Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
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Accession | NC_009972 |
Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159899869
Identifier: 159899869
GI number: 159899869
Start: 4228127
End: 4230175
Strand: Direct
Name: 159899869
Synonym: Haur_3352
Alternate gene names: NA
Gene position: 4228127-4230175 (Clockwise)
Preceding gene: 159899868
Following gene: 159899870
Centisome position: 66.62
GC content: 48.56
Gene sequence:
>2049_bases ATGCAGATCGATTCCCAGCATTTAACCCAAGCCAATCAATCAACTTGGCAACGCTATCAAACGGTTATCGCCAGCCTTAG TGCAGGGGTAGCCATCCTGCTTGCATTGTTCAGCTTTGGCCTTGCTGCAAGCTTCGACTGGCTCGTAGCTAATGCTCAAC CAATTATTGGCTTTGGTAGCTTTGTGCTTTTGGTGATTGGGCTACCTGGCTGGGCTACAATTCGCTGGCTTACCCCGCAG CATGTGCTCACTCGCAGCGAGCGTTGGGCTTTGAGCTGGGCCGTGGGCATTGCCTTACCACCAATTTTATTCAATCTCTT TCACATCGTAGGCCTATCAATTAATCGTTGGGTTGTGGTTGGCTATGCGTTGCTTGGGCTATTGTTGACAATCTGGCCTG AGCCACGGTCAGCTTGGAATACCCGCCTTGCCCAACTCAAACAAATCCGCATCAGCAGCCATGCCTGGATCTTGCTGAGC ATCACGCTAGTCAGTATCCTTCAGCGTTTGTTGGCTGTACGCGAATTGAGCGTAGCCCAGTGGAACGATGCCTATCACCA TACGATCATCACCCAACTTTTTTTAGATCATGGTGGTATTTTTGAGACATGGCAGCCCTATGCTGATTTAAACACCTTCA GCTACCACTATGGGTTTCATGCCAATAGCGCCTTTTTGGCATGGTGGAGCCAACTGCCCGCCACCACTAGCGTGCTCTAC ACAGGTCAACTGCTGGGCATTGCCACCGGCGTGATGGCCTATTTACTGGGCCGTCGCTTGAGCAATCGGCCAAGTGTGGG CTTAATCGCCTTTGGCTTGACCAGCTTCTACAACCTCATGCCCGCATATTATGTCAATTGGAGCCGTTTTACCCAATTGA TTGGCCAAGTTATTTTAGTAGGCTTGGTGGTCATTTGGCTGCTAGTGTTGGAATATCCACAGTTTAGTTGGAAATTGGTT GGTCTCGCCAGCGTGCTAACGACAAGTTTGCTGCTGACTCATTATTTAGTCACGATATTTGCGGTGGTTATGGTTGGTTT CGGCATTTTAGCCTTATTAGCCCGCCAGCCAAGCTTAACCAATTTGAAGCAAATCAGCTTACGTGCAACAGCAATTAGCC TTGCAAGCGCTCTGATCGCAGCACCATGGCTGTATACCATTATTCAAAGTAAACTTACGGCGATTGCCCGTAACTATGTG ACTGGTTATAGCGTTGGCTATGCCACAACGGTAGCAACCCTCGACCAAATTGTGCCAACCTATATTAAAGCTCCAATTAT GCTGTTGGCCGTTGTCGGGATTTGGTTGGCTTGTGCCCAACGGGCTTGGCGTATGCTGTTACTGGTGGTTTGGAGCCTTG GGCTTCAGATTTTGGCAGTGCCCTATGTCTTTAACTTACCAATTAGCGGCATTATTAGCGGATTCGCCGTTTCAATTATG CTCTATCTGACGCTGATTCCATTAGCAGCCTATCCCTTGGGCCTTGTGCTGGAGCGCTTTAACCAGCAATGGTATGTCAA AGGCTTGGCTCTGATCGGCTTATATGGGCTGATTGTGTGGTCTACACCATGGCAAACTGCGATTGTCAACGAGCAAAATC GTTTATTGACACGGGCTGATGAGCAAGCGATGCACTGGATTCGCACTACAACTGAGTCAGAAGCTCGCTTTCTGATTAAT GGACTTTTTAGCTATGGCGATGCATTAATTATTGCCGATGATGGTGGCATGTGGATTCCCTTCCTGACTGGTCGCCAAAC TACCATTCCACCACTGACCTATGGCTCGGAAAAAGCGATTAATCCGCAACTTGATCGCGAAGTCTACGCCTTATACGATG CATTACGCACCACCAACCTAGAGACTGCCGCAGGCCTTGCCTTGCTGCAACAGCATCAGGTTGATTATATTTATACTGGG CCGCATATGGGCAAAAATGCTCAAAAAATTCAACTCAACACCCAAGCACTCCGCTATCGTCCTGAACAATTTCCAATTGT CTACGAGCGCGATGGAGTGGTGATTTTTGCAGTAAAGGCGCAACAATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases AGCCTAGCGCAACTCAAGCCCCAAGGTTTGACAGCGTTTTAGGCTATTGTTATACTCGCCACGTTGTGACACCTGTCACA TGAATTAAAGGCCACAATGC
Downstream 100 bases:
>100_bases AACTATGTGTGGTTGGACCAACCTATCCCTACCGTGGGGGGATTGCTCATTACACCACGCTGTTGGTCAAACATTTGCGC GAAGTTGGCCATCATGTACG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 682; Mature: 682
Protein sequence:
>682_residues MQIDSQHLTQANQSTWQRYQTVIASLSAGVAILLALFSFGLAASFDWLVANAQPIIGFGSFVLLVIGLPGWATIRWLTPQ HVLTRSERWALSWAVGIALPPILFNLFHIVGLSINRWVVVGYALLGLLLTIWPEPRSAWNTRLAQLKQIRISSHAWILLS ITLVSILQRLLAVRELSVAQWNDAYHHTIITQLFLDHGGIFETWQPYADLNTFSYHYGFHANSAFLAWWSQLPATTSVLY TGQLLGIATGVMAYLLGRRLSNRPSVGLIAFGLTSFYNLMPAYYVNWSRFTQLIGQVILVGLVVIWLLVLEYPQFSWKLV GLASVLTTSLLLTHYLVTIFAVVMVGFGILALLARQPSLTNLKQISLRATAISLASALIAAPWLYTIIQSKLTAIARNYV TGYSVGYATTVATLDQIVPTYIKAPIMLLAVVGIWLACAQRAWRMLLLVVWSLGLQILAVPYVFNLPISGIISGFAVSIM LYLTLIPLAAYPLGLVLERFNQQWYVKGLALIGLYGLIVWSTPWQTAIVNEQNRLLTRADEQAMHWIRTTTESEARFLIN GLFSYGDALIIADDGGMWIPFLTGRQTTIPPLTYGSEKAINPQLDREVYALYDALRTTNLETAAGLALLQQHQVDYIYTG PHMGKNAQKIQLNTQALRYRPEQFPIVYERDGVVIFAVKAQQ
Sequences:
>Translated_682_residues MQIDSQHLTQANQSTWQRYQTVIASLSAGVAILLALFSFGLAASFDWLVANAQPIIGFGSFVLLVIGLPGWATIRWLTPQ HVLTRSERWALSWAVGIALPPILFNLFHIVGLSINRWVVVGYALLGLLLTIWPEPRSAWNTRLAQLKQIRISSHAWILLS ITLVSILQRLLAVRELSVAQWNDAYHHTIITQLFLDHGGIFETWQPYADLNTFSYHYGFHANSAFLAWWSQLPATTSVLY TGQLLGIATGVMAYLLGRRLSNRPSVGLIAFGLTSFYNLMPAYYVNWSRFTQLIGQVILVGLVVIWLLVLEYPQFSWKLV GLASVLTTSLLLTHYLVTIFAVVMVGFGILALLARQPSLTNLKQISLRATAISLASALIAAPWLYTIIQSKLTAIARNYV TGYSVGYATTVATLDQIVPTYIKAPIMLLAVVGIWLACAQRAWRMLLLVVWSLGLQILAVPYVFNLPISGIISGFAVSIM LYLTLIPLAAYPLGLVLERFNQQWYVKGLALIGLYGLIVWSTPWQTAIVNEQNRLLTRADEQAMHWIRTTTESEARFLIN GLFSYGDALIIADDGGMWIPFLTGRQTTIPPLTYGSEKAINPQLDREVYALYDALRTTNLETAAGLALLQQHQVDYIYTG PHMGKNAQKIQLNTQALRYRPEQFPIVYERDGVVIFAVKAQQ >Mature_682_residues MQIDSQHLTQANQSTWQRYQTVIASLSAGVAILLALFSFGLAASFDWLVANAQPIIGFGSFVLLVIGLPGWATIRWLTPQ HVLTRSERWALSWAVGIALPPILFNLFHIVGLSINRWVVVGYALLGLLLTIWPEPRSAWNTRLAQLKQIRISSHAWILLS ITLVSILQRLLAVRELSVAQWNDAYHHTIITQLFLDHGGIFETWQPYADLNTFSYHYGFHANSAFLAWWSQLPATTSVLY TGQLLGIATGVMAYLLGRRLSNRPSVGLIAFGLTSFYNLMPAYYVNWSRFTQLIGQVILVGLVVIWLLVLEYPQFSWKLV GLASVLTTSLLLTHYLVTIFAVVMVGFGILALLARQPSLTNLKQISLRATAISLASALIAAPWLYTIIQSKLTAIARNYV TGYSVGYATTVATLDQIVPTYIKAPIMLLAVVGIWLACAQRAWRMLLLVVWSLGLQILAVPYVFNLPISGIISGFAVSIM LYLTLIPLAAYPLGLVLERFNQQWYVKGLALIGLYGLIVWSTPWQTAIVNEQNRLLTRADEQAMHWIRTTTESEARFLIN GLFSYGDALIIADDGGMWIPFLTGRQTTIPPLTYGSEKAINPQLDREVYALYDALRTTNLETAAGLALLQQHQVDYIYTG PHMGKNAQKIQLNTQALRYRPEQFPIVYERDGVVIFAVKAQQ
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76181; Mature: 76181
Theoretical pI: Translated: 9.67; Mature: 9.67
Prosite motif: PS00237 G_PROTEIN_RECEP_F1_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MQIDSQHLTQANQSTWQRYQTVIASLSAGVAILLALFSFGLAASFDWLVANAQPIIGFGS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEECCCCCCHHHH FVLLVIGLPGWATIRWLTPQHVLTRSERWALSWAVGIALPPILFNLFHIVGLSINRWVVV HHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH GYALLGLLLTIWPEPRSAWNTRLAQLKQIRISSHAWILLSITLVSILQRLLAVRELSVAQ HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WNDAYHHTIITQLFLDHGGIFETWQPYADLNTFSYHYGFHANSAFLAWWSQLPATTSVLY CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHH TGQLLGIATGVMAYLLGRRLSNRPSVGLIAFGLTSFYNLMPAYYVNWSRFTQLIGQVILV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH GLVVIWLLVLEYPQFSWKLVGLASVLTTSLLLTHYLVTIFAVVMVGFGILALLARQPSLT HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC NLKQISLRATAISLASALIAAPWLYTIIQSKLTAIARNYVTGYSVGYATTVATLDQIVPT CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH YIKAPIMLLAVVGIWLACAQRAWRMLLLVVWSLGLQILAVPYVFNLPISGIISGFAVSIM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH LYLTLIPLAAYPLGLVLERFNQQWYVKGLALIGLYGLIVWSTPWQTAIVNEQNRLLTRAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHH EQAMHWIRTTTESEARFLINGLFSYGDALIIADDGGMWIPFLTGRQTTIPPLTYGSEKAI HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCC NPQLDREVYALYDALRTTNLETAAGLALLQQHQVDYIYTGPHMGKNAQKIQLNTQALRYR CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEHHHHHCC PEQFPIVYERDGVVIFAVKAQQ CCCCCEEEECCCEEEEEEECCC >Mature Secondary Structure MQIDSQHLTQANQSTWQRYQTVIASLSAGVAILLALFSFGLAASFDWLVANAQPIIGFGS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEECCCCCCHHHH FVLLVIGLPGWATIRWLTPQHVLTRSERWALSWAVGIALPPILFNLFHIVGLSINRWVVV HHHHHCCCCCCEEEEEECHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHH GYALLGLLLTIWPEPRSAWNTRLAQLKQIRISSHAWILLSITLVSILQRLLAVRELSVAQ HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WNDAYHHTIITQLFLDHGGIFETWQPYADLNTFSYHYGFHANSAFLAWWSQLPATTSVLY CCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHH TGQLLGIATGVMAYLLGRRLSNRPSVGLIAFGLTSFYNLMPAYYVNWSRFTQLIGQVILV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH GLVVIWLLVLEYPQFSWKLVGLASVLTTSLLLTHYLVTIFAVVMVGFGILALLARQPSLT HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC NLKQISLRATAISLASALIAAPWLYTIIQSKLTAIARNYVTGYSVGYATTVATLDQIVPT CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH YIKAPIMLLAVVGIWLACAQRAWRMLLLVVWSLGLQILAVPYVFNLPISGIISGFAVSIM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHH LYLTLIPLAAYPLGLVLERFNQQWYVKGLALIGLYGLIVWSTPWQTAIVNEQNRLLTRAD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCHHHHHHHH EQAMHWIRTTTESEARFLINGLFSYGDALIIADDGGMWIPFLTGRQTTIPPLTYGSEKAI HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCC NPQLDREVYALYDALRTTNLETAAGLALLQQHQVDYIYTGPHMGKNAQKIQLNTQALRYR CCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCEEEEEHHHHHCC PEQFPIVYERDGVVIFAVKAQQ CCCCCEEEECCCEEEEEEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA