| Definition | Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010320 |
| Length | 2,457,259 |
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The map label for this gene is feoB [C]
Identifier: 167038858
GI number: 167038858
Start: 190174
End: 192147
Strand: Direct
Name: feoB [C]
Synonym: Teth514_0188
Alternate gene names: 167038858
Gene position: 190174-192147 (Clockwise)
Preceding gene: 167038857
Following gene: 167038864
Centisome position: 7.74
GC content: 34.85
Gene sequence:
>1974_bases ATGAAAAAAGAAATAGTTATAGCCTTAGCAGGAAATGCTAATGTAGGTAAAAGCGTTATCTTCAATCAATTGACGGGTTT AACTCAGATAATTGGCAACTGGCCGGGGAAAACAGTGGAAAGGGCAGAAGGGCTTTTGAGATTTAAAGGCCGGACTATAA AAATTGTTGACCTTCCCGGTATTTATTCTCTTTCTGCCTATTCTCAAGAGGAAATTGTTTCTCGTGAGTTTATAGCTTTT GAAAAACCGGATGTTGTAATAAACGTGGTGGATGCCTCTAATCTTGAGAGAAATTTGTTTTTTACAGTGCAACTTTTAGA GCTTCATGTGCCTATGGTTATGGCTTTAAACCAAGTGGATTATGCCCTTAAAAAGGGTATAGATATAAATGTAAAAAGGC TTGAAGAACTTTTAGGAATTCCTGTTGTAAAAACTATCGCTACAAAGGGGAAAGGCCTTGAAGAATTGATAGATAAAGCT TTAGAAGTTGTAGATTCACATAAAGAAACGGCTGTAAAAGAGTATGACATAAAACAAGAAAAAATTCTCAAATACAGAAA TGAAGTAAGCGAGTATGTAATGAGAATTTACAATATTCTTTTAAAACACAATGTAGTAAACATTATAAATTTGTTTCATC CTCTGTGGATTTCTCTAAAACTTATAGAAGAAGATAGCGATATAATTGAAAAGCTAAAAAGAGAGCCTGATGGTAAAAAG GCTTATGAAGAGATTCAAAAAGAACTAGAGGGATTAAAGGCGAAGACAGATGGCCCTCTTGTGACTTTAGTTACAGCAGC CAGGTATGATATTGCCTCTTTTATAGCCAGGCAGACAGTATCAGAAATTCACCATAGAATTACATGGACTGATTTGATTG ACAATGTTGCTCTTCATAAAATATTTGGCTATATATCAATGTTTGCTATTGTCTTCATATCATTTTACGGCATATTTAAA TTTGGAGAGTATTTCTCTGGCGTGTTGGAGGGATTTTTTGATGTATTAAGACCTTTGGTGTATAATTTGCATATTCCAAA TATGTATAAAGATGTTTTATGGAATGGACTTGTTGAAGGACTTATTTCTGCTATAACCATCGTACTACCTTATATACTCC CATTTTATGTATTTTTATCAATACTTGAAAACACGGGTTATCTTGCGAGAATTGCCTTTTTAATGGATGAGATAATGCAC AAAGTGGGACTTCACGGCAAAGCTCTCATTCCAATATTGATGGGCTTTGGGTGCAATGTCCCGGCAGTACTAGGCACAAA AATTTTAGAAACTGATAGAGAAATATTTGTTGCGTCTTTTATGTCCACTCTTGTGCCTTGTTCTGCAAGGATTGTGATAA TTTTAGGTACAATAGGGGTATTCATGGGGCCGCAATACGCACTTGCTGTTTTTGCCTTAGATGTTTTGGTAATTTATATA GCAGCGTATTTTGCAGATAAAATAGCGCATGGAAAACCCTATGATTTGATAATGGAACTTCCCGGTTACAGAGTACCCGC GTTAAAACCAACATTAAAGCAAATATGGATTAGGATTAAAGACTTTTTGTATGTGGCACTTCCTATAATTGTTGTAGGAA GTCTTGTGCTTGAAATATTGAAATACACAGGTATATTTAAATATGTGACGTATGTAACGGACCCTATTGTAGTAAAATGG TTGGGATTGCCATCAATAGTAGGAATAGTATTGATTTTTGGGGTTTTAAGGAAAGAGCTTACCCTTATAATGCTTTTAAC ACTGTCTGGGACAAGTCATATAACACAGATTTTGACGCCGCGGCAGATGATTGTCTTTGGTGTTGTTACAATGCTTTATA TTCCCTGTATTGCTACAATTGCGGCATTAAAAAGGACAATTGGATGGAGAAAAACATGGTGGGTAGTTTTTGTTAATATT TTTATTGCAATACTAATAGGGGGAATATTAAATAGAATTCTTACTTTTGTATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GCCTGTTGAGCTTGAAGTTAGAAATTCTCACCTTGTGATTGGATATGGTCTTGCTTCAAAAATATATGTAAAAATTGCCT AACAGAAAGGAAGGCTTAAG
Downstream 100 bases:
>100_bases TTGTGCTATAATGTTAATGGGTGAAAAACAATAGAATTTATAGAAAAAATAAATTGAAAATAGAGTAGGACACTAGACCT ACTCTATTTTTTTATCAAAT
Product: ferrous iron transport protein B
Products: Fe (II) [Cytoplasm] [C]
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 657; Mature: 657
Protein sequence:
>657_residues MKKEIVIALAGNANVGKSVIFNQLTGLTQIIGNWPGKTVERAEGLLRFKGRTIKIVDLPGIYSLSAYSQEEIVSREFIAF EKPDVVINVVDASNLERNLFFTVQLLELHVPMVMALNQVDYALKKGIDINVKRLEELLGIPVVKTIATKGKGLEELIDKA LEVVDSHKETAVKEYDIKQEKILKYRNEVSEYVMRIYNILLKHNVVNIINLFHPLWISLKLIEEDSDIIEKLKREPDGKK AYEEIQKELEGLKAKTDGPLVTLVTAARYDIASFIARQTVSEIHHRITWTDLIDNVALHKIFGYISMFAIVFISFYGIFK FGEYFSGVLEGFFDVLRPLVYNLHIPNMYKDVLWNGLVEGLISAITIVLPYILPFYVFLSILENTGYLARIAFLMDEIMH KVGLHGKALIPILMGFGCNVPAVLGTKILETDREIFVASFMSTLVPCSARIVIILGTIGVFMGPQYALAVFALDVLVIYI AAYFADKIAHGKPYDLIMELPGYRVPALKPTLKQIWIRIKDFLYVALPIIVVGSLVLEILKYTGIFKYVTYVTDPIVVKW LGLPSIVGIVLIFGVLRKELTLIMLLTLSGTSHITQILTPRQMIVFGVVTMLYIPCIATIAALKRTIGWRKTWWVVFVNI FIAILIGGILNRILTFV
Sequences:
>Translated_657_residues MKKEIVIALAGNANVGKSVIFNQLTGLTQIIGNWPGKTVERAEGLLRFKGRTIKIVDLPGIYSLSAYSQEEIVSREFIAF EKPDVVINVVDASNLERNLFFTVQLLELHVPMVMALNQVDYALKKGIDINVKRLEELLGIPVVKTIATKGKGLEELIDKA LEVVDSHKETAVKEYDIKQEKILKYRNEVSEYVMRIYNILLKHNVVNIINLFHPLWISLKLIEEDSDIIEKLKREPDGKK AYEEIQKELEGLKAKTDGPLVTLVTAARYDIASFIARQTVSEIHHRITWTDLIDNVALHKIFGYISMFAIVFISFYGIFK FGEYFSGVLEGFFDVLRPLVYNLHIPNMYKDVLWNGLVEGLISAITIVLPYILPFYVFLSILENTGYLARIAFLMDEIMH KVGLHGKALIPILMGFGCNVPAVLGTKILETDREIFVASFMSTLVPCSARIVIILGTIGVFMGPQYALAVFALDVLVIYI AAYFADKIAHGKPYDLIMELPGYRVPALKPTLKQIWIRIKDFLYVALPIIVVGSLVLEILKYTGIFKYVTYVTDPIVVKW LGLPSIVGIVLIFGVLRKELTLIMLLTLSGTSHITQILTPRQMIVFGVVTMLYIPCIATIAALKRTIGWRKTWWVVFVNI FIAILIGGILNRILTFV >Mature_657_residues MKKEIVIALAGNANVGKSVIFNQLTGLTQIIGNWPGKTVERAEGLLRFKGRTIKIVDLPGIYSLSAYSQEEIVSREFIAF EKPDVVINVVDASNLERNLFFTVQLLELHVPMVMALNQVDYALKKGIDINVKRLEELLGIPVVKTIATKGKGLEELIDKA LEVVDSHKETAVKEYDIKQEKILKYRNEVSEYVMRIYNILLKHNVVNIINLFHPLWISLKLIEEDSDIIEKLKREPDGKK AYEEIQKELEGLKAKTDGPLVTLVTAARYDIASFIARQTVSEIHHRITWTDLIDNVALHKIFGYISMFAIVFISFYGIFK FGEYFSGVLEGFFDVLRPLVYNLHIPNMYKDVLWNGLVEGLISAITIVLPYILPFYVFLSILENTGYLARIAFLMDEIMH KVGLHGKALIPILMGFGCNVPAVLGTKILETDREIFVASFMSTLVPCSARIVIILGTIGVFMGPQYALAVFALDVLVIYI AAYFADKIAHGKPYDLIMELPGYRVPALKPTLKQIWIRIKDFLYVALPIIVVGSLVLEILKYTGIFKYVTYVTDPIVVKW LGLPSIVGIVLIFGVLRKELTLIMLLTLSGTSHITQILTPRQMIVFGVVTMLYIPCIATIAALKRTIGWRKTWWVVFVNI FIAILIGGILNRILTFV
Specific function: Probable GTP-driven transporter of Fe(2+) ion [H]
COG id: COG0370
COG function: function code P; Fe2+ transport system protein B
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Contains 1 G (guanine nucleotide-binding) domain [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1789813, Length=626, Percent_Identity=31.4696485623003, Blast_Score=265, Evalue=8e-72,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003373 - InterPro: IPR011640 - InterPro: IPR011619 - InterPro: IPR011642 - InterPro: IPR006073 - InterPro: IPR002917 - InterPro: IPR005225 [H]
Pfam domain/function: PF07664 FeoB_C; PF02421 FeoB_N; PF07670 Gate; PF01926 MMR_HSR1 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 74098; Mature: 74098
Theoretical pI: Translated: 9.04; Mature: 9.04
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.3 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.3 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKKEIVIALAGNANVGKSVIFNQLTGLTQIIGNWPGKTVERAEGLLRFKGRTIKIVDLPG CCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCC IYSLSAYSQEEIVSREFIAFEKPDVVINVVDASNLERNLFFTVQLLELHVPMVMALNQVD CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YALKKGIDINVKRLEELLGIPVVKTIATKGKGLEELIDKALEVVDSHKETAVKEYDIKQE HHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH KILKYRNEVSEYVMRIYNILLKHNVVNIINLFHPLWISLKLIEEDSDIIEKLKREPDGKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHCCCCCHH AYEEIQKELEGLKAKTDGPLVTLVTAARYDIASFIARQTVSEIHHRITWTDLIDNVALHK HHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFGYISMFAIVFISFYGIFKFGEYFSGVLEGFFDVLRPLVYNLHIPNMYKDVLWNGLVEG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH LISAITIVLPYILPFYVFLSILENTGYLARIAFLMDEIMHKVGLHGKALIPILMGFGCNV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCC PAVLGTKILETDREIFVASFMSTLVPCSARIVIILGTIGVFMGPQYALAVFALDVLVIYI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH AAYFADKIAHGKPYDLIMELPGYRVPALKPTLKQIWIRIKDFLYVALPIIVVGSLVLEIL HHHHHHHHCCCCCHHHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYTGIFKYVTYVTDPIVVKWLGLPSIVGIVLIFGVLRKELTLIMLLTLSGTSHITQILTP HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCH RQMIVFGVVTMLYIPCIATIAALKRTIGWRKTWWVVFVNIFIAILIGGILNRILTFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MKKEIVIALAGNANVGKSVIFNQLTGLTQIIGNWPGKTVERAEGLLRFKGRTIKIVDLPG CCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCC IYSLSAYSQEEIVSREFIAFEKPDVVINVVDASNLERNLFFTVQLLELHVPMVMALNQVD CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YALKKGIDINVKRLEELLGIPVVKTIATKGKGLEELIDKALEVVDSHKETAVKEYDIKQE HHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH KILKYRNEVSEYVMRIYNILLKHNVVNIINLFHPLWISLKLIEEDSDIIEKLKREPDGKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHCCCCCHH AYEEIQKELEGLKAKTDGPLVTLVTAARYDIASFIARQTVSEIHHRITWTDLIDNVALHK HHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IFGYISMFAIVFISFYGIFKFGEYFSGVLEGFFDVLRPLVYNLHIPNMYKDVLWNGLVEG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH LISAITIVLPYILPFYVFLSILENTGYLARIAFLMDEIMHKVGLHGKALIPILMGFGCNV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCC PAVLGTKILETDREIFVASFMSTLVPCSARIVIILGTIGVFMGPQYALAVFALDVLVIYI CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHH AAYFADKIAHGKPYDLIMELPGYRVPALKPTLKQIWIRIKDFLYVALPIIVVGSLVLEIL HHHHHHHHCCCCCHHHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KYTGIFKYVTYVTDPIVVKWLGLPSIVGIVLIFGVLRKELTLIMLLTLSGTSHITQILTP HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCH RQMIVFGVVTMLYIPCIATIAALKRTIGWRKTWWVVFVNIFIAILIGGILNRILTFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: Fe (II) [Periplasm] [C]
Specific reaction: Fe (II) [Periplasm] = Fe (II) [Cytoplasm] [C]
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]