Definition | Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6, complete genome. |
---|---|
Accession | NC_010380 |
Length | 2,245,615 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is mtlR [H]
Identifier: 169834153
GI number: 169834153
Start: 456507
End: 458462
Strand: Direct
Name: mtlR [H]
Synonym: SPH_0505
Alternate gene names: 169834153
Gene position: 456507-458462 (Clockwise)
Preceding gene: 169833737
Following gene: 169832843
Centisome position: 20.33
GC content: 35.22
Gene sequence:
>1956_bases ATGCTATTAACCAAACGAGAAGAACAATTATTGAAGGCTTTCCTACATGTAGGGAAGCTTTCAATGCAAGATATGACTGA AATCTTACAGGTTTCATCTAGAACAATTTATCGAACTTTATCAGATTTGACAGATAGCATGGAGCAATATGGAATCGAAA TAACGAAGCATTGGAAATACTATATTTTGACTGGAGAGTTGGATAATTTGCCGACAGAACTTGAAGTGTTAGTTGAGTAT AGTCCCCAAGAAAGACAAGAGTTGATTACCTATCGCCTTCTGACTGAGAGTGGTTTTGTCACCAATGAAGCATTGCAAGA GTGCACGAAAGTCAGTAATGTAACTATTATTCAGGATATTTCAGATATTGATAAGCGTCTTTTAGACTTTGATCTGAAAA TTGAACGACAAAAAGGTTATCGGATTTCTGGTGATTCAGTTGGTAAGAGAAGATTTTTGGCTATTTTACTGACAAACTGT ATCTCAGTAGCAGATTTTTCAACCGGTAATTTTGGGAGCTTTGATATTTTAGAAGCAGATAGAACTAGGCTGGCCAGTCA GATTGTTAATAAGCAACTGTCAGGTTTTCCAGATATGGATGCTAGGATGAAGATGTTTTTTGCGATCTTGTTATCTCTTA TAGGTCAGGAGCAAAACATTGAAAATTCACCTAATACTAGTAAGCAGGCTTTGGAAATTTCTCAAAAAATTTTTCAAACT TACTCTAAGCAGACTGCACAATTTTATAGTATTCAGGAAATTATCTATTTTGCGAGCATCTTGGATGAATTAATCATTAA ACGTCAGGACAATCCGCTCTTTACGGAGAAATTTGATGGTGAATTTTTCTACAATATTTCAAATCTGATTGATACGGTTT CCATGTATACCAAGATTGACTTTTTTAAGGACAAGGTTTTATTCAATTTTCTTTTCCATCATATTCGGCTCAGTTTAGGC GTCCCTATCCTTTTTCAGGGTAAAAATTTGCCAGAATCTGTCCAGATTTTAGTTGAAAGGAATAAATTTCTTTATACAGT CATCAGTCTTTTAGTGAATGATATTTTTCCGAAATATCTTCATACAGAGTATGAGTATGGCATGATTGCCCTACATTTTA TCTCTAGCTTAGGCCGTAGTCCAGAGATTTATCCAGTCCGTGTTTTGCTTTTAACGGATGAACGTCGGGTCACTAGAGAT TTATTAGTCAGTAAAATTAAGAGTGTTGCTCCTTTTGTAGAGTTGATAGATATTCAGTCTCTAGTAGATTACCACAGTAT TGATCTCAGTCAGTATGATTATATTTTATCTACCAAGCCGCTGACTAATCAGGAAATCGGTGTAATTTCTAGTTTTCCAA CCGTCAAAGAATTGCTTGAATTACAGGAACGACTTCAGTATGTACAGGCACATCGTACAATTGTCGCGCGTGATGCTATC GCTCCAGAGAAAAGTTATGACTTGCAAGATTATTTAATATCTAGTAGTCAGCTTTTGAGTCAATTCGAGTTGGTTCAATT GGAGAATAATCAATCATTTGAGCACACGGTAGAACAAATCATCCAATATCAGAAGAATGTGAGTGACAGAGATTACCTAA CAAGAAAATTGTTATCTCACTTCCAGAATAGTCCTATGGCTATTCCTAATACTGGTCTGGTGCTTTTACATAGTCAGTCT AGCAAAGTAACAACAAATAGTTTTACTATGTTTGAACTCAAACTACCTATCTCCGCATTGTCAATGAAACGAGAGGAAGA AGAGGTCAAAAGGTGTCTGCTAATGCTAATGTCTAAAGAAGCTAGCGAGGAAGCTAGAGATTTAATGACAGCTATTAGTC AGTCGATTATTGAAAATCATCTTTATACAGAGATTTACAAGACGGGAAATCAATCCATTATTTATCAGATGCTAAATACT ATTTTTAACGAAAAAATTAAGAAATTGGAGAACTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTCTCAATTTCTTATTGTGGATAGTTTAGTAACAACACCAGAATATGACAAAATGGCTGCTAGAATGTACAAATAGAAC TAGAGGTTTCTAAATTACGA
Downstream 100 bases:
>100_bases TATGAAACTTGAAAAACATTTGATTAAGCTTAATAAACAATTTTCTAACAAGGAGGAAGCTATTTGTTATTGTGGGCAAG TTCTTTATGAGGGTGGATAT
Product: putative transcriptional regulator MtlR
Products: NA
Alternate protein names: Putative phosphotransferase enzyme IIA component; Putative PTS system EIIA component [H]
Number of amino acids: Translated: 651; Mature: 651
Protein sequence:
>651_residues MLLTKREEQLLKAFLHVGKLSMQDMTEILQVSSRTIYRTLSDLTDSMEQYGIEITKHWKYYILTGELDNLPTELEVLVEY SPQERQELITYRLLTESGFVTNEALQECTKVSNVTIIQDISDIDKRLLDFDLKIERQKGYRISGDSVGKRRFLAILLTNC ISVADFSTGNFGSFDILEADRTRLASQIVNKQLSGFPDMDARMKMFFAILLSLIGQEQNIENSPNTSKQALEISQKIFQT YSKQTAQFYSIQEIIYFASILDELIIKRQDNPLFTEKFDGEFFYNISNLIDTVSMYTKIDFFKDKVLFNFLFHHIRLSLG VPILFQGKNLPESVQILVERNKFLYTVISLLVNDIFPKYLHTEYEYGMIALHFISSLGRSPEIYPVRVLLLTDERRVTRD LLVSKIKSVAPFVELIDIQSLVDYHSIDLSQYDYILSTKPLTNQEIGVISSFPTVKELLELQERLQYVQAHRTIVARDAI APEKSYDLQDYLISSSQLLSQFELVQLENNQSFEHTVEQIIQYQKNVSDRDYLTRKLLSHFQNSPMAIPNTGLVLLHSQS SKVTTNSFTMFELKLPISALSMKREEEEVKRCLLMLMSKEASEEARDLMTAISQSIIENHLYTEIYKTGNQSIIYQMLNT IFNEKIKKLEN
Sequences:
>Translated_651_residues MLLTKREEQLLKAFLHVGKLSMQDMTEILQVSSRTIYRTLSDLTDSMEQYGIEITKHWKYYILTGELDNLPTELEVLVEY SPQERQELITYRLLTESGFVTNEALQECTKVSNVTIIQDISDIDKRLLDFDLKIERQKGYRISGDSVGKRRFLAILLTNC ISVADFSTGNFGSFDILEADRTRLASQIVNKQLSGFPDMDARMKMFFAILLSLIGQEQNIENSPNTSKQALEISQKIFQT YSKQTAQFYSIQEIIYFASILDELIIKRQDNPLFTEKFDGEFFYNISNLIDTVSMYTKIDFFKDKVLFNFLFHHIRLSLG VPILFQGKNLPESVQILVERNKFLYTVISLLVNDIFPKYLHTEYEYGMIALHFISSLGRSPEIYPVRVLLLTDERRVTRD LLVSKIKSVAPFVELIDIQSLVDYHSIDLSQYDYILSTKPLTNQEIGVISSFPTVKELLELQERLQYVQAHRTIVARDAI APEKSYDLQDYLISSSQLLSQFELVQLENNQSFEHTVEQIIQYQKNVSDRDYLTRKLLSHFQNSPMAIPNTGLVLLHSQS SKVTTNSFTMFELKLPISALSMKREEEEVKRCLLMLMSKEASEEARDLMTAISQSIIENHLYTEIYKTGNQSIIYQMLNT IFNEKIKKLEN >Mature_651_residues MLLTKREEQLLKAFLHVGKLSMQDMTEILQVSSRTIYRTLSDLTDSMEQYGIEITKHWKYYILTGELDNLPTELEVLVEY SPQERQELITYRLLTESGFVTNEALQECTKVSNVTIIQDISDIDKRLLDFDLKIERQKGYRISGDSVGKRRFLAILLTNC ISVADFSTGNFGSFDILEADRTRLASQIVNKQLSGFPDMDARMKMFFAILLSLIGQEQNIENSPNTSKQALEISQKIFQT YSKQTAQFYSIQEIIYFASILDELIIKRQDNPLFTEKFDGEFFYNISNLIDTVSMYTKIDFFKDKVLFNFLFHHIRLSLG VPILFQGKNLPESVQILVERNKFLYTVISLLVNDIFPKYLHTEYEYGMIALHFISSLGRSPEIYPVRVLLLTDERRVTRD LLVSKIKSVAPFVELIDIQSLVDYHSIDLSQYDYILSTKPLTNQEIGVISSFPTVKELLELQERLQYVQAHRTIVARDAI APEKSYDLQDYLISSSQLLSQFELVQLENNQSFEHTVEQIIQYQKNVSDRDYLTRKLLSHFQNSPMAIPNTGLVLLHSQS SKVTTNSFTMFELKLPISALSMKREEEEVKRCLLMLMSKEASEEARDLMTAISQSIIENHLYTEIYKTGNQSIIYQMLNT IFNEKIKKLEN
Specific function: Not necessary for mannitol utilization. May be involved in regulation of the mannitol phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system (PTS) [H]
COG id: COG3711
COG function: function code K; Transcriptional antiterminator
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 PTS EIIA type-2 domain [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR013196 - InterPro: IPR011608 - InterPro: IPR016152 - InterPro: IPR002178 - InterPro: IPR011991 [H]
Pfam domain/function: PF08279 HTH_11; PF00359 PTS_EIIA_2 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 75453; Mature: 75453
Theoretical pI: Translated: 5.19; Mature: 5.19
Prosite motif: PS51094 PTS_EIIA_TYPE_2
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.5 %Met (Translated Protein) 2.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.5 %Met (Mature Protein) 2.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLLTKREEQLLKAFLHVGKLSMQDMTEILQVSSRTIYRTLSDLTDSMEQYGIEITKHWKY CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEE YILTGELDNLPTELEVLVEYSPQERQELITYRLLTESGFVTNEALQECTKVSNVTIIQDI EEEECCCCCCCHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEHHH SDIDKRLLDFDLKIERQKGYRISGDSVGKRRFLAILLTNCISVADFSTGNFGSFDILEAD HHHHHHHHCCCCEEECCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHH RTRLASQIVNKQLSGFPDMDARMKMFFAILLSLIGQEQNIENSPNTSKQALEISQKIFQT HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH YSKQTAQFYSIQEIIYFASILDELIIKRQDNPLFTEKFDGEFFYNISNLIDTVSMYTKID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH FFKDKVLFNFLFHHIRLSLGVPILFQGKNLPESVQILVERNKFLYTVISLLVNDIFPKYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HTEYEYGMIALHFISSLGRSPEIYPVRVLLLTDERRVTRDLLVSKIKSVAPFVELIDIQS CCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVDYHSIDLSQYDYILSTKPLTNQEIGVISSFPTVKELLELQERLQYVQAHRTIVARDAI HHHHHHCCHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC APEKSYDLQDYLISSSQLLSQFELVQLENNQSFEHTVEQIIQYQKNVSDRDYLTRKLLSH CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH FQNSPMAIPNTGLVLLHSQSSKVTTNSFTMFELKLPISALSMKREEEEVKRCLLMLMSKE HCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASEEARDLMTAISQSIIENHLYTEIYKTGNQSIIYQMLNTIFNEKIKKLEN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MLLTKREEQLLKAFLHVGKLSMQDMTEILQVSSRTIYRTLSDLTDSMEQYGIEITKHWKY CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEE YILTGELDNLPTELEVLVEYSPQERQELITYRLLTESGFVTNEALQECTKVSNVTIIQDI EEEECCCCCCCHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEEHHH SDIDKRLLDFDLKIERQKGYRISGDSVGKRRFLAILLTNCISVADFSTGNFGSFDILEAD HHHHHHHHCCCCEEECCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHH RTRLASQIVNKQLSGFPDMDARMKMFFAILLSLIGQEQNIENSPNTSKQALEISQKIFQT HHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH YSKQTAQFYSIQEIIYFASILDELIIKRQDNPLFTEKFDGEFFYNISNLIDTVSMYTKID HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHH FFKDKVLFNFLFHHIRLSLGVPILFQGKNLPESVQILVERNKFLYTVISLLVNDIFPKYL HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HTEYEYGMIALHFISSLGRSPEIYPVRVLLLTDERRVTRDLLVSKIKSVAPFVELIDIQS CCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVDYHSIDLSQYDYILSTKPLTNQEIGVISSFPTVKELLELQERLQYVQAHRTIVARDAI HHHHHHCCHHHCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC APEKSYDLQDYLISSSQLLSQFELVQLENNQSFEHTVEQIIQYQKNVSDRDYLTRKLLSH CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH FQNSPMAIPNTGLVLLHSQSSKVTTNSFTMFELKLPISALSMKREEEEVKRCLLMLMSKE HCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEEECCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASEEARDLMTAISQSIIENHLYTEIYKTGNQSIIYQMLNTIFNEKIKKLEN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 10878121; 12397186; 1322373 [H]