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The map label for this gene is yvcS [H]

Identifier: 170756066

GI number: 170756066

Start: 351225

End: 353195

Strand: Direct

Name: yvcS [H]

Synonym: CLD_0477

Alternate gene names: 170756066

Gene position: 351225-353195 (Clockwise)

Preceding gene: 170756065

Following gene: 170757299

Centisome position: 8.87

GC content: 23.9

Gene sequence:

>1971_bases
ATGACAATTAATAATATAGTCATTAAAAATATTAAAGGAAATTTAAATAAATATGCTATGTATTATTTGAGTAATGTAAT
AGTTGTAACTATATTTTTTATATTTGCTAATTTTATATATAATCCAGGTGTTAGTAGCGGAAATATTAGTGATAAGGCCA
TAAGTGAAGTTGCCAGTAAATTAATGTATTTGTGCGAGTTTGTAATAATAATTTTTACTTTTATATTCTCAAATTACTCA
ATAACTACTTTTTTAAAGTCTAGAGAAAAAGAATTTGGACTTTTATCAATGTTTGGTTTAACTAAAACTCAAATAAGAAG
ATATGTTATGTTCGAAAATATAGTAATTTCAATTATTTCTATTATAACAGGAATTTTCTTTGGAATTTTATTTTCAAAAT
TATTTTTCATGGCCCTGTCTGTAATTTTAGATTTAAATGCAGAAATTCCATTTTTAATATCAAGTAAAGCTGTAAAAATA
ACAATATTAAGTTTTTTAGTAGTTCTTAATCTTATAAGTTTTATTACAAGTTTTAAAATAAAAAATAATAACATTGCAGA
ATTATTAAAAGGTGAAAGAATACCTAAGACAACACCAAAATTTTCTAAAATAAAAGCAATACTAGGAATAGTACTTATAA
TTTCTGGATATATTGTAGGGATATTTTCTGGTACAGCTATTATATCTACAATGATTCCAATACTTATAGTTGTAATAATA
GGAACTAAACTTTTGTTTTCTCAGTTTAGTGTGTTTTTCACAAATAAGCTTCAAAATAATAAGAGTATTTATTATAAAGG
GATAAATTTAATAACCTTGTCTCAAATTATATATAAATTAAAAGATAATGCAAAGGTATTGTTTATTACTTCAATACTTA
GCGGAATTACCCTTGCATCAGCTATATCAGTTTATTCTCTACAAAGGGTAAGTTTATCTTCAATGGAAGAGAATTGTCCA
CAGGATATAGGAATCATAGAACAGGGAATAAATTCTCATAAAGTTATAGCTAATGGAAAAGTTGAAGATATATTAAAAAA
ATACAAATTCGATATACAATATAAAAATAAAATAGAATTAATAAAAGCAAAAAATAATGATATGGTAAAAGAAAATAAGA
AAAATCCCTATAATATAAAAATAAATAAAAATGATTTTAATATAATGTCAGAAAATAGCTTTAATGAGTTTGCAAAACAG
TATAATAATAAACCTTTAGACTTGAAAAATGGAGAAGTAGTAATATATACTTACGATTTCACTAATAATCTAGCTAATCT
AAAAACAGAACTTCCTTTTAATCATCAGAAGACCTTAAATTTAAAGATTGACGGTAAAGTAAGTAGCTTTAATATATTAG
ATAATTTAAAAGGTGGAGTTATAAATGCAGATATCAAAAATACTAATACTATAATTGTTAGTGATAGTGATTTTAAAAAG
TTGTGGAATAATGTTTCAGATCATAATAAACTTATTTATTATGGATATAACATCAAACATAATTTAAAAGCTGCTGGTGC
AGTAACTGAAATAAAAAATGCAGTTACAAAAGGTCAAGAAGCATTCTTTACTGAAAGGGTAATAAGTGCAGCAAGTGTAA
TGCAGCTCTTATCTGTACTTTTATTTATAGGAACCTTTATTGCAATGATATTTTTTATTGCAACAGGAAGTATATTATAT
TTCAAAATGTTTAATGAAGTTCAGAAAGATAAGCAAGATTTTATAGGACTAAAAAAGATAGGTGTTACACAAGAAGAAAT
AAAAAAGATAGTTAGTATTCAAAGTTTTACAATGTTCTTCTTACCACTTACAGTTGCAATCCTTCATGCTGCTTTTGCTG
TAAAATCCGTAGGACTTTTATATACAAAATATTTTATATTTATTGCGGGAATATATCTAGTTTTACAAATAATATATTAT
CTATTTGCTAAATGGATGTATATGAAACAAATTAATAGTTGGAACATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATGGAGGAAATAGGCAAGCATTTTTTAAGGAAATTATGGATTCTCTTTCACTGTTAGGAAGTAGATCAAACAATTATAC
ATTGTAGGAGGAGGAGCAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATTTTATCCGTTTATTATATAGATTTTAATGTTAATTTATAAAACTAAAGAACCATATGAGATATTCTAATTTTAATT
TTTCAATCTATAAAAGCTTC

