Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010503 |
Length | 751,679 |
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The map label for this gene is pstA [H]
Identifier: 170762278
GI number: 170762278
Start: 242671
End: 244866
Strand: Direct
Name: pstA [H]
Synonym: UPA3_0205
Alternate gene names: 170762278
Gene position: 242671-244866 (Clockwise)
Preceding gene: 170762047
Following gene: 170762201
Centisome position: 32.28
GC content: 27.69
Gene sequence:
>2196_bases ATGAGTATTTTAAATCTTAATTCGCAACAGACTAAAAAAATCATTTTTAACAAAAAAATAAAAGATAAACTAGCTAAAAC GTTAGTTATTAGTTTTGCTTGATTATTTTCTATTTGTTTTATTGGTTTAGTTGTTTTTATTATTATTCGTTCAATACCTG GCTTTGAAGCTTATGGATTAAAAAACATTTTTTGAAGCAAGAATTTTAACTTAGCTGATTATGCTGCTGGTTCATCAGTT TGATTTCCATTAGCAATTACTTTGCTTGTTTCGTTTGGTGCAATTATAATTGCTGCTCCAATTGGTATTAAAACAGCTAC TTTTATTAAGTTTAGAATTAAAAACAAAAGATTACAAAAATTTTTTAGAGTCACGATTTTAGCATTAGCTGGAATTCCTT CAGTTATTTTTGGATTATTTGCTATTCAGTCTTTAGGTCCTGCAATTTCGTTTGTTTTCCACATTGATACTGTTCAAAAC ATTACTACGTCAATGTTTATGTTAGCGTTTATTATTATTCCGACAATTATTTCTTTAACGCTAAGCACATATGATGGTAT TGATATGCGTTTAATTGAAAATGGGATAGGAATGGGAAGTTCTTATACACGTTCAATTTATAAGATTTTTAAAAAAGAAG CTCGTGGTGGTATCATTATTGCCATTATTATTGCCTTAGGTCGTGCGATCGGCGAAACAATGGCCATTAGTATGATTTTA AGTGATCAAGGTTACCAAAACATTTTTGGTACTGGTTTTTTACAAATTATGCACTCTGCTCTTCGTCCATTAGGTGCTGT AATTTCAGCTAACATGTTCGCTGAAAATGGTGGCGAAGGTTTAAGAGGATTACTATATATTTATGGGATCGTTTTATTTG TAGCGATTATGATTTTAAATGGCCTTGTAACTTATTTAACAAGAAAACGTTCAAAGAAAACATATGCTTGATTTATTAAA TTAGAAAAAAGTTTAGCTTATATAGTTTGTTTTATACCAGATCAATTAAAAATTTTATATGAGAAAATTACGCATCGTTC CCAATATAAATTACATGTAAACAATTTGGATAACTTAAATAACTATATTACAGATCGTATTCAAAATCGAAAACTAAAAC GTTTATATACTGTTCACAAATTATTTTTTGAATCATTAGCGTTTATGGTTGCTTTTGCTTTTTTAGCTTGAATTTCACTA GATATTTTAGTTAATGGAATTAAAGCAATTAATTTACCAACATCAACAGTAGTAGCTTATACAAAAAACACAACTGGACA AGCAACAATTAATACTTTAATAATTATTATTGTTGCAATTTTAATTGGTTTACCATTTTCATTGTTTGTCGCAATTTATA TTAATGAATATGCTAAAAATAAATGACCAAAAAAAGTTTTATTATTTTTTATTGATTCATTTGGATCAACGCCTTCGATT ATTTTTGGGATGTTTGGTTTAGTTATTTTTATTGAAATTTTTGGTTTTACTTCAATGGGTAATATTGGTAAATCACTATT AGCGGGTGCTTTAACAATTACTTTAGTAGTCCTTCCAACATTTACACGTTCAATTCAACAATCTTTAAAAGCAGTACCAA TGAGCATTCGTGAAAATGCTTATGGATTGGGATGTTCAAAGTGAGAAACAATTGTTAAATTAGTTTTACCACAAGCAAAA AAAGGAATTATTTCTGCGATTGTATTAACAATTGGTCGAATTGTAGCTGAAACTGCACCATTGTATTTAACAGCAGGTTT ATCATCAGCTCAAAGCATAACAATTTTAAATCCTGGACAAACATTAACAACACGTATTTATGCTCAATTATATGAAAATA ATACAAATATTGCTCATAATGTAATGTACGAATCTGCTTTTATTACTTTATGATTAGTTATTGCATTAATCATCATTGCT