Definition | Thermoanaerobacter sp. X514 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_010320 |
Length | 2,457,259 |
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The map label for this gene is mviN [H]
Identifier: 167038787
GI number: 167038787
Start: 110024
End: 111589
Strand: Direct
Name: mviN [H]
Synonym: Teth514_0114
Alternate gene names: 167038787
Gene position: 110024-111589 (Clockwise)
Preceding gene: 167038786
Following gene: 167038788
Centisome position: 4.48
GC content: 33.08
Gene sequence:
>1566_bases ATGTCGACGGCTAAAAAAGCTGTAAAAGCAGCTAGCGTCATAATGATAATAACTTTATTAAGTAAAGTATCTGGATTTTT GAGAGAAATAACTTTTGCTGCTAAATTTGGTACTTCTGTTTCCATGGATGCCTACAATATAGCAACTGTTATACCTATGA CACTTTTTGTGGCGGTAACTGCCGCAATAGCTACCACTGTTGTGCCAATATTTACCGAATACTTTCAAAAAGAAGGAAAG CAAAAGGCATTTGATTTTATAAATAACCTTTTAGGTGTTGTATTGGTTGCAACAGTAATTTTAACTTTCTTGGGTTTTAC ATTCGCACCTTATCTTGTAAAATTTGTGGCGCCAGCTTTTACTGGAGAAAAATTTGAGTTGACAGTAAAGATTACGACTA TATTATTGCCTACAATGGTGTTGATAGCTGCATCTAATATTTTTACTGGTGCTCTTCAGGCGATGGAACATTTCACTGTT CCTGCCATGATTGGTATACCTTACAATATTATTGTAATAACAGTAGCAATTTTATATGGGGGCAAATTTGGAATTACTGC AGTAGCTTATTCTACAATTATCGCCACTTTTATACAAACATTAGTTCATTTGCCTGTTTTATATAAATTAGGTTACAGAT TCAAGTTGAGAGTGAATTTTAAAGATGAAGGAGTAAAAAGAGTCATTTTATTAGCAATGCCTGTGCTTGTGGGGACAGGG GTGCAGACTATAAATGTTTATGTGGATAGAGTGATAGCTTCTTTTTTGCCTGACGGAAGTATTGCGGCATTGAGTTATGC CAATAGGCTTAAGACGTTTGCATTAGGTGTTTTTTCAACATCAATTGCAACTGCTATATATCCTGTTTTATCGCAACATT CAGTAGCAGACGACAAAGAAGGTTTTCTAAAAAGTTTAAATTTTGTAGTAAGTGGTATTTTATATGTATTAATACCTGTA TCAGTTGGTGCAATGGTACTCCGAGTGCCTATAATAAAAGTATTATTTGAAAGAGGAGCTTTTGATGAGAAGTCCACATA TCTTACCTCAATCGCCCTTTTTTATTATGCCATAGGAATGACTGCGTATGGCCTTAGAGATGTCTTAAGTAGAAGTTTTT ACTCTATGAAAGACACAAAAACTCCCATGATAAATGGTGCCATGGCTGTATTATTAAATATTGCACTTAATTTAATTTTG GTAAGATATTTAAAATTAGGAGGACTTGCTCTTTCTACTTCTATTGCAGCCATATTTGCTACTTTTCTTTTATTTACTTC TTTAAAAAGAAAACTTGGTAAAATAGGCGGGAAATACATGTTTATGAGTTTTATAAGGGCAATGTTTGCATCAGTTGTAA TGGGGGTTGTAGTGCATTTTGTGTATAATAATATGATTATTAAGATGCCGTCAGATAAAAGAATTTATGAGGTTATAGTC TTGTTTATGACCATATTAATTGGAACTATAATTTACTCTGCCATTGTATTAATCACTGACAAATCTGCCCTCTCTTATTT TAAAAAAGGCATAAAATTTGTAAATTCTAAACTTGTAAGAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GCTTGTTAAAGCTAAAGGTGTTGCAAAAGTTGGAGATGAAGTTGCAGCTACTGCAGAGCTTATGTTTATAATGACTGAAG AAGGATAGGAGGCTTAATAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTAAAAATGAGGTGATATCATGAAATCAAAGGTATATTTTTACAATCTGAGAGCGAATAAAGCCAGCAGTAGTTTGTCT TCCAAAGTAGCGAGAATTTT
Product: integral membrane protein MviN
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 521; Mature: 520
Protein sequence:
>521_residues MSTAKKAVKAASVIMIITLLSKVSGFLREITFAAKFGTSVSMDAYNIATVIPMTLFVAVTAAIATTVVPIFTEYFQKEGK QKAFDFINNLLGVVLVATVILTFLGFTFAPYLVKFVAPAFTGEKFELTVKITTILLPTMVLIAASNIFTGALQAMEHFTV PAMIGIPYNIIVITVAILYGGKFGITAVAYSTIIATFIQTLVHLPVLYKLGYRFKLRVNFKDEGVKRVILLAMPVLVGTG VQTINVYVDRVIASFLPDGSIAALSYANRLKTFALGVFSTSIATAIYPVLSQHSVADDKEGFLKSLNFVVSGILYVLIPV SVGAMVLRVPIIKVLFERGAFDEKSTYLTSIALFYYAIGMTAYGLRDVLSRSFYSMKDTKTPMINGAMAVLLNIALNLIL VRYLKLGGLALSTSIAAIFATFLLFTSLKRKLGKIGGKYMFMSFIRAMFASVVMGVVVHFVYNNMIIKMPSDKRIYEVIV LFMTILIGTIIYSAIVLITDKSALSYFKKGIKFVNSKLVRN
Sequences:
>Translated_521_residues MSTAKKAVKAASVIMIITLLSKVSGFLREITFAAKFGTSVSMDAYNIATVIPMTLFVAVTAAIATTVVPIFTEYFQKEGK QKAFDFINNLLGVVLVATVILTFLGFTFAPYLVKFVAPAFTGEKFELTVKITTILLPTMVLIAASNIFTGALQAMEHFTV PAMIGIPYNIIVITVAILYGGKFGITAVAYSTIIATFIQTLVHLPVLYKLGYRFKLRVNFKDEGVKRVILLAMPVLVGTG VQTINVYVDRVIASFLPDGSIAALSYANRLKTFALGVFSTSIATAIYPVLSQHSVADDKEGFLKSLNFVVSGILYVLIPV SVGAMVLRVPIIKVLFERGAFDEKSTYLTSIALFYYAIGMTAYGLRDVLSRSFYSMKDTKTPMINGAMAVLLNIALNLIL VRYLKLGGLALSTSIAAIFATFLLFTSLKRKLGKIGGKYMFMSFIRAMFASVVMGVVVHFVYNNMIIKMPSDKRIYEVIV LFMTILIGTIIYSAIVLITDKSALSYFKKGIKFVNSKLVRN >Mature_520_residues STAKKAVKAASVIMIITLLSKVSGFLREITFAAKFGTSVSMDAYNIATVIPMTLFVAVTAAIATTVVPIFTEYFQKEGKQ KAFDFINNLLGVVLVATVILTFLGFTFAPYLVKFVAPAFTGEKFELTVKITTILLPTMVLIAASNIFTGALQAMEHFTVP AMIGIPYNIIVITVAILYGGKFGITAVAYSTIIATFIQTLVHLPVLYKLGYRFKLRVNFKDEGVKRVILLAMPVLVGTGV QTINVYVDRVIASFLPDGSIAALSYANRLKTFALGVFSTSIATAIYPVLSQHSVADDKEGFLKSLNFVVSGILYVLIPVS VGAMVLRVPIIKVLFERGAFDEKSTYLTSIALFYYAIGMTAYGLRDVLSRSFYSMKDTKTPMINGAMAVLLNIALNLILV RYLKLGGLALSTSIAAIFATFLLFTSLKRKLGKIGGKYMFMSFIRAMFASVVMGVVVHFVYNNMIIKMPSDKRIYEVIVL FMTILIGTIIYSAIVLITDKSALSYFKKGIKFVNSKLVRN
Specific function: Unknown
COG id: COG0728
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mviN family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=429, Percent_Identity=28.6713286713287, Blast_Score=187, Evalue=2e-48,
Paralogues:
None
Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004268 [H]
Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 57046; Mature: 56915
Theoretical pI: Translated: 10.42; Mature: 10.42
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 3.8 %Met (Translated Protein) 3.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 3.7 %Met (Mature Protein) 3.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSTAKKAVKAASVIMIITLLSKVSGFLREITFAAKFGTSVSMDAYNIATVIPMTLFVAVT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH AAIATTVVPIFTEYFQKEGKQKAFDFINNLLGVVLVATVILTFLGFTFAPYLVKFVAPAF HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC TGEKFELTVKITTILLPTMVLIAASNIFTGALQAMEHFTVPAMIGIPYNIIVITVAILYG CCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHC GKFGITAVAYSTIIATFIQTLVHLPVLYKLGYRFKLRVNFKDEGVKRVILLAMPVLVGTG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC VQTINVYVDRVIASFLPDGSIAALSYANRLKTFALGVFSTSIATAIYPVLSQHSVADDKE HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH GFLKSLNFVVSGILYVLIPVSVGAMVLRVPIIKVLFERGAFDEKSTYLTSIALFYYAIGM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH TAYGLRDVLSRSFYSMKDTKTPMINGAMAVLLNIALNLILVRYLKLGGLALSTSIAAIFA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH TFLLFTSLKRKLGKIGGKYMFMSFIRAMFASVVMGVVVHFVYNNMIIKMPSDKRIYEVIV HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHH LFMTILIGTIIYSAIVLITDKSALSYFKKGIKFVNSKLVRN HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure STAKKAVKAASVIMIITLLSKVSGFLREITFAAKFGTSVSMDAYNIATVIPMTLFVAVT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH AAIATTVVPIFTEYFQKEGKQKAFDFINNLLGVVLVATVILTFLGFTFAPYLVKFVAPAF HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC TGEKFELTVKITTILLPTMVLIAASNIFTGALQAMEHFTVPAMIGIPYNIIVITVAILYG CCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHC GKFGITAVAYSTIIATFIQTLVHLPVLYKLGYRFKLRVNFKDEGVKRVILLAMPVLVGTG CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC VQTINVYVDRVIASFLPDGSIAALSYANRLKTFALGVFSTSIATAIYPVLSQHSVADDKE HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH GFLKSLNFVVSGILYVLIPVSVGAMVLRVPIIKVLFERGAFDEKSTYLTSIALFYYAIGM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH TAYGLRDVLSRSFYSMKDTKTPMINGAMAVLLNIALNLILVRYLKLGGLALSTSIAAIFA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH TFLLFTSLKRKLGKIGGKYMFMSFIRAMFASVVMGVVVHFVYNNMIIKMPSDKRIYEVIV HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCHHHHHHHH LFMTILIGTIIYSAIVLITDKSALSYFKKGIKFVNSKLVRN HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8200538; 11677609 [H]