Definition | Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010503 |
Length | 751,679 |
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The map label for this gene is 170761999
Identifier: 170761999
GI number: 170761999
Start: 112800
End: 114587
Strand: Direct
Name: 170761999
Synonym: UPA3_0093
Alternate gene names: NA
Gene position: 112800-114587 (Clockwise)
Preceding gene: 170762113
Following gene: 170762104
Centisome position: 15.01
GC content: 21.81
Gene sequence:
>1788_bases ATGAATAAAAAAATAAATTTGAACAGCAGTTTAGCTTATATTGGTTTTTTAACACGCCTTATTATTGTAAAAAAAACAAC ATATCTTTTACCGATCATAACTTTATTAATTACATTAATTATAGGAATTGTTGTCGGCTGTGTTGTTAAGCAAAAAACAC AATTTTTGATAATTTCATATGTAATGATCATGTTTAATTTATTAATGACAACAATTTTTGCTTCACTAAAAGCATTAAAT ATTTTTAAGGATTTTAGTGAAGATGGTATTGATATTTTAGTAATTTCTAAACCAATTAGCCGTAAAAACATTGTTTGATC AAAAATTTTTTTCTTCGTCCTAACAGGTATTGTTTGAAGTCTAGTTAGTTTTTTAGGACTATTAATTTTTTATTTAATTA GCTTTAATTTTGCTAAAAATGTTAATTATTATTGAATCTTAAGTTATATAAGTCCTTTTATTTGTTATTTAATTTTTGGG TTAATAACAAGCCTTTTAGCTTTAAAATTAAATGCAAAAATAAGTATTTTAATTCCTTTTGTTAGTTTTATTCCCTTACT TACTATTGGAATTATTGCGAACTTAGTTAGTCAAGTCCAATCACAAGCCTTTTTAAGATTATTAAAACAAAAATCAACAA ACAATATTGAGGCTTTTTATTTAAATAATAATTTAGATCAATATTATTTAATTAACACAGGTTTTTTTAATCATAAATTT AATGAAAATCAAAATTTAGAAATTATGAACGCTTATTTAAAAACTAGAAGTTTAGCAACTTTTTGACAAGTAAGTAGTTG AATTCTTCCTGTTTATCAATTAGCTGATGTTTTTAATAAAAGTGATTATGAGCCATTTAGTGATTTTATTAAAAATCAAG TAGATCAGATTTTATATGCCAATAATTTAGCATCAAAACAATTTAATTATCAGTTAGAAAAAAATAGTAATTCATTAATC AATTTTAGTATTAATAATGATAAAAGTTTTTTAATTCCAAGTTTGTTAAAAAACGATTCTCAAAATTTAATTAACAATAA CTTAAATCAAGAAGTAATTTATGCAATTGACAATTGAAAAGATCAAACGATCGAATATCAAAAAAACAGTTATACACAAT TAAGTAGTGATGATATTGTTGGTTCGCTTAAATGAATGATTATTAAAGAGGTATTAAACGTAAGATCGTTTAATACATAT GCTAATAATTTATTTAAAACACTTGATCAAAAAGCAAATCAAAAACAAATCTTAGATTTAATTTCAAATAGTGTACAAAA ATTTGATTTCAATAAATGAAACGATGAGAATGCTGATTTATTTAAAAAGGATTTTAATAAATTATTAATTAAATCAAAAA CTGAACAACAAATATATTTAGCAGTTAGTTTAATTTATTATCTATATTTCAATCCACACTATACGAATTTACTAAAAATT TTATTAGTTGATCATCAAAATAATTTACAATATAAAACACAATTAAAAATAAATTTAAATAATAAAAATTATTTAATTGG CGGTTTTAAAAGCTACTTACTTCATCAGATATTGCCTCAAGAAAATGACGATGGCATAGATGAATTAAAAAAAGATAAAA AGATTCGTTACAGATATAGTTTAGAACAAGGCGGAAATTATTTATTCGATTATGTCCAACAAAATTATAGTTTTAAAAGA AAGCAACAAATTGTTTATAAAGAAGCTTACTGCGTAATTTGATTAATATTAATTTTTAGTTTATTAATTGGTACATATTA TGGCTATAAAAGAAAGGACTATCGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAAAATAATCAAAATAAAAAAATACAATAAAACCAAAATTAAATTTATCTTTTGAATAAAATTATTAACAATATTTAATA TATGGAAAAATCACATAAAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAATAATGAATTTATTTTAGAAGTTAAAAATTTAACAAAAATTTATAAAAAATCAAACCAAGGGGTTTTTGATTTAAGT TTTAATGTAAAACGTGGCGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 595; Mature: 595