CACGTTATTGTTCCTTATTTTGAATTTATTAAACATGATATTAAAAAATGGTTTAAAATTTTAAAAAATTATCTTCGCGC ACCTTACATGCGTGATATTAAAGTTTTCAAACCACAAATTTATCAAAAACATCTTTATTTAACACATAATCAAGCCAAAA TCATGGGATATAATGAATCAGTAAATAAAGTTGCTAAAATTGGTTTAAAGTTATATGAAATTCGTTATGTTGATGATGAA CAAATTCAAAAAGAGTTATTAAAAGTTAGGGGATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAGCCATTAACAATCAAAGCGCAAAAAACAATTTTTTTGTAAGTGATTTTGAATTAATAGAATCAAATAGAATTAATATA TTAGGAGCAAAATCAGCATA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAATATGAATGATCAAAAAGACAATAAAGAAATTCAAACAATTGTTCCTTTAAATCAAAAAACTAATTTAAATGAATTGG ATGCTAAAGCAATTTATGAT
Product: phosphate transport system permease
Products: ADP; phosphate [Cytoplasm]; phosphate [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 731; Mature: 730
Protein sequence:
>731_residues MSILNLNSQQTKKIIFNKKIKDKLAKTLVISFAWLFSICFIGLVVFIIIRSIPGFEAYGLKNIFWSKNFNLADYAAGSSV WFPLAITLLVSFGAIIIAAPIGIKTATFIKFRIKNKRLQKFFRVTILALAGIPSVIFGLFAIQSLGPAISFVFHIDTVQN ITTSMFMLAFIIIPTIISLTLSTYDGIDMRLIENGIGMGSSYTRSIYKIFKKEARGGIIIAIIIALGRAIGETMAISMIL SDQGYQNIFGTGFLQIMHSALRPLGAVISANMFAENGGEGLRGLLYIYGIVLFVAIMILNGLVTYLTRKRSKKTYAWFIK LEKSLAYIVCFIPDQLKILYEKITHRSQYKLHVNNLDNLNNYITDRIQNRKLKRLYTVHKLFFESLAFMVAFAFLAWISL DILVNGIKAINLPTSTVVAYTKNTTGQATINTLIIIIVAILIGLPFSLFVAIYINEYAKNKWPKKVLLFFIDSFGSTPSI IFGMFGLVIFIEIFGFTSMGNIGKSLLAGALTITLVVLPTFTRSIQQSLKAVPMSIRENAYGLGCSKWETIVKLVLPQAK KGIISAIVLTIGRIVAETAPLYLTAGLSSAQSITILNPGQTLTTRIYAQLYENNTNIAHNVMYESAFITLWLVIALIIIA HVIVPYFEFIKHDIKKWFKILKNYLRAPYMRDIKVFKPQIYQKHLYLTHNQAKIMGYNESVNKVAKIGLKLYEIRYVDDE QIQKELLKVRG
Sequences:
>Translated_731_residues MSILNLNSQQTKKIIFNKKIKDKLAKTLVISFA*LFSICFIGLVVFIIIRSIPGFEAYGLKNIF*SKNFNLADYAAGSSV *FPLAITLLVSFGAIIIAAPIGIKTATFIKFRIKNKRLQKFFRVTILALAGIPSVIFGLFAIQSLGPAISFVFHIDTVQN ITTSMFMLAFIIIPTIISLTLSTYDGIDMRLIENGIGMGSSYTRSIYKIFKKEARGGIIIAIIIALGRAIGETMAISMIL SDQGYQNIFGTGFLQIMHSALRPLGAVISANMFAENGGEGLRGLLYIYGIVLFVAIMILNGLVTYLTRKRSKKTYA*FIK LEKSLAYIVCFIPDQLKILYEKITHRSQYKLHVNNLDNLNNYITDRIQNRKLKRLYTVHKLFFESLAFMVAFAFLA*ISL DILVNGIKAINLPTSTVVAYTKNTTGQATINTLIIIIVAILIGLPFSLFVAIYINEYAKNK*PKKVLLFFIDSFGSTPSI IFGMFGLVIFIEIFGFTSMGNIGKSLLAGALTITLVVLPTFTRSIQQSLKAVPMSIRENAYGLGCSK*ETIVKLVLPQAK KGIISAIVLTIGRIVAETAPLYLTAGLSSAQSITILNPGQTLTTRIYAQLYENNTNIAHNVMYESAFITL*LVIALIIIA HVIVPYFEFIKHDIKKWFKILKNYLRAPYMRDIKVFKPQIYQKHLYLTHNQAKIMGYNESVNKVAKIGLKLYEIRYVDDE QIQKELLKVRG >Mature_730_residues SILNLNSQQTKKIIFNKKIKDKLAKTLVISFA*LFSICFIGLVVFIIIRSIPGFEAYGLKNIF*SKNFNLADYAAGSSV* FPLAITLLVSFGAIIIAAPIGIKTATFIKFRIKNKRLQKFFRVTILALAGIPSVIFGLFAIQSLGPAISFVFHIDTVQNI TTSMFMLAFIIIPTIISLTLSTYDGIDMRLIENGIGMGSSYTRSIYKIFKKEARGGIIIAIIIALGRAIGETMAISMILS DQGYQNIFGTGFLQIMHSALRPLGAVISANMFAENGGEGLRGLLYIYGIVLFVAIMILNGLVTYLTRKRSKKTYA*FIKL EKSLAYIVCFIPDQLKILYEKITHRSQYKLHVNNLDNLNNYITDRIQNRKLKRLYTVHKLFFESLAFMVAFAFLA*ISLD ILVNGIKAINLPTSTVVAYTKNTTGQATINTLIIIIVAILIGLPFSLFVAIYINEYAKNK*PKKVLLFFIDSFGSTPSII FGMFGLVIFIEIFGFTSMGNIGKSLLAGALTITLVVLPTFTRSIQQSLKAVPMSIRENAYGLGCSK*ETIVKLVLPQAKK GIISAIVLTIGRIVAETAPLYLTAGLSSAQSITILNPGQTLTTRIYAQLYENNTNIAHNVMYESAFITL*LVIALIIIAH VIVPYFEFIKHDIKKWFKILKNYLRAPYMRDIKVFKPQIYQKHLYLTHNQAKIMGYNESVNKVAKIGLKLYEIRYVDDEQ IQKELLKVRG
Specific function: Could be part of a binding-protein-dependent transport system for phosphate; probably responsible for the translocation of the substrate across the membrane [H]
COG id: COG0581
COG function: function code P; ABC-type phosphate transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 2 ABC transmembrane type-1 domains [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790164, Length=228, Percent_Identity=28.0701754385965, Blast_Score=94, Evalue=3e-20, Organism=Escherichia coli, GI1790163, Length=281, Percent_Identity=28.8256227758007, Blast_Score=89, Evalue=9e-19,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR000515 - InterPro: IPR001991 - InterPro: IPR005672 [H]
Pfam domain/function: PF00528 BPD_transp_1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 80539; Mature: 80407
Theoretical pI: Translated: 10.44; Mature: 10.44
Prosite motif: PS50928 ABC_TM1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSILNLNSQQTKKIIFNKKIKDKLAKTLVISFALFSICFIGLVVFIIIRSIPGFEAYGLK CCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCHH NIFSKNFNLADYAAGSSVFPLAITLLVSFGAIIIAAPIGIKTATFIKFRIKNKRLQKFFR HHHHCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHEEEEEECHHHHHHHHH VTILALAGIPSVIFGLFAIQSLGPAISFVFHIDTVQNITTSMFMLAFIIIPTIISLTLST HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC YDGIDMRLIENGIGMGSSYTRSIYKIFKKEARGGIIIAIIIALGRAIGETMAISMILSDQ CCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GYQNIFGTGFLQIMHSALRPLGAVISANMFAENGGEGLRGLLYIYGIVLFVAIMILNGLV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TYLTRKRSKKTYAFIKLEKSLAYIVCFIPDQLKILYEKITHRSQYKLHVNNLDNLNNYIT HHHHHHCCCCEEEEEEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHH DRIQNRKLKRLYTVHKLFFESLAFMVAFAFLAISLDILVNGIKAINLPTSTVVAYTKNTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCCCEEEEEECCCC GQATINTLIIIIVAILIGLPFSLFVAIYINEYAKNKPKKVLLFFIDSFGSTPSIIFGMFG CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHH LVIFIEIFGFTSMGNIGKSLLAGALTITLVVLPTFTRSIQQSLKAVPMSIRENAYGLGCS HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCC KETIVKLVLPQAKKGIISAIVLTIGRIVAETAPLYLTAGLSSAQSITILNPGQTLTTRIY HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCHHHHHHH AQLYENNTNIAHNVMYESAFITLLVIALIIIAHVIVPYFEFIKHDIKKWFKILKNYLRAP HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC YMRDIKVFKPQIYQKHLYLTHNQAKIMGYNESVNKVAKIGLKLYEIRYVDDEQIQKELLK CHHHHHHHCHHHHHHHEEEEECCEEEEECCHHHHHHHHHCCEEEEEEECCHHHHHHHHHH VRG HCC >Mature Secondary Structure SILNLNSQQTKKIIFNKKIKDKLAKTLVISFALFSICFIGLVVFIIIRSIPGFEAYGLK CEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCHH NIFSKNFNLADYAAGSSVFPLAITLLVSFGAIIIAAPIGIKTATFIKFRIKNKRLQKFFR HHHHCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHEEEEEECHHHHHHHHH VTILALAGIPSVIFGLFAIQSLGPAISFVFHIDTVQNITTSMFMLAFIIIPTIISLTLST HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC YDGIDMRLIENGIGMGSSYTRSIYKIFKKEARGGIIIAIIIALGRAIGETMAISMILSDQ CCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC GYQNIFGTGFLQIMHSALRPLGAVISANMFAENGGEGLRGLLYIYGIVLFVAIMILNGLV CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TYLTRKRSKKTYAFIKLEKSLAYIVCFIPDQLKILYEKITHRSQYKLHVNNLDNLNNYIT HHHHHHCCCCEEEEEEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCHHHHHHHH DRIQNRKLKRLYTVHKLFFESLAFMVAFAFLAISLDILVNGIKAINLPTSTVVAYTKNTT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEECCCCCEEEEEECCCC GQATINTLIIIIVAILIGLPFSLFVAIYINEYAKNKPKKVLLFFIDSFGSTPSIIFGMFG CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHH LVIFIEIFGFTSMGNIGKSLLAGALTITLVVLPTFTRSIQQSLKAVPMSIRENAYGLGCS HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCC KETIVKLVLPQAKKGIISAIVLTIGRIVAETAPLYLTAGLSSAQSITILNPGQTLTTRIY HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCEEEEECCCCHHHHHHH AQLYENNTNIAHNVMYESAFITLLVIALIIIAHVIVPYFEFIKHDIKKWFKILKNYLRAP HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC YMRDIKVFKPQIYQKHLYLTHNQAKIMGYNESVNKVAKIGLKLYEIRYVDDEQIQKELLK CHHHHHHHCHHHHHHHEEEEECCEEEEECCHHHHHHHHHCCEEEEEEECCHHHHHHHHHH VRG HCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: ATP; phosphate [Periplasm]; H2O [C]
Specific reaction: ATP + phosphate [Periplasm] + H2O = ADP + phosphate [Cytoplasm] + phosphate [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8948633 [H]