Product: peptide ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 656; Mature: 655

Protein sequence:

>656_residues
MTINNIVIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGNISDKAISEVASKLMYLCEFVIIIFTFIFSNYS
ITTFLKSREKEFGLLSMFGLTKTQIRRYVMFENIVISIISIITGIFFGILFSKLFFMALSVILDLNAEIPFLISSKAVKI
TILSFLVVLNLISFITSFKIKNNNIAELLKGERIPKTTPKFSKIKAILGIVLIISGYIVGIFSGTAIISTMIPILIVVII
GTKLLFSQFSVFFTNKLQNNKSIYYKGINLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLASAISVYSLQRVSLSSMEENCP
QDIGIIEQGINSHKVIANGKVEDILKKYKFDIQYKNKIELIKAKNNDMVKENKKNPYNIKINKNDFNIMSENSFNEFAKQ
YNNKPLDLKNGEVVIYTYDFTNNLANLKTELPFNHQKTLNLKIDGKVSSFNILDNLKGGVINADIKNTNTIIVSDSDFKK
LWNNVSDHNKLIYYGYNIKHNLKAAGAVTEIKNAVTKGQEAFFTERVISAASVMQLLSVLLFIGTFIAMIFFIATGSILY
FKMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKIVSIQSFTMFFLPLTVAILHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIIYY
LFAKWMYMKQINSWNI

Sequences:

>Translated_656_residues
MTINNIVIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGNISDKAISEVASKLMYLCEFVIIIFTFIFSNYS
ITTFLKSREKEFGLLSMFGLTKTQIRRYVMFENIVISIISIITGIFFGILFSKLFFMALSVILDLNAEIPFLISSKAVKI
TILSFLVVLNLISFITSFKIKNNNIAELLKGERIPKTTPKFSKIKAILGIVLIISGYIVGIFSGTAIISTMIPILIVVII
GTKLLFSQFSVFFTNKLQNNKSIYYKGINLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLASAISVYSLQRVSLSSMEENCP
QDIGIIEQGINSHKVIANGKVEDILKKYKFDIQYKNKIELIKAKNNDMVKENKKNPYNIKINKNDFNIMSENSFNEFAKQ
YNNKPLDLKNGEVVIYTYDFTNNLANLKTELPFNHQKTLNLKIDGKVSSFNILDNLKGGVINADIKNTNTIIVSDSDFKK
LWNNVSDHNKLIYYGYNIKHNLKAAGAVTEIKNAVTKGQEAFFTERVISAASVMQLLSVLLFIGTFIAMIFFIATGSILY
FKMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKIVSIQSFTMFFLPLTVAILHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIIYY
LFAKWMYMKQINSWNI
>Mature_655_residues
TINNIVIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGNISDKAISEVASKLMYLCEFVIIIFTFIFSNYSI
TTFLKSREKEFGLLSMFGLTKTQIRRYVMFENIVISIISIITGIFFGILFSKLFFMALSVILDLNAEIPFLISSKAVKIT
ILSFLVVLNLISFITSFKIKNNNIAELLKGERIPKTTPKFSKIKAILGIVLIISGYIVGIFSGTAIISTMIPILIVVIIG
TKLLFSQFSVFFTNKLQNNKSIYYKGINLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLASAISVYSLQRVSLSSMEENCPQ
DIGIIEQGINSHKVIANGKVEDILKKYKFDIQYKNKIELIKAKNNDMVKENKKNPYNIKINKNDFNIMSENSFNEFAKQY
NNKPLDLKNGEVVIYTYDFTNNLANLKTELPFNHQKTLNLKIDGKVSSFNILDNLKGGVINADIKNTNTIIVSDSDFKKL
WNNVSDHNKLIYYGYNIKHNLKAAGAVTEIKNAVTKGQEAFFTERVISAASVMQLLSVLLFIGTFIAMIFFIATGSILYF
KMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKIVSIQSFTMFFLPLTVAILHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIIYYL
FAKWMYMKQINSWNI

