Definition | Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010334 |
Length | 5,226,917 |
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The map label for this gene is 167623675
Identifier: 167623675
GI number: 167623675
Start: 2090990
End: 2096740
Strand: Direct
Name: 167623675
Synonym: Shal_1744
Alternate gene names: NA
Gene position: 2090990-2096740 (Clockwise)
Preceding gene: 167623674
Following gene: 167623676
Centisome position: 40.0
GC content: 39.05
Gene sequence:
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Downstream 100 bases:
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Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 1916; Mature: 1915
Protein sequence:
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Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: COG1112
COG function: function code L; Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the DNA2/NAM7 helicase family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 217723; Mature: 217592
Theoretical pI: Translated: 5.13; Mature: 5.13
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 1.4 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 1.4 %Met (Mature Protein) 2.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSKLTDAIVASLEKTPNLTAKELAQACNTDKKSVNRCLYYDLKDKAKINTYYQWALVDSK CCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHEEEECCCCCCEECEEEEEEEEECC KGTIVQADIEDNKKDRESTMDSHSTNNLNSNFAFDSLQAIRNRLLDLTGRNRLLNFRHGR CCCEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCC TGFIRVIDEMPNQLAENILNSKSYTFIPVEEPKREELIKHGYIGIDDKGQEFRIKADPTA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCH KDWAKVLGLNTNYELPMSSKTKDSKHNDSYIQSMLYPRELEAQLRNIRSKANTAIEETGA HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NILYLAFGFLEWFEDESSDVSRQAPLYLIPVKVDRASLNKNTGTYTYTIEYNSEDIIPNL CEEHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCCEEEEEEEEEHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCC SLSEKLKHDFHIHLPELDEDTLPEEYFQLVESNVLRNKPKWKIKRYSTLAMFDFGKLLMY CHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCEEEE LDLDPSRWPDGQNNIQNHAILQMFFAKEGIENTNASTGFGVEYPIDTIEHVHEKYPLIDD EECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCC ADSSQHSSLMDAIKGKNLVIEGPPGSGKSQTITNLIAAAISQGKKVLFVAEKMAALQVVK 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