Protein sequence:
>595_residues MNKKINLNSSLAYIGFLTRLIIVKKTTYLLPIITLLITLIIGIVVGCVVKQKTQFLIISYVMIMFNLLMTTIFASLKALN IFKDFSEDGIDILVISKPISRKNIVWSKIFFFVLTGIVWSLVSFLGLLIFYLISFNFAKNVNYYWILSYISPFICYLIFG LITSLLALKLNAKISILIPFVSFIPLLTIGIIANLVSQVQSQAFLRLLKQKSTNNIEAFYLNNNLDQYYLINTGFFNHKF NENQNLEIMNAYLKTRSLATFWQVSSWILPVYQLADVFNKSDYEPFSDFIKNQVDQILYANNLASKQFNYQLEKNSNSLI NFSINNDKSFLIPSLLKNDSQNLINNNLNQEVIYAIDNWKDQTIEYQKNSYTQLSSDDIVGSLKWMIIKEVLNVRSFNTY ANNLFKTLDQKANQKQILDLISNSVQKFDFNKWNDENADLFKKDFNKLLIKSKTEQQIYLAVSLIYYLYFNPHYTNLLKI LLVDHQNNLQYKTQLKINLNNKNYLIGGFKSYLLHQILPQENDDGIDELKKDKKIRYRYSLEQGGNYLFDYVQQNYSFKR KQQIVYKEAYCVIWLILIFSLLIGTYYGYKRKDYR
Sequences:
>Translated_595_residues MNKKINLNSSLAYIGFLTRLIIVKKTTYLLPIITLLITLIIGIVVGCVVKQKTQFLIISYVMIMFNLLMTTIFASLKALN IFKDFSEDGIDILVISKPISRKNIV*SKIFFFVLTGIV*SLVSFLGLLIFYLISFNFAKNVNYY*ILSYISPFICYLIFG LITSLLALKLNAKISILIPFVSFIPLLTIGIIANLVSQVQSQAFLRLLKQKSTNNIEAFYLNNNLDQYYLINTGFFNHKF NENQNLEIMNAYLKTRSLATF*QVSS*ILPVYQLADVFNKSDYEPFSDFIKNQVDQILYANNLASKQFNYQLEKNSNSLI NFSINNDKSFLIPSLLKNDSQNLINNNLNQEVIYAIDN*KDQTIEYQKNSYTQLSSDDIVGSLK*MIIKEVLNVRSFNTY ANNLFKTLDQKANQKQILDLISNSVQKFDFNK*NDENADLFKKDFNKLLIKSKTEQQIYLAVSLIYYLYFNPHYTNLLKI LLVDHQNNLQYKTQLKINLNNKNYLIGGFKSYLLHQILPQENDDGIDELKKDKKIRYRYSLEQGGNYLFDYVQQNYSFKR KQQIVYKEAYCVI*LILIFSLLIGTYYGYKRKDYR >Mature_595_residues MNKKINLNSSLAYIGFLTRLIIVKKTTYLLPIITLLITLIIGIVVGCVVKQKTQFLIISYVMIMFNLLMTTIFASLKALN IFKDFSEDGIDILVISKPISRKNIV*SKIFFFVLTGIV*SLVSFLGLLIFYLISFNFAKNVNYY*ILSYISPFICYLIFG LITSLLALKLNAKISILIPFVSFIPLLTIGIIANLVSQVQSQAFLRLLKQKSTNNIEAFYLNNNLDQYYLINTGFFNHKF NENQNLEIMNAYLKTRSLATF*QVSS*ILPVYQLADVFNKSDYEPFSDFIKNQVDQILYANNLASKQFNYQLEKNSNSLI NFSINNDKSFLIPSLLKNDSQNLINNNLNQEVIYAIDN*KDQTIEYQKNSYTQLSSDDIVGSLK*MIIKEVLNVRSFNTY ANNLFKTLDQKANQKQILDLISNSVQKFDFNK*NDENADLFKKDFNKLLIKSKTEQQIYLAVSLIYYLYFNPHYTNLLKI LLVDHQNNLQYKTQLKINLNNKNYLIGGFKSYLLHQILPQENDDGIDELKKDKKIRYRYSLEQGGNYLFDYVQQNYSFKR KQQIVYKEAYCVI*LILIFSLLIGTYYGYKRKDYR
Specific function: Unknown
COG id: COG1277
COG function: function code R; ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 67950; Mature: 67950
Theoretical pI: Translated: 9.75; Mature: 9.75
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 1.0 %Met (Translated Protein) 1.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 1.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKKINLNSSLAYIGFLTRLIIVKKTTYLLPIITLLITLIIGIVVGCVVKQKTQFLIISY CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VMIMFNLLMTTIFASLKALNIFKDFSEDGIDILVISKPISRKNIVSKIFFFVLTGIVSLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFLGLLIFYLISFNFAKNVNYYILSYISPFICYLIFGLITSLLALKLNAKISILIPFVSF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHH IPLLTIGIIANLVSQVQSQAFLRLLKQKSTNNIEAFYLNNNLDQYYLINTGFFNHKFNEN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCC QNLEIMNAYLKTRSLATFQVSSILPVYQLADVFNKSDYEPFSDFIKNQVDQILYANNLAS CCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC KQFNYQLEKNSNSLINFSINNDKSFLIPSLLKNDSQNLINNNLNQEVIYAIDNKDQTIEY CCCCEEEECCCCCEEEEEECCCCCEECHHHHCCCCHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEEE QKNSYTQLSSDDIVGSLKMIIKEVLNVRSFNTYANNLFKTLDQKANQKQILDLISNSVQK CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH FDFNKNDENADLFKKDFNKLLIKSKTEQQIYLAVSLIYYLYFNPHYTNLLKILLVDHQNN CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEEECCCC LQYKTQLKINLNNKNYLIGGFKSYLLHQILPQENDDGIDELKKDKKIRYRYSLEQGGNYL CEEEEEEEEEECCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEEEHHCCCHHH FDYVQQNYSFKRKQQIVYKEAYCVILILIFSLLIGTYYGYKRKDYR HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MNKKINLNSSLAYIGFLTRLIIVKKTTYLLPIITLLITLIIGIVVGCVVKQKTQFLIISY CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VMIMFNLLMTTIFASLKALNIFKDFSEDGIDILVISKPISRKNIVSKIFFFVLTGIVSLV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SFLGLLIFYLISFNFAKNVNYYILSYISPFICYLIFGLITSLLALKLNAKISILIPFVSF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHH IPLLTIGIIANLVSQVQSQAFLRLLKQKSTNNIEAFYLNNNLDQYYLINTGFFNHKFNEN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCC QNLEIMNAYLKTRSLATFQVSSILPVYQLADVFNKSDYEPFSDFIKNQVDQILYANNLAS CCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC KQFNYQLEKNSNSLINFSINNDKSFLIPSLLKNDSQNLINNNLNQEVIYAIDNKDQTIEY CCCCEEEECCCCCEEEEEECCCCCEECHHHHCCCCHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEEE QKNSYTQLSSDDIVGSLKMIIKEVLNVRSFNTYANNLFKTLDQKANQKQILDLISNSVQK CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH FDFNKNDENADLFKKDFNKLLIKSKTEQQIYLAVSLIYYLYFNPHYTNLLKILLVDHQNN CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEEECCCC LQYKTQLKINLNNKNYLIGGFKSYLLHQILPQENDDGIDELKKDKKIRYRYSLEQGGNYL CEEEEEEEEEECCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEEEHHCCCHHH FDYVQQNYSFKRKQQIVYKEAYCVILILIFSLLIGTYYGYKRKDYR HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA