETRNNLNLGDFI KQVAGFQKECKDYSEMGHRVIITGRSMALQGIANLPRNLERVEIVEMDGQLQQQWLNKWEALQINKGKTIAFEQFLQSDK CPDEVKKLAQEPLLLYLLAAMYRDWKLDIHKLEQASDNRTAKIIIYQEAVNWVLTKQRSDADGTDLNIEFTKQKPEDLKR ILMEAAVCVVQSGGEFASMSMLEARLQEDEAAKALIEKAKEKLGNEALKTALAAFYIRPAEKQEGGVEFFHKSFGEFLFA ERLKARLKAWTQYYDGDEGRQPIISEAVMNWEVYDLLGYGGLTREIVDYLMGLLTESQDFRWVELFKRLDKFYSKWCQGK FIDTAEETLPQKKLRQLQRYGITGLGQRQVDVYAGLNVMILLLELHRYAQERDDLKAEIVFYPSGKPQENRRTIQLLRII NYSDGLNLSNFIKIVGKFLRGAYLSGAYLSGADLSGADLSGADFSDAYLSGADLGDTSLRGAFLREADFRGAYLDAADLS GADLTEADLTEANLSGAYLSGAYLSNADLSGAYLSDEFWGDVKWDEKTNWENVRGLDTAINVPEALKQQLGLS
Sequences:
>Translated_953_residues MGKRFWQTWQEFRQSFSVSDSLSTGIETGKALLEAANTLKEEGDSIEILQSVLQNSSSLLDVLCSPMAQVIGAGLPFVPI GIALLKFARDINQQDPSLEDCFFIVSQAAYLESAKEILSLNIYQNFNWDAKLDIKAISQQIEKLNDVEFNSDTASKAIRC FHESPLAEAFNQVLLARLAAANISPGLAEILTQRVARNTHRYIIKAWIEAGEAIKTLIQPSLGDWQREQERFQSIDSYLK THIEQKPFELVFDEKFAFKDIYVPIKAKPVDANGKIDEEKDSFNLETWAKTILWKPDNLEQVMFIQGGPGRGKSVFCRMF AYAVWRQLHPIWTPILIRLRDIDTFESRLENTIKAELKLGFIQGDANWLTNANTRFLFILDGFDELHIETRNNLNLGDFI KQVAGFQKECKDYSEMGHRVIITGRSMALQGIANLPRNLERVEIVEMDGQLQQQWLNKWEALQINKGKTIAFEQFLQSDK CPDEVKKLAQEPLLLYLLAAMYRDWKLDIHKLEQASDNRTAKIIIYQEAVNWVLTKQRSDADGTDLNIEFTKQKPEDLKR ILMEAAVCVVQSGGEFASMSMLEARLQEDEAAKALIEKAKEKLGNEALKTALAAFYIRPAEKQEGGVEFFHKSFGEFLFA ERLKARLKAWTQYYDGDEGRQPIISEAVMNWEVYDLLGYGGLTREIVDYLMGLLTESQDFRWVELFKRLDKFYSKWCQGK FIDTAEETLPQKKLRQLQRYGITGLGQRQVDVYAGLNVMILLLELHRYAQERDDLKAEIVFYPSGKPQENRRTIQLLRII NYSDGLNLSNFIKIVGKFLRGAYLSGAYLSGADLSGADLSGADFSDAYLSGADLGDTSLRGAFLREADFRGAYLDAADLS GADLTEADLTEANLSGAYLSGAYLSNADLSGAYLSDEFWGDVKWDEKTNWENVRGLDTAINVPEALKQQLGLS >Mature_952_residues GKRFWQTWQEFRQSFSVSDSLSTGIETGKALLEAANTLKEEGDSIEILQSVLQNSSSLLDVLCSPMAQVIGAGLPFVPIG IALLKFARDINQQDPSLEDCFFIVSQAAYLESAKEILSLNIYQNFNWDAKLDIKAISQQIEKLNDVEFNSDTASKAIRCF HESPLAEAFNQVLLARLAAANISPGLAEILTQRVARNTHRYIIKAWIEAGEAIKTLIQPSLGDWQREQERFQSIDSYLKT HIEQKPFELVFDEKFAFKDIYVPIKAKPVDANGKIDEEKDSFNLETWAKTILWKPDNLEQVMFIQGGPGRGKSVFCRMFA YAVWRQLHPIWTPILIRLRDIDTFESRLENTIKAELKLGFIQGDANWLTNANTRFLFILDGFDELHIETRNNLNLGDFIK QVAGFQKECKDYSEMGHRVIITGRSMALQGIANLPRNLERVEIVEMDGQLQQQWLNKWEALQINKGKTIAFEQFLQSDKC PDEVKKLAQEPLLLYLLAAMYRDWKLDIHKLEQASDNRTAKIIIYQEAVNWVLTKQRSDADGTDLNIEFTKQKPEDLKRI LMEAAVCVVQSGGEFASMSMLEARLQEDEAAKALIEKAKEKLGNEALKTALAAFYIRPAEKQEGGVEFFHKSFGEFLFAE RLKARLKAWTQYYDGDEGRQPIISEAVMNWEVYDLLGYGGLTREIVDYLMGLLTESQDFRWVELFKRLDKFYSKWCQGKF IDTAEETLPQKKLRQLQRYGITGLGQRQVDVYAGLNVMILLLELHRYAQERDDLKAEIVFYPSGKPQENRRTIQLLRIIN YSDGLNLSNFIKIVGKFLRGAYLSGAYLSGADLSGADLSGADFSDAYLSGADLGDTSLRGAFLREADFRGAYLDAADLSG ADLTEADLTEANLSGAYLSGAYLSNADLSGAYLSDEFWGDVKWDEKTNWENVRGLDTAINVPEALKQQLGLS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 5 pentapeptide repeat domains [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR001646 [H]
Pfam domain/function: PF00805 Pentapeptide [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 108030; Mature: 107899
Theoretical pI: Translated: 4.78; Mature: 4.78
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MGKRFWQTWQEFRQSFSVSDSLSTGIETGKALLEAANTLKEEGDSIEILQSVLQNSSSLL CCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHH DVLCSPMAQVIGAGLPFVPIGIALLKFARDINQQDPSLEDCFFIVSQAAYLESAKEILSL HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE NIYQNFNWDAKLDIKAISQQIEKLNDVEFNSDTASKAIRCFHESPLAEAFNQVLLARLAA HEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH ANISPGLAEILTQRVARNTHRYIIKAWIEAGEAIKTLIQPSLGDWQREQERFQSIDSYLK CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH THIEQKPFELVFDEKFAFKDIYVPIKAKPVDANGKIDEEKDSFNLETWAKTILWKPDNLE HHHCCCCHHEEECCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCC QVMFIQGGPGRGKSVFCRMFAYAVWRQLHPIWTPILIRLRDIDTFESRLENTIKAELKLG EEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEEE FIQGDANWLTNANTRFLFILDGFDELHIETRNNLNLGDFIKQVAGFQKECKDYSEMGHRV EEECCCCEECCCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE IITGRSMALQGIANLPRNLERVEIVEMDGQLQQQWLNKWEALQINKGKTIAFEQFLQSDK EEECCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHCCCC CPDEVKKLAQEPLLLYLLAAMYRDWKLDIHKLEQASDNRTAKIIIYQEAVNWVLTKQRSD CHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHCCCCC ADGTDLNIEFTKQKPEDLKRILMEAAVCVVQSGGEFASMSMLEARLQEDEAAKALIEKAK CCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKLGNEALKTALAAFYIRPAEKQEGGVEFFHKSFGEFLFAERLKARLKAWTQYYDGDEGR HHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC QPIISEAVMNWEVYDLLGYGGLTREIVDYLMGLLTESQDFRWVELFKRLDKFYSKWCQGK CHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC FIDTAEETLPQKKLRQLQRYGITGLGQRQVDVYAGLNVMILLLELHRYAQERDDLKAEIV CCCCHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE FYPSGKPQENRRTIQLLRIINYSDGLNLSNFIKIVGKFLRGAYLSGAYLSGADLSGADLS ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCCC GADFSDAYLSGADLGDTSLRGAFLREADFRGAYLDAADLSGADLTEADLTEANLSGAYLS CCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCEEE GAYLSNADLSGAYLSDEFWGDVKWDEKTNWENVRGLDTAINVPEALKQQLGLS CCEECCCCCCCCEECHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure GKRFWQTWQEFRQSFSVSDSLSTGIETGKALLEAANTLKEEGDSIEILQSVLQNSSSLL CCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCHHHH DVLCSPMAQVIGAGLPFVPIGIALLKFARDINQQDPSLEDCFFIVSQAAYLESAKEILSL HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE NIYQNFNWDAKLDIKAISQQIEKLNDVEFNSDTASKAIRCFHESPLAEAFNQVLLARLAA HEEECCCCCCEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH ANISPGLAEILTQRVARNTHRYIIKAWIEAGEAIKTLIQPSLGDWQREQERFQSIDSYLK CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH THIEQKPFELVFDEKFAFKDIYVPIKAKPVDANGKIDEEKDSFNLETWAKTILWKPDNLE HHHCCCCHHEEECCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCC QVMFIQGGPGRGKSVFCRMFAYAVWRQLHPIWTPILIRLRDIDTFESRLENTIKAELKLG EEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHEEE FIQGDANWLTNANTRFLFILDGFDELHIETRNNLNLGDFIKQVAGFQKECKDYSEMGHRV EEECCCCEECCCCCEEEEEECCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEE IITGRSMALQGIANLPRNLERVEIVEMDGQLQQQWLNKWEALQINKGKTIAFEQFLQSDK EEECCHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHCCCCEEEECCCCCHHHHHHHCCCC CPDEVKKLAQEPLLLYLLAAMYRDWKLDIHKLEQASDNRTAKIIIYQEAVNWVLTKQRSD CHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHCCCCC ADGTDLNIEFTKQKPEDLKRILMEAAVCVVQSGGEFASMSMLEARLQEDEAAKALIEKAK CCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKLGNEALKTALAAFYIRPAEKQEGGVEFFHKSFGEFLFAERLKARLKAWTQYYDGDEGR HHHCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC QPIISEAVMNWEVYDLLGYGGLTREIVDYLMGLLTESQDFRWVELFKRLDKFYSKWCQGK CHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC FIDTAEETLPQKKLRQLQRYGITGLGQRQVDVYAGLNVMILLLELHRYAQERDDLKAEIV CCCCHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE FYPSGKPQENRRTIQLLRIINYSDGLNLSNFIKIVGKFLRGAYLSGAYLSGADLSGADLS ECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECCCCCCCCCCC GADFSDAYLSGADLGDTSLRGAFLREADFRGAYLDAADLSGADLTEADLTEANLSGAYLS CCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCEEE GAYLSNADLSGAYLSDEFWGDVKWDEKTNWENVRGLDTAINVPEALKQQLGLS CCEECCCCCCCCEECHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA