Definition Ureaplasma parvum serovar 3 str. ATCC 27815 chromosome, complete genome.
Accession NC_010503
Length 751,679

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The map label for this gene is 170761999

Identifier: 170761999

GI number: 170761999

Start: 112800

End: 114587

Strand: Direct

Name: 170761999

Synonym: UPA3_0093

Alternate gene names: NA

Gene position: 112800-114587 (Clockwise)

Preceding gene: 170762113

Following gene: 170762104

Centisome position: 15.01

GC content: 21.81

Gene sequence:

>1788_bases
ATGAATAAAAAAATAAATTTGAACAGCAGTTTAGCTTATATTGGTTTTTTAACACGCCTTATTATTGTAAAAAAAACAAC
ATATCTTTTACCGATCATAACTTTATTAATTACATTAATTATAGGAATTGTTGTCGGCTGTGTTGTTAAGCAAAAAACAC
AATTTTTGATAATTTCATATGTAATGATCATGTTTAATTTATTAATGACAACAATTTTTGCTTCACTAAAAGCATTAAAT
ATTTTTAAGGATTTTAGTGAAGATGGTATTGATATTTTAGTAATTTCTAAACCAATTAGCCGTAAAAACATTGTTTGATC
AAAAATTTTTTTCTTCGTCCTAACAGGTATTGTTTGAAGTCTAGTTAGTTTTTTAGGACTATTAATTTTTTATTTAATTA
GCTTTAATTTTGCTAAAAATGTTAATTATTATTGAATCTTAAGTTATATAAGTCCTTTTATTTGTTATTTAATTTTTGGG
TTAATAACAAGCCTTTTAGCTTTAAAATTAAATGCAAAAATAAGTATTTTAATTCCTTTTGTTAGTTTTATTCCCTTACT
TACTATTGGAATTATTGCGAACTTAGTTAGTCAAGTCCAATCACAAGCCTTTTTAAGATTATTAAAACAAAAATCAACAA
ACAATATTGAGGCTTTTTATTTAAATAATAATTTAGATCAATATTATTTAATTAACACAGGTTTTTTTAATCATAAATTT
AATGAAAATCAAAATTTAGAAATTATGAACGCTTATTTAAAAACTAGAAGTTTAGCAACTTTTTGACAAGTAAGTAGTTG
AATTCTTCCTGTTTATCAATTAGCTGATGTTTTTAATAAAAGTGATTATGAGCCATTTAGTGATTTTATTAAAAATCAAG
TAGATCAGATTTTATATGCCAATAATTTAGCATCAAAACAATTTAATTATCAGTTAGAAAAAAATAGTAATTCATTAATC
AATTTTAGTATTAATAATGATAAAAGTTTTTTAATTCCAAGTTTGTTAAAAAACGATTCTCAAAATTTAATTAACAATAA
CTTAAATCAAGAAGTAATTTATGCAATTGACAATTGAAAAGATCAAACGATCGAATATCAAAAAAACAGTTATACACAAT
TAAGTAGTGATGATATTGTTGGTTCGCTTAAATGAATGATTATTAAAGAGGTATTAAACGTAAGATCGTTTAATACATAT
GCTAATAATTTATTTAAAACACTTGATCAAAAAGCAAATCAAAAACAAATCTTAGATTTAATTTCAAATAGTGTACAAAA
ATTTGATTTCAATAAATGAAACGATGAGAATGCTGATTTATTTAAAAAGGATTTTAATAAATTATTAATTAAATCAAAAA
CTGAACAACAAATATATTTAGCAGTTAGTTTAATTTATTATCTATATTTCAATCCACACTATACGAATTTACTAAAAATT
TTATTAGTTGATCATCAAAATAATTTACAATATAAAACACAATTAAAAATAAATTTAAATAATAAAAATTATTTAATTGG
CGGTTTTAAAAGCTACTTACTTCATCAGATATTGCCTCAAGAAAATGACGATGGCATAGATGAATTAAAAAAAGATAAAA
AGATTCGTTACAGATATAGTTTAGAACAAGGCGGAAATTATTTATTCGATTATGTCCAACAAAATTATAGTTTTAAAAGA
AAGCAACAAATTGTTTATAAAGAAGCTTACTGCGTAATTTGATTAATATTAATTTTTAGTTTATTAATTGGTACATATTA
TGGCTATAAAAGAAAGGACTATCGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAAATAATCAAAATAAAAAAATACAATAAAACCAAAATTAAATTTATCTTTTGAATAAAATTATTAACAATATTTAATA
TATGGAAAAATCACATAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAATAATGAATTTATTTTAGAAGTTAAAAATTTAACAAAAATTTATAAAAAATCAAACCAAGGGGTTTTTGATTTAAGT
TTTAATGTAAAACGTGGCGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 595; Mature: 595