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003838 [H]

Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74401; Mature: 74270

Theoretical pI: Translated: 10.15; Mature: 10.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTINNIVIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGNISDKAISEVASK
CCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
LMYLCEFVIIIFTFIFSNYSITTFLKSREKEFGLLSMFGLTKTQIRRYVMFENIVISIIS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IITGIFFGILFSKLFFMALSVILDLNAEIPFLISSKAVKITILSFLVVLNLISFITSFKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
KNNNIAELLKGERIPKTTPKFSKIKAILGIVLIISGYIVGIFSGTAIISTMIPILIVVII
CCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GTKLLFSQFSVFFTNKLQNNKSIYYKGINLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
AISVYSLQRVSLSSMEENCPQDIGIIEQGINSHKVIANGKVEDILKKYKFDIQYKNKIEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCEECCCEEE
IKAKNNDMVKENKKNPYNIKINKNDFNIMSENSFNEFAKQYNNKPLDLKNGEVVIYTYDF
EEECCCCCHHCCCCCCEEEEEECCCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECC
TNNLANLKTELPFNHQKTLNLKIDGKVSSFNILDNLKGGVINADIKNTNTIIVSDSDFKK
CCCHHHCEECCCCCCCEEEEEEECCCCCEEHHHHCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCHHHH
LWNNVSDHNKLIYYGYNIKHNLKAAGAVTEIKNAVTKGQEAFFTERVISAASVMQLLSVL
HHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFIGTFIAMIFFIATGSILYFKMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKIVSIQSFTMFF
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPLTVAILHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIIYYLFAKWMYMKQINSWNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TINNIVIKNIKGNLNKYAMYYLSNVIVVTIFFIFANFIYNPGVSSGNISDKAISEVASK
CCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
LMYLCEFVIIIFTFIFSNYSITTFLKSREKEFGLLSMFGLTKTQIRRYVMFENIVISIIS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IITGIFFGILFSKLFFMALSVILDLNAEIPFLISSKAVKITILSFLVVLNLISFITSFKI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE
KNNNIAELLKGERIPKTTPKFSKIKAILGIVLIISGYIVGIFSGTAIISTMIPILIVVII
CCCCHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GTKLLFSQFSVFFTNKLQNNKSIYYKGINLITLSQIIYKLKDNAKVLFITSILSGITLAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHH
AISVYSLQRVSLSSMEENCPQDIGIIEQGINSHKVIANGKVEDILKKYKFDIQYKNKIEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCEECCCEEE
IKAKNNDMVKENKKNPYNIKINKNDFNIMSENSFNEFAKQYNNKPLDLKNGEVVIYTYDF
EEECCCCCHHCCCCCCEEEEEECCCCCEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECC
TNNLANLKTELPFNHQKTLNLKIDGKVSSFNILDNLKGGVINADIKNTNTIIVSDSDFKK
CCCHHHCEECCCCCCCEEEEEEECCCCCEEHHHHCCCCCEEEECCCCCCEEEEECCHHHH
LWNNVSDHNKLIYYGYNIKHNLKAAGAVTEIKNAVTKGQEAFFTERVISAASVMQLLSVL
HHCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFIGTFIAMIFFIATGSILYFKMFNEVQKDKQDFIGLKKIGVTQEEIKKIVSIQSFTMFF
HHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LPLTVAILHAAFAVKSVGLLYTKYFIFIAGIYLVLQIIYYLFAKWMYMKQINSWNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]