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The map label for this gene is yhcI [H]

Identifier: 170755018

GI number: 170755018

Start: 3642635

End: 3643843

Strand: Reverse

Name: yhcI [H]

Synonym: CLD_1170

Alternate gene names: 170755018

Gene position: 3643843-3642635 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170755859

Following gene: 170757016

Centisome position: 92.06

GC content: 24.65

Gene sequence:

>1209_bases
ATGAAATTAATAAAAAATGAAATAAAAAAAATTGTTTTATCAAGAAAATATATAGTTGCTATGAGTATATTTCTTGTTTT
ATATGCATGTATGAGTGTTTTAATGTGTAAGGATACGATAAATTCTAAACCTGAAATTTCATTAAGTAAAAATCAAAAAA
ATTTGGAGTATTGGCAAAAGGAAAAGGAAAATAAAGATATATCTAAAAAAAGAAAAAGTGAAATAGATCAAAATATAAAA
TATATGGAAAGAAGAAATAAAGATTTAAAATTTCAAATTGCAAACAAAAACTTAGATTGGAAAAAGAGATTAACTAAAGA
TAATAATAATTTAAAAAAGCAGATAAAAGAGGCAGAAAAAAAGGATGGGAATATAGAAATAAGTGAATATAAGCAGCGGA
TAGCAACGAATGATTATTATCTAAATAATAATATTGAGCCTACATTAGATTATGAGATAACTGCATTTAATGTTATGCCT
AAAATTAATATTTTTGTAGGATTATTGATTATTTCAATAATTATAGCGATAATGACCTCTGATTCAGTGTCAGGAGAATT
CAATCCAGCTACCATAAAACTTCTTTTGACTAAGCCAGTTTCAAGAGAAAAAGTTTTATTTTCAAAGTTTATGGCCTCAG
TGTTAACTTGCATTCTATCATTTTTAATTATAAAAATATTAGCATTTTTAGTTTTGGGTACAGTATTTAGCTTTGGATCT
TTTAAAGAGCCAATATCTTTTTATAGTAGATATATTGCTGATAAGGATTTAATTGCAAATACGGGTTTGGGAGTAAAACC
AGATTTCAGTAGTTTAAAAATATATTCTATTTTAAAATTAGCAGCGTTAAGTGAAGTAATAAATATGTTATTTATTATGG
CAGCTGTATCATTATGTTTATTAATTTCTACATTAACTAAAAAAAGTGCAACTTCTATTAGCATTAGTACTATATTCTTT
GCCATAATATCTGTTATAACTACTAAGCAATTAGATGGGGGTGGTGGAGGAAATTTAGCAATTCATAAAGTTATGCCTTA
CTTATTCTCAACTTATAGTACTGGAGAATTTGTAATTAGTAGAGAAATAATTAGGAAAATTGGATTAGAATTTGTAAATG
TACCTTTTATTATAATTATTCTCATAGCTTGGACTATAATCTGCTATTTAATATCTAATTTTGTTTTTGTAAAAAGAGAT
ATATTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GAAATAGGTAAAAATAATATAAATGTTGATGATATATGTAGGGTTAAAAGTAACCTTGAGAATAAATTTATGAAAATACT
TGAGGAAGGTGCTTAGATAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTAGATGTCTCAAATTATTCATATGAAGTAGTTCATTACTACTCTGAAGTAATAAAGAGGAGCTTTATTAAAAAATATTC
TGAATCTCTTATTTGGAAAA

Product: putative lipoprotein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 402; Mature: 402

Protein sequence:

>402_residues
MKLIKNEIKKIVLSRKYIVAMSIFLVLYACMSVLMCKDTINSKPEISLSKNQKNLEYWQKEKENKDISKKRKSEIDQNIK
YMERRNKDLKFQIANKNLDWKKRLTKDNNNLKKQIKEAEKKDGNIEISEYKQRIATNDYYLNNNIEPTLDYEITAFNVMP
KINIFVGLLIISIIIAIMTSDSVSGEFNPATIKLLLTKPVSREKVLFSKFMASVLTCILSFLIIKILAFLVLGTVFSFGS
FKEPISFYSRYIADKDLIANTGLGVKPDFSSLKIYSILKLAALSEVINMLFIMAAVSLCLLISTLTKKSATSISISTIFF
AIISVITTKQLDGGGGGNLAIHKVMPYLFSTYSTGEFVISREIIRKIGLEFVNVPFIIIILIAWTIICYLISNFVFVKRD
IL

Sequences:

>Translated_402_residues
MKLIKNEIKKIVLSRKYIVAMSIFLVLYACMSVLMCKDTINSKPEISLSKNQKNLEYWQKEKENKDISKKRKSEIDQNIK
YMERRNKDLKFQIANKNLDWKKRLTKDNNNLKKQIKEAEKKDGNIEISEYKQRIATNDYYLNNNIEPTLDYEITAFNVMP
KINIFVGLLIISIIIAIMTSDSVSGEFNPATIKLLLTKPVSREKVLFSKFMASVLTCILSFLIIKILAFLVLGTVFSFGS
FKEPISFYSRYIADKDLIANTGLGVKPDFSSLKIYSILKLAALSEVINMLFIMAAVSLCLLISTLTKKSATSISISTIFF
AIISVITTKQLDGGGGGNLAIHKVMPYLFSTYSTGEFVISREIIRKIGLEFVNVPFIIIILIAWTIICYLISNFVFVKRD
IL
>Mature_402_residues
MKLIKNEIKKIVLSRKYIVAMSIFLVLYACMSVLMCKDTINSKPEISLSKNQKNLEYWQKEKENKDISKKRKSEIDQNIK
YMERRNKDLKFQIANKNLDWKKRLTKDNNNLKKQIKEAEKKDGNIEISEYKQRIATNDYYLNNNIEPTLDYEITAFNVMP
KINIFVGLLIISIIIAIMTSDSVSGEFNPATIKLLLTKPVSREKVLFSKFMASVLTCILSFLIIKILAFLVLGTVFSFGS
FKEPISFYSRYIADKDLIANTGLGVKPDFSSLKIYSILKLAALSEVINMLFIMAAVSLCLLISTLTKKSATSISISTIFF
AIISVITTKQLDGGGGGNLAIHKVMPYLFSTYSTGEFVISREIIRKIGLEFVNVPFIIIILIAWTIICYLISNFVFVKRD
IL

Specific function: Unknown

COG id: COG1277

COG function: function code R; ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45748; Mature: 45748

Theoretical pI: Translated: 10.13; Mature: 10.13

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
4.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
4.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKLIKNEIKKIVLSRKYIVAMSIFLVLYACMSVLMCKDTINSKPEISLSKNQKNLEYWQK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHH
EKENKDISKKRKSEIDQNIKYMERRNKDLKFQIANKNLDWKKRLTKDNNNLKKQIKEAEK
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
KDGNIEISEYKQRIATNDYYLNNNIEPTLDYEITAFNVMPKINIFVGLLIISIIIAIMTS
CCCCEEHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
DSVSGEFNPATIKLLLTKPVSREKVLFSKFMASVLTCILSFLIIKILAFLVLGTVFSFGS
CCCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
FKEPISFYSRYIADKDLIANTGLGVKPDFSSLKIYSILKLAALSEVINMLFIMAAVSLCL
CCHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISTLTKKSATSISISTIFFAIISVITTKQLDGGGGGNLAIHKVMPYLFSTYSTGEFVIS
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
REIIRKIGLEFVNVPFIIIILIAWTIICYLISNFVFVKRDIL
HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MKLIKNEIKKIVLSRKYIVAMSIFLVLYACMSVLMCKDTINSKPEISLSKNQKNLEYWQK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCHHHHHHH
EKENKDISKKRKSEIDQNIKYMERRNKDLKFQIANKNLDWKKRLTKDNNNLKKQIKEAEK
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
KDGNIEISEYKQRIATNDYYLNNNIEPTLDYEITAFNVMPKINIFVGLLIISIIIAIMTS
CCCCEEHHHHHHHHHCCCEEECCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
DSVSGEFNPATIKLLLTKPVSREKVLFSKFMASVLTCILSFLIIKILAFLVLGTVFSFGS
CCCCCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
FKEPISFYSRYIADKDLIANTGLGVKPDFSSLKIYSILKLAALSEVINMLFIMAAVSLCL
CCHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LISTLTKKSATSISISTIFFAIISVITTKQLDGGGGGNLAIHKVMPYLFSTYSTGEFVIS
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH
REIIRKIGLEFVNVPFIIIILIAWTIICYLISNFVFVKRDIL
HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969498; 9384377 [H]