Definition Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome.
Accession NC_010516
Length 3,958,233

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The map label for this gene is cgs

Identifier: 170754772

GI number: 170754772

Start: 3613432

End: 3622080

Strand: Reverse

Name: cgs

Synonym: CLD_1186

Alternate gene names: 170754772

Gene position: 3622080-3613432 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170755777

Following gene: 170756958

Centisome position: 91.51

GC content: 27.88

Gene sequence:

>8649_bases
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TATGAGAGAATAATGAACAATTATAAATACATAGTATCTTTAGATGAAGATATAAATATGACTGTACCTGCTGGAGAATG
GTTATTAGACAACATATATCTTATAGAAAAGCAATATAAAGATATAAAAAAGAATATGCCATCTTCTCATTATGTAAAAT
TGCCTGTTATAAATAAAGGTATAATGAAATGCTATCCTAGAGTGTATCATTTAGCTTTAGCTATAATACACAATTTTCGT
GGAAATATGGATAAAGATTTTATAATAACATTTATGAGTGAATATCAAAAAAACAATGTGTTAACTAGTTCTGAAGTATG
GGCTTTGCCTATAATGTTGAGAATAGCTTTAATACAAAAGATATCCATAATAACAGAAGAAATAACATATATACAAAGAG
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GAAAGCAATCTAAACAACAAATAGTTATGGGTAATTGCATAAATGGATTAAGACATATAGAAGCTATTAATTGGAAAAAT
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GTTGGCACCATCTGTAGTCATACTTATATTAATATCATTATTCAGTCACTATGGAACTAATGAAATGATTACAGTAGCAT
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TAAACCTACTATGAAGGAAGATGATTTGAATTTATTGAAGGCTATATGTAGGCTATATATAGACTGTAACAAAGGCTCCC
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AATCCATATAAGTTTAAAGTATCAAAATTAGAGTATTTTAATGATATAGGTGGATTTGATATAGAGAATAATGAATATAC
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GTCAGGAGCAGGTAAAGAATTTAGAGTAAAAGAGGCAATGGCAGCTGTTGAAAGGAATCTTATTAAAAAGGATAAAGGAA
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TAAGGAAAGGATGAATTCTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
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Product: cyclic beta 1-2 glucan synthetase

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 2882; Mature: 2881

Protein sequence:

>2882_residues
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Sequences:

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YSRIYNTAKTDIPRVGVLSNGSYSLMLSNRGGGYSKKDDITIYRWREDLTSDSKGLFLYIKNINANNYWSATYEPCKSEG
EHYKVKFYSDKIIFAREDGNITTETHVTVSQEEDAEIRSINLKNNSNHDRVIEVTSYCEATLANYNTDLVHPSFSNLFVK
TELREDPFCLLANRRKRSEKDISPWLMQTVAVEGDQIGGFQYETSRIDFIGRGRNLYNPQAMDNETNLKGSIGPVLDPII
SIRTRVRLKAKENCTVAYTTAFCNSKEEGVKIAEKYRNIDNVKNAFNLSWSHSNLEMKHLGIRSTAANMYQYILSNILFI
NRNIKEREKYIKDIKLGQSNLWSYGISGDYPIVLVTLDKESEVDIVRQLLLTYKYWRMKNINVDLIIVNTKESSYTKPIE
DSILNLVNSLGLMNNINKSAGVFLFNKPTMKEDDLNLLKAICRLYIDCNKGSLAEQIDTGNNKSKELNLLEKKEIEYTVN
PYKFKVSKLEYFNDIGGFDIENNEYTIVLEDYNNTPLPWINVMSNSNFGFHVSESGSSYSWYKNSRENKLTNWCNDPVVD
GESEHIYIRDEVTGEIWSITPKPIRDEGQYIINHGFGYSNFKHYREGVIGEITSYCPIGDNCKISLIKLKNNTDIKRKIS
VTYYASTVLGVSKQLSSPYISTYLDKDNFIYSRNPYNSSFKETTAYLKIVGGKEESFTGDRKEFLGIDGTIEKPKALNYE
KLSNEVGAGIDPCMAENSKITLEPNEEKVLIAILGAEDSIEAVKENINKYDNEIIAFKELNNTKNYWKKITETIKVKTPD
KSMDLMLNGWLLYQVIVCRLWARTAFYQSGGAYGFRDQLQDVMSVCYIDPDITKKQIIYSSSRQFREGDVQHWWHPVVES
GIRTRFSDDLLWLPYVTIDYIKNTGDYSILEESSNYLEEPLLREGEDERYNVASVSSEKGTIYEHCIRAINRALKFGEHN
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DDGTLLGSIENEECTIDSLSQSWSVLSGAGKEFRVKEAMAAVERNLIKKDKGIIALLTPAFDKSTLQPGYIKGYLPGVRE
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YRTGIEGILGLKLKGKDGFYVDPCIPKDWSEYEIIYNRGNCRYNIKVIRENKKELWIDGELKEGNIIPIFEEGTHEIKVI
I

Specific function: Involved in the production of beta-(1,2)-glucan. It is involved not only in invasion but also in bacteroid development [H]

COG id: COG3459

COG function: function code G; Cellobiose phosphorylase

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To A.tumefaciens ChvB [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR008928
- InterPro:   IPR009342
- InterPro:   IPR019282
- InterPro:   IPR021478
- InterPro:   IPR011013
- InterPro:   IPR010383
- InterPro:   IPR010403 [H]

Pfam domain/function: PF06204 CBM_X; PF10091 DUF2329; PF11329 DUF3131; PF06165 Glyco_transf_36; PF06205 GT36_AF [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 333990; Mature: 333859

Theoretical pI: Translated: 7.31; Mature: 7.31

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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II
EC
>Mature Secondary Structure 
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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHH
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EEECCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHEECEECCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHEE
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II
EC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

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Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 2154461; 11481430 [H]