Protein sequence:

>595_residues
MNKKINLNSSLAYIGFLTRLIIVKKTTYLLPIITLLITLIIGIVVGCVVKQKTQFLIISYVMIMFNLLMTTIFASLKALN
IFKDFSEDGIDILVISKPISRKNIVWSKIFFFVLTGIVWSLVSFLGLLIFYLISFNFAKNVNYYWILSYISPFICYLIFG
LITSLLALKLNAKISILIPFVSFIPLLTIGIIANLVSQVQSQAFLRLLKQKSTNNIEAFYLNNNLDQYYLINTGFFNHKF
NENQNLEIMNAYLKTRSLATFWQVSSWILPVYQLADVFNKSDYEPFSDFIKNQVDQILYANNLASKQFNYQLEKNSNSLI
NFSINNDKSFLIPSLLKNDSQNLINNNLNQEVIYAIDNWKDQTIEYQKNSYTQLSSDDIVGSLKWMIIKEVLNVRSFNTY
ANNLFKTLDQKANQKQILDLISNSVQKFDFNKWNDENADLFKKDFNKLLIKSKTEQQIYLAVSLIYYLYFNPHYTNLLKI
LLVDHQNNLQYKTQLKINLNNKNYLIGGFKSYLLHQILPQENDDGIDELKKDKKIRYRYSLEQGGNYLFDYVQQNYSFKR
KQQIVYKEAYCVIWLILIFSLLIGTYYGYKRKDYR

Sequences:

>Translated_595_residues
MNKKINLNSSLAYIGFLTRLIIVKKTTYLLPIITLLITLIIGIVVGCVVKQKTQFLIISYVMIMFNLLMTTIFASLKALN
IFKDFSEDGIDILVISKPISRKNIV*SKIFFFVLTGIV*SLVSFLGLLIFYLISFNFAKNVNYY*ILSYISPFICYLIFG
LITSLLALKLNAKISILIPFVSFIPLLTIGIIANLVSQVQSQAFLRLLKQKSTNNIEAFYLNNNLDQYYLINTGFFNHKF
NENQNLEIMNAYLKTRSLATF*QVSS*ILPVYQLADVFNKSDYEPFSDFIKNQVDQILYANNLASKQFNYQLEKNSNSLI
NFSINNDKSFLIPSLLKNDSQNLINNNLNQEVIYAIDN*KDQTIEYQKNSYTQLSSDDIVGSLK*MIIKEVLNVRSFNTY
ANNLFKTLDQKANQKQILDLISNSVQKFDFNK*NDENADLFKKDFNKLLIKSKTEQQIYLAVSLIYYLYFNPHYTNLLKI
LLVDHQNNLQYKTQLKINLNNKNYLIGGFKSYLLHQILPQENDDGIDELKKDKKIRYRYSLEQGGNYLFDYVQQNYSFKR
KQQIVYKEAYCVI*LILIFSLLIGTYYGYKRKDYR
>Mature_595_residues
MNKKINLNSSLAYIGFLTRLIIVKKTTYLLPIITLLITLIIGIVVGCVVKQKTQFLIISYVMIMFNLLMTTIFASLKALN
IFKDFSEDGIDILVISKPISRKNIV*SKIFFFVLTGIV*SLVSFLGLLIFYLISFNFAKNVNYY*ILSYISPFICYLIFG
LITSLLALKLNAKISILIPFVSFIPLLTIGIIANLVSQVQSQAFLRLLKQKSTNNIEAFYLNNNLDQYYLINTGFFNHKF
NENQNLEIMNAYLKTRSLATF*QVSS*ILPVYQLADVFNKSDYEPFSDFIKNQVDQILYANNLASKQFNYQLEKNSNSLI
NFSINNDKSFLIPSLLKNDSQNLINNNLNQEVIYAIDN*KDQTIEYQKNSYTQLSSDDIVGSLK*MIIKEVLNVRSFNTY
ANNLFKTLDQKANQKQILDLISNSVQKFDFNK*NDENADLFKKDFNKLLIKSKTEQQIYLAVSLIYYLYFNPHYTNLLKI
LLVDHQNNLQYKTQLKINLNNKNYLIGGFKSYLLHQILPQENDDGIDELKKDKKIRYRYSLEQGGNYLFDYVQQNYSFKR
KQQIVYKEAYCVI*LILIFSLLIGTYYGYKRKDYR

