Definition | Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_009997 |
Length | 5,347,283 |
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The map label for this gene is 160876961
Identifier: 160876961
GI number: 160876961
Start: 4540671
End: 4544345
Strand: Reverse
Name: 160876961
Synonym: Sbal195_3857
Alternate gene names: NA
Gene position: 4544345-4540671 (Counterclockwise)
Preceding gene: 160876962
Following gene: 160876960
Centisome position: 84.98
GC content: 50.78
Gene sequence:
>3675_bases ATGGCAAGCTTGATTCGTATTGTGCTGATTGATACGCACCTTCCGGGCGTTGTGGAACTCGCCCTCAATGGCCATACCAA CATTTGTGGTACTAACGCCTCAGGTAAGACGACATTACAACGTCTAGTCCCTGTTTTTTATGGCGAATACCCAAGCCGCG TGGTGCCTTCGACCCGCGACAGTTTCGAGCGTTGGTATTTGCCACACGATTCAAGCTACATCATTTACGAATATCAAAAA GCCGATGGCTTACTGTATCAAGCCGTGCTGGCCTCGGCGGGCGATGGCAAGGGCGTTAATTATCGCTTTATCGCCAAAGG TTTTGAGCTAAGCGATTATATTAAATCGCAAAATGGCGACACTATTCTGTGCCACACCATGGCGGAATTAGGCCGTGATT TAAAACGTGCCGGCATCGCCACCACTAACTTGCTTAACACCCGCGAATATCGCGCCATTATTCAAAACGATCGCACCCTA TTAAGCACGGGCAGCAACCGCAGCGAACTACGCGGCTATGCCCGCCAATTTGCCCTGTGTGAGGGCGAGCATTCCCTGCG CCACATCGAAAAGCTCGCCAAAGCGGTGCACTCCAAAGAAGGTAAGATGGAGACGGTCAAATCCATGATCGCCGCCATTT TAGAGGAAGACGGGGTTAATCCGCCCAGCTCACGCTTAAACCCACAGCGCGTTGAAGCGTGGATCCGTGAAAGCCAACTT ATCCAAGGGTTTGAAGTCATTCGCCCTGAGTTTGAAAAACTCGAGCAAGAATTTAACCAATTGCTCAGCGCCGAACTGCG CTTATCAAGCTTGTCCCGCGGTTATCGCAACGATGAAACCTTAGAAGCCGATCGCCAAGATATTCAGCAAACCTTATCTA AAGAGCTGAATTTAAAACTCAGATTGCTCGACGATGAATGGAAAGAGCAGCGCGATGAGCTCAACCTCGATTTATCGGCC GCCAAGGGCGATGTGGCAAAGTGCGAGTATGAACTCGATGCCATTGAAGATCAGCACAGCGCCTTTTTAGATGCCAACAT AGAGCAAGCTAAGGCCGATCTTGAGATGCTGCCAAACTGGCGCACCGATGTTGAAAACTTAAGTGAACGCCATAAGCTGC AAACCGAGAAGCACCAAGATATCGAGGCGGCCTACAATGCCCGTCGCAGTAAGATTGGTGAGCAGTTAAACCGCGAGCTA GAAGGTTTGCATGCCGACCAAGACAAGCAGCGCGAAGCCCGCGATAAGCAACGCGAAGTGGCGCGCACCGATATCGACGC CTTAGAGCTGCAATGGCGCAACCAAATGGATGCGGGCAAGGCCAGCTTTAGCGAGCAGGAATACCAATTTAAACTCACTG CCGCCGAGCTTAAATTACGTGTCGATGGTGTGACTTACACCGAAGAAGAAAAGCTGAGCCTAGCAATTTTCGACGAACGT ATTCACCGTGCCGACGAAGAACAAGAAAGCTGCAATGCCAAGGTCGAACGCTTAAGCAGCGATGAACGCAAGCTCAGAGC CAAACGCGACCAAGCCAACGAAGCCTTGCGTATCGCCACCTTAAGGGTAAACGAGCGTCAAACTGCGCTGGATGAACTGC ACCACATGCTGTTCCCGCAATCCCACACCCTATTGGAGTTTCTGCGTAAGGAAGCCCAAGGTTGGGAGCAAAGTTTAGGT AAAGTGATCGCGCCTGAACTACTGCATCGCACTGATTTACATCCCAGTTTAGTAAGTGAGTCGAGCGAAGCTTTCTTTGG CGTACATTTAGATCTTAAGGCGATCGATGTGCCTGAATATGCCGCCTCTGAGCAAGAGCTGCGGATTCGGTTAAGTAAAG CCGAAGAAGCCCACACTAGCGCCCAAGAAATGCAGGCCGAGGCCGAATCTCAGCTAGTGGCCATTAATGGCGAGCTGGAT AATCTCAGCCGTGAACTTACTTTTGCCCGCACAGCGTATAAAAATAGCCGTGACGATCTGCGTCGCCTGTTCGATGAAAA ACGCAGTGAGCAAGATAAAATCAACAAAGCATTGAGCGAGCGCAAAGCCCAAGCGGGACAAAGACTGACACAGCTGGATG GCGAGCTAAAACAGCTTAAACATCAGCACGAACTCTGGCTCGAAGAGCAAAAAGAGCAAGCGCTCGAAGCGCGCATGGAA AAACAAGCCTATTGGCAGGAAGTGATCGGCGCGCTCGACAATCAACTCGGCCAAATTAAAGCGACCATTGAAGGCCGCCG TGAAAGCGCCAAAATCGAGCTGAAAGCCTGCGAGACCTGGTACAAAAACGAGCTTAAATCCCGCGGTGTGGACGAGGAGA ATATCCTCAAACTCAAGCAACAGATCCGCGAGTTAGAAACCAAAATTAGCCGCGCTGAGCAGCGTCGTAGTGACGTACTG CGTTTCGATGATTGGTATCAACACACTTGGCTGATGCGTAAACCTAAACTGCAAACTCAGCTTGCAGATGTGAAGCGCGC GGTCTCGGAAATCGATCAACAGCTTAAGGCGAAAACCTTAGATGTGAAGACTCGCCGTCAGCAACTCGAAACCGAGCGTA AAGCGTCCGATGCGGCGCAGGTGGAAGCCTCTGAAAACTTAACGAAGTTACGTGCAGTAATGCGTAAACTCGCCGAGCTT AAGTTGCCGACCAATAACGAAGAAGCCCAAGGCAGCCTAGGCGAGCGTCTGCGCCAAGGCGAAGACTTGCTGCTGAAACG CGATTATTTGATGGGTTCAGTGAAGCAATATGTAGAGCATTTCGACTCAGTGATCGCCAGCAAGTCAGGTTCGGGCCTTG CCGAAACCTGGGAGCGTGCCCGTGAAGAATCGAGCTTTATCAACGACAAAGGTATTCGTCTGCTGGATTACCGCAAGTTA GTGCCACAGCTTGAGCAATTGTTGAACGTGATAGTGCCGCAATCTATTACTGCGTTGCGTGAGCAAGGACGAATTTTCGG CGTCGACTTAACTGCCTTCTATGATGTATTAGCCGATATCGACCGCCGCATCGCCTCCCAAAGTGCGCGTATTACCCGCG AAGTGGGTGAAGAGTTATTCCTTGAGGGCGTGTCTGAATCGGCGGTACGTATTCGTTCGCGCATCAGCGAGTTAGAGTTC TGGCCTGAGCTTGAACAGTTCGTCAAAGCCTTTAAACATTGGAAAGCCGATGGCTTTAATGGCTTGCCCGATGAGGATTA CACCAACAGTATGCGCCGGGCCTTAGACATTATCGGCCGCGCCGCGTTAACGGGGGGCATCTCTAAGTTGCTGGAAATCG AGCTGCGCCTTAAAGAAGGTAACAGCGACTTAATTATCCGCACCGACAGACAGCTTAACGAATCCTCAAGCCACGGTATG GCGTATCTGATTTTGTGTAAGTTCTTGCTGGCATTCACGCGCTTGCTGCGTGGCCGCGCCGATGTGACCATTCACTGGCC AATCGATGAGTTGGGCACTTTGCACCATACCAACGTGAAGAAGATTTTCGATGCCTGCGAAAACAACAATATTTGTGTGC TGGGCGCCTTCCCGAACCCAGAGTCCGAGGTGCTGAACTTGTTCGCCAACCGTTACATTATCAACAAACAAACCAAGAAG TTGCAGGTGGTTAAGCCTAAAGTGAACCCAATCGCCGACATGTTGAATAAGCGTTTGTCGAAGGAGGCCATCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GCTTTTTTAAGGTCTGTGGCCCTCTTGGATTGTTTTCTCTTTGTCCTGTAGAAGGCTTCTGCAGCTTAGATAAGACGCTC CCGTTTGCATAAGGAATGAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAGTGATGCAACCCAAACCGTATTAGTTGGCACTGGCGCTTTGATTGAGCTGTTACTCAAGGGCGAGTTTATTTGCCGC ACCACCAATGAAGAAGGCTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 1224; Mature: 1223
Protein sequence:
>1224_residues MASLIRIVLIDTHLPGVVELALNGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRDSFERWYLPHDSSYIIYEYQK ADGLLYQAVLASAGDGKGVNYRFIAKGFELSDYIKSQNGDTILCHTMAELGRDLKRAGIATTNLLNTREYRAIIQNDRTL LSTGSNRSELRGYARQFALCEGEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETVKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQL IQGFEVIRPEFEKLEQEFNQLLSAELRLSSLSRGYRNDETLEADRQDIQQTLSKELNLKLRLLDDEWKEQRDELNLDLSA AKGDVAKCEYELDAIEDQHSAFLDANIEQAKADLEMLPNWRTDVENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEQLNREL EGLHADQDKQREARDKQREVARTDIDALELQWRNQMDAGKASFSEQEYQFKLTAAELKLRVDGVTYTEEEKLSLAIFDER IHRADEEQESCNAKVERLSSDERKLRAKRDQANEALRIATLRVNERQTALDELHHMLFPQSHTLLEFLRKEAQGWEQSLG KVIAPELLHRTDLHPSLVSESSEAFFGVHLDLKAIDVPEYAASEQELRIRLSKAEEAHTSAQEMQAEAESQLVAINGELD NLSRELTFARTAYKNSRDDLRRLFDEKRSEQDKINKALSERKAQAGQRLTQLDGELKQLKHQHELWLEEQKEQALEARME KQAYWQEVIGALDNQLGQIKATIEGRRESAKIELKACETWYKNELKSRGVDEENILKLKQQIRELETKISRAEQRRSDVL RFDDWYQHTWLMRKPKLQTQLADVKRAVSEIDQQLKAKTLDVKTRRQQLETERKASDAAQVEASENLTKLRAVMRKLAEL KLPTNNEEAQGSLGERLRQGEDLLLKRDYLMGSVKQYVEHFDSVIASKSGSGLAETWERAREESSFINDKGIRLLDYRKL VPQLEQLLNVIVPQSITALREQGRIFGVDLTAFYDVLADIDRRIASQSARITREVGEELFLEGVSESAVRIRSRISELEF WPELEQFVKAFKHWKADGFNGLPDEDYTNSMRRALDIIGRAALTGGISKLLEIELRLKEGNSDLIIRTDRQLNESSSHGM AYLILCKFLLAFTRLLRGRADVTIHWPIDELGTLHHTNVKKIFDACENNNICVLGAFPNPESEVLNLFANRYIINKQTKK LQVVKPKVNPIADMLNKRLSKEAI
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 140523; Mature: 140391
Theoretical pI: Translated: 5.97; Mature: 5.97
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.7 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 2.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.7 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 1.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MASLIRIVLIDTHLPGVVELALNGHTNICGTNASGKTTLQRLVPVFYGEYPSRVVPSTRD CCCCEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHH SFERWYLPHDSSYIIYEYQKADGLLYQAVLASAGDGKGVNYRFIAKGFELSDYIKSQNGD HHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCCC TILCHTMAELGRDLKRAGIATTNLLNTREYRAIIQNDRTLLSTGSNRSELRGYARQFALC EEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHC EGEHSLRHIEKLAKAVHSKEGKMETVKSMIAAILEEDGVNPPSSRLNPQRVEAWIRESQL CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH IQGFEVIRPEFEKLEQEFNQLLSAELRLSSLSRGYRNDETLEADRQDIQQTLSKELNLKL HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEE RLLDDEWKEQRDELNLDLSAAKGDVAKCEYELDAIEDQHSAFLDANIEQAKADLEMLPNW EEECHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCC RTDVENLSERHKLQTEKHQDIEAAYNARRSKIGEQLNRELEGLHADQDKQREARDKQREV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHH ARTDIDALELQWRNQMDAGKASFSEQEYQFKLTAAELKLRVDGVTYTEEEKLSLAIFDER 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PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA