Definition Shewanella baltica OS195 chromosome, complete genome.
Accession NC_009997
Length 5,347,283

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The map label for this gene is cadC [C]

Identifier: 160874661

GI number: 160874661

Start: 1859916

End: 1863185

Strand: Reverse

Name: cadC [C]

Synonym: Sbal195_1544

Alternate gene names: 160874661

Gene position: 1863185-1859916 (Counterclockwise)

Preceding gene: 160874662

Following gene: 160874660

Centisome position: 34.84

GC content: 47.0

Gene sequence:

>3270_bases
ATGGACATCGTTATGAGTGACAGCACATTTTTCTTTGGTGAATGGCAAATCAATCCCAGCGCCAATAGTCTGCTCCTTGG
CAAACAAGTCAAACAACTTGAGCCCAAGGCGATGGATGTGCTGCTGTTTCTCTGCCAACGGGCGGGCGAAGTCGTCAGCA
GTGATGAAATAGTCAGCCACTGCTGGCCGGGTGTTGATACTGGCGACAACCCACTACATAAAATTATCAATCAGTTACGT
AGAGCATTAGGCGATAGCGCCACCGATCCCACCTATATAGAAACCATACGCAAACGCGGCTATCGCACCTTAGCCGAAGT
GCGTTTTCCTATCGGCCACGAAGCCACCGCCAGCCCGCAAAGTTGGCAAGGCGGCTCGCCCTTTCCGGGTCTGCAAGCCT
ATAACGCTAACTATGCCGAGGTGTTTTTTGGTCGCAGTGAACAAATCAGCACTTTGCTTAACCGTATCAGCCAGCAAATC
ATCTATGGTCGTGCCTTCTGTCTGGTTTTAGGCCCAAGTGGCAGCGGTAAATCCTCCCTGATAAATGCCGGTGTTGTGCC
CAATTTAATGAAGGGCGGCGGCTATAACGGCATTGGTGTCGCGTCATTCAGCAGCTTAGATTTTGCCGATGTGAGTAAAG
GGCAACTGTTAACCGATCTTGCCAGCGCTATGCTCGACTGGGAAATCAACGACACGCCAGTGTTCGAAGGCATGAGTGCC
GATACTCTGGCGGTTCAACTCATCGAAGATATCCAAGGCGTAATCAACCAGTGCACCCAAGCGCTCAAGGCTAAACCCTT
TTCCAATCCGTTTTTTGCCTTGTTTATCGACCGATTAGAAGTGTTGCTCTCATCACCGCTATTTAGCGATACCGAACGAA
CTCAGTTCATAGAATTATTGGAACAACTCGCCACCTCTAAGGCCGTGATTATTATCAGTGCCTGTCGCAACGATTTTTAT
CCTTTACTTGTGGGCTACCCAAGCTTAATGGCCGGTAAATCTCGCGGCGCCCACTTTGACTTAGCGCCGCCGACACGCAC
TGAACTGTTGCAAATGATCCGCCTGCCCGCGGTGGCCGCCAACTTAAGCTGGGAAGTTGACAGCGAAACCGCAATGCCGC
TCGATGAAATGCTCTGCAGCGACGCCGCCAGTAACCCAGATGCACTGCCCATGTTGCAATACACGCTGCAGGCCTTGTAT
TTGCAGCGCAGCGCCGACGATAAGTTATTAGTCTCGGTTTATCATGCCCTTGGCGGTATTGAAGGGGCGATTGGTAAAAA
TGCCGAGCAAGCGATTTCCCATTTAAGCGATGCCGAAAAAGCCAGTCTGCCACGGATTTTATCCCTGCTAGTCACCCTGC
GCGAAGATGAAAAGTCCATCACCAGCCGCACCGCCCGCTGGTCGCAGCTGCAAAGCACCGCCGAAACCGCCCTAGTGCAA
GCCATGGTCGATAGCCGCTTATTCGTGTCGCATCTGCAAAATGGTGAACCCTGTTTTAGCATCGCCCACGAAGCCCTGCT
GCGCCGTTGGCCACGGGCGACGGCTTGGATTAGCGAACATAGCGACAGTTTGAGCATTAAGAGTCGCCTGCAGCATCTTT
CAACACGCTGGCTCAGCGAAGCCAAACACAGCGCCTATCTACTCGCTGAAGGTAAACCTTTAAAAGAAGCCCAAAGCCTC
AGCCAAAATCCGTTATTCGATTTAGACGATCCCGAAACCGCCTTTATCGCAGCCTCCACCAAACGCGCCAATATGTTGCG
CTGGACGAGGCGTTTAACCGTTACCCTGTTATGCGTCCTCACCCTCACCTCCATTATCATGAGTGTGCGCAGCATAGAAG
CTGAAAAACTCGCCCTGCAAAAACGCCTCGCCGCCGAAGATTTGCTCGGTTTCATGGTGGGCGACTTCGCCGACAAGATG
CGCGGCATCGGCCGAATGGACTTACTCGACGGGATCAGCAATAAAGCACTGGAATATTTCAGTGATTTTTCCAATAAAGA
GGATGATGCACACTTAAGCTTCGACGCCCGCTTCCAACACGGCCAAACCTTAGAGGCCATGGGCGAAGTGGCATATTCGC
GCAATAAAATCGATGAAGCTCGCAGCGCATTACTCGCGGCGCAAGAAAAAATGCTGCCACTTTTGAGTTTACAGCCGGAA
AACTTAGCCCTACTAAAAACTCTAGGTGCCAATGCCTTTTGGTTAGGACAGCTTAAGTATGATGTGAGTGATTGGGCAGC
ATCACGTCCCTACTTCGAGCAATACTTAAAATACAGCCAAACGATGTACGCCCTTGCGCCCGAAGATAAAGATGCACTTA
TGGAGCTGTCATACGCCCACAATACTTTGGGCTCTGTGTCTATGAAGCAGCAGGAATTTGCCAAAGCGCAGCAAGATTTT
GAGGAATCATTAAGGCTTAAATTGCTCGCCTTAGCGAAAGCCCCCGAGGATAGCCAGTTGATTGCCGATGTGGCCGATAC
CCGATCTTGGTTAGCCAGCGCTGCGGTTTCTCTTGGAGATTTAAGTTACGCCGTACAAGCCCATCAAGAAATCCAACAAC
AGCTTGAAAGTCAAAATTTAGAAAAACAACCTTATTTATTAGATAGGCTCGCAGGGAGCTATCAGAATTTAGCAACTCTA
CTAGCATATCAAGGGCATTTTTCTCAAGCATCGTCAAAAGCAGAATCTGGACTAGCTATTATTATCGATGTTCTAAAACA
GGATCCAGAAAATGAAAAGTGGAAGAGACTTAAATTTTATTCATCATTTCAATCAATTGAACTTTCAACTAGTACAGCAG
CACCTAACGCACAGGATAGGCTAATAAAGGTAAAATATGAACTTGATTCCGATGAAAAATTTAAGCTGTCACCAAAATAT
CAAGAAACTCTTGCAAAGTATTATTACACTCAAGCAAAATCATTTTTTGAGACGAAGAATTACAAAAACGGCACAATCAA
CATTAAACTCGCAGTCAAGTTGTACTACGACTTATCAAAATCATTTAAGCAGAATTATATATATTATTCAGATTTGAGTA
TTGCAGAGCTTTTATATGCCTCATACCTAAAGAAATCTAAAAACTCTGACGCTGTTATAGAATTATGCAAAAATACTAAA
GAAAGACTTCAGCCTTTAGTTGAAAAAGATAAAGACCCTAGATTTACAGTTCCTTACATAAGAGCATTAGATTGTCTAGG
TGAACTGAGTGATGAGAAAGAACTTGCTAACTTATTAAAGTTAGCAGGGGTTAGTGATATTAATTTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAACAGCCCAGCACTTACAATAAAAAATAACAAAAATATAACTATAAGAGTGGTAACTAACGGTACGTTTTCCCACAGTA
CGCTAGCCAATACTCAATAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACAATAGGAGATAAAAATGAACGTTCCACAAGGATCTGCACAGTTTGTAAAAGTGAATGTCACCCTTGAAAATGGTGAA
CCTGTTTTTATTTATACCGA

Product: transcriptional regulator CadC

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1089; Mature: 1089

Protein sequence:

>1089_residues
MDIVMSDSTFFFGEWQINPSANSLLLGKQVKQLEPKAMDVLLFLCQRAGEVVSSDEIVSHCWPGVDTGDNPLHKIINQLR
RALGDSATDPTYIETIRKRGYRTLAEVRFPIGHEATASPQSWQGGSPFPGLQAYNANYAEVFFGRSEQISTLLNRISQQI
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DTLAVQLIEDIQGVINQCTQALKAKPFSNPFFALFIDRLEVLLSSPLFSDTERTQFIELLEQLATSKAVIIISACRNDFY
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LQRSADDKLLVSVYHALGGIEGAIGKNAEQAISHLSDAEKASLPRILSLLVTLREDEKSITSRTARWSQLQSTAETALVQ
AMVDSRLFVSHLQNGEPCFSIAHEALLRRWPRATAWISEHSDSLSIKSRLQHLSTRWLSEAKHSAYLLAEGKPLKEAQSL
SQNPLFDLDDPETAFIAASTKRANMLRWTRRLTVTLLCVLTLTSIIMSVRSIEAEKLALQKRLAAEDLLGFMVGDFADKM
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NLALLKTLGANAFWLGQLKYDVSDWAASRPYFEQYLKYSQTMYALAPEDKDALMELSYAHNTLGSVSMKQQEFAKAQQDF
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LAYQGHFSQASSKAESGLAIIIDVLKQDPENEKWKRLKFYSSFQSIELSTSTAAPNAQDRLIKVKYELDSDEKFKLSPKY
QETLAKYYYTQAKSFFETKNYKNGTINIKLAVKLYYDLSKSFKQNYIYYSDLSIAELLYASYLKKSKNSDAVIELCKNTK
ERLQPLVEKDKDPRFTVPYIRALDCLGELSDEKELANLLKLAGVSDINF

Sequences:

>Translated_1089_residues
MDIVMSDSTFFFGEWQINPSANSLLLGKQVKQLEPKAMDVLLFLCQRAGEVVSSDEIVSHCWPGVDTGDNPLHKIINQLR
RALGDSATDPTYIETIRKRGYRTLAEVRFPIGHEATASPQSWQGGSPFPGLQAYNANYAEVFFGRSEQISTLLNRISQQI
IYGRAFCLVLGPSGSGKSSLINAGVVPNLMKGGGYNGIGVASFSSLDFADVSKGQLLTDLASAMLDWEINDTPVFEGMSA
DTLAVQLIEDIQGVINQCTQALKAKPFSNPFFALFIDRLEVLLSSPLFSDTERTQFIELLEQLATSKAVIIISACRNDFY
PLLVGYPSLMAGKSRGAHFDLAPPTRTELLQMIRLPAVAANLSWEVDSETAMPLDEMLCSDAASNPDALPMLQYTLQALY
LQRSADDKLLVSVYHALGGIEGAIGKNAEQAISHLSDAEKASLPRILSLLVTLREDEKSITSRTARWSQLQSTAETALVQ
AMVDSRLFVSHLQNGEPCFSIAHEALLRRWPRATAWISEHSDSLSIKSRLQHLSTRWLSEAKHSAYLLAEGKPLKEAQSL
SQNPLFDLDDPETAFIAASTKRANMLRWTRRLTVTLLCVLTLTSIIMSVRSIEAEKLALQKRLAAEDLLGFMVGDFADKM
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NLALLKTLGANAFWLGQLKYDVSDWAASRPYFEQYLKYSQTMYALAPEDKDALMELSYAHNTLGSVSMKQQEFAKAQQDF
EESLRLKLLALAKAPEDSQLIADVADTRSWLASAAVSLGDLSYAVQAHQEIQQQLESQNLEKQPYLLDRLAGSYQNLATL
LAYQGHFSQASSKAESGLAIIIDVLKQDPENEKWKRLKFYSSFQSIELSTSTAAPNAQDRLIKVKYELDSDEKFKLSPKY
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ERLQPLVEKDKDPRFTVPYIRALDCLGELSDEKELANLLKLAGVSDINF
>Mature_1089_residues
MDIVMSDSTFFFGEWQINPSANSLLLGKQVKQLEPKAMDVLLFLCQRAGEVVSSDEIVSHCWPGVDTGDNPLHKIINQLR
RALGDSATDPTYIETIRKRGYRTLAEVRFPIGHEATASPQSWQGGSPFPGLQAYNANYAEVFFGRSEQISTLLNRISQQI
IYGRAFCLVLGPSGSGKSSLINAGVVPNLMKGGGYNGIGVASFSSLDFADVSKGQLLTDLASAMLDWEINDTPVFEGMSA
DTLAVQLIEDIQGVINQCTQALKAKPFSNPFFALFIDRLEVLLSSPLFSDTERTQFIELLEQLATSKAVIIISACRNDFY
PLLVGYPSLMAGKSRGAHFDLAPPTRTELLQMIRLPAVAANLSWEVDSETAMPLDEMLCSDAASNPDALPMLQYTLQALY
LQRSADDKLLVSVYHALGGIEGAIGKNAEQAISHLSDAEKASLPRILSLLVTLREDEKSITSRTARWSQLQSTAETALVQ
AMVDSRLFVSHLQNGEPCFSIAHEALLRRWPRATAWISEHSDSLSIKSRLQHLSTRWLSEAKHSAYLLAEGKPLKEAQSL
SQNPLFDLDDPETAFIAASTKRANMLRWTRRLTVTLLCVLTLTSIIMSVRSIEAEKLALQKRLAAEDLLGFMVGDFADKM
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LAYQGHFSQASSKAESGLAIIIDVLKQDPENEKWKRLKFYSSFQSIELSTSTAAPNAQDRLIKVKYELDSDEKFKLSPKY
QETLAKYYYTQAKSFFETKNYKNGTINIKLAVKLYYDLSKSFKQNYIYYSDLSIAELLYASYLKKSKNSDAVIELCKNTK
ERLQPLVEKDKDPRFTVPYIRALDCLGELSDEKELANLLKLAGVSDINF

Specific function: Required For Pcad Induction, A Promoter Upstream Of Cadb That Is Responsible For The Ph-Regulated Expression Of Cada. [C]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 13 WD repeats [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790576, Length=104, Percent_Identity=34.6153846153846, Blast_Score=76, Evalue=1e-14,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR020472
- InterPro:   IPR011600
- InterPro:   IPR015943
- InterPro:   IPR001680
- InterPro:   IPR011046
- InterPro:   IPR019782
- InterPro:   IPR019775
- InterPro:   IPR017986
- InterPro:   IPR019781 [H]

Pfam domain/function: PF00656 Peptidase_C14; PF00400 WD40 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 121325; Mature: 121325

Theoretical pI: Translated: 5.28; Mature: 5.28

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDIVMSDSTFFFGEWQINPSANSLLLGKQVKQLEPKAMDVLLFLCQRAGEVVSSDEIVSH
CCEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
CWPGVDTGDNPLHKIINQLRRALGDSATDPTYIETIRKRGYRTLAEVRFPIGHEATASPQ
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
SWQGGSPFPGLQAYNANYAEVFFGRSEQISTLLNRISQQIIYGRAFCLVLGPSGSGKSSL
CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCHHHH
INAGVVPNLMKGGGYNGIGVASFSSLDFADVSKGQLLTDLASAMLDWEINDTPVFEGMSA
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DTLAVQLIEDIQGVINQCTQALKAKPFSNPFFALFIDRLEVLLSSPLFSDTERTQFIELL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHH
EQLATSKAVIIISACRNDFYPLLVGYPSLMAGKSRGAHFDLAPPTRTELLQMIRLPAVAA
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NLSWEVDSETAMPLDEMLCSDAASNPDALPMLQYTLQALYLQRSADDKLLVSVYHALGGI
CCCEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCC
EGAIGKNAEQAISHLSDAEKASLPRILSLLVTLREDEKSITSRTARWSQLQSTAETALVQ
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AMVDSRLFVSHLQNGEPCFSIAHEALLRRWPRATAWISEHSDSLSIKSRLQHLSTRWLSE
HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKHSAYLLAEGKPLKEAQSLSQNPLFDLDDPETAFIAASTKRANMLRWTRRLTVTLLCVL
HCCCEEEEECCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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NLALLKTLGANAFWLGQLKYDVSDWAASRPYFEQYLKYSQTMYALAPEDKDALMELSYAH
CHHHHHHCCCCEEEEEEEEECHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHH
NTLGSVSMKQQEFAKAQQDFEESLRLKLLALAKAPEDSQLIADVADTRSWLASAAVSLGD
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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QETLAKYYYTQAKSFFETKNYKNGTINIKLAVKLYYDLSKSFKQNYIYYSDLSIAELLYA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHCEEEECCCHHHHHHHH
SYLKKSKNSDAVIELCKNTKERLQPLVEKDKDPRFTVPYIRALDCLGELSDEKELANLLK
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
LAGVSDINF
HCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
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CCEEECCCEEEEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
CWPGVDTGDNPLHKIINQLRRALGDSATDPTYIETIRKRGYRTLAEVRFPIGHEATASPQ
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
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CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEECCCCCCHHHH
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EECCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCH
DTLAVQLIEDIQGVINQCTQALKAKPFSNPFFALFIDRLEVLLSSPLFSDTERTQFIELL
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HHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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SDFSNKEDDAHLSFDARFQHGQTLEAMGEVAYSRNKIDEARSALLAAQEKMLPLLSLQPE
HHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCC
NLALLKTLGANAFWLGQLKYDVSDWAASRPYFEQYLKYSQTMYALAPEDKDALMELSYAH
CHHHHHHCCCCEEEEEEEEECHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHEEEECCCCHHHHHHHHHHH
NTLGSVSMKQQEFAKAQQDFEESLRLKLLALAKAPEDSQLIADVADTRSWLASAAVSLGD
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSYAVQAHQEIQQQLESQNLEKQPYLLDRLAGSYQNLATLLAYQGHFSQASSKAESGLAI
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HHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCEECCCHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHCEEEECCCHHHHHHHH
SYLKKSKNSDAVIELCKNTKERLQPLVEKDKDPRFTVPYIRALDCLGELSDEKELANLLK
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
LAGVSDINF
HCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11759840 [H]