Specific function: Unknown

COG id: COG1277

COG function: function code R; ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67950; Mature: 67950

Theoretical pI: Translated: 9.75; Mature: 9.75

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKKINLNSSLAYIGFLTRLIIVKKTTYLLPIITLLITLIIGIVVGCVVKQKTQFLIISY
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMIMFNLLMTTIFASLKALNIFKDFSEDGIDILVISKPISRKNIVSKIFFFVLTGIVSLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFLGLLIFYLISFNFAKNVNYYILSYISPFICYLIFGLITSLLALKLNAKISILIPFVSF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHH
IPLLTIGIIANLVSQVQSQAFLRLLKQKSTNNIEAFYLNNNLDQYYLINTGFFNHKFNEN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCC
QNLEIMNAYLKTRSLATFQVSSILPVYQLADVFNKSDYEPFSDFIKNQVDQILYANNLAS
CCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
KQFNYQLEKNSNSLINFSINNDKSFLIPSLLKNDSQNLINNNLNQEVIYAIDNKDQTIEY
CCCCEEEECCCCCEEEEEECCCCCEECHHHHCCCCHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEEE
QKNSYTQLSSDDIVGSLKMIIKEVLNVRSFNTYANNLFKTLDQKANQKQILDLISNSVQK
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
FDFNKNDENADLFKKDFNKLLIKSKTEQQIYLAVSLIYYLYFNPHYTNLLKILLVDHQNN
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEEECCCC
LQYKTQLKINLNNKNYLIGGFKSYLLHQILPQENDDGIDELKKDKKIRYRYSLEQGGNYL
CEEEEEEEEEECCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEEEHHCCCHHH
FDYVQQNYSFKRKQQIVYKEAYCVILILIFSLLIGTYYGYKRKDYR
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNKKINLNSSLAYIGFLTRLIIVKKTTYLLPIITLLITLIIGIVVGCVVKQKTQFLIISY
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMIMFNLLMTTIFASLKALNIFKDFSEDGIDILVISKPISRKNIVSKIFFFVLTGIVSLV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFLGLLIFYLISFNFAKNVNYYILSYISPFICYLIFGLITSLLALKLNAKISILIPFVSF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHH
IPLLTIGIIANLVSQVQSQAFLRLLKQKSTNNIEAFYLNNNLDQYYLINTGFFNHKFNEN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCC
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CCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
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CCCCEEEECCCCCEEEEEECCCCCEECHHHHCCCCHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCEEEE
QKNSYTQLSSDDIVGSLKMIIKEVLNVRSFNTYANNLFKTLDQKANQKQILDLISNSVQK
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
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CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEEECCCC
LQYKTQLKINLNNKNYLIGGFKSYLLHQILPQENDDGIDELKKDKKIRYRYSLEQGGNYL
CEEEEEEEEEECCCCEEEECHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCEEEEEEHHCCCHHH
FDYVQQNYSFKRKQQIVYKEAYCVILILIFSLLIGTYYGYKRKDYR
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA