Definition Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome, complete genome.
Accession NC_010334
Length 5,226,917

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The map label for this gene is 167623675

Identifier: 167623675

GI number: 167623675

Start: 2090990

End: 2096740

Strand: Direct

Name: 167623675

Synonym: Shal_1744

Alternate gene names: NA

Gene position: 2090990-2096740 (Clockwise)

Preceding gene: 167623674

Following gene: 167623676

Centisome position: 40.0

GC content: 39.05

Gene sequence:

>5751_bases
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GGGCTTTAGTCGACAGTAAGAAAGGTACGATAGTCCAAGCAGATATCGAAGATAATAAGAAGGACCGGGAAAGTACTATG
GACAGTCACTCAACAAACAATTTAAATAGTAATTTTGCTTTTGATTCTCTTCAAGCAATTCGAAATAGACTACTAGATCT
AACTGGTAGAAACCGCCTTCTAAATTTTCGCCATGGTAGAACAGGCTTCATCAGAGTAATTGATGAGATGCCGAATCAAC
TTGCAGAAAATATTCTCAATAGTAAGTCGTATACGTTTATCCCTGTTGAAGAGCCTAAGCGAGAAGAGCTCATTAAGCAT
GGTTATATTGGTATTGATGATAAAGGACAAGAGTTTAGAATCAAAGCTGATCCAACAGCTAAGGATTGGGCTAAAGTTTT
AGGCTTGAATACAAATTATGAATTGCCTATGAGCTCTAAAACAAAAGACTCTAAGCATAATGATTCATATATCCAGTCAA
TGCTTTACCCAAGAGAGTTAGAAGCACAGCTTAGAAATATTAGATCTAAAGCTAACACCGCTATAGAGGAGACTGGAGCC
AATATTTTGTATTTGGCATTTGGTTTTCTTGAGTGGTTTGAGGATGAAAGCTCGGATGTTTCCAGACAAGCGCCACTGTA
TCTTATTCCTGTAAAAGTTGACCGTGCATCACTAAATAAAAATACAGGGACCTATACCTATACGATTGAATATAATAGTG
AAGATATCATTCCAAACCTATCTTTAAGTGAAAAGCTAAAGCATGATTTTCACATTCATTTGCCTGAGTTAGATGAAGAT
ACTCTTCCGGAGGAATATTTTCAGTTAGTCGAGAGCAATGTACTTCGCAATAAACCTAAATGGAAGATTAAGCGATATTC
AACATTGGCGATGTTCGATTTTGGCAAGTTGTTGATGTATTTAGATCTTGATCCATCACGCTGGCCAGATGGACAAAACA
ACATCCAGAATCACGCTATTTTGCAGATGTTTTTTGCAAAAGAAGGGATTGAAAACACTAATGCTAGTACAGGTTTTGGG
GTTGAATATCCAATCGATACAATTGAACACGTTCATGAAAAGTATCCACTAATTGATGACGCAGACAGCTCTCAACATAG
TTCCTTAATGGATGCTATTAAAGGTAAAAATTTAGTCATTGAAGGACCGCCAGGTTCTGGTAAATCGCAAACTATTACAA
ACTTAATTGCGGCTGCTATTTCTCAAGGCAAAAAAGTTCTATTTGTTGCCGAAAAGATGGCTGCGCTGCAGGTCGTTAAG
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AAATATAAACCAAAGACTAAATCGGCAAGACGAGTATCGATATCCTCATACAATTGCCATCGATATTGGTATGTATGAGG
AAAAAAAGAGCACGCTCAGCAAATATGCAAATTTGATTAATAGTGAGTGGAAGAGTACTGGCCGAACAATCCATCAGATA
TTTTCTACAGCAACGCGCTACAGAGAAGAATTTGAATCAATATCATTAGATGATATTAAACCATCACATGTAACGGGTGA
TAAATTCGATGCAACCTCTGCAAGACGAACGATAGATAGCCTTCGTCGATACGCAGATGTTTATCAAGAGGTGAAGTTGC
AACTGGGAGTTGAAGCTGAGTTATCAGATCATCCATGGTTTGCTGTATATAACACAGATATTCAGGTTTTCGAATGTGAT
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CGGCGAGCAGAATCTTAAGAACATCGAAGTCTTAGAGTTACTTTTCACTGATGCCAAAGTGTTGCCACGAATTTCGGGCT
TAGAAGATAACAAGGCCTTATATTCAATCTTTGAAAATGCAAGCCTTGAACAAGAGTTAAAGTCATACCTGAAAAGCTAC
AGCCTAGCTAGAAGACTTCATCGACAATTAATCACCGAGTTCGAACCATCGGTATTAGATACTCCAAACAGTTTTTCTGC
TGTTGTTAATTCACATGTGGCGTTAAATAAGCTGTGCCTTGATAGCAGAACTCAATTTTCGACTTTGTTTCAAACAGTCA
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TCACGTATCTCGTCGTAACCCTCTATTTGACAATGACTTACTCGATGCTTATTTACCTACGCTTCAAGATATATTGCCAG
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AATGAAAGCATTACAGAGGCTGGTTTCTTTCGTTGGTTAAGTAGTGACTGGCGCTCAGCAAGACATGATCTTCTCGCAAT
ATCTAATAACAACAAGCATAAGTTCAATAAGTTAACACAGCACTTGCCAGACCTTATTATCTATAAGGGGCTATTGGATG
AGCTCAATAGCGAACCTCTGTATTCAAGCCTTTTACAAAATGAGTACAAGGGAATAGATACGCCGATTGAAGATATCCTT
GTAATACGTAGCTGGTACAAAGATGTTAGAGCAGCATTCGGTATAGGTTTTGGTACAAAGGTCCCGTTCGCAACGTCTTT
ATTTGAATCACATAGTGATATTTTTAAAGGAATTAAGCATTTATCGTCATCAAATACACTGGAGTTACTTGAGAGGTTCT
CAGAGTCCCATCAAAATTTAGGTGAGCTTCTTTCACACGTTCTGTTTAGTGATCATGATATTGATTTTAATAATCAATCT
GTAAGCTTCGACAATTTAGCACAACAGCTAAAATCAGACGTTAAGGTACTGCAGTCTGCTTGTAAGCAGGACGTATCATT
AGCTGATTTAGATGGCAATATACAGCAAGCTATAGAGTTTAAAGCACTAGAACAGCAACTTAAATCACAAACTTTGACCG
ATGATTTGTTTAATGAAAAAGTTGAATTATCTGCAGATAGTGATTGTGAGCATAGTGAGCGAGTTATTGCATCAACACTC
ATGCTGAATAAAGCCATTCAGGGACTAAAAACAAAACAGTTAGCTAATTACTATTTAACTTGCCCACCACGTAATGCTTG
TGAAGCACTAAGTGAAATGTTGAAAAATGTAGAGCTTCAGTATCAAAAATACAATCTTGCATTTGGTGTTTTTGTAACAA
AAGCAAAAGTGGATGAGCTATTTTGGTATGGTATTGATGACAGCTGTATTGATTCTTGGATTGCCCGTAATCAACGCGCA
ACTAGTCAGCCTAGGTGGTTAAGTACTTGGGTCGACTTTATCCGCATAAGAACAGCACTTTCTGATAAAGGCTTAGAGAA
TTTGCTTCGTTACACTGAAATGGGTGCTATTAGACTAGAAGACCTTGAGAAAATTTACCTTTATTCTGTTTATGACATAT
TAGCAAGAGAAGTGATATCAGAACGTCAAGAACTCGCCTATTTCTCTGGCGCAGAACAAAATGCAATTCGTAAGCAATTT
GCTGAGTATGACAATAAATTAAAAGCGCTTCAGCAAGAGAAGATTGCTTATGAAGTGGCACAGATTGGCATACAAAAAAC
AGTATCTGGAATTTCAACTGGGAGGGTAGGCGCATACTCTGAAATGGGCTTGATTACCCATCAAGTTAATTTAAAAACGC
GCCACGCTCCAGTTCGTCAGCTAATTAAGCGTGCAAGTCAGTCGCTAGTAGCGTTAAAACCCTGCTTCATGATGGGGCCA
CACTCAGTTGCACAATATCTCGCTCCAGGTCAGATAGAGTTTGACATTATCGTCATGGATGAAGCATCGCAAATTAAACC
TGAAGATGCACTCGGAACAATTGCGCGAGGTAAACAGCTGGTAGTGGTAGGTGACCCTAAACAACTACCTCCAACAAGCT
TTTTTGATAAAGCCATTGAAGTTGATGATGAAGATATAACGGCTATTGAACAGTCCGAAAGTATACTTGATGTATCACTC
CCCATGTTTAATGCAAGGCGTTTACGTTGGCATTACCGCTCACGCCATGAAAGCTTAATAGCCTTCTCGAATCAGAAATT
CTATGACAGCAATCTGGTCGTCTTCCCATCGCCATCGAATAAGAGCGATGAGTTTGGTATTAAATTTACCCATGTAAAGC
TAGGTCGTTTTGTTAACCAGCACAATATTGAAGAGGCAAAAGTCATTGCTGAAGCAGTGCGTAAACATTTGCTAAACAGA
CCCGATGAATCGCTTGGTGTTGTCGCTATGAGCTCTAAACAACGTGAACAGATCGAGCGCTGTGTTGAAGAGCTGTCAAA
AGATGATGATCAATTCAGAGACGCTTTAGCGCTTAATGCTGACGTAGATGAACCGTTGTTTCTTAAAAACCTTGAAAACG
TACAAGGAGATGAGCGGGACGTTATTTTCATATCTTGTACTTATGGTCCTCAAGAGGCTGGTGCCGCTCAAATGCCGCAG
CGTTTTGGCCCAATAAACTCTGCCGCAGGTGGCCGACGACTTAACGTACTGTTTACGCGTTCTAAAAAGCGTATGCATGT
CTTTAGTTCGATGACTGAAGGCCACATATTGGCATCTGAGACTTCGAGTGAAGGAGTACATGCACTAAAGAGCTTTTTAG
CCTATGCACAAACAGGCAAACTAACTCAGCAAATTCATACAGGCAAACAACCTGATAGTGATTTTGAAATAGCGGTTATG
GATGCCTTAAAGTCAGAAGGCTTTACCTGTATTCCACAAGTAGGTGTGGCGGGGTACTTTATCGATTTAGCCGTGCAAGA
TCCCGGGCAACCAGGCCGTTACCTTATGGGAATAGAGTGTGACGGTGCGACATATCATTCAGCTAAATCTGCCCGTGATA
GAGACAGACTTCGCCAATCAGTATTAGAAAGTTTGGGCTGGACGATTAATCGTATATGGTCGACTGATTGGTTTAAAAAC
CCTCAAGCACAGCTCAAGCCAATTATAGAGTTGTTACACCAGTTAAAGACTGAGGTGCAAGAGCATTACGAAACTGAGCA
GCCAAAGAGTGAGCAAAATCAAATAGAGGAAGTTGTTGAGCAAGAAGAGCTGCAACAAGAATTAATTGAAGCTTATTGCC
ACAGCGATGACTCATTAGCGGCTAAACTCGAAAAGTTTGAGCAAGCAGTGATTTCTCAGTCAAGTACTGGCATACCTTTG
GCTAATAGATTGTTACGTCCCGCGATGATTGCGGCTTTGTGTGAATTCAAGCCAATATCTAAGAGTGAGTTTTTAGAAAT
GATCCCATCATATTTGCGAAATACTACGGCGGCAGAACAAGGAGTATACCTAGAGCAGGTACTAAATATTATTGCGGATA
ACGAACAAGAGTTGAGTATTGATAATAGTGACGATGAGCTTACCTATAGCAAGGTACCATTTTATTATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGGTGTAGAATTATGGAATACAATGTAGTTGTAAACTACACATCCCTTCGTTCTAGATTAGTATAAAACGATAGCTAAAT
AATAAAGAAATGGAACCTTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TCCATTAGTAAACAAGGAAGTTAAAGTGAAAGTACCGGATATTAAGAGAACAGCACCAGATGTACTTAGGGTAACAGCAT
TTGTATTGGAGAAAAGTGAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1916; Mature: 1915

Protein sequence:

>1916_residues
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Sequences:

>Translated_1916_residues
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>Mature_1915_residues
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Specific function: Unknown

COG id: COG1112

COG function: function code L; Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the DNA2/NAM7 helicase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 217723; Mature: 217592

Theoretical pI: Translated: 5.13; Mature: 5.13

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
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2.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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KDWAKVLGLNTNYELPMSSKTKDSKHNDSYIQSMLYPRELEAQLRNIRSKANTAIEETGA
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NILYLAFGFLEWFEDESSDVSRQAPLYLIPVKVDRASLNKNTGTYTYTIEYNSEDIIPNL
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SLSEKLKHDFHIHLPELDEDTLPEEYFQLVESNVLRNKPKWKIKRYSTLAMFDFGKLLMY
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SRLERAGLGDFCLELHSHKTQKKQVYENINQRLNRQDEYRYPHTIAIDIGMYEEKKSTLS
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HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
SLARRLHRQLITEFEPSVLDTPNSFSAVVNSHVALNKLCLDSRTQFSTLFQTVTKLNDLN
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CEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHH
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HCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHH
VIRSWYKDVRAAFGIGFGTKVPFATSLFESHSDIFKGIKHLSSSNTLELLERFSESHQNL
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
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KALEQQLKSQTLTDDLFNEKVELSADSDCEHSERVIASTLMLNKAIQGLKTKQLANYYLT
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TSQPRWLSTWVDFIRIRTALSDKGLENLLRYTEMGAIRLEDLEKIYLYSVYDILAREVIS
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HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
EMGLITHQVNLKTRHAPVRQLIKRASQSLVALKPCFMMGPHSVAQYLAPGQIEFDIIVMD
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CCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCEECCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHH
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CCHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH
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