Definition Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome, complete genome.
Accession NC_010320
Length 2,457,259

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is mviN [H]

Identifier: 167038787

GI number: 167038787

Start: 110024

End: 111589

Strand: Direct

Name: mviN [H]

Synonym: Teth514_0114

Alternate gene names: 167038787

Gene position: 110024-111589 (Clockwise)

Preceding gene: 167038786

Following gene: 167038788

Centisome position: 4.48

GC content: 33.08

Gene sequence:

>1566_bases
ATGTCGACGGCTAAAAAAGCTGTAAAAGCAGCTAGCGTCATAATGATAATAACTTTATTAAGTAAAGTATCTGGATTTTT
GAGAGAAATAACTTTTGCTGCTAAATTTGGTACTTCTGTTTCCATGGATGCCTACAATATAGCAACTGTTATACCTATGA
CACTTTTTGTGGCGGTAACTGCCGCAATAGCTACCACTGTTGTGCCAATATTTACCGAATACTTTCAAAAAGAAGGAAAG
CAAAAGGCATTTGATTTTATAAATAACCTTTTAGGTGTTGTATTGGTTGCAACAGTAATTTTAACTTTCTTGGGTTTTAC
ATTCGCACCTTATCTTGTAAAATTTGTGGCGCCAGCTTTTACTGGAGAAAAATTTGAGTTGACAGTAAAGATTACGACTA
TATTATTGCCTACAATGGTGTTGATAGCTGCATCTAATATTTTTACTGGTGCTCTTCAGGCGATGGAACATTTCACTGTT
CCTGCCATGATTGGTATACCTTACAATATTATTGTAATAACAGTAGCAATTTTATATGGGGGCAAATTTGGAATTACTGC
AGTAGCTTATTCTACAATTATCGCCACTTTTATACAAACATTAGTTCATTTGCCTGTTTTATATAAATTAGGTTACAGAT
TCAAGTTGAGAGTGAATTTTAAAGATGAAGGAGTAAAAAGAGTCATTTTATTAGCAATGCCTGTGCTTGTGGGGACAGGG
GTGCAGACTATAAATGTTTATGTGGATAGAGTGATAGCTTCTTTTTTGCCTGACGGAAGTATTGCGGCATTGAGTTATGC
CAATAGGCTTAAGACGTTTGCATTAGGTGTTTTTTCAACATCAATTGCAACTGCTATATATCCTGTTTTATCGCAACATT
CAGTAGCAGACGACAAAGAAGGTTTTCTAAAAAGTTTAAATTTTGTAGTAAGTGGTATTTTATATGTATTAATACCTGTA
TCAGTTGGTGCAATGGTACTCCGAGTGCCTATAATAAAAGTATTATTTGAAAGAGGAGCTTTTGATGAGAAGTCCACATA
TCTTACCTCAATCGCCCTTTTTTATTATGCCATAGGAATGACTGCGTATGGCCTTAGAGATGTCTTAAGTAGAAGTTTTT
ACTCTATGAAAGACACAAAAACTCCCATGATAAATGGTGCCATGGCTGTATTATTAAATATTGCACTTAATTTAATTTTG
GTAAGATATTTAAAATTAGGAGGACTTGCTCTTTCTACTTCTATTGCAGCCATATTTGCTACTTTTCTTTTATTTACTTC
TTTAAAAAGAAAACTTGGTAAAATAGGCGGGAAATACATGTTTATGAGTTTTATAAGGGCAATGTTTGCATCAGTTGTAA
TGGGGGTTGTAGTGCATTTTGTGTATAATAATATGATTATTAAGATGCCGTCAGATAAAAGAATTTATGAGGTTATAGTC
TTGTTTATGACCATATTAATTGGAACTATAATTTACTCTGCCATTGTATTAATCACTGACAAATCTGCCCTCTCTTATTT
TAAAAAAGGCATAAAATTTGTAAATTCTAAACTTGTAAGAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCTTGTTAAAGCTAAAGGTGTTGCAAAAGTTGGAGATGAAGTTGCAGCTACTGCAGAGCTTATGTTTATAATGACTGAAG
AAGGATAGGAGGCTTAATAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTAAAAATGAGGTGATATCATGAAATCAAAGGTATATTTTTACAATCTGAGAGCGAATAAAGCCAGCAGTAGTTTGTCT
TCCAAAGTAGCGAGAATTTT

Product: integral membrane protein MviN

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 521; Mature: 520

Protein sequence:

>521_residues
MSTAKKAVKAASVIMIITLLSKVSGFLREITFAAKFGTSVSMDAYNIATVIPMTLFVAVTAAIATTVVPIFTEYFQKEGK
QKAFDFINNLLGVVLVATVILTFLGFTFAPYLVKFVAPAFTGEKFELTVKITTILLPTMVLIAASNIFTGALQAMEHFTV
PAMIGIPYNIIVITVAILYGGKFGITAVAYSTIIATFIQTLVHLPVLYKLGYRFKLRVNFKDEGVKRVILLAMPVLVGTG
VQTINVYVDRVIASFLPDGSIAALSYANRLKTFALGVFSTSIATAIYPVLSQHSVADDKEGFLKSLNFVVSGILYVLIPV
SVGAMVLRVPIIKVLFERGAFDEKSTYLTSIALFYYAIGMTAYGLRDVLSRSFYSMKDTKTPMINGAMAVLLNIALNLIL
VRYLKLGGLALSTSIAAIFATFLLFTSLKRKLGKIGGKYMFMSFIRAMFASVVMGVVVHFVYNNMIIKMPSDKRIYEVIV
LFMTILIGTIIYSAIVLITDKSALSYFKKGIKFVNSKLVRN

Sequences:

>Translated_521_residues
MSTAKKAVKAASVIMIITLLSKVSGFLREITFAAKFGTSVSMDAYNIATVIPMTLFVAVTAAIATTVVPIFTEYFQKEGK
QKAFDFINNLLGVVLVATVILTFLGFTFAPYLVKFVAPAFTGEKFELTVKITTILLPTMVLIAASNIFTGALQAMEHFTV
PAMIGIPYNIIVITVAILYGGKFGITAVAYSTIIATFIQTLVHLPVLYKLGYRFKLRVNFKDEGVKRVILLAMPVLVGTG
VQTINVYVDRVIASFLPDGSIAALSYANRLKTFALGVFSTSIATAIYPVLSQHSVADDKEGFLKSLNFVVSGILYVLIPV
SVGAMVLRVPIIKVLFERGAFDEKSTYLTSIALFYYAIGMTAYGLRDVLSRSFYSMKDTKTPMINGAMAVLLNIALNLIL
VRYLKLGGLALSTSIAAIFATFLLFTSLKRKLGKIGGKYMFMSFIRAMFASVVMGVVVHFVYNNMIIKMPSDKRIYEVIV
LFMTILIGTIIYSAIVLITDKSALSYFKKGIKFVNSKLVRN
>Mature_520_residues
STAKKAVKAASVIMIITLLSKVSGFLREITFAAKFGTSVSMDAYNIATVIPMTLFVAVTAAIATTVVPIFTEYFQKEGKQ
KAFDFINNLLGVVLVATVILTFLGFTFAPYLVKFVAPAFTGEKFELTVKITTILLPTMVLIAASNIFTGALQAMEHFTVP
AMIGIPYNIIVITVAILYGGKFGITAVAYSTIIATFIQTLVHLPVLYKLGYRFKLRVNFKDEGVKRVILLAMPVLVGTGV
QTINVYVDRVIASFLPDGSIAALSYANRLKTFALGVFSTSIATAIYPVLSQHSVADDKEGFLKSLNFVVSGILYVLIPVS
VGAMVLRVPIIKVLFERGAFDEKSTYLTSIALFYYAIGMTAYGLRDVLSRSFYSMKDTKTPMINGAMAVLLNIALNLILV
RYLKLGGLALSTSIAAIFATFLLFTSLKRKLGKIGGKYMFMSFIRAMFASVVMGVVVHFVYNNMIIKMPSDKRIYEVIVL
FMTILIGTIIYSAIVLITDKSALSYFKKGIKFVNSKLVRN

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=429, Percent_Identity=28.6713286713287, Blast_Score=187, Evalue=2e-48,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004268 [H]

Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57046; Mature: 56915

Theoretical pI: Translated: 10.42; Mature: 10.42

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
3.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
3.7 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
STAKKAVKAASVIMIITLLSKVSGFLREITFAAKFGTSVSMDAYNIATVIPMTLFVAVT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AAIATTVVPIFTEYFQKEGKQKAFDFINNLLGVVLVATVILTFLGFTFAPYLVKFVAPAF
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
TGEKFELTVKITTILLPTMVLIAASNIFTGALQAMEHFTVPAMIGIPYNIIVITVAILYG
CCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHC
GKFGITAVAYSTIIATFIQTLVHLPVLYKLGYRFKLRVNFKDEGVKRVILLAMPVLVGTG
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
VQTINVYVDRVIASFLPDGSIAALSYANRLKTFALGVFSTSIATAIYPVLSQHSVADDKE
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
GFLKSLNFVVSGILYVLIPVSVGAMVLRVPIIKVLFERGAFDEKSTYLTSIALFYYAIGM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
TAYGLRDVLSRSFYSMKDTKTPMINGAMAVLLNIALNLILVRYLKLGGLALSTSIAAIFA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
TFLLFTSLKRKLGKIGGKYMFMSFIRAMFASVVMGVVVHFVYNNMIIKMPSDKRIYEVIV
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHH
LFMTILIGTIIYSAIVLITDKSALSYFKKGIKFVNSKLVRN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8200538; 11677609